Sciences de la santé
John David Rioux
Base génétique et fonctionnelle des maladies inflammatoires
- Professeur titulaire
-
Faculté de médecine - Département de médecine
Autre numéro :
514 376-3330 #3741
(Travail 1)
Portrait
Expertise de recherche
Le laboratoire de génétique et médecine génomique en inflammation étudie la base génétique et fonctionnelle des maladies inflammatoires communes dont l'asthme, les maladies cardiovasculaires, la maladie de Crohn, la colite ulcéreuse, le lupus érythémateux disséminé, la polyarthrite rhumatoïde et la sclérose en plaques. En plus, notre groupe s'intéresse à identifier des gènes responsables de maladies mendéliens rares qui affectent la population canadienne française.
Biographie
John D. Rioux est professeur agrégé de médecine à l'Université de Montréal et à l’Institut de Cardiologie de Montréal où il œuvre en tant que chercheur et directeur du Laboratoire de génétique et médecine génomique en inflammation. Depuis 2005, il est titulaire de la Chaire de recherche du Canada en génétique et médecine génomique.
Le Dr Rioux a obtenu un baccalauréat en sciences (B.Sc. Immunologie) en 1987 et un doctorat en médecine (Ph.D. Médecine expérimentale) de l'Université McGill en 1994. Il a ensuite complété un stage postdoctoral au Whitehead Institute/MIT Center for Genome Research en 1997. À la suite de cette formation, le Dr Rioux a créé un groupe de recherche travaillant sur la génétique et la génomique des maladies monogéniques et des maladies polygéniques/complexes. En 2001, il est devenu directeur du groupe de recherche sur les maladies inflammatoires au Whitehead Institute/MIT Center for Genome Research, puis au Broad Institute of MIT and Harvard. Il a été nommé professeur adjoint au Harvard Medical School et au Brigham and Women’s Hospital en 2003 et, en 2004, membre associé du Broad Institute of MIT and Harvard jusqu’en 2007.
Ses recherches ont pour but de découvrir les facteurs de risque génétiques des maladies communes (polygéniques) et de déterminer les mécanismes biologiques par lesquelles ces variantes génétiques influencent le risque de développer ces maladies chroniques. Il est membre fondateur de quatre consortiums internationaux en génétique. Dr. Rioux a plus de 150 publications incluant plusieurs publications dans les revues de prestige comme Nature, Science, Nature Genetics, et New England Journal of Medicine.
Affiliations et responsabilités
Affiliations de recherche
Unités de recherche
Titulaire
Membre
Établissements affiliés
- Institut de cardiologie de Montréal (ICM)
Enseignement et encadrement
Encadrement
Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)
2024
L'effet d'une prédisposition génétique aux maladies inflammatoires de l'intestin sur la barrière épithéliale intestinale
Diplômé(e) : Hébert-Milette, Isabelle
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2022
Comprendre la fonction cellulaire par l’analyse du transcriptome : une approche bio-informatique
Diplômé(e) : Mola, Saraï
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2020
Facteurs de risque pour les maladies inflammatoires de l’intestin : caractérisation de l’impact de variants rares d’IFIH1 sur la réponse épithéliale antivirale
Diplômé(e) : Pruneau, Laurie
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2018
Développement d’un outil bio-informatique pour l’annotation des associations entre gènes et métabolites basée sur les voies métaboliques
Diplômé(e) : Therrien-Laperrière, Sandra
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2017
Étude génétique et fonctionnelle des gènes de la région 14q31 associée aux maladies inflammatoires de l’intestin
Diplômé(e) : Mercier, Virginie
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2016
Développement d’une méthode bio-informatique permettant de relier les gènes aux métabolites
Diplômé(e) : Cherkaoui, Sarah
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2016
Déterminer le rôle de C1orf106, un gène associé aux maladies inflammatoires de l’intestin
Diplômé(e) : Lévesque, Chloé
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2015
Syndrome du QT long: étude clinique à l’Institut Cardiologique de Montréal et recherche de nouvelles variantes causales par séquençage à haut débit
Diplômé(e) : Chaix, Marie-Alexandre
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2012
MAST3 : facteur de risque génétique aux maladies inflammatoires de l’intestin et modulateur d’inflammation
Diplômé(e) : Labbé, Catherine
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2012
Le locus 1q32 : susceptibilité aux maladies inflammatoires de l’intestin et rôles biologiques de C1orf106 et KIF21B
Diplômé(e) : David, Geneviève
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2011
Étude génétique et fonctionnelle de variantes de la région chromosomique 3p21 associée aux maladies inflammatoires de l'intestin
Diplômé(e) : Lévesque, Marie-Pierre
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Projets
Projets de recherche
2022
- 2029
Canada Research Chair in Genetics and Genomic Medicine
Chercheur principal :
John David Rioux
Sources de financement :
SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention :
PVX50399-Chaires de recherche du Canada
2021
- 2027
Identifying and functionally validating IBD genes and variants impacting intestinal epithelial barrier integrity
Chercheur principal :
John David Rioux
Co-chercheurs :
François Boudreau
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2018
- 2024
Characterization of the immunologic events that lead to development of Systemic Autoimmune Rheumatic Disease
Chercheur principal :
Joan Elizabeth Wither
Co-chercheurs :
John David Rioux
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2022
- 2023
Montreal-Boston Collaborative GRC
Chercheur principal :
John David Rioux
Sources de financement :
NIH/National Institutes of Health (NIH)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Subvention de recherche
2022
- 2023
Canadian autoimmunity standardization core (CAN-ASC)
Chercheur principal :
Megan Levings
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Subvention d'équipe
2018
- 2023
Understanding the role of Epigenetic Reader SP 140 in IBD
Co-chercheurs :
John David Rioux
Sources de financement :
NIH/National Institutes of Health (NIH)
Programmes de subvention :
2021
- 2022
Developing an inexpensive blood-based diagnostic test for Crohn's Disease
Chercheur principal :
John David Rioux
Sources de financement :
Génome Québec
Programmes de subvention :
2015
- 2022
Génétique et médecine génomique
Chercheur principal :
John David Rioux
Sources de financement :
SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention :
PVX50399-Chaires de recherche du Canada
2018
- 2021
A prospective study of immune cell responsiveness to understand drug response in UC patients treated with tofacitinib
Chercheur principal :
John David Rioux
Sources de financement :
Pfizer Canada Inc.
Programmes de subvention :
2015
- 2021
Suvention FICM 2015-2018
Chercheur principal :
John David Rioux
Sources de financement :
Fondation de l'Institut de cardiologie de Montréal
Programmes de subvention :
2014
- 2021
Insights into Parkinson's disease, Crohn's disease and leprosy: common role of LRRK2
Chercheur principal :
David Park
Co-chercheurs :
John David Rioux
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
2019
- 2020
Comprendre l'hétérogénéité tissulaire dans l'acidose lactique: une fenêtre sur les mécanismes physiopathologiques et cardioprotection
Chercheur principal :
John David Rioux
Sources de financement :
Le Grand Défi Pierre Lavoie
Programmes de subvention :
2018
- 2020
Canadian Autoimmunity Standardization Core (CAN-ASC)
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
2013
- 2018
IBD GENOMIC MEDICINE CONSORTIUM (IGENOMED): TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO A PERSONALIZED APPROACH TO TREATING THE INFLAMMATORY BOWEL DISEASES
Chercheur principal :
John David Rioux
Co-chercheurs :
Christine Des Rosiers
,
Guillaume Lettre
,
Sylvie Lesage
,
Jean Lachaine
,
Lambert Busque
,
Brian White-Guay
,
Sidhu Sachdev
,
Lawrence Joseph
,
Alain Bitton
,
Harding Mathew
,
Levings Megan
,
Denis J. Garand
,
Sophie Veilleux
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
,
Génome Canada
,
AmorChem
,
Génome Québec
Programmes de subvention :
,
,
,
2013
- 2018
IBD GENOMIC MEDICINE CONSORTIUM (IGENOMED) : TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO A PERSONALIZED APPROACH TO TREATING THE INFLAMMATORY BOWEL DISEASES
Sources de financement :
Génome Québec
Programmes de subvention :
2016
- 2017
Plateforme de support aux analyses cellulaires et génomiques appliquées à la recherche biomédicale
Chercheur principal :
John David Rioux
Sources de financement :
FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Fonds des leaders
2015
- 2017
Defining the causality & biologic impact of genes within ulcerative colitis loci.
Chercheur principal :
John David Rioux
Sources de financement :
NIH/National Institutes of Health (NIH)
Programmes de subvention :
2014
- 2017
IBD GENOMIC MEDICINE CONSORTIUM (IGENOMED) : TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO A PERSONALIZED APPROACH TO TREATING THE INFLAMMATORY BOWEL DISEASES
Sources de financement :
Génome Québec
Programmes de subvention :
2015
- 2016
Studies of immune status and responsiveness, metabolites and secreted proteins in retrospective and prospective IBD cohorts
Co-chercheurs :
John David Rioux
Sources de financement :
NIH/National Institutes of Health (NIH)
Programmes de subvention :
2013
- 2015
SUBVENTION FICM 2013-2014
Chercheur principal :
John David Rioux
Sources de financement :
Fondation de l'Institut de cardiologie de Montréal
Programmes de subvention :
2010
- 2015
GENETICS AND GENOMIC MEDICINE OF INFLAMMATION
Chercheur principal :
John David Rioux
Sources de financement :
SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention :
PVX50399-Chaires de recherche du Canada
2009
- 2015
CIHR TEAM IN THE LEIGH SYNDROME FRENCH CANADIAN TYPE (LSFC) : TRANSLATING LSFC GENE DISCOVERY INTO TREATMENTS FOR PATIENTS
Chercheur principal :
Christine Des Rosiers
Co-chercheurs :
Bruce G. Allen
,
Lise Coderre
,
Yan Burelle
,
John David Rioux
,
Catherine Laprise
,
Eric Alan Shoubridge
,
Charles Morin
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
2009
- 2015
CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATION DISEASE : IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY : A MODEL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES
Chercheur principal :
Stephen Michnick
Co-chercheurs :
John David Rioux
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Subvention d'équipe
2009
- 2015
CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATORY DISEASES : IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY : A MODAL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES
Chercheur principal :
John David Rioux
Sources de financement :
Fondation canadienne des maladies inflammatoires de l'intestin
Programmes de subvention :
2009
- 2015
CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATORY DISEASES : IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY: A MODAL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES
Chercheur principal :
John David Rioux
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Subvention d'équipe
2014
IBD GENOMIC MEDECINE CONSORTIUM (IGENOMED) : TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO A PERSONALIZED APPROACH TO TREATING THE INFLAMMATORY BOWEL DISEASES
Chercheur principal :
John David Rioux
Sources de financement :
Crohn's and Colitis Foundation of America
Programmes de subvention :
2013
- 2014
MONTREAL-BOSTON COLLABORATIVE IBD GENETIC RESEARCH CENTER
Chercheur principal :
John David Rioux
Co-chercheurs :
Alain Bitton
Sources de financement :
NIH/National Institutes of Health (NIH)
Programmes de subvention :
2009
- 2014
CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATORY DISEASES: IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY: A MODAL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES
Chercheur principal :
John David Rioux
2011
- 2013
GENETIQUE ET MEDECINE GENOMIQUE DE L'INFLAMMATION
Chercheur principal :
John David Rioux
Sources de financement :
MSSS/Ministère de la Santé et des Services sociaux
Programmes de subvention :
2011
- 2013
GENETIQUE ET MEDECINE GENOMIQUE DE L'INFLAMMATION
Chercheur principal :
John David Rioux
Sources de financement :
Regroupement de compagnies, corporations canadiennes
Programmes de subvention :
2011
- 2013
GENETIQUE ET MEDECINE GENOMIQUE DE L'INFLAMMATION
Chercheur principal :
John David Rioux
Sources de financement :
FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention :
2009
- 2011
BIOLOGIE INTEGRATIVE DES GENES ASSOCIES A PLUSIEURS MALADIES INFLAMMATOIRES: AMELIORATIONS DIAGNOSTIQUE ET THERAPEUTIQUE
Chercheur principal :
John David Rioux
2009
ATELIER GENOMIQUE FRSQ-NSFC, BEIJING, CHINA
Rayonnement
Publications et communications
Disciplines
- Génétique
Champ d’expertise
- Cartographie génétique
- Chromosomes: structure / organisation
- Dépistage génétique des maladies
- Dommages et réparation du génome
- Expression et régulation génique
- Gènes
- Gènes de susceptibilité
- Génétique appliquée
- Génétique de traits complexes
- Génétique du développement
- Génétique et éthique
- Génétique et hérédité
- Génétique évolutive
- Génétique moléculaire
- Génétique populationnelle
- Génome
- Génomique
- Interactions gènes et environnement
- Maladies génétiques
- Marqueurs génétiques
- Micropuces d'ADN et d'ARN
- Modèle transgénique
- Mutation (processus)
- Phénotype
- Polymorphisme
- Protéines
- Protéomique
- Télomères
- Thérapie génique
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