Sciences naturelles et génie; Sciences de la santé; Sciences médicales
Adrian Serohijos
Observation de l’évolution microbienne et comprendre les mutations du génome des bactéries
- Professeur agrégé
-
Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire
Roger-Gaudry, local C-324
Portrait
Expertise de recherche
L'interaction entre la biophysique moléculaire et les processus de mutation, de sélection et de dérive génétique façonnent l'évolution. Les méthodes traditionnelles qui étudient le repli et la conception de protéines se concentrent sur l’explication des propriétés moléculaires des protéines à partir des principes de la physique et de la chimie. L'étude de l’évolution moléculaire traditionnelle se concentre elle sur l'explication de la variation des séquences à partir des principes de la biologie de l’évolution et de la génétique des populations.
La synthèse de la biophysique et de la biologie de l’évolution est une nécessité scientifique qui a des répercussions pratiques sur notre compréhension de l'évolution de la résistance aux antibiotiques, de la progression du cancer, ou encore de la propagation d'agents pathogènes.
Nous avons utilisé cette approche intégrée pour déterminer les paramètres biophysiques, cellulaires et de génétique des populations qui régissent le taux d'évolution des protéines. Cette approche a été également appliquée à l'évolution des virus à ARN et des bactéries.
Nous utilisons maintenant une approche similaire pour prédire l’accroissement de la résistance aux antibiotiques, pour quantifier les contraintes épistatiques et pléiotropiques sur la capacité d'évolution des protéines, et pour développer de nouvelles méthodologies en phylogénie.
Nos projets sont pluridisciplinaires. Nous collaborons aussi avec des laboratoires au Canada et le monde.
Formation
- 2015 — Post-doctorat — Biologie et autres sciences connexes, Microbiologie — Harvard University
- 2002 — Baccalauréat — Physique — Université Ateneo de Manille
- 2003 — Baccalauréat — Génie informatique et génie logiciel — Université Ateneo de Manille
- 2009 — Doctorat — Physique — Université de Caroline du Nord à Chapel Hill
Pour en savoir plus…
- Portraits de chercheurs - Adrian Serohijos : la multidisciplinarité au service de la santé
- 28-02-2017 Un financement de 10 M$ pour des infrastructures de recherche à l’UdeM
- 20-06-2017 Quelques exemples d’engagement de la communauté et de réussite étudiante
- 18-06-2019 L’UdeM obtient vingt nouvelles chaires de recherche du Canada et huit renouvellements
Affiliations et responsabilités
Affiliations de recherche
Unités de recherche
Titulaire
Enseignement et encadrement
Enseignement
Cours siglés (session en cours uniquement)
- BCM-2004 – Évolution moléculaire
- BCM-3553 – Bioinformatique pour biochimistes
- BCM-6010 – Bio-informatique appliquée
Programmes
- 146511 – Baccalauréat en biochimie et médecine moléculaire
- 146811 – Baccalauréat en bio-informatique
- 146811 – Baccalauréat en bio-informatique
- 246510 – Génétique moléculaire
- 246513 – Maîtrise en biotechnologie appliquée au milieu industriel
- 248410 – Maîtrise en sciences biomédicales
- 252010 – Maîtrise en pharmacologie
- 270010 – Maîtrise en sciences pharmaceutiques
- 352010 – Doctorat en pharmacologie
- 370010 – Doctorat en sciences pharmaceutiques
Encadrement
Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)
2023
Approches bio-informatiques protéome-centrées pour l’étude des phénotypes complexes
Diplômé(e) : Besse, Savandara Ladyson
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2022
The mutational fitness landscape of TEM-1 Beta-lactamase is modulated by intracellular processes
Diplômé(e) : Mojaradshafiee, Niloofar
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2021
L’évolution des pangénomes de procaryotes sur des échelles de temps humaines
Diplômé(e) : N'Guessan, Arnaud
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2019
A multiscale framework for microbial evolution to identify the emergence of antibiotic resistance
Diplômé(e) : Ton, Anh-Tien
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Projets
Projets de recherche
2023
- 2028
Canada Research Chair in Evolutionary systems biology and population dynamics (renouvellement)
Chercheur principal :
Adrian Serohijos
Sources de financement :
SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention :
PVX50399-Chaires de recherche du Canada
2019
- 2026
Comprehensive mapping and evolutionary dynamics of the mutational landscape of antimicrobial resistance
Chercheur principal :
Adrian Serohijos
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2016
- 2026
Experimentally derived quantitative model of protein evolution
Chercheur principal :
Adrian Serohijos
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2018
- 2023
Canada Research Chair in Evolutionary Biophysics and Population Dynamics
Chercheur principal :
Adrian Serohijos
Sources de financement :
SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention :
PVX50399-Chaires de recherche du Canada
2019
- 2022
Drop-based microfluidics (DBM) for single cell studies and ultrahighthroughput phenotypic screens and lab evolution
Chercheur principal :
Adrian Serohijos
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (de 7 001 $ à 150 000 $)
2018
- 2022
Biophysique évolutive: intégrer la biophysique des protéines, la biologie évolutive et la génétique des populations pour prédire l’émergence de la résistance aux antibiotiques des microbes
Chercheur principal :
Adrian Serohijos
Sources de financement :
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Junior 1
2018
- 2022
Biophysique évolutive: intégrer la biophysique des protéines, la biologie évolutive et la génétique des populations pour prédire l’émergence de la résistance aux antibiotiques des microbes
Chercheur principal :
Adrian Serohijos
Sources de financement :
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Établissement de jeunes chercheurs Juniors 1
2018
- 2022
Persistance des bactéries contre les antibiotiques et la vitrosité de leur cytoplasme
Chercheur principal :
Stephen Michnick
Sources de financement :
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention :
PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2020
- 2021
Supplément COVID-19 CRSNG_Experimentally derived quantitative model of protein evolution
Chercheur principal :
Adrian Serohijos
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Supplément à l’appui des étudiants, des stagiaires postdoctoraux et du personnel de soutien à la recherche COVID-19
2018
- 2021
Macromolecular interaction analysis using a surface plasmon resonance biosensor
Chercheur principal :
John Pascal
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (de 7 001 $ à 150 000 $)
2018
- 2021
L'intégration de la biophysique et de la génétique des populations pour la prédiction de la résistance aux médicaments et le développement de nouveaux outils en évolution moléculaire.
Chercheur principal :
Adrian Serohijos
Sources de financement :
FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Fonds d'exploitation des infrastructures (FEI)
2018
- 2020
Bourse postdoc, Candidat Pouria Dasmeh / Une approche d'apprentissage profond pour prédire le niveau de résistance et le potentiel de propagation de la résistance aux antibiotiques / Subvention accordée au projet Apogée Données au service des Canadiens..
Chercheur principal :
Adrian Serohijos
Sources de financement :
FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2017
- 2019
A versatile broad range microscale thermophoresis apparatus for the measurement of biomolecular interactions
Chercheur principal :
Rafaël Najmanovich
Co-chercheurs :
Rémy Sauvé
,
Christian Baron
,
Rikard Blunck
,
James G. Omichinski
,
Adrian Serohijos
,
John Pascal
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (de 7 001 $ à 150 000 $)
2016
- 2018
L'intégration de la biophysique et de la génétique des populations pour la prédiction de la résistance aux médicaments et le développement de nouveaux outils en évolution moléculaire.
Chercheur principal :
Adrian Serohijos
Sources de financement :
FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Fonds des leaders
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