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Sciences de la santé; Sciences médicales

Brian Wilhelm

Génomique à haut débit

Professeur sous octroi agrégé

Faculté de médecine - Département de médecine

Pavillon Marcelle-Coutu, local 4306-13

514 343-6111 #0923

brian.wilhelm@umontreal.ca

Portrait

Expertise de recherche

La régulation transcriptionnelle est un processus complexe qui exige le recrutement de l’ARN polymérase vers les sites dirigés de transcription, la modification de la structure locale de la chromatine et l’épissage des nouveaux transcrits. Une interruption de la coordination de ce processus, comme la transcription erronée qui active de façon inappropriée des gènes qui modifient le comportement normal des cellules, peut favoriser l’apparition d’un cancer. Dans le but de comprendre clairement la nature de cette anomalie, il est souvent nécessaire d’avoir un aperçu global du système.

Notre équipe de recherche s’intéresse actuellement à l’utilisation des technologies d’avant-garde, à haut débit, comme les biopuces à ADN et le séquençage d’ADN de nouvelle génération afin d’élucider les connexions sous-jacentes à l’activité transcriptionnelle et au comportement des cellules. Pour comprendre ce phénomène dans le contexte de la biologie du cancer, nous utilisons actuellement ces approches pour caractériser les échantillons de patients atteints de la leucémie myéloïde aiguë (LMA) dans le but d’identifier les mutations qui favorisent l’apparition de la maladie. De plus, nous utilisons la levure à fission (Schizosaccharomyces pombe) comme système modèle pour étudier le recrutement de l’ARN polymérase II et son comportement pendant la transcription. Le fait de mieux comprendre la machinerie moléculaire qui est à la base de ces processus nous permettra ultimement de mettre au point de nouveaux médicaments pour traiter le cancer.

Biographie

Brian Wilhelm obtient son diplôme de doctorat en génétique médicale du UBC au Terry Fox Laboratory de Vancouver, en 2003. Il poursuit une formation postdoctorale au Wellcome Trust Sanger Institute, au Royaume-Uni dans le labo du Dr Jurg Bahler, puis au sein du laboratoire du docteur Guy Sauvageau à l’IRIC.

En 2010, Brian Wilhelm a lancé son laboratoire, l’Unité de recherche en génomique à haut débit de l’Institut, et a débuté comme professeur au Département de médecine de l’Université de Montréal.

Affiliations et responsabilités

Enseignement et encadrement

Encadrement

Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)

Projets

Projets de recherche

2017 - 2023

Systematic studies of human models of acute myeloide leukemia: establishing a pipeline for novel targeted therapeutics

Chercheur principal : Brian Wilhelm
Sources de financement : IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Programmes de subvention :
2017 - 2023

Systematic studies of human models of acute myeloide leukemia: establishing a pipeline for novel targeted therapeutics

Chercheur principal : Brian Wilhelm
Sources de financement : FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Subventions de recherche en partenariat
2018 - 2021

Établissement d'un pipeline de criblage chimiogénomique pour les leucémies pédiatriques à haut risque

Chercheur principal : Brian Wilhelm
Sources de financement : IRICoR
Programmes de subvention : PV143493-(RCE) Réseaux de centres d'excellence
2018 - 2021

Towards a better risk-adapted therapy in young adults with acute myeloid leukemia

Chercheur principal : Josée Hébert
Co-chercheurs : Brian Wilhelm , Sonia Cellot
Sources de financement : (16631)Société canadienne du cancer (16631) , COLE Foundation/Fondation Cole
Programmes de subvention : ,
2018 - 2021

Towards a better risk-adapted therapy in young adults with acute myeloid leukemia

Chercheur principal : Josée Hébert
Co-chercheurs : Brian Wilhelm , Sonia Cellot
Sources de financement : IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Programmes de subvention :
2018 - 2021

Towards a better risk-adapted therapy in young adults with acute myeloid leukemia

Co-chercheurs : Brian Wilhelm , Josée Hébert
Sources de financement : IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Programmes de subvention :
2018 - 2021

Établissement d'un pipeline de criblage chimiogénomique pour les leucémies pédiatriques à haut risque

Chercheur principal : Brian Wilhelm
Sources de financement : FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Oncopole EMC2 (Équipes multidisciplinaires contre le cancer)
2018 - 2021

Towards a better risk-adapted therapy in young adults with acute myeloid leukemia

Chercheur principal : Josée Hébert
Co-chercheurs : Brian Wilhelm , Sonia Cellot
Sources de financement : SRC/Société de recherche sur le cancer
Programmes de subvention :
2018 - 2020

MARATHON OF HOPE CANCER CENTRES NETWORK PILOT : THE MONTREAL CANCER CONSORTIUM AGREEMENT

Chercheur principal : Claude Perreault
Co-chercheurs : Michel Bouvier , Brian Wilhelm , Sonia Cellot , Elie Haddad
Sources de financement : Terry Fox Research Institute
Programmes de subvention :
2016 - 2020

Identification de nouveaux mécanismes moléculaires impliqués dans les leucémies myéloïde aigüe en pédiatrie

Chercheur principal : Brian Wilhelm
Sources de financement : FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Junior 2
2013 - 2020

MECHANISMS FOR ESTABLISHMENT AND MAINTENANCE OF ALLELE SPECIFIC EXPRESSION OF GATA2

Chercheur principal : Brian Wilhelm
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2015 - 2019

UNE APPROCHE CHIMIO- ET PROTEO-GENOMIQUE EN MEDECINE PERSONNALISEE POUR LA LEUCEMIE MYELOIDE AIGUE

Chercheur principal : Guy Sauvageau
Sources de financement : FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'innovation
2018

Machine Learning & Biological Systems

Chercheur principal : Brian Wilhelm
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Subventions Connexion
2017 - 2018

Microfluidic detection of leukemia cells by electronic biomolecular sensors

Chercheur principal : Brian Wilhelm
Co-chercheurs : Delphine Bouilly
Sources de financement : LLS Canada/Leukemia and Lymphoma Society of Canada (The)
Programmes de subvention : PVXX1862-Subvention de fonctionnement
2015 - 2018

TRANSCRIPTIONAL AND EPIGENETIC CONSEQUENCES OF MLL-AF9 TRANSLOCATIONS

Chercheur principal : Brian Wilhelm
Co-chercheurs : Frédéric Barabé
Sources de financement : Terry Fox Research Institute , FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ) , COLE Foundation/Fondation Cole
Programmes de subvention : , PVXXXXXX-Établissement de jeunes chercheurs Juniors 1 ,
2017

Optimization of screening procedures for monoclonal antibodies directed against membrane bound proteins

Chercheur principal : Brian Wilhelm
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PV128974-(EGP) Programme de subvention d'engagement partenarial
2015 - 2017

TRANSCRIPTIONAL AND EPIGENETIC CONSEQUENCES OF MLL-AF9 TRANSLOCATIONS

Chercheur principal : Brian Wilhelm
Sources de financement : Terry Fox Research Institute , FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ) , COLE Foundation/Fondation Cole
Programmes de subvention : , PVXXXXXX-Établissement de jeunes chercheurs Juniors 1 , PVXXXXXX-Subvention d'équipe: programme nouvelles frontières Terry Fox en cancérologie
2013 - 2017

INNOVATIVE CHEMOGENOMIC TOOLS TO IMPROVE OUTCOME IN ACUTE MYELOID LEUKEMIA

Chercheur principal : Guy Sauvageau , Josée Hébert
Sources de financement : Génome Canada , Génome Québec
Programmes de subvention : ,
2013 - 2017

INNOVATIVE CHEMOGENOMIC TOOLS TO IMPROVE OUTCOME IN ACUTE MYELOID LEUKEMIA

Chercheur principal : Guy Sauvageau
Sources de financement : Génome Canada
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Projets de recherche en génomique à grande échelle et Plates-formes scientifiques tech.
2013 - 2017

INNOVATIVE CHEMOGENOMIC TOOLS TO IMPROVE OUTCOME IN ACUTE MYELOID LEUKEMIA

Chercheur principal : Guy Sauvageau
Sources de financement : Génome Canada
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Projets de recherche en génomique à grande échelle et Plates-formes scientifiques tech.
2013 - 2017

INNOVATIVE CHEMOGENOMIC TOOLS TO IMPROVE OUTCOME IN ACUTE MYELOID LEUKEMIA

Chercheur principal : Guy Sauvageau
Sources de financement : Génome Canada
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Projets de recherche en génomique à grande échelle et Plates-formes scientifiques tech.
2013 - 2017

INNOVATIVE CHEMOGENOMIC TOOLS TO IMPROVE OUTCOME IN IN ACUTE MYELOID LEUKEMIA

Chercheur principal : Guy Sauvageau
Sources de financement : Génome Québec
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Projets de recherche en génomique à grande échelle et Plates-formes scientifiques tech.
2013 - 2016

FUNCTIONAL ANALYSIS OF TRANSCRIPTIONAL NETWORKS IN MLL-AF9 PEDIATRIC LEUKEMIA

Chercheur principal : Brian Wilhelm
Sources de financement : SRC/Société de recherche sur le cancer
Programmes de subvention : PVX12154-Subvention de recherche
2012 - 2016

IDENTIFICATION DE NOUVEAUX MECANISMES MOLECULAIRES IMPLIQUES DANS LES LEUCEMIES MYELOIDE AIGUE EN PEDIATRIE

Chercheur principal : Brian Wilhelm
Sources de financement : FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Junior 1
2013 - 2015

ROLE AND BIOLOGY OF MLL FUSION GENES IN HUMAN LEUKEMIAS.

Chercheur principal : Frédéric Barabé
Co-chercheurs : Brian Wilhelm
Sources de financement : LLS Canada/Leukemia and Lymphoma Society of Canada (The)
Programmes de subvention :
2012 - 2015

IDENTIFICATION DE NOUVEAUX MECANISMES MOLECULAIRES IMPLIQUES DANS LES LEUCEMIES MYELOIDE AIGUE EN PEDIATRIE

Chercheur principal : Brian Wilhelm
Sources de financement : FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Établissement de jeunes chercheurs Juniors 1
2011 - 2015

RESEAU POUR LES ETUDES THERAPEUTIQUES ET GENETIQUES DES CELLULES SOUCHES-STEMNET / NOVEL STRATEGIES TO EXPAND HUMAN HEMATOPOIETIC STEM CELL POPULATIONS FOR CLINICAL USE

Chercheur principal : Guy Sauvageau
Sources de financement : Secrétariat Inter-Conseil et Réseaux des centres d'excellence (RCE)
Programmes de subvention : PV143493-(RCE) Réseaux de centres d'excellence
2012 - 2014

IMPROVED ASSIGMENT TO BEST AVAILABLE THERAPY FOR PATIENTS WITH MYELODYSPLASIA AND ACUTE MYELOID LEUKEMIA

Chercheur principal : Guy Sauvageau
Co-chercheurs : Brian Wilhelm , Josée Hébert , Stephane Couban
Sources de financement : Terry Fox Research Institute
Programmes de subvention :
2012 - 2014

IMPROVED ASSIGNMENT TO BEST AVAILABLE THERAPY FOR PATIENTS WITH MYELODYSPLASIA AND ACUTE MYELOID LEUKEMIA

Chercheur principal : Brian Wilhelm
Sources de financement : Terry Fox Research Institute
Programmes de subvention :
2011 - 2013

ESTABLISHMENT OF DR. B WILHELM LAB TO DISCOVER NOVEL AND RECURRENT MUTATIONS IN ACUTE MYELOID LEUKEMIA

Chercheur principal : Brian Wilhelm
Sources de financement : FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention :
2010 - 2013

LE PROJET LEUCEGENE : SEQUENCAGE DU TRANSCRIPTOME POUR L'IDENTIFICATION DE NOUVEAUX MARQUEURS PRONOSTIQUES ET CIBLES THERAPEUTIQUES DANS LA LEUCEMIE MYELOIDE AIGUE

Chercheur principal : Guy Sauvageau
Sources de financement : Génome Québec
Programmes de subvention :
2011

MONBUG SYMPOSIUM/COLLOQUE DU RÉSEAU DE BIOINFORMATIQUE DE MONTRÉAL

Chercheur principal : Brian Wilhelm

Rayonnement

Publications et communications

Publications

  • Wilhelm BT, Briau M, Austin P, Faubert A, Boucher G, Chagnon P, Hope K, Girard S, Mayotte N, Landry JR, Hébert J, Sauvageau G. RNA-seq analysis of 2 closely related leukemia clones that differ in their self-renewal capacity. Blood. 2011 Jan 13;117(2):e27-38. Epub 2010 Oct 27. PubMed PMID: 20980679.
  • Wilhelm BT, Marguerat S, Aligianni S, Codlin S, Watt S, Bähler J. Differential patterns of intronic and exonic DNA regions with respect to RNA polymerase II occupancy, nucleosome density and H3K36me3 marking in fission yeast. Genome Biol. 2011 Aug 22;12(8):R82. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 21859475.
  • Wilhelm BT, Marguerat S, Watt S, Schubert F, Wood V, Goodhead I, Penkett CJ, Rogers J, Bähler J. Dynamic repertoire of a eukaryotic transcriptome surveyed at single-nucleotide resolution. Nature. 2008 Jun 26;453(7199):1239-43. Epub 2008 May 18. PubMed PMID: 18488015.
  • Wilhelm BT, Mager DL. Rapid expansion of the Ly49 gene cluster in rat. Genomics. 2004 Jul;84(1):218-21. PubMed PMID: 15203220.
  • Wilhelm BT, Landry JR, Takei F, Mager DL. Transcriptional control of murine CD94 gene: differential usage of dual promoters by lymphoid cell types. J Immunol. 2003 Oct 15;171(8):4219-26. PubMed PMID: 14530345.

Disciplines

  • Génomique
  • Oncologie
  • Bio-informatique
  • Biologie moléculaire

Champ d’expertise

  • Micropuces d'ADN et d'ARN
  • Génomique
  • Génome
  • Biotechnologie
  • Innovations technologiques
  • Technologies biomédicales
  • Technologies des soins
  • Génétique du cancer