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Health Sciences; Medical Sciences

Marlene Oeffinger

Régulation et dynamique des voies de maturation de l'ARN

Professeure/chercheuse agrégée

Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire

marlene.oeffinger@umontreal.ca

Secondary number: 514 987-5668 (Travail 1)
Secondary email: marlene.oeffinger@ircm.qc.ca (Travail)

Profile

Research expertise

Nous étudions la régulation et la dynamique des voies de maturation de l’ARN. Notre objectif principal est de déterminer l’ensemble temporelle et spatiale et la coordination des facteurs de maturation de l’ARN, ainsi que d’identifier les mécanismes de contrôle sous-jacents qui conduisent le traitement, la modification et l’assemblage des différents ARN dans la levure bourgeonnante S.cerevisiae et les humains. Nous combinons des approches protéomiques, biochimiques et computationnelles pour construire une image dynamique des voies de maturation de l’ARN dans différents contextes cellulaires et organismes pour obtenir des informations importantes sur la façon dont la maturation des ARN est liée à d’autres processus cellulaires, y compris les voies qui détectent et réparent les dommages à l’ADN, le développement et l’apparition de diverses maladies telles que la maladie d’Alzheimer et la SLA.

Affiliations and responsabilities

Research affiliations

Teaching and supervision

Student supervision

Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)

2021

Deciphering mRNP – nuclear pore interactions : study of basket protein dynamics in budding yeast

Graduate : Bensidoun, Pierre
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2014

Uncovering parallel ribosome biogenesis pathways during pre-60S subunit maturation

Graduate : Aguilar, Lisbeth C.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.

Projects

Research projects

2020 - 2027

Determining the role of the nuclear basket protein Mlp1/TPR in mRNA homeostasis

Lead researcher : Daniel Zenklusen
Co-researchers : Marlene Oeffinger
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2020 - 2026

Determining spatial arrangement, stoichiometry, and substrate specificity of messenger RNA-binding proteins along the gene expression pathway.

Lead researcher : Marlene Oeffinger
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2020 - 2026

Determining spatial arrangement, stoichiometry, and substrate specificity of messenger RNA-binding proteins along the gene expression pathway.

Lead researcher : Marlene Oeffinger
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PV118029-(RGPAS) Programme de suppléments d'accélération à la découverte
2022 - 2025

Nuclear Transport Meeting 2022

Lead researcher : Daniel Zenklusen
Co-researchers : Katherine Borden , Marlene Oeffinger
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-Subventions pour réunion, planification et dissémination
2017 - 2023

Determining the pathways, components and functional niches that define specialized ribosomes.

Lead researcher : Marlene Oeffinger
Co-researchers : Daniel Zenklusen , Sebastian Pechmann
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2015 - 2022

DETERMINING THE MOLECULAR MECHANISMS OF RIBOSOMAL EXPORT THROUGH THE NUCLEAR PORE

Lead researcher : Marlene Oeffinger
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2020 - 2021

Supplément COVID-19 CRSNG_Determining spatial arrangement, stoichiometry, and substrate specificity of messenger RNA-binding proteins along the gene expression pathway.

Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-Supplément à l’appui des étudiants, des stagiaires postdoctoraux et du personnel de soutien à la recherche COVID-19
2018 - 2020

Disséquer les mécanismes et les composants qui définissent la fonction différentielle des ribosomes dans l’ homéostasie cellulaire

Lead researcher : Marlene Oeffinger
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Junior 2
2016 - 2019

Host factors involved in polyomavirus genome replication

Lead researcher : Jacques Archambault
Co-researchers : Marlene Oeffinger
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
2013 - 2019

HOST FACTORS INVOLVED IN POLYOMAVIRUS GENOME REPLICATION

Lead researcher : Jacques Archambault
Co-researchers : Marlene Oeffinger
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2013 - 2018

THE ROLES OF MBNL PROTEINS IN THE PATHOGENESIS OF MYOTONIC DYSTROPHY

Lead researcher : Pascal Chartrand
Co-researchers : Éric Lécuyer , Marlene Oeffinger
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada , Association canadienne de la dystrophie musculaire (L')
Grant programs: PVXXXXXX-Subvention de fonctionnement - annonce de priorités ,
2017

Proteomic and transcriptomic profiling of paraspeckle function in healthy and LAS model neuronal cells

Lead researcher : Marlene Oeffinger
Funding sources: ALS/Amyotrophic Lateral Sclerosis Association
Grant programs:
2011 - 2017

DISSECTING THE DYNAMICS OF LARGE RIBONUCLEOPROTEIN COMPLEX MATURATION

Lead researcher : Marlene Oeffinger
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(MSH) Bourses de nouveaux chercheurs
2010 - 2016

DISSECTING THE DYNAMICS OF LARGE RIBONUCLEOPROTEIN COMPLEX MATURATION

Lead researcher : Marlene Oeffinger
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2010 - 2016

INTERACTIONS BETWEEN RIBOSOME BIOGENESIS AND REGULATORY NETWORKS OF CELL DIVISION IN EUKARYOTIC CELLS

Lead researcher : Marlene Oeffinger
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2010 - 2016

Training program in cellular dynamics of macromolecular complexes

Lead researcher : Christian Baron
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PV118026-FONCER : Prog. formation orientée nouveauté, la collaboration et l'expérience en recherche
2010 - 2016

DISSECTING THE DYNAMICS OF LARGE RIBONUCLEOPROTEIN COMPLEX MATURATION

Lead researcher : Marlene Oeffinger
2011 - 2015

LA MATURATION DYNAMIQUE DES COMPLEXES DES PROTEINES RIBONUCLEIQUES

Lead researcher : Marlene Oeffinger
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier clinicien: junior I et II et senior (offre seulement)
2011 - 2014

LA MATURATION DYNAMIQUE DES COMPLEXES DES PROTEINES RIBONUCLEIQUES

Lead researcher : Marlene Oeffinger
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Établissement de jeunes chercheurs Juniors 1
2011 - 2014

LA MATURATION DYNAMIQUE DES COMPLEXES DES PROTÉINES RIBONUCLÉIQUES

Lead researcher : Marlene Oeffinger
2010 - 2014

INTERACTIONS BETWEEN RIBOSOME BIOGENESIS AND REGULATORY NETWORKS OF CELL DIVISION IN EUKARYOTIC CELLS

Lead researcher : Marlene Oeffinger

Outreach

Publications and presentations

Publications

  • Lessard F, Igelmann S, Trahan C, Huot G, Saint-Germain E, Mignacca L, Del Toro N, Lopes-Paciencia S, Le Calvé B, Montero M, Deschênes-Simard X, Bury M, Moiseeva O, Rowell MC, Zorca CE, Zenklusen D, Brakier-Gingras L, Bourdeau V, Oeffinger M and Ferbeyre G. (2018) Ribosome biogenesis defects in senescence reveal a novel checkpoint to control CDK4. Nat Cell Biology June 25.
  • Scott DDTrahan CZindy PJAguilar LCDelubac M, Van Nostrand EL, Adivarahan S, Wei KE, Zenklusen D, Yeo GW and Oeffinger M. (2017) Nol12 is a multifunctional endonuclease at the nexus of RNA and DNA metabolism. Acids Res. EPub Oct 23. doi: 10.1093/nar/gkx963.
  • Trahan C and Oeffinger M. (2016) Targeted cross-linking-mass spectrometry determines vicinal interactomes within heterogeneous RNP complexes. Acids Res. Feb; 44(3): 1354-69.
  • Burlacu E, Lackmann F, Aguilar LC, Berlikoc S, van Nues R, Trahan C, Hector RD, Whiteley ND, Cockroft SL, Wieslander L, Oeffinger M and Granneman S. (2017) High through-put RNA structure probing reveals critical folding events during early stages of ribosome biogenesis in yeast. Nat Comm. Sep 28;8(1):714.
  • Oeffinger M and Montpetit B. (2015) Emerging properties of nuclear RNP biogenesis and export. Curr Opinion Cell Biol. – Special Issue Cell Nucleus June; (34): 46-53.

Disciplines

  • Biochemistry
  • Medical Biochemistry
  • Genomics
  • Cell Biology

Areas of expertise

  • Biological and Biochemical Mechanisms
  • Proteomics
  • Functional and Structural Proteomics
  • Alzheimer’s Disease
  • Multiple Sclerosis