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Natural Sciences and Engineering; Health Sciences; Medical Sciences

François Major

Bio-informatique et ARN

Professeur titulaire

Faculté des arts et des sciences - Département d'informatique et de recherche opérationnelle

Pavillon Marcelle-Coutu, room 3306-11

514 343-6752

francois.major@umontreal.ca

Professeur accrédité

Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire

Secondary number: 514 343-5834 (Télécopieur)

Media

François Major est chercheur principal à l'IRIC

 - © IRIC

ARN, sport et rock'n roll

Chercheur, sportif et D.J., François Major met ses talents de programmeur informatique au service de la lutte contre le cancer. Avec son équipe, il travaille sur les acides ribonucléiques, mieux connu sous le nom de ARN. Il existe plusieurs familles d'ARN, mais ce sont les ARN messagers qui permettent à nos gènes de fabriquer les protéines nécessaires à la survie des cellules.

Profile

Research expertise

Approche bioinformatique pour la détermination et la prédiction de structure et fonction des ARN et des protéines (financement IRSC). Développement de méthodes pour la recherche et l'analyse de motifs structuraux dans les ARN (financement CRSNG). Approche bioinformatique pour la recherche et l'analyse des micro-ARN et des ARN d'interférence (financement stratégique CRSNG).

Biography

François Major compte parmi les précurseurs de la bio-informatique. Alors qu’il entame ses études supérieures en informatique à l’Université de Montréal en 1984, il s’affaire à utiliser l’informatique pour répondre aux questions de la biologie. Son travail l’amène à développer un logiciel de modélisation tridimensionnelle des ARN sous la supervision de Robert Cedergren et de Guy Lapalme.

Après l’obtention de son diplôme de doctorat en 1990, le chercheur effectue un stage postdoctoral au NCBI sous la direction de David Lipman. L’Université de Montréal l’embauche en 1994 à titre de chercheur. En 2005, Francois Major est recruté par l’IRIC à titre de chercheur principal.

Awards and recognitions

  • Prix Urgel-Archambault 2010 - Association francophone pour le savoir (Acfas)

Teaching and supervision

Student supervision

Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)

2021

Modélisation des réseaux de régulation de l’expression des gènes par les microARN

Graduate : Poirier-Morency, Guillaume
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2019

Nucleotide Complementarity Features in the Design of Effective Artificial miRNAs

Graduate : Yan, Yifei
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2017

Étude de la signature dynamique de transcrits primaires impliquée dans la maturation des microARN

Graduate : Robitaille, Julie
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2017

Unfolding RNA 3D structures for secondary structure prediction benchmarking

Graduate : C-Parent, Gabriel
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2010

A new paradigm for the folding of ribonucleic acids

Graduate : Parisien, Marc
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2009

Conception de microARNs pour attenuer l'expression de genes

Graduate : Caron, Maxime
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2008

Analyse de motifs d'ARN

Graduate : Lavoie, Louis-Philippe
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2007

Approche plurielle à l'étude de la structure tertiaire de l'ARN chez les virus

Graduate : Permal, Emmanuelle
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2007

MC-Map, un nouvel outil d'intégration de motifs

Graduate : St-Onge, Nicolas
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2007

Un dictionnaire pour faciliter la recherche des gènes dans la littérature et sur Internet

Graduate : Halawani, Amine
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2005

Les feuillets beta dans les protéines : annotation, comparaison et construction

Graduate : Parisien, Marc
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2005

Prédiction des pré-miARN basée sur la conservation de structure dans les pri-miARN

Graduate : Tibiche, Chabane
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2005

Analyse des données d'expression de gènes

Graduate : Paquet, Éric
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2005

Prédiction de la structure commune aux ARN messagers codant pour la protéine STG

Graduate : Terbaoui, Ratiba
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2003

Recherche de motifs structuraux dans les complexes acides ribonucléiques/protéines

Graduate : Drapeau, Mathieu
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2002

Sélection d'oligonucléotides pour la fabrication de biopuces d'ADN

Graduate : Dallaire, Paul
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2002

Modélisation automatisée de la structure 3-D des ARNs

Graduate : Lemieux, Sébastien
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2002

Un algorithme génétique pour l'arrimage moléculaire

Graduate : Levac, François
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2001

Étude de la structure des ARNm et des protéines impliqués dans les maladies neurodégénératives à prion

Graduate : Barrette, Isabelle H.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2000

Détection et analyse de motifs structuraux et fonctionnels dans les acides ribonucléiques

Graduate : Gendron, Patrick
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
1999

Étude des environnements de microsimulation économique avec agents partiellement rationnels

Graduate : Trussart, Vincent
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
1999

Modélisation des boucles dans les protéines

Graduate : Lefebvre, Sébastien
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
1999

Modélisation de la structure 3-D des ARN par satisfaction de contraintes

Graduate : Lemieux, Sébastien
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
1998

Phylogénétique basée sur les cassures du génome

Graduate : Blanchette, Mathieu
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
1998

Propriétés relationnelles tridimensionnelles des structures d'acides nucléiques

Graduate : Ftouhi, Abdelmjid
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.

Projects

Research projects

2020 - 2026

Computational analysis and modeling of ribonucleic acid structure, function, and dynamics

Lead researcher : François Major
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2023 - 2025

CECR_IRICoR_Integration of Multiple Algorithms into a Service Platform for Accurate and Precise Design and Structure Prediction of Coding and Non-Coding RNA Sequences

Co-researchers : François Major
Funding sources: Secrétariat Inter-Conseil et Réseaux des centres d'excellence (RCE)
Grant programs:
2014 - 2022

COMPUTATIONAL ANALYSIS AND MODELING OF NONCODING RIBONUCLEIC ACID STRUCTURE AND FUNCTION

Lead researcher : François Major
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2020 - 2021

Supplément COVID-19 CRSNG_Computational analysis and modeling of ribonucleic acid structure, function, and dynamics

Lead researcher : François Major
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-Supplément à l’appui des étudiants, des stagiaires postdoctoraux et du personnel de soutien à la recherche COVID-19
2020 - 2021

Identifier le talon d’Achille du SARS-CoV-2

Lead researcher : François Major
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Projet de recherche
2016 - 2021

Computation of cell-specific microRNA: Mrna rgulatory networks enables the design of efficient RNAi-based therapeutics

Lead researcher : François Major
Co-researchers : Thomas Duchaine
Funding sources: Génome Canada , IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-Projets de recherche en génomique à grande échelle et Plates-formes scientifiques tech. , PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2015 - 2020

UNE APPROCHE CHIMIO- ET PROTEO-GENOMIQUE EN MEDECINE PERSONNALISEE POUR LA LEUCEMIE MYELOIDE AIGUE

Lead researcher : Guy Sauvageau
Funding sources: FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'innovation
2018

Programme de bourse d'été et d'initiation à la recherche au premier cycle IVADO. Candidat: Jorge Luis Flores / Discoverning the RNA structural determinants of the RNA-binding proteins

Lead researcher : François Major
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2015 - 2018

Deciphering and targeting the gene interaction networks that shape cancer cells

Lead researcher : François Major
Co-researchers : Étienne Gagnon
Funding sources: SRC/Société de recherche sur le cancer
Grant programs: PVX12154-Subvention de fonctionnement
2013 - 2016

RÉSEAU FRANCO-QUÉBÉCOIS DE RECHERCHE SUR L'ARN

Lead researcher : Jérôme Waldispuhl
Co-researchers : François Major , Éric Lécuyer
Funding sources: Centre/Coop.Interuni.Franco-Québéc/Fra
Grant programs:
2010 - 2016

COMPUTATIONAL PREDICTION OF RNA 3D STRUCTURE USING LOW RESOLUTION DATA AND A NEW RNA FOLDING ALGORITHM

Lead researcher : François Major
Funding sources: NIH/National Institutes of Health (NIH)
Grant programs:
2011 - 2015

METHODES INFORMATIQUE POUR PREDIRE LES MUTATIONS MODIFIANT LA STRUCTURE TERTIAIRE DES ARNS

Lead researcher : Jérôme Waldispuhl
Co-researchers : François Major
Funding sources: FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs: PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2009 - 2015

COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL STUDIES OF GENE SILENCING MECHANISMS

Lead researcher : François Major
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
1997 - 2015

COMPUTERIZED ANALYSIS AND PREDICTION OF RNA STRUCTURE AND FUNCTION

Lead researcher : François Major
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2011 - 2014

METHODES INFORMATIQUES POUR PREDIRE LES MUTATIONS MODIFIANT LA STRUCTURE TERTIAIRE DES ARNS

Lead researcher : Jérôme Waldispuhl
Co-researchers : François Major
Funding sources: FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs: PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2009 - 2013

COMPUTERIZED ANALYSIS AND PREDICTION OF RNA STRUCTURE AND FUNCTION

Lead researcher : François Major
2009 - 2013

RNA FOLDING AS A MEDIATOR OF STRESS RESPONSE IN PLANTS

Lead researcher : François Major
Funding sources: International Human Frontier Science Program Organisation
Grant programs:
2008 - 2013

COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL STUDIES OF GENE SILENCING MECHANISMS

Lead researcher : François Major
2009 - 2012

DEVELOPING AND TESTING SMALL RNA-BASED MULTIPLE-TARGET GENE THERAPIES AGAINST CANCER AND AIDS

Lead researcher : François Major
2011

TECHNOLOGICAL ADVANCES IN RNA THERAPY SYMPOSIUM

Lead researcher : François Major

Outreach

Publications and presentations

Disciplines

  • Bioinformatics
  • Biochemistry
  • Computer Science
  • Genomics

Areas of expertise

  • Bioinformatics
  • Genomics
  • Data structures
  • Model Building
  • DNA and RNA Chips
  • COVID-19
  • COVID19