Les efforts de ce regroupement visent également à valoriser l'exploitation des connaissances provenant de ces études. Le créneau de recherche occupé par PROTEO représente un secteur stratégique en pleine croissance qui a des retombées économiques indéniables pour le Québec dans le secteur des industries pharmaceutiques et biopharmaceutiques.

Il importe de mentionner le caractère opportun de PROTEO. En effet, la cartographie complète du génome humain et de plusieurs organismes importants (bactéries, levures, plantes) constitue une percée scientifique de grande importance. Cependant, seule l'étude des protéines résultant de la transcription des gènes permettra d'expliquer le fonctionnement et le dysfonctionnement des organismes au niveau moléculaire. La compréhension des protéines est donc le maillon fondamental qui mènera au développement de biocatalyseurs industriels acceptables pour l'environnement, d'agents thérapeutiques, de matériaux biodégradables, de bioréacteurs de détoxification, etc.

Les protéines ont une structure beaucoup plus complexe que les acides nucléiques, et bon nombre d'entre elles doivent subir des modifications structurales post-traductionnelles majeures pour acquérir leur forme active. La fonction d'une protéine étant reliée à sa structure tridimensionnelle, l'étude des relations structure-fonction revêt une importance capitale. Ces travaux fondamentaux sur les protéines constitueront la pierre angulaire des développements scientifiques les plus importants de la prochaine décennie. Vu la complexité des protéines, l'étude des problématiques d'envergure touchant ces biomolécules demande la mise en commun de multiples expertises diversifiées et d'infrastructures de recherche coûteuses. Il est donc particulièrement opportun de supporter un regroupement pluridisciplinaire dont la mission scientifique est l'étude des propriétés et la caractérisation des protéines. De tels regroupements existent déjà dans le monde et il est primordial de créer et de maintenir cet environnement scientifique au Québec où la majorité des entreprises de recherches pharmaceutiques et biopharmaceutiques canadiennes y sont concentrées.

C'est donc dans ce contexte de grands bouleversements scientifiques que le Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FRQ_NT) a reconnu la pertinence, l'opportunité et la qualité scientifique des membres et de leurs travaux en octroyant en janvier 2008 une subvention de 2 000 000 de dollars pour 6 ans à PROTEO dans le cadre du programme Regroupement stratégique.