Yoshiaki Tanaka
- Professeur sous octroi adjoint
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Faculté de médecine - Département de médecine
Portrait
Expertise de recherche
Son équipe étudie les mécanismes cellulaires et moléculaires à l’œuvre dans l’envahissement tumoral ainsi que la croissance et la pharmacorésistance des tumeurs, le tout au moyen de modèles tridimensionnels de culture de cellules humaines in vitro et d’analyses in silico à grande échelle de données génomiques issues du séquençage de l’ARN unicellulaire (single-cell RNA-seq), de la cartographie des sites d’accessibilité de la chromatine (ATAC-seq), du séquençage ChIP (ChIP-seq) et de la cartographie des contacts chromosomiques (Hi-C). Ce laboratoire vise à élucider les phénomènes moléculaires qui régulent la progression des tumeurs et le processus de métastase, et à orienter le développement de nouveaux traitements.
Biographie
Dr Yoshiaki Tanaka a obtenu son diplôme de premier cycle (2006) en sciences pharmaceutiques à l’Université des Sciences de Tokyo au Japon. Pendant sa formation doctorale (2006-2011), il a étudié des méthodologies bioinformatiques d'analyse de données pures en utilisant des données à grande échelle telle que l’ARN-seq et la ChIP-seq pour la modélisation de l’association entre la régulation transcriptionnelle et la régulation épigénétique dans des cellules eucaryotiques sous la supervision du Dr Kenta Nakai de l'Université de Tokyo au Japon. Il a aussi appliqué l’apprentissage-machine aux données de séquençage à haut débit pour étudier la régulation de la conformation de la chromatine. Pour ses études postdoctorales, Dr Tanaka a participé au laboratoire du Dr In-Hyun Park de l'Université de Yale aux États-Unis (2011-2020) pour chercher la formation complémentaire dans la biologie cellulaire et moléculaire dans le but de comprendre la pluripotence des cellules souches et le développement de tissu. Récemment, il a développé des modèles in-vitro du cerveau humain en 3D et a élucidé certains mécanismes du développement du cerveau et des maladies neuronales. La vision de recherche de Dr Tanaka au Centre de Recherche de l’Hôpital Maisonneuve-Rosemont à l’Université de Montréal est d’explorer des problèmes complexes des tumeurs du cerveau et d’autres maladies du cerveau en utilisant des modèles in-vitro et in-silico.
Affiliations et responsabilités
Affiliations de recherche
Unités de recherche
Membre
Établissements affiliés
- CIUSSS de l'Est-de-l'Île-de-Montréal – Hôpital Maisonneuve-Rosemont (HMR)
Enseignement et encadrement
Projets
Projets de recherche
Étude de les maladies cérébrales à l'aide d'organoïdes cérébraux et de l'intelligence artificielle
BRD4-mediated regulation of human brain development and function
BRD4-mediated regulation of human brain development and function
Investigating Intercommunications of Glioblastoma with Brain Microenvironment using 3D Organoid
Investigating Intercommunications of Glioblastoma with Brain Microenvironment using 3D Organoid
Investigating Roles of Primate-Specific Retrotransposon-Derived Transcripts in Glioblastoma
Investigating Roles of Primate-Specific Retrotransposon-Derived Transcripts in Glioblastoma
therapeutic potential of the CCNE1 variant in pediatric leukemia.
Étude de la transition du sous-type de tumeur cérébrale à l'aide de l'intelligence artificielle
Étude de la transition du sous-type de tumeur cérébrale à l'aide de l'intelligence artificielle
Versement additionnel COVID-19 pour un étudiant Étude de la transition du sous-type de tumeur cérébrale à l'aide de l'intelligence artificielle
Rayonnement
Publications et communications
Disciplines
- Génomique
- Bio-informatique
Champ d’expertise
- Antibiotiques et résistance
- Interaction hôte-tumeur
- Cellule
- Génétique moléculaire
- Modélisation
- Génomique
- Bioinformatique
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