Sciences de la santé; Sciences naturelles et génie
Éric Lécuyer
Biologie des ARN
- Professeur/chercheur titulaire
-
Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire
Secondary numbers:
514 987-5646
(Travail 1)
514 987-5706
(Travail 2)
Secondary email:
eric.lecuyer@ircm.qc.ca
(Travail)
Profile
Research expertise
Notre laboratoire cherche à comprendre les fonctions biologiques de la localisation intracellulaire des ARN, ces molécules qui permettent entre autre la transmission de l’information génétique nécessaire à la production de protéines cellulaires. Pour ces études, nous utilisons une combinaison de modèles cellulaires humains et d’insectes, ainsi qu’un organisme modèle expérimentalement puissant, la mouche à fruit Drosophila melanogaster. En combinant la versatilité de la génétique Drosophilienne à des approches d’imagerie à haute-résolution et de génomique fonctionnelle, nous visons à disséquer les mécanismes moléculaires contrôlant le ciblage des ARN et leur impact sur l’organisation cellulaire. Les études effectuées avec des organismes modèles simples, tel que la mouche à fruit, ont grandement contribuées à notre compréhension d’une multitude de processus cellulaires essentiels.
Nos projets visent à élucider la fonctions normales du trafiquage subcellulaire des ARN dans le maintien de la polarité cellulaire, de la stabilité génomique et dans la régulation de la division cellulaire. De plus, nous cherchons à comprendre comment la perturbation des voies normales de localisation des ARN peut contribuer à l’étiologie de différentes pathologies humaines, dont les maladies musculo-/neuro-dégénératives et le cancer.
Enfin, notre laboratoire collabore aussi au sein du consortium ENCODE (ENcyclopedia Of DNA Elements), un regroupement international d’experts en génomique et bioinformatique visant à identifier les éléments de régulation (ADN et ARN) qui contrôlent l’expression du génome Humain. Spécifiquement, nous participons au sein d’une équipe, dirigée par le Dr. Brenton Graveley (UConn), qui cherche à définir les fonctions de 250 protéines humaines liant les ARN (RNA Binding Proteins, RBPs). Dans ce contexte, notre équipe effectue i) des expériences de d’imagerie à haut-débit pour caractériser les patrons de distribution intracellulaire des RBPs dans plusieurs lignées cellulaires humaines, et ii) des études de fractionnement cellulaire biochimique combiné au séquençage haut-débit des ARN (RNA-Seq) pour évaluer les fonctions des RBPs dans la localisation des ARN. Ces projets impliquent une combinaison d’approches biochimiques, en génétique et biologie moléculaire, et de bioinformatique.
Affiliations and responsabilities
Research affiliations
Research units
Membre
Affiliated institutions
- Institut de recherches cliniques de Montréal (IRCM)
Teaching and supervision
Student supervision
Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)
2024
Comparative analysis of RNA-associated proteins in the cellular and extracellular environments of HMLE cells
Diplômé(e) : Chen, Yiran
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2023
Defining the functions and mechanisms of mRNA targeting to the mitotic apparatus
Diplômé(e) : Patel, Dhara
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2020
Investigating the localization mechanism of Bsg25D mRNA in Drosophila melanogaster
Diplômé(e) : Velupillai, Sinduja
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2020
Caractérisation systématique des motifs de régulation en cis à l’échelle transcriptomique et liens avec la localisation des ARN
Diplômé(e) : Benoit Bouvrette, Louis Philip
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2018
Approches de fractionnement biochimique couplé à la transcriptomique dans l’étude systématique de la localisation subcellulaire et extracellulaire des ARNs
Diplômé(e) : Lefebvre, Fabio Alexis
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2017
Approches globales afin d’élucider les mécanismes pathogéniques de la dystrophie myotonique de type 1
Diplômé(e) : Nguyen, Xuan-Tam
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2016
Définition du mécanisme de localisation des ARNm cen et ik2 aux centrosomes chez la Drosophile
Diplômé(e) : Legendre, Félix
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2016
Identification de protéines impliquées dans la localisation des ARNm au niveau de l'appareil mitotique
Diplômé(e) : Oré Rodriguez, Sulin
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Projects
Research projects
2025
- 2029
Régulation de l'expression des gènes chez les Dinoflagellés
Lead researcher :
David Morse
Funding sources:
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs:
PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2022
- 2028
Defining the functions and mechanisms of centrosomal RNA localization
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2022
- 2028
Defining the repertoires and functional impacts of RNA binding proteins that undergo sequestration by toxic repeat RNA
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Co-researchers :
Pascal Chartrand
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2024
- 2027
Détermination des répertoires et du potentiel thérapeutique de protéines de liaison à l'ARN qui subissent une séquestration par des ARN à répétitions toxiques causant des ataxies spinocérébelleuses
Funding sources:
Génome Québec
Grant programs:
2023
- 2027
Caractérisation des voies de transport intracellulaire des ARN: implications dans divers processus cellulaires normaux et pathologiques et pour l’innovation de nouvelles approches thérapeutiques.
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs:
PVXXXXXX-Chercheurs-boursiers de mérite
2022
- 2027
Defining the repertoires and functional impacts of RNA binding proteins that undergo sequestration by toxic repeat RNA
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2023
- 2026
Subvention d'aide à la recherche pour la chaire double en intelligence artificielle/ sciences de données et sciences de la vie
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs:
2021
- 2026
Médicament Québec - Partenariat en Découverte et Production de Médicament du Québec
Co-researchers :
André Charette
,
Yves Joanette
,
Éric Lécuyer
,
Anne Marinier
,
Grégoire Leclair
,
Jean-François Gélinas
,
Philippe Sarret
,
Corinne Hoesli
,
Hanadi Sleiman
,
Jean-François Gélinas
Funding sources:
Ministère Économie et Innovation
Grant programs:
2023
- 2024
"La plateforme de Zipcodes ARN: Une nouvelle génération d’outils de livraison intra-cellulaire d’ARN guidée par l’intelligence artificielle"
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
Ministère Économie et Innovation
Grant programs:
2023
- 2024
Concours - Fonds de recherche biomédicale du Canada et au fonds d’infrastructures de recherche en sciences biologiques
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
2017
- 2024
DNA Damage Signaling and Transcriptome Regulation in Drosophila Embryogenesis
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2019
- 2023
Caractérisation des voies de trafiquage intracellulaire des ARN: implications dans divers processus cellulaires normaux et pathologiques.
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs:
PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Senior
2018
- 2022
Approches d'intelligence artificielle pour l'analyse de la localisation subcellulaire des ARN dans les cellules humaines
Lead researcher :
Mathieu Blanchette
Co-researchers :
Éric Lécuyer
Funding sources:
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs:
PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2020
- 2021
Supplément COVID-19 CRSNG_DNA Damage Signaling and Transcriptome Regulation in Drosophila Embryogenesis
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVXXXXXX-Supplément à l’appui des étudiants, des stagiaires postdoctoraux et du personnel de soutien à la recherche COVID-19
2018
- 2021
Characterization of childhood acute lymphoblastic leukemia-specific long non-...
Lead researcher :
Daniel Sinnett
Funding sources:
IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs:
PVX12154-Subvention de fonctionnement
2014
- 2021
DEFINING THE MECHANISMS AND FUNCTIONS OF RNA LARGETING TO THE MITOTIC APPARATUS
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2019
- 2020
Characterization of childhood acute lymphoblastic leukemia-specific long non-coding RNAs (the "Project")
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Co-researchers :
Daniel Sinnett
Funding sources:
IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs:
2018
- 2020
Developing a machine learning framework to dissect gene expression control in subcellular space
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs:
PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Projet de recherche
2018
- 2020
Defining the RBP repertoires of ALS-associated membrane-less granules
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
SLA Canada/Société canadienne de la sclérose latérale amyotrophique
Grant programs:
2019
Stress granule components as potential modulators of protein aggregation in ALS
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
Larry L. Hillblom Foundation
Grant programs:
2018
- 2019
A Comprehensive Functional Map of Human Pretein-RNA Interactions
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
NIH/National Institutes of Health (NIH)
Grant programs:
2015
- 2019
CARACTÉRISATION DES VOIES DE TRAFIQUAGE INTRACELLULAIRE DES ARN: IMPLICATIONS DANS DIVERS PROCESSUS CELLULAIRES NORMAUX ET PATHOLOGIQUES
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs:
PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Junior 2
2015
- 2019
Approches bioinformatiques et expérimentales pour l'analyse du rôle de la structure des ARN messagers de la drosophile dans leur localisation durant le dévelopement
Lead researcher :
Mathieu Blanchette
Co-researchers :
Éric Lécuyer
Funding sources:
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs:
PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2017
- 2018
Defining conserved functions of RNA binding proteins in stress-granule biogenesis
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
Fondation Brain Canada
Grant programs:
2016
- 2018
The RNA zipcode discovery pipeline: emerging tools for targeting therapeutic molecules at subcellular resolution
Lead researcher :
Mathieu Blanchette
Co-researchers :
Éric Lécuyer
Funding sources:
Génome Canada
Grant programs:
2013
- 2018
THE ROLES OF MBNL PROTEINS IN THE PATHOGENESIS OF MYOTONIC DYSTROPHY
Lead researcher :
Pascal Chartrand
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
,
Association canadienne de la dystrophie musculaire (L')
Grant programs:
PVXXXXXX-Subvention de fonctionnement - annonce de priorités
,
2015
- 2017
Defining the mechanisms of RNA targeting to cancer cell-derived extracellular vesicles during epithelial to mesenchymal transitions
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
SRC/Société de recherche sur le cancer
Grant programs:
PVX12154-Subvention de fonctionnement
2013
- 2016
RÉSEAU FRANCO-QUÉBÉCOIS DE RECHERCHE SUR L'ARN
Lead researcher :
Jérôme Waldispuhl
Funding sources:
Centre/Coop.Interuni.Franco-Québéc/Fra
Grant programs:
2010
- 2016
DEVELOPMENTAL REGULATION OF TRANSPOSABLE ELEMENTS
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2014
- 2015
Maud Menten New Principal Investigator Prize 2014
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
2013
- 2015
EPITHELIAL CELL POLARITY REGULATION BY LOCALIZED MRNAS
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs:
2011
- 2015
DEFINIR LE ROLE DE LA LOCALISATION DES ARN MESSAGERS DANS LE CONTRÔLE DE LA STABILITE ET LA SEGREGATION DU GENOME
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs:
PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier clinicien: junior I et II et senior (offre seulement)
2010
- 2015
MRNA LOCALIZATION IN THE REGULATION OF GENOME STABILITY AND CELL DIVISION
Lead researcher :
Éric Lécuyer
2011
- 2014
DEFINIR LE ROLE DE LA LOCALISATION DES ARN MESSAGERS DANS LE CONTRÔLE DE LA STABILITE ET LA SEGREGATION DU GENOME
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs:
PVXXXXXX-Établissement de jeunes chercheurs Juniors 1
2011
- 2014
DÉFINIR LE RÔLE DE LA LOCALISATION DES ARN MESSAGERS DANS LE CONTRÔLE DE LA STABILITÉ ET LA SÉGRÉGATION DU GÉNOME
Lead researcher :
Éric Lécuyer
2010
- 2014
MRNA LOCALIZATION IN THE REGULATION OF GENOME STABILITY AND CELL DIVISION
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2010
- 2014
DEVELOPMENTAL REGULATION OF TRANSPOSABLE ELEMENTS
Lead researcher :
Éric Lécuyer
Outreach
Publications and presentations
Publications
- Iampietro, C., Bergalet, J., Wang, X., Cody, N.A., Chin, A., Lefebvre, F.A., Douziech, M., Krause, H.M., and Lécuyer, E. 2014. Developmentally-regulated elimination of damaged nuclei via a Chk2-dependent mechanism of mRNA nuclear retention. <http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24835465> Developmental Cell 29: 468-81.
- Cody, N.A., Iampietro, C., and Lécuyer, E. 2013. The many functions of mRNA localization during normal development and disease: from pillar to post.<http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24123937> WIREs Dev Biol 2:781-96.
- Zhang, Y,, Ponty, Y., Blanchette, M., Lécuyer, E., and Waldispühl, J. 2013. SPARCS: a web server to analyze (un)structured regions in coding RNA sequences.<http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23748952> Nucleic Acids Res 41(Web Server issue):W480-5.
- Wang, E.T., Cody, N.A., Jog, S., Biancollela, M., Wang, T.T., Treacy, D.J., Luo, S., Schroth, G.P., Housman, D.E., Reddy, S., Lécuyer, E., and Burge, C.B. 2012. Transcriptome-wide regulation of pre-mRNA splicing and mRNA localization by muscleblind proteins.<http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22901804> Cell 150:710-24.
- Lécuyer, E., Yoshida, H., Parthasarathy, N., Alm, C., Babak, T., Cerovina, T., Hughes, T.R., Tomancak, P., and Krause, H. M. 2007. Global analysis of mRNA localization reveals a prominent role in organizing cellular architecture and function<http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17923096>. Cell 131, 174-87.
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