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Sciences de la santé

Daniel Sinnett Modifier son profil

Déterminants génétiques de la leucémie de l’enfant

Professeur titulaire

Faculté de médecine - Département de pédiatrie

514 345-4931

daniel.sinnett@umontreal.ca

Autres numéros : 514 345-4931 #2990 (Travail 1) 514 345-4731 (Télécopieur)

Portrait

Expertise de recherche

Rôle du facteur de transcription ETV6 dans la leucémogenèse de l’enfant.  L’oncogenèse est un processus multi-étapes impliquant l’accumulation de mutations dans les oncogènes et les gènes répresseurs de tumeurs. Le bras court du chromosome 12 humain est affecté par des réarrangements génétiques menant à la perte de matériel génétique dans diverses tumeurs hématologiques. Il a été démontré que le chromosome 12p12.3 contient un gène répresseur putatif qui serait important dans la leucémogenèse de l’enfant, ainsi que dans l’étiologie de certaines tumeurs solides. Le facteur de transcription ETV6 serait ce gène candidat. Dans ce projet nous poursuivons la caractérisation de ETV6 en identifiant des gènes ciblés par ce répresseur transcriptionnel afin de recréer le réseau de régulation et en déterminant la nature des partenaires protéiques du complexe de répression.

Déterminants génétiques de la leucémie de l’enfant.  La leucémie aiguë lymphoblastique (LAL) est le cancer pédiatrique le plus fréquent et la principale cause de décès chez les enfants. Nous proposons que l’origine de la leucémie de l’enfant s’explique par une combinaison de facteurs génétiques de susceptibilité et des expositions environnementales. Peu d'études se sont penchées sur le rôle de variations génétiques héréditaires dans la modulation du risque de LAL chez l'enfant. Nous avons démontré que la LAL pédiatrique pourrait être le fruit d'une collaboration entre plusieurs variations dans les gènes régulant l'efficacité du métabolisme d'agents cancérogènes, le maintient de l'intégrité génomique et la réponse au stress oxydatif. Des études pan-génomiques récentes supportent le rôle de la génétique dans la pathogenèse de la LAL. Toutefois, peu de facteurs de risque génétiques de la LAL ont été caractérisés, laissant les causes génétiques de cette maladie largement inexpliquées, quoiqu'il est probable qu'elle soit le résultats de collaborations entre variantes génétiques rares et communes.Un modèle plus réaliste de cette maladie implique la combinaison de variantes fonctionnelles rares et communes jumelées à des variations génomiques somatiques et des changements épigénetiques. Le développement du séquençage haut-débit et des outils bioinformatiques connexes nous donnent une vue inégalée du paysage génomique de la LAL pédiatrique. Ces données permettent de détecter à la fois les variantes germinales communes et rares ainsi que les mutations somatiques spécifiques aux cellules leucémiques.  Ces approchent génomiques génèrent de grands ensembles de jeux de données qui nécessitent de développer des outils bioinformatiques afin d’assurer une gestion, intégration et analyse efficace et productive de ces données. L'identification des événements génétiques menant à la leucémogenèse, ménera au développement d'outils de recherche et cliniques qui amélioreront la détection, le diagnostic et le traitement de la leucémie pédiatrique.

Étude des facteurs génétiques influençant la susceptibilité de développer des effets secondaires à long-terme suite aux traitements chez les survivants de leucémie pédiatrique.  Bien que 85% des LAL soient guéries par les traitements actuels, l'exposition aux agents de chimiothérapie ou à la radiothérapie pendant une période de développement critique chez l'enfant a été associée avec une fréquence élevée de problèmes de santé tardifs dans plus de deux tiers des survivants. La sévérité et la fréquence de ces effets dans cette population est très variable et les causes de cette variabilité inconnues. L'absence de marqueurs biologiques permettant de détecter ces effets secondaires tôt dans leur développement demeure un problème.Nous avons réuni une équipe multidisciplinaire regroupant des chercheurs cliniciens et fondamentaux qui se penchera sur ce problème dans le but d’identifier des marqueurs biologiques spécifiques aux effets secondaires les plus communs chez les survivants de la LAL pédiatrique. Ceux-ci comprennent des effets neurocognitifs, un syndrome métabolique, de la cardiotoxicité et de la morbidité squelettique. Nous proposons d'élucider les mécanismes menant à ces problèmes de santé en étudiant les variantes génétiques ainsi qu'une panoplie de biomarqueurs cliniques pertinents. Nous voulons aussi déterminer l'impact de certains marqueurs génétiques et biologiques sur le traitement à long-terme chez les survivants de la LAL pédiatrique. Ces résultats mèneront au développement de nouvelles stratégies et d'outils cliniques pour prévenir, ou du moins réduire, l'apparition des effets à long-terme des traitements, améliorant ainsi la détection, le diagnostic et le traitement de la leucémie pédiatrique.

Enseignement et encadrement

Encadrement

Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)

2017

Paysage génomique de la leucémie aiguë lymphoblastique de l’enfant

Diplômé(e) : Spinella, Jean-François
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2017

Caractérisation du microDNome et sa modulation par le traitement anti-cancer

Diplômé(e) : Mehanna, Pamela
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2011

Alternative strategies for deciphering the genetic architecture of childhood Pre-B acute lymphoblastic leukemia

Diplômé(e) : Healy, Jasmine
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2009

Impacts fonctionnels des polymorphismes dans les promoteurs des gènes de l’apoptose

Diplômé(e) : Lalonde, Marie-Eve
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2008

Détection et caractérisation des interactions dans les maladies complexes

Diplômé(e) : St-Onge, Pascal
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2006

Identification de transcrits modulés par ETV6 : un gène candidat suppresseur de tumeur

Diplômé(e) : Boily, Gino
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2005

Variabilité génétique dans les régions régulatrices de gènes impliqués dans le contrôle du cycle cellulaire

Diplômé(e) : Bélanger, Hélène
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2004

Polymorphismes dans des gènes de métabolisme des corticostéroïdes : rôle dans la réponse thérapeutique

Diplômé(e) : Fleury, Isabelle
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2003

Variabilité génétique au niveau des gènes de réparation de l'ADN

Diplômé(e) : Meloche, Caroline
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

Projets

Projets de recherche

2015 - 2023

Vascular remodeling in hypertension and cardiometabolic disease: from mice to humans.

Chercheur principal : Daniel Sinnett
Co-chercheurs : Ernesto Luis Schiffrin
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
2015 - 2022

CALCUL QUEBEC

Chercheur principal : Paul Charbonneau , Timothée Poisot
Co-chercheurs : Damian Labuda , Jesse Shapiro , Mohamed Hijri , Daniel Sinnett , Mark E. Samuels , Laurent J. Lewis , Normand Mousseau , Jacques Drouin , Anne Bruneau , Georges Michaud , François Schiettekatte , Rémy Sauvé , Michel Côté , Pierre-Louis Bellec , Louis Jean Dubé , Guy Dumas , Marc Parizeau , Louis Pérusse , Alain De Champlain , Daniel Reinharz , Hugo Martel , Christian Gagné , Arnaud Droit , Frédéric Maps , R Platt , Alan C Evans , W Robert J Funnell , Hong Guo , Victoria Kaspi , Sang Yong Jeon , Nikolas Provatas , Russell Davidson , Jackalyn Marie Vogel , Nicolas Moitessier , Guy Moore , Sivakumaran Nadarajah , Abdelkader Baggag , Erica Moodie , Jacek A. Majewski , Andrew Piper , Luc Mongeau , Guillaume Bourque , Stefan Sinclair , Daniel Joseph Kirshbaum , Jun Song , Brigitte Jaumard , Jean-Yves Trépanier , François Guibault , François Bertrand , Alain Rochefort , Frédéric Sirois , Éric Laurendeau , Georges Dionne , Wagdi Habashi , G. Peslherbe , Thomas Fevens , Marius Paraschivoiu , Ali Dolatabadi , André Dieter Bandrauk , André-Marie Tremblay , Pierre Proulx , Noureddine Atalla , David Sénéchal , Armand Soldera , Kalifa Goïta , Alexandre Blais , Claude Legault , Stéphane Moreau , Hugo Larochelle , Gabriel Crainic , René Laprise , Pierre Gauthier , Laxmi Sushama , Simon Guillotte , Adam Skorek , Patrizio Antici , Dany Dumont , François Vidal , Jannette Frandsen , Lorne Archie Nelson , Martin Aube , Leandro Coelho , Jacques Drouin , Louis Jean Dubé , Guy Dumas , Marc Parizeau , Louis Pérusse , Alain De Champlain , Daniel Reinharz , Hugo Martel , Christian Gagné , Arnaud Droit , Frédéric Maps , Sivakumaran Nadarajah , Abdelkader Baggag , Hugo Larochelle , Gabriel Crainic , René Laprise , Pierre Gauthier , Laxmi Sushama , Simon Guillotte , Leandro Coelho , Hugo Larochelle , Sivakumaran Nadarajah , Pierre-Étienne Jacques
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Programme de Regroupements Stratégiques
2013 - 2017

CLINICAL EVALUATION OF SURFACE-PLASMON RESONANCE AND NANOPARTICLE-BASED FLUORESCENT DETECTION OF SERUM BIOMARKERS

Chercheur principal : Joelle Pelletier
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Recherche concertée sur la santé (en partenariat avec le CRSNG)
2013 - 2017

CLINICAL EVALUATION OF SURFACE-PLASMON RESONANCE AND NANOPARTICLE-BASED FLUORESCENT DETECTION OF SERUM BIOMARKERS

Chercheur principal : Joelle Pelletier
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(PRCS/CHRP) Recherche en équipe concertée sur la santé avec l'appareillage (avec IRSC)
2014 - 2016

LONG NONCODING RNAS DEREGULATED IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA

Chercheur principal : Daniel Sinnett
Sources de financement : IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Programmes de subvention :
2011 - 2016

GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS

Chercheur principal : Daniel Sinnett
2010 - 2015

INVESTIGATION OF THE GENOMIC DETERMINANTS OF CHILDHOOD LEUKEMIA USING NEXT-GENERATION SEQUENCING

Chercheur principal : Daniel Sinnett
2010 - 2014

MONTREAL BIOBANK NETWORK FOR PEDIATRIC AND YOUNG ADULT LEUKEMIA : CORE 1 PROPOSAL - CHILDREN LEUKEMIA BANK

Chercheur principal : Daniel Sinnett
Sources de financement : COLE Foundation/Fondation Cole
Programmes de subvention :
2011 - 2013

GENOMICS OF CHILDHOOD LEUKEMIA

Chercheur principal : Daniel Sinnett
Sources de financement : Regroupement de compagnies, corporations canadiennes
Programmes de subvention :
2011 - 2013

GENOMICS OF CHILDHOOD LEUKEMIA

Chercheur principal : Daniel Sinnett
Sources de financement : MSSS/Ministère de la Santé et des Services sociaux
Programmes de subvention :
2011 - 2013

GENOMICS OF CHILDHOOD LEUKEMIA

Chercheur principal : Daniel Sinnett
Sources de financement : FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention :
2010 - 2013

GENOMIC DETERMINANTS OF CHILDHOOD LEUKEMIA

Chercheur principal : Daniel Sinnett
2008 - 2013

CIHR TEAM OF PREDICTION AND COMMUNICATION OF FAMILIAL RISK OF BREAST CANCER

Chercheur principal : Bartha Maria Knoppers
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
2008 - 2013

CRN-87521 CIHR TEAM OF PREDICTION AND COMMUNICATION OF FAMILIAL RISK OF BREAST CANCER

Chercheur principal : Bartha Maria Knoppers
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
2008 - 2011

REGULATORY POLYMORPHISMS IN APOPTOSIS GENES AND SUSCEPTIBILITY TO CHILDHOOD LEUKEMIA

Chercheur principal : Daniel Sinnett
2010

DEVELOPPEMENT DE DEMANDE: GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS

Chercheur principal : Daniel Sinnett
2009

ATELIER GENOMIQUE FRSQ-NSFC, BEIJING, CHINA

Chercheur principal : Daniel Sinnett , John David Rioux

Rayonnement

Publications et communications

Disciplines

  • Biologie moléculaire
  • Oncologie
  • Génétique

Champ d’expertise

  • Bioinformatique
  • Cancer du sang
  • Cellule
  • Diagnostic et détection du cancer
  • Exploration de données (Data mining)
  • Expression et régulation génique
  • Gène suppresseur
  • Gènes
  • Gènes de susceptibilité
  • Génétique de traits complexes
  • Génétique du cancer
  • Génétique et hérédité
  • Génétique moléculaire
  • Génome
  • Génomique
  • Génotype et phénotype
  • Maladies génétiques
  • Marqueurs génétiques
  • Micropuces d’ADN et d’ARN
  • Polymorphisme