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Sciences de la santé

John David Rioux

Base génétique et fonctionnelle des maladies inflammatoires

Professeur titulaire

Faculté de médecine - Département de médecine

514 376-3330

john.david.rioux@umontreal.ca

Autre numéro : 514 376-3330 #3741 (Travail 1)

Portrait

Expertise de recherche

Le laboratoire de génétique et médecine génomique en inflammation étudie la base génétique et fonctionnelle des maladies inflammatoires communes dont l'asthme, les maladies cardiovasculaires, la maladie de Crohn, la colite ulcéreuse, le lupus érythémateux disséminé, la polyarthrite rhumatoïde et la sclérose en plaques. En plus, notre groupe s'intéresse à identifier des gènes responsables de maladies mendéliens rares qui affectent la population canadienne française.

Biographie

John D. Rioux est professeur agrégé de médecine à l'Université de Montréal et à l’Institut de Cardiologie de Montréal où il œuvre en tant que chercheur et directeur du Laboratoire de génétique et médecine génomique en inflammation. Depuis 2005, il est titulaire de la Chaire de recherche du Canada en génétique et médecine génomique.

Le Dr Rioux a obtenu un baccalauréat en sciences (B.Sc. Immunologie) en 1987 et un doctorat en médecine (Ph.D. Médecine expérimentale) de l'Université McGill en 1994. Il a ensuite complété un stage postdoctoral au Whitehead Institute/MIT Center for Genome Research en 1997. À la suite de cette formation, le Dr Rioux a créé un groupe de recherche travaillant sur la génétique et la génomique des maladies monogéniques et des maladies polygéniques/complexes. En 2001, il est devenu directeur du groupe de recherche sur les maladies inflammatoires au Whitehead Institute/MIT Center for Genome Research, puis au Broad Institute of MIT and Harvard. Il a été nommé professeur adjoint au Harvard Medical School et au Brigham and Women’s Hospital en 2003 et, en 2004, membre associé du Broad Institute of MIT and Harvard jusqu’en 2007.

Ses recherches ont pour but de découvrir les facteurs de risque génétiques des maladies communes (polygéniques) et de déterminer les mécanismes biologiques par lesquelles ces variantes génétiques influencent le risque de développer ces maladies chroniques.  Il est membre fondateur de quatre consortiums internationaux en génétique. Dr. Rioux a plus de 150 publications incluant plusieurs publications dans les revues de prestige comme  Nature, Science, Nature Genetics, et New England Journal of Medicine.

Affiliations et responsabilités

Affiliations de recherche

Unités de recherche

Titulaire

Membre

Établissements affiliés

  • Institut de cardiologie de Montréal (ICM)

Enseignement et encadrement

Encadrement

Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)

2022

Comprendre la fonction cellulaire par l’analyse du transcriptome : une approche bio-informatique

Diplômé(e) : Mola, Saraï
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2017

Étude génétique et fonctionnelle des gènes de la région 14q31 associée aux maladies inflammatoires de l’intestin

Diplômé(e) : Mercier, Virginie
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2016

Développement d’une méthode bio-informatique permettant de relier les gènes aux métabolites

Diplômé(e) : Cherkaoui, Sarah
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2016

Déterminer le rôle de C1orf106, un gène associé aux maladies inflammatoires de l’intestin

Diplômé(e) : Lévesque, Chloé
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2012

MAST3 : facteur de risque génétique aux maladies inflammatoires de l’intestin et modulateur d’inflammation

Diplômé(e) : Labbé, Catherine
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2012

Le locus 1q32 : susceptibilité aux maladies inflammatoires de l’intestin et rôles biologiques de C1orf106 et KIF21B

Diplômé(e) : David, Geneviève
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2011

Étude génétique et fonctionnelle de variantes de la région chromosomique 3p21 associée aux maladies inflammatoires de l'intestin

Diplômé(e) : Lévesque, Marie-Pierre
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

Projets

Projets de recherche

2022 - 2029

Canada Research Chair in Genetics and Genomic Medicine

Chercheur principal : John David Rioux
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVX50399-Chaires de recherche du Canada
2021 - 2027

Identifying and functionally validating IBD genes and variants impacting intestinal epithelial barrier integrity

Chercheur principal : John David Rioux
Co-chercheurs : François Boudreau
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2018 - 2024

Characterization of the immunologic events that lead to development of Systemic Autoimmune Rheumatic Disease

Chercheur principal : Joan Elizabeth Wither
Co-chercheurs : John David Rioux
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2021 - 2022

Developing an inexpensive blood-based diagnostic test for Crohn's Disease

Chercheur principal : John David Rioux
Sources de financement : Génome Québec
Programmes de subvention :
2015 - 2022

Génétique et médecine génomique

Chercheur principal : John David Rioux
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVX50399-Chaires de recherche du Canada
2018 - 2021

A prospective study of immune cell responsiveness to understand drug response in UC patients treated with tofacitinib

Chercheur principal : John David Rioux
Sources de financement : Pfizer Canada Inc.
Programmes de subvention :
2015 - 2021

Suvention FICM 2015-2018

Chercheur principal : John David Rioux
Sources de financement : Fondation de l'Institut de cardiologie de Montréal
Programmes de subvention :
2014 - 2021

Insights into Parkinson's disease, Crohn's disease and leprosy: common role of LRRK2

Chercheur principal : David Park
Co-chercheurs : John David Rioux
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
2019 - 2020

Comprendre l'hétérogénéité tissulaire dans l'acidose lactique: une fenêtre sur les mécanismes physiopathologiques et cardioprotection

Chercheur principal : John David Rioux
Sources de financement : Le Grand Défi Pierre Lavoie
Programmes de subvention :
2018 - 2020

Canadian Autoimmunity Standardization Core (CAN-ASC)

Co-chercheurs : Christine Des Rosiers , John David Rioux
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
2018 - 2019

Understanding the role of Epigenetic Reader SP 140 in IBD

Chercheur principal : John David Rioux
Sources de financement : NIH/National Institutes of Health (NIH)
Programmes de subvention :
2013 - 2018

IBD GENOMIC MEDICINE CONSORTIUM (IGENOMED) : TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO A PERSONALIZED APPROACH TO TREATING THE INFLAMMATORY BOWEL DISEASES

Co-chercheurs : John David Rioux , Jean Lachaine
Sources de financement : Génome Québec
Programmes de subvention :
2013 - 2018

IBD GENOMIC MEDICINE CONSORTIUM (IGENOMED): TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO A PERSONALIZED APPROACH TO TREATING THE INFLAMMATORY BOWEL DISEASES

Chercheur principal : John David Rioux
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada , Génome Canada , AmorChem , Génome Québec
Programmes de subvention : , , ,
2016 - 2017

Plateforme de support aux analyses cellulaires et génomiques appliquées à la recherche biomédicale

Chercheur principal : John David Rioux
Sources de financement : FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds des leaders
2015 - 2017

Defining the causality & biologic impact of genes within ulcerative colitis loci.

Chercheur principal : John David Rioux
Sources de financement : NIH/National Institutes of Health (NIH)
Programmes de subvention :
2014 - 2017

IBD GENOMIC MEDICINE CONSORTIUM (IGENOMED) : TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO A PERSONALIZED APPROACH TO TREATING THE INFLAMMATORY BOWEL DISEASES

Co-chercheurs : John David Rioux , Brian White-Guay
Sources de financement : Génome Québec
Programmes de subvention :
2015 - 2016

Studies of immune status and responsiveness, metabolites and secreted proteins in retrospective and prospective IBD cohorts

Co-chercheurs : John David Rioux
Sources de financement : NIH/National Institutes of Health (NIH)
Programmes de subvention :
2013 - 2015

SUBVENTION FICM 2013-2014

Chercheur principal : John David Rioux
Sources de financement : Fondation de l'Institut de cardiologie de Montréal
Programmes de subvention :
2010 - 2015

GENETICS AND GENOMIC MEDICINE OF INFLAMMATION

Chercheur principal : John David Rioux
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVX50399-Chaires de recherche du Canada
2009 - 2015

CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATORY DISEASES : IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY: A MODAL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES

Chercheur principal : John David Rioux
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Subvention d'équipe
2009 - 2015

CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATION DISEASE : IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY : A MODEL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES

Chercheur principal : Stephen Michnick
Co-chercheurs : John David Rioux
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Subvention d'équipe
2009 - 2015

CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATORY DISEASES : IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY : A MODAL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES

Chercheur principal : John David Rioux
Sources de financement : Fondation canadienne des maladies inflammatoires de l'intestin
Programmes de subvention :
2009 - 2015

CIHR TEAM IN THE LEIGH SYNDROME FRENCH CANADIAN TYPE (LSFC) : TRANSLATING LSFC GENE DISCOVERY INTO TREATMENTS FOR PATIENTS

Chercheur principal : Christine Des Rosiers
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
2014

IBD GENOMIC MEDECINE CONSORTIUM (IGENOMED) : TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO A PERSONALIZED APPROACH TO TREATING THE INFLAMMATORY BOWEL DISEASES

Chercheur principal : John David Rioux
Sources de financement : Crohn's and Colitis Foundation of America
Programmes de subvention :
2013 - 2014

MONTREAL-BOSTON COLLABORATIVE IBD GENETIC RESEARCH CENTER

Chercheur principal : John David Rioux
Co-chercheurs : Alain Bitton
Sources de financement : NIH/National Institutes of Health (NIH)
Programmes de subvention :
2009 - 2014

CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATORY DISEASES: IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY: A MODAL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES

Chercheur principal : John David Rioux
2011 - 2013

GENETIQUE ET MEDECINE GENOMIQUE DE L'INFLAMMATION

Chercheur principal : John David Rioux
Sources de financement : FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention :
2011 - 2013

GENETIQUE ET MEDECINE GENOMIQUE DE L'INFLAMMATION

Chercheur principal : John David Rioux
Sources de financement : Regroupement de compagnies, corporations canadiennes
Programmes de subvention :
2011 - 2013

GENETIQUE ET MEDECINE GENOMIQUE DE L'INFLAMMATION

Chercheur principal : John David Rioux
Sources de financement : MSSS/Ministère de la Santé et des Services sociaux
Programmes de subvention :
2009 - 2011

BIOLOGIE INTEGRATIVE DES GENES ASSOCIES A PLUSIEURS MALADIES INFLAMMATOIRES: AMELIORATIONS DIAGNOSTIQUE ET THERAPEUTIQUE

Chercheur principal : John David Rioux
2009

ATELIER GENOMIQUE FRSQ-NSFC, BEIJING, CHINA

Chercheur principal : Daniel Sinnett , John David Rioux

Rayonnement

Publications et communications

Disciplines

  • Génétique

Champ d’expertise

  • Cartographie génétique
  • Chromosomes: structure / organisation
  • Dépistage génétique des maladies
  • Dommages et réparation du génome
  • Expression et régulation génique
  • Gènes
  • Gènes de susceptibilité
  • Génétique appliquée
  • Génétique de traits complexes
  • Génétique du développement
  • Génétique et éthique
  • Génétique et hérédité
  • Génétique évolutive
  • Génétique moléculaire
  • Génétique populationnelle
  • Génome
  • Génomique
  • Interactions gènes et environnement
  • Maladies génétiques
  • Marqueurs génétiques
  • Micropuces d'ADN et d'ARN
  • Modèle transgénique
  • Mutation (processus)
  • Phénotype
  • Polymorphisme
  • Protéines
  • Protéomique
  • Télomères
  • Thérapie génique

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