Philippe Roux et son équipe cherchent à comprendre les mécanismes moléculaires par lesquels les oncogènes transforment une cellule normale en cellule cancéreuse. Ces connaissances s’avèrent cruciales pour le développement de nouvelles cibles thérapeutiques et pour décrypter les causes moléculaires de la résistance au traitement.

Thématique de recherche

Les mécanismes de signalisation cellulaire sont essentiels pour que les cellules intègrent les signaux de l’environnement externe génèrent des réponses adaptées. La dérégulation de ces mécanismes par des mutations dans des protéines de signalisation entraînent diverses pathologies. L’un des exemples les plus létaux est le cancer, qui résulte souvent de mutations qui activent des proto-oncogènes (par exemple, KRAS, BRAF, PIK3CA) ou inactivent des gènes suppresseurs de tumeurs (par exemple, PTEN, APC, TP53). L’objectif principal du laboratoire Roux est de décoder les réseaux de signalisation au sein des cellules cancéreuses afin de faciliter le développement de nouveaux traitements anticancéreux.

Objectifs de recherche 

Un objectif clé du laboratoire Roux est d’identifier de nouveaux effecteurs de la voie RAS/MAPK, souvent dérégulée dans le cancer humain. Le mélanome, dépendant de cette voie, présente des mutations dans ~85 % des cas (BRAF, NRAS, NF1). Pour mieux caractériser cette voie et identifier de nouveaux effecteurs, le laboratoire utilise des approches en protéomique, dont la phosphoprotéomique et le BioID. Ces méthodes ont permis d’identifier de nouveaux effecteurs, dont les fonctions biologiques et le potentiel thérapeutique seront étudiés.

Un autre objectif est d’identifier les vulnérabilités des cellules cancéreuses liées à des oncogènes activés. Pour comprendre la signalisation oncogénique dans la tumorigenèse et la résistance aux médicaments, plusieurs modèles cellulaires exprimant des oncogènes humains ont été développés. Avec une approche protéogénomique intégrant transcriptomique, protéomique et criblage fonctionnel CRISPR/Cas9, le laboratoire cherche à identifier les vulnérabilités associées aux oncogènes KRAS, PIK3CA, MYC et HER2.

Enfin, le laboratoire vise à identifier de nouveaux outils diagnostiques et cibles immunothérapeutiques pour les leucémies adultes et pédiatriques. L’utilisation d’anticorps en oncologie progresse, mais il reste difficile d’identifier des protéines de surface spécifiques à certains cancers. Les avancées en chimioprotéomique, combinant marquage chimique, spectrométrie de masse et purification par affinité (AP-MS), ont permis de surmonter ces défis. Le laboratoire Roux adapte ces techniques pour analyser les antigènes de surface des échantillons de leucémie myéloïde aiguë (LMA) et vise à développer une immunothérapie basée sur ces cibles.