Sciences de la santé; Sciences naturelles et génie
James G. Omichinski
- Professeur titulaire
-
Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire
Roger-Gaudry, room D301
Profile
Research expertise
Études RMN et crystallographie pour la détermination de structures tridimensionnelles de complexes ADN-protéines et protéines-protéines. Notre laboratoire est principalement intéressé aux systèmes impliqués dans la régulation de la transcription, autophagie,les infections virales (VIH), le cancer et le développement de nouveaux agents thérapeutiques.
Affiliations and responsabilities
Teaching and supervision
Teaching
Courses taught (current session only)
- BCM-2501 – Macromolécules biologiques
- BCM4002A – Stage honor en biochimie 2
- BCM4004A – Stage honor en génétique et génomique 2
- BCM-6016 – Méthodes de pointe en purification de protéines
Programs
- 123510 – Baccalauréat en sciences biologiques
- 146511 – Baccalauréat en biochimie et médecine moléculaire
- 146811 – Baccalauréat en bio-informatique
- 146811 – Baccalauréat en bio-informatique
- 148410 – Baccalauréat en sciences biomédicales
- 150010 – Baccalauréat en microbiologie et immunologie
- 246510 – Maîtrise en biochimie
- 246513 – Maîtrise en biotechnologie appliquée au milieu industriel
Student supervision
Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)
2024
Effects of evolutionary changes and mutations on tetramer formation and function in tumor suppressor protein p53
Diplômé(e) : Sakaguchi, Shuya
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2023
Investigating the role of acetylation of LC3-family proteins in regulating autophagy
Diplômé(e) : Ali, Mohamed
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2021
Posttranslational modification and evolution of tetramerization domain in tumor suppressor protein p53
Diplômé(e) : Nakagawa, Natsumi
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2020
Études structurales et fonctionnelles sur les mécanismes de régulation des interactions entre protéines SUMOs et les domaines SIMs.
Diplômé(e) : Lussier-Price, Mathieu
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2019
Régulation de l’activité de Dicer par TRBP dans la biogénèse des micro-ARN
Diplômé(e) : Bouvette, Jonathan
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2018
Caractérisation structurale et biophysique de l’impact de l’acétylation de SUMO1 sur son interaction dépendante de la phosphorylation avec PML
Diplômé(e) : Gagnon, Christina
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2018
Détection à grande échelle des réarrangements génomiques et élucidation de leurs mécanismes
Diplômé(e) : Tremblay-Belzile, Samuel
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2017
Structural and biochemical characterization of the irganomercurial Lyase MerB
Diplômé(e) : Abdelgawwad, Haytham Mohamed Gamaleldin Wahba
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2017
Études structurales d’interactions protéine/protéine impliquées dans la leucopoïèse
Diplômé(e) : Idrissa Moussa, Mohamed
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2014
Étude sur la reconnaissance de l'ubiquitine par les domaines de transactivation acides des activateurs de transcription
Diplômé(e) : Lussier-Price, Mathieu
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2010
Études structurales d’interactions protéine/protéine impliquées dans l’érythropoïèse
Diplômé(e) : Mas, Caroline
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Projects
Research projects
2023
- 2029
Structural and functional characterization of proteinmetal interactions
Lead researcher :
James G. Omichinski
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2022
- 2025
An integrated AI based platform for the identification of broad-spetrum host therapeutic targets fo hemorrahgic fever virus infections
Lead researcher :
Kylene Kehn-Hall
Co-researchers :
James G. Omichinski
Funding sources:
Defense Threat Reduction Agency
Grant programs:
2022
- 2025
Studies of transient complexes that regulate PML nuclear bodies
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2017
- 2024
Structural and functional characterization of proteinmetal interactions
Lead researcher :
James G. Omichinski
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2015
- 2023
Structural and functional studies of macromolecular interactions regulating hematopoietic development
Lead researcher :
James G. Omichinski
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2020
- 2021
Supplément COVID-19 CRSNG_Structural and functional characterization of proteinmetal interactions
Lead researcher :
James G. Omichinski
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVXXXXXX-Supplément à l’appui des étudiants, des stagiaires postdoctoraux et du personnel de soutien à la recherche COVID-19
2018
- 2021
Macromolecular interaction analysis using a surface plasmon resonance biosensor
Lead researcher :
John Pascal
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (de 7 001 $ à 150 000 $)
2013
- 2021
STRUCTURAL AND FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF DYNAMIC COMPLEXES INVOLVED IN TRANSCRIPTION DNA REPAIR AND VIRAL INFECTION AND THEIR ASSOCIATION TO CANCER FORMATION
Lead researcher :
James G. Omichinski
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2018
- 2019
Groupe d"etude des proteines membranaires (GEPROM)
Lead researcher :
Derek Bowie
Co-researchers :
James G. Omichinski
Funding sources:
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs:
PVXXXXXX-Subvention de groupe de recherche
2017
- 2019
A versatile broad range microscale thermophoresis apparatus for the measurement of biomolecular interactions
Lead researcher :
Rafaël Najmanovich
Co-researchers :
Rémy Sauvé
,
Christian Baron
,
Rikard Blunck
,
James G. Omichinski
,
Adrian Serohijos
,
John Pascal
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (de 7 001 $ à 150 000 $)
2012
- 2018
STRUCTURAL AND FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF PROTEIN-METAL INTERACTIONS
Lead researcher :
James G. Omichinski
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2015
- 2017
ROBOT FOR LIPIDIC CUBIC PHASE (LCP) CRYSTALLIZATION OF MEMBRANE PROTEINS
Lead researcher :
Christian Baron
Co-researchers :
Jurgen Sygusch
,
Michel Bouvier
,
Lucie Parent
,
Rikard Blunck
,
James G. Omichinski
,
Kalle Burges Gehring
,
Peter Pawelek
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (de 7 001 $ à 150 000 $)
2015
- 2017
Groupe de recherche axé sur la recherche des protéines (GRASP)
Lead researcher :
Kalle Burges Gehring
Co-researchers :
James G. Omichinski
Funding sources:
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs:
PVXXXXXX-Subvention de groupe de recherche
2010
- 2016
Training program in cellular dynamics of macromolecular complexes
Lead researcher :
Christian Baron
Co-researchers :
Jurgen Sygusch
,
Stephen Michnick
,
Antonio Nanci
,
Benoit Coulombe
,
Pascal Chartrand
,
Nicolas Lartillot
,
Marlene Oeffinger
,
James G. Omichinski
,
Daniel Zenklusen
,
Jackalyn Marie Vogel
,
James W Coulton
,
Sachdev Sidhu
,
Franck Duong
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PV118026-FONCER : Prog. formation orientée nouveauté, la collaboration et l'expérience en recherche
2005
- 2016
STRUCTURAL AND FUNCTIONAL STUDIES OF PROTEIN/PROTEIN AND PROTEIN/DNA INTERACTIONS REGULATING HEMATOPOIETIC DEVELOPMENT
Lead researcher :
James G. Omichinski
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2011
- 2015
STRUCTURE AND MECHANISTIC STUDIES OF THE BACTERIAL ORGANOMERCURIAL LYASE MERB
Lead researcher :
James G. Omichinski
2002
- 2015
GROUPE DETUDE DES PROTEINES MEMBRANAIRES (GEPROM)
Lead researcher :
Rikard Blunck
Co-researchers :
Jean-Yves Lapointe
,
Réjean Couture
,
Daniel Bichet
,
Rémy Sauvé
,
Normand Mousseau
,
Lucie Parent
,
Jean-Louis Schwartz
,
Madhu Anand-Srivastava
,
Audrey Claing
,
Michael Mourez
,
Christian Baron
,
James G. Omichinski
,
Guillaume Lamoureux
,
Paul William Wiseman
,
James W Coulton
,
John Orlowski
,
John R Silvius
,
Alvin Shrier
,
John W Hanrahan
,
Isabelle Rouiller
,
Brett Christopher
Funding sources:
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs:
PVXXXXXX-Subvention de groupe de recherche
2012
- 2014
LOW-VOLUME ITC FOR INVESTIGATING BIOMOLECULAR INTERACTIONS
Lead researcher :
James G. Omichinski
Co-researchers :
Jurgen Sygusch
,
Stephen Michnick
,
Normand Brisson
,
Pascale Legault
,
Christian Baron
,
Rikard Blunck
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (OIR) -1 -(de 7 001 $ à 150 000 $)
2011
- 2014
GROUPE D'ETUDE DES PROTEINES MEMBRANAIRES (GEPROM)
Lead researcher :
Lucie Parent
Co-researchers :
Jean-Yves Lapointe
,
Réjean Couture
,
Daniel Bichet
,
Rémy Sauvé
,
Normand Mousseau
,
Jean-Louis Schwartz
,
Madhu Anand-Srivastava
,
Audrey Claing
,
Michael Mourez
,
Christian Baron
,
Rikard Blunck
,
James G. Omichinski
,
Guillaume Lamoureux
,
Paul William Wiseman
,
James W Coulton
,
John Orlowski
,
John R Silvius
,
Alvin Shrier
,
John W Hanrahan
,
Isabelle Rouiller
,
Brett Christopher
Funding sources:
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs:
PVXXXXXX-Subvention de groupe de recherche
2009
- 2014
STRUCTURAL AND FUNCTIONAL STUDIES OF PROTEIN/PROTEIN AND PROTEIN/DNA INTERACTIONS REGULATING HEMATOPOIETIC DEVELOPMENT
Lead researcher :
James G. Omichinski
2008
- 2014
ROLE OF THE INTERACTIONS OF TFIIH WITH ACTIVATOR PROTEINS IN REGULATING TRANSCRIPTION
Lead researcher :
James G. Omichinski
Funding sources:
IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs:
2005
- 2014
STRUCTURE AND MECHANISTIC STUDIES OF THE BACTERIAL ORGANOMERCURIAL LYASE MERB
Lead researcher :
James G. Omichinski
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2009
INVESTIGATIONS OF BIOMOLECULES BY FLUORESCENCE SPECTROSCOPY
Lead researcher :
James G. Omichinski
Outreach
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- Biochimie
- Virologie
- Biologie moléculaire
- Chimie
- Toxicologie
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