Luis Barreiro
Évolution des réponses immunitaires entre les espèces et les populations humaines
- Professeur associé
-
Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire
Médias
Luis Barreiro dans son labo du CHU Sainte-Justine.
© Université de Montréal
Portrait
Expertise de recherche
Luis Barreiro et son équipe se penchent sur l’évolution des réponses immunitaires entre les espèces ainsi qu’entre diverses personnes et populations humaines.
1. Identification des facteurs génétiques de la sensibilité aux maladies infectieuses
Les maladies infectieuses sont depuis toujours partout dans le monde un problème majeur de santé publique. Malgré la production récente de vaccins et d’antibiotiques, ces maladies sont responsables de presque 15 millions de décès annuellement. Même si la variation interindividuelle de la sensibilité à certains microbes particuliers peut être en grande partie attribuée à des facteurs environnementaux comme la malnutrition ou à de mauvaises conditions d’hygiène, une proportion importante peut être attribuée à des facteurs génétiques chez leur hôte. Toutefois, jusqu’à ce jour, on connaît très peu les facteurs génétiques sous-jacents pouvant contribuer à des différences de sensibilité aux maladies infectieuses au niveau des populations. Par le biais d’une approche pluridisciplinaire combinant des techniques génomiques de pointe et des outils génétiques immunologiques et évolutionnaires, l’équipe du laboratoire de Luis Barreiro vise à identifier des gènes individuels ainsi que des voies génétiques entières dont la réponse transcriptionnelle à des infections bactériennes distinctes varie d’un individu à l’autre et d’une population à l’autre et qui permet la localisation de certains locus génétiques spécifiques (QTL). Réussir à localiser de tels QTL se traduira par l’identification de certains gènes candidats très prometteurs de la sensibilité aux maladies infectieuses.
2. Évolution et réponses immunitaires chez les primats
Les humains ainsi que nos proches cousins évolutionnaires répondent différemment à un grand nombre d’infections. Si le SIDA, le paludisme et le cancer tuent des millions d’humains autour du monde annuellement, certains primats non humains semblent avoir une protection naturelle contre ces maladies. On croit que ces différences entre les humains et les autres primats sont, au moins en partie, attribuables aux différences entre les espèces en ce qui a trait à la réponse immunitaire à l’infection. Par contre, en raison de la pénurie de données fonctionnelles pouvant servir à des fins de comparaison entre les espèces, les différences entre le système immunitaire des humains et celui des autres primats sont toujours mal élucidées. Au laboratoire, nous examinons l’évolution phénotypique des réponses immunitaires chez les primats en combinant des essais immunologiques in vitro et des techniques génomiques de point. Nous projets s’annoncent très prometteurs quant à l’éventuelle identification des différences entre les espèces impliquées dans la réponse précoce à l’infection, ce qui permettrait peut-être d’expliquer les différences de sensibilité aux maladies chez les primats.
Dr Barreiro a reçu plusieurs prix/honneurs depuis le début de sa carrière, tels que: boursier postdoctoral (Fundaçao para a Ciencia e Tecnologia 2004-2008, Fondation pour la recherche médicale 2008-2009, Organisation européenne de biologie moléculaire 2009, Human Frontiers Science Foundation 2009-2011), chercheur-boursier junior 1 du Fonds de la recherche en santé du Québec 2001-2014 et Chaire de recherche du Canada en génomique fonctionnelle et évolutive du système immunitaire.
Il a obtenu plusieurs subventions de recherches des organismes suivants : Instituts de recherche en santé du Canada, Fondation canadienne pour l’innovation, International Human Frontier Science Program Organization, National Institutes of Health (USA), CRSNG, etc.
Biographie
Luis Barreiro a reçu ses diplômes de premier et deuxième cycles en biotechnologie de l’Université Lusófona à Lisbonne, Portugal. En 2008, il a obtenu un doctorat en génétique humaine des populations de l’Université Paris VII. Sa recherche vise à mieux comprendre le rôle de la sélection naturelle dans l’évolution de notre espèce et le niveau d’impact sur la sensibilité aux maladies aujourd’hui des évènements de sélection historiques.
Prix et distinctions
- Prix du jeune chercheur de la société canadienne de pédiatrie - 2017
- Nomination au Collège de nouveaux chercheurs et créateurs en arts et en science de la Société royale du Canada - 2017
- Prix Excellence expertise et compétence du CHU Ste-Justine - 2017
- Chercheur-boursier junior 1, Fonds de la recherche en santé du Québec, 2011-2014.
- Dr Luis Barreiro reçoit le «Career Development Award 2012» du Human Frontiers Science Program (HFSP) pour son étude : «Deciphering the genetic architecture of immune responses to infection». (mars 2012)
- Boursier postdoctoral, Human Frontiers Science Foundation, 05/2009 – 02/2011.
- Boursier postdoctoral, Organisation européenne de biologie moléculaire, 03/2009 – 05/2009.
- Boursier postdoctoral, Fondation pour La Recherche Médicale, 03/2008 -02/2009.
- Boursier doctoral, Fundação para a Ciência e Tecnologia (gouvernement portugais), 2004-2008.
Formation
- 2002 — Diplôme en génie biotechnologique — Génie biomédical, Génie biochimique — Université Lusófona
- 2008 — Doctorat en génétique humaine des populations — Génétique, Génétique médicale — Université Paris VII
- 2011 — Stage postdoctoral en génomique fonctionnelle — Génétique, Génétique médicale — Université de Chicago
Pour en savoir plus…
- Portrait de chercheurs - Luis Barreiro : la bonne voie
- 04-01-2018 Pauvre comme rhésus
-
12-01-2018 Le travail novateur de Luis Barreiro, promet de faire des vaccins plus efficaces pour lutter contre la tuberculose
En anglais seulement.
- 22-10-2016 Africains et Européens ont des systèmes immunitaires génétiquement différents
- 12-01-2018 Innate Immune Cells Reprogrammed to Fight Tuberculosis
Affiliations et responsabilités
Affiliations de recherche
Enseignement et encadrement
Encadrement
Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)
Rôle de la déméthylation active de l'ADN en réponse à l'infection dans les cellules dendritiques humaines
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Insights on interspecies disease tolerance mechanisms through comparative and functional genomics
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Contrôle génétique de l’épissage alternatif dans le contexte de la réponse immunitaire innée
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Impact des variants génétiques sur la réponse immunitaire des populations humaines
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Epigenetic regulation of innate immune responses to infection
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Dynamic epigenetic changes in immune responses to infection in human dendritic cells
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Les macrophages d’ascendance européenne et africaine répondent différemment aux infections bactériennes
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Projets
Projets de recherche
The lungs as HIV reservoirs: Interplay between disrupted respiratory immunity and Chronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD)
Multidimensional Epigenomics Mapping Centre (EMC) at McGill
A toolkit for genome-wide association studies in bacteria
EVOLUTION OF INNATE IMMUNE RESPONSES IN HUMAN AND NON-HUMAN PRIMATES
IDENTIFYING HOST GENETIC FACTORS THAT AFFECT THE INTERPLAY BETWEEN M. TUBERCULOSIS AND MACROPHAGES
CHAIRE DE RECHERCHE DU CANADA - FUNCTIONAL AND EVOLUTIONARY GENOMICS OF THE IMMUNE
Hunter-gatherer vs. agriculturalist growth and immune system functional genomics.
Human Genetics of Resistance to TB in HIV-infected persons.
Species Inspired Research for Innovative Treatments (SPIRIT).
MAPPING EQTLS THAT AFFECT SUSCEPTIBILITY TO BACTERIAL INFECTIONS
Réseau de Médecine Génétique Appliquée (RMGA) - Génomique intégrée
MECHANISMS OF B CELL RESPONSES IN AUTOIMMUNE DISEASE
DECIPHERING THE GENETIC ARCHITECTURE OF IMMUNE RESPONSES TO INFECTION
USING EVOLUTIONARY AND GENOMIC TOOLS TO IDENTIFY GENETIC FACTORS THAT AFFECT SUSCEPTIBILITY TO INFECTIOUS DISEASES
MAPPING EQTLS THAT AFFECT SUSCEPTIBILITY TO BACTERIAL INFECTIONS
FONDS DE DEMARRAGE - IDENTIFICATION DE FACTEURS GENETIQUES INFLUENCANT LA SUSCEPTIBILITE AUX MALADIES INFECTIEUSES PAR L'UTILISATION D'OUTILS EVOLUTIFS ET GENOMIQUES
DECIPHERING THE PATHWAYS ASSOCIATED WITH TISSUE DESTRUCTION IN CELIAC DISEASE
IDENTIFYING HOST GENETIC FACTORS THAT AFFECT THE INTERPLAY BETWEEN M. TUBERCULOSIS AND MACROPHAGES
IDENTIFICATION DE FACTEURS GÉNÉTIQUES INFLUENÇANT LA SUSCEPTIBILITÉ AUX MALADIES INFECTIEUSES PAR L'UTILISATION D'OUTILS ÉVOLUTIFS ET GÉNOMIQUES
IDENTIFICATION DE FACTEURS GENETIQUES INFLUENCANT LA SUSCEPTIBILITE AUX MALADIES INFECTIEUSES PAR L'UTILISATION D'OUTILS EVOLUTIFS ET GENOMIQUES
A LABORATORY TO STUDY OF GENETIC BASIS OF SUSCEPTIBILITY TO INFECTIOUS DISEASES
A LABORATORY TO STUDY THE GENETIC BASIS OF SUSCEPTIBILITY TO INFECTIOUS DISEASES
A LABORATORY TO STUDY THE GENETIC BASIS OF SUSCEPTIBILITY TO INFECTIOUS DISEASES
IDENTIFICATION DE FACTEURS GENETIQUES INFLUENCANTS LA SUSCEPTIBILITE AUX MALADIES INFECTIEUSES PAR L'UTILISATION D'OUTILS EVOLUTIFS ET GENOMIQUES
Rayonnement
Publications et communications
Publications
Dr Barreiro a plusieurs publications à son actif dont les cinq plus importantes sont citées ci-dessous :
- Perry GH, Foll M, Grenier JC, Patin E, NédélecY, Pacis A, Barakatt M, Gravel S, Zhou X, Nsobya S, Excoffier L, Quintana-Murci L, Dominy NJ, Barreiro LB. (2014) Adaptive, convergent origins of the pygmy phenotype in African rainforest hunter-gatherers. Proc Natl Acad Sci U S A, 2;111(35):E3596-603
- Barreiro LB, Tailleux L, Marioni JC, Blekhman R, Stephens S, Gicquel B, Gilad Y (2012) Deciphering the genetic architecture of variation in the immune response to Mycobacterium tuberculosis infection. Proc Natl Acad Sci U S A. 24;109(4):1204-9.
- Barreiro LB, Marioni JC, BlekhmanR, Stephens S, Gilad Y (2010) Functional comparison of innate immune signaling pathways in primates. PLoS Genetics. Dec;6(12):e1001249.
- Barreiro LB, Quintana-Murci L (2009) From evolutionary genetics to human immunology: how selection shapes host defence genes. Nature Reviews Genetics11(1):17-30.
- Barreiro LB, Laval, G, Quach H, Patin E, Quintana-Murci L (2008) Natural selection has driven population differentiation in modern humans. Nat Genet 40(3):340-5.
Disciplines
- Pédiatrie
- Biochimie
- Génétique
- Génétique médicale
- Médecine préventive
Champ d’expertise
- Développement du nourrisson / de l'enfant
- Maladies inflammatoires du système nerveux central
- Maladies inflammatoires du système respiratoire
- Maladies auto-immunes
- Génétique du cancer
- Maladies du système immunitaire
- Réactions immunitaires
- Système immunitaire
- Facteurs de croissance (cancer)
- Hormones et facteurs de croissance
- Cartographie génétique
- Dépistage génétique des maladies
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