Passer au contenu

/ La recherche

Je donne

Rechercher

Sciences de la santé; Sciences médicales

Sarah Gagliano Taliun

Génomique computationnelle sur des traits génétiques complexes

Professeure sous octroi adjointe

Faculté de médecine - Département de médecine

sarah.gagliano@umontreal.ca

Portrait

Expertise de recherche

Notre groupe utilise des approches computationnelles et bio-informatiques à la fine pointe de la technologie, y compris des modèles d’apprentissage machine, pour comprendre les facteurs génétiques qui contribuent aux traits complexes et aux maladies courantes chez les êtres humains, notamment les maladies cardiovasculaires ou neurologiques.

Formation

  • 2020 — Stage de formation postdoctoral — Épidémiologie et biostatistiqueUniversité de Michigan
  • 2016 — Ph.D — Sciences biomédicalesUniversité de Toronto

Affiliations et responsabilités

Affiliations de recherche

Enseignement et encadrement Ce professeur recrute

Recrutement en recherche Ce professeur recrute

Le développement des modèles prédictifs pour la médecine personnalisée en santé cardiovasculaire et neurologique– M.Sc./Ph.D/PostDoc 

Institut de Cardiologie de Montréal

Chercheuse principale : Sarah A Gagliano Taliun, Ph.D
Professeure sous octroi adjointe, Faculté de médecine - Université de Montréal 

Date de début :  Immédiate 

Description du projet 

Le nouveau groupe de la Dre. Gagliano Taliun utilise des approches computationnelles et bio-informatiques à la fine pointe de la technologie, y compris des modèles d’apprentissage machine, pour comprendre des facteurs génétiques qui contribuent aux traits complexes et aux maladies courantes chez les êtres humains, notamment les maladies cardiovasculaires ou neurologiques. Le français est la langue officielle de l’Université de Montréal, mais notre groupe utilise l’anglais. 

Profil demandé

  • Ambitieux et très motivé 
  • Diplôme universitaire en génétique, biologie, biochimie, bioinformatique ou informatique
  • Connaissances poussées et intérêt pour la génétique 
  • Excellentes aptitudes à la communication orale et écrite 

Comment s'inscrire 

Les candidats intéressés sont invités à soumettre leur demande avant le 31 décembre 2020 par courrier électronique à l'adresse suivante sarah <dot> gagliano <at> icm-mhi.org y compris: 

  • CV 
  • Lettre de motivation 
  • Relevé de notes
  • Noms de 2 références 

Informations sur le laboratoire et les publications sgagliano.github.io/

À propos du Centre de recherche 

Affilié à l'Université de Montréal, l’ICM est avant-gardiste dans la médecine cardiovasculaire au Québec. L’institut est reconnu au Canada et à travers le monde pour son expertise dans la médecine cardiovasculaire de pointe. Concrètement, le Centre de recherche représente plus de 350 articles scientifiques publiés chaque année avec plus de 80 chercheurs fondamentaux et cliniciens, dont plus de 48 sont chercheurs à temps plein. En plus de son infrastructure de recherche technologique de pointe, l’institut comprend le Centre de Coordination des Essais Cliniques de Montréal qui travaille avec 2 500 sites cliniques dans 20 pays sur 4 continents, une Biobanque contenant des échantillons d'une cohorte de plus de 20 000 patients (objectif de 30 000 patients) entièrement phénotypés, un budget annuel de plus de 50 millions de dollars et un leadership inégalé de sorte qu’il constitue un point central pour la coordination de la recherche nationale et internationale. 

Projets

Projets de recherche

2020 - 2024

Le développement des modèles prédictifs qui sont spécifiques au sexe pour la médecine personnalisée en santé cardiovasculaire

Chercheur principal : Sarah Gagliano Taliun
Sources de financement : FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Junior 1

Rayonnement

Publications et communications

Publications

Publications choisies
* Equal contribution    Co-senior author

S.A. Gagliano Taliun*, P. VandeHaar*, A.P. Boughton, R.P. Welch, D. Taliun, E.M. Schmidt, W. Zhou, J.B. Nielsen, C.J. Willer, S. Lee, L.G. Fritsche, M. Boehnke, G.R. Abecasis (2020) Exploring and visualizing large-scale genetic associations using PheWeb. Nature Genetics. 52:550–552. PMID: 32504056

W. Zhou*, Z. Zhao*, J.B. Nielsen, L.G. Fritsche, J. LeFaive, S.A. Gagliano Taliun, W. Bi, M.J. Daly, B.M. Neale, K. Hveem, G.R. Abecasis, C.J. Willer, S. Lee. (2020) Scalable generalized linear mixed model for region-based association tests in large biobanks and cohorts. Nature Genetics. 52:634–639. PMID: 32424355

R.H. Reynolds, J. Hardy, M. RytenS.A. Gagliano Taliun (2019) Informing disease modelling with brain-relevant functional genomic annotations. Brain. 0:1-19. PMID: 31603214

D. Dutta, S.A. Gagliano Taliun, J. Weinstock, M. Zawistowski, C. Sidore, F. Cucca, D. Schlessinger, G. Abecasis, C. Brummett, S. Lee. (2019) Meta-MultiSKAT: Multiple phenotype meta-analysis for region-based association test. Genetic Epidemiology. 43(7):800-814. PMID: 31433078

R.H. Reynolds, J.A. Botía, M.A. Nalls, International Parkinson’s Disease Genomics Consortium (IPDGC), J. Hardy, S.A. Gagliano Taliun, M. Ryten (2019) Moving beyond neurons: the role of cell type-specific gene regulation in Parkinson’s disease heritability. 5:6. NPJ Parkinsons Disease. PMID: 31016231

S.A. Gagliano, S. Sengupta, C. Sidore, A. Maschio, F. Cucca, D. Schlessinger, G.R Abecasis (2018) Relative impact of indels versus SNPs on complex disease. Genetic Epidemiology. 43(1):112-117. PMID: 30565766

W. Zhou, J.B. Nielsen, L.G. Fritsche, R. Dey, M.B. Elvestad, B.N. Wolford, J. LeFaive, P. VandeHaar, S.A. Gagliano, A. Gifford, L.A. Bastarache, W-Q. Wei, J.C. Denny, M. Lin, K. Hveem, H.M. Kang, G.R. Abecasis, C.J. Willer, S. Lee (2018) Efficiently controlling for case-control imbalance and sample relatedness in large-scale genetic association studies. Nature Genetics. 50(9):1335-1341. PMID: 30104761

S.A. Gagliano, J. G. Pouget, J. Hardy, J. Knight, M.R. Barnes, M. Ryten, M.E. Weale (2016) Genomics implicates adaptive and innate immunity in Alzheimer’s and Parkinson’s. Annals of Clinical and Translational Neurology. 3(12):924-933. PMID: 28097204

S.A. Gagliano, C. Ptak, D.Y.F. Mak, M. Shamsi, G. Oh, J. Knight, P.C. Boutros, A. Petronis (2016) Allele-skewed DNA modification in the brain: relevance to schizophrenia GWAS. American Journal of Human Genetics. 98(5):956-962. PMID: 27087318

Communications

S.A. Gagliano Taliun(2019) Teaching at the university-level is not a hassle. Nature. 574(7777): 285. PMID: 31591538

Disciplines

  • Génétique
  • Bio-informatique
  • Épidémiologie et biostatistique

Champ d’expertise

  • Génétique de traits complexes
  • Génomique
  • Génétique des maladies neurologiques et psychiatriques
  • Maladies cardiovasculaires
  • Maladies neurologiques