Sciences de la santé; Sciences de la vie
Julie Hussin
Méthodes d'apprentissage profond en recherche biomédicale
Autre numéro :
514 376-3330 #2028
(Travail 1)
Autre courriel :
julie.hussin@umontreal.ca
(Travail)
Médias
Portrait
Expertise de recherche
Julie Hussin dirige un groupe de recherche à l’Institut de Cardiologie de Montréal (ICM). Son poste consiste à réaliser et superviser des projets de recherche en génétique des populations humaines et en génomique personnalisée. Elle organise également des activités et événements pour rejoindre les bio-informaticiens du centre de recherche et créer une synergie entre les équipes qui utilisent des méthodes statistiques et informatiques à l’ICM.
Le travail de recherche la passionne depuis des années et elle adore faire de nouvelles découvertes dans les données biologiques qui n’en finissent plus d’être générées.
Biographie
Dre Julie Hussin est professeure sous octroi adjointe au Département de médecine de l’Université de Montréal et chercheuse junior 1 du FRQS. Elle dirige le groupe de bioinformatique OMICS à l’Institut de Cardiologie de Montréal (ICM). Julie est formée en biologie computationnelle et s’intéresse particulièrement à la génétique des populations, à la recherche biomédicale et aux méthodes d’apprentissage profond.
Avant de se joindre à l’ICM, elle a été boursière postdoctorale du groupe de Peter Donnelly au Wellcome Trust Centre for Human Genetics de l’Université d’Oxford et boursière invitée au Centre d’innovation Génome Québec et à l’Université McGill. De 2009 à 2013, elle a fait son doctorat avec Philip Awadalla au Centre de recherche de l’Hôpital Sainte-Justine.
Affiliations et responsabilités
Affiliations de recherche
Unités de recherche
Membre
Établissements affiliés
- Institut de cardiologie de Montréal (ICM)
Enseignement et encadrement
Enseignement
Cours siglés (session en cours uniquement)
Programmes
Encadrement
Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)
2024
Épistasie en médecine évolutive
Diplômé(e) : Gamache, Isabel
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2023
Approches bio-informatiques protéome-centrées pour l’étude des phénotypes complexes
Diplômé(e) : Besse, Savandara Ladyson
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2023
L’impact des mutations récurrentes du SARS-CoV-2 sur l’évasion immunitaire
Diplômé(e) : Fournelle, Dominique
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2022
Modeling meiotic recombination hotspots using deep learning
Diplômé(e) : Takla, Emad
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2022
Characterizing the impact of the mutational landscape of SARS-CoV-2 on epitope presentation and CTL
Diplômé(e) : Hamelin, David
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2022
Évaluation de l’imputation des données génétiques Canadiennes-Françaises
Diplômé(e) : Pelletier, Justin
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2021
Caractérisation de deux familles de pharmacogènes, les gènes CYP3A et CYP4F
Diplômé(e) : Richard-St-Hilaire, Alex
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2020
Le cœur métabolique : la métabolomique afin de mieux caractériser l’infarctus du myocarde
Diplômé(e) : Samman, Karla N.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Projets
Projets de recherche
2024
- 2031
Réseau Québécois en Reproduction
Co-chercheurs :
Lawrence C. Smith
,
Bruce D. Murphy
,
Christopher A. Price
,
Jacques Drouin
,
André Tremblay
,
Jean-Claude Labbé
,
Julie Lavoie
,
Sébastien Buczinski
,
Simon Dufour
,
Greg Fitzharris
,
Alexandre Boyer
,
Kalidou Ndiaye
,
Serge McGraw
,
Mouhamadou Diaw
,
Gustavo Zamberlam
,
Marianne Villettaz Robichaud
,
Sophie Petropoulos
,
Julie Hussin
,
Juan Carlos Arango Sabogal
,
Julie Brind'Amour
,
Guillaume St-Jean
,
Pablo Valdes Donoso
,
Sarah Kimmins
,
Paul François
,
Anthony Estienne
,
Nicolas Gévry
,
Daniel J. Bernard
,
Cathy Vaillancourt
,
Jacquetta M Trasler
,
Hugh Clarke
,
Bernard Robaire
,
Guylain Boissonneault
,
Éric Asselin
,
Barbara F Hales
,
Makoto Nagano
,
Rima Slim
,
Rajesha Duggavathi
,
Carlos Reyes-Moreno
,
Roger I Cue
,
Roger I Cue
,
Marc-André Sirard
,
Robert Viger
,
François Richard
,
Pierre Leclerc
,
Jacques J. Tremblay
,
Édith Charbonneau
,
Vilceu Bordignon
,
Kessen Patten
,
Claude Robert
,
Yojiro Yamanaka
,
Daniel Cyr
,
Isabelle Plante
,
Géraldine Delbès
,
Debora Santschi
,
Elsa Vasseur
,
Elsa Vasseur
,
Guylaine Sauvé
,
Clémence Belleannée
,
Kevin Wade
,
Nicolas Pilon
,
Maritza Jaramillo Patino
,
Sylvie Breton
,
William Pastor
,
Abdoulaye Banire Diallo
,
Véronique Ouellet
,
Teruko Taketo-Hosotani
,
Aimee Ryan
,
Loydie Majewska
,
Cristian Marcel O'Flaherty
,
Laurence Charton
,
Philippe Constant
,
Cristiano Côrtes
,
Sylvain Riendeau
,
Xianming Zhang
Sources de financement :
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques
2024
- 2030
The Canadian Bioinformatics and Computational Biology Training and Community Platform (BCBHDS Platform)
Chercheur principal :
Michelle Brazas
Co-chercheurs :
Julie Hussin
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Subvention de formation
2024
- 2028
Evolutionary and Functional Dynamics of Cytochrome P450 Genes and Pseudogenes
Chercheur principal :
Julie Hussin
Sources de financement :
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
,
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Programme NOVA pour chercheur(e)s de la relève (partenariat avec CRSNG)
,
PVXXXXXX-Programme NOVA pour chercheur(e)s de la relève (partenariat avec FRQNT)
2024
- 2028
Evolutionary and Functional Dynamics of Cytochrome P450 Genes and Pseudogenes
Chercheur principal :
Julie Hussin
2022
- 2028
Precision medicine study of type 2 diabetes in the COLCOT-T2D trial
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Subvention d'équipe
2022
- 2028
Study of sex-specific biological factors underlying cognitive function and cardiovascular outcomes
Chercheur principal :
Marie-Pierre Dubé
Co-chercheurs :
Jean-Claude Tardif
,
Simon de Denus
,
Louis Bherer
,
Joëlle Rouleau
,
Julie Hussin
,
Sarah Gagliano Taliun
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2022
- 2028
Interpretable Machine Learning Approaches Applied to Omics Datasets
Chercheur principal :
Julie Hussin
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2022
- 2028
Interpretable Machine Learning Approaches Applied to Omics Datasets
Chercheur principal :
Julie Hussin
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(DGECR) Tremplin vers la découverte
2022
- 2028
Precision medicine study of treatment options in type 2 diabetes patients without cardiovascular disease
Chercheur principal :
Marie-Pierre Dubé
Co-chercheurs :
Jean-Claude Tardif
,
Simon de Denus
,
Louis Bherer
,
Julie Hussin
,
Sarah Gagliano Taliun
,
André Carpentier
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2022
- 2027
Precision medicine study of type 2 diabetes in the COLCOT-T2D trial
Chercheur principal :
Marie-Pierre Dubé
Co-chercheurs :
Jacques Le Lorier
,
Jean-Claude Tardif
,
Simon de Denus
,
Grégoire Leclair
,
Louis Bherer
,
Julie Hussin
,
Sarah Gagliano Taliun
,
André Carpentier
,
Sandra Black
,
Gary Lewis
,
Walter Swardfager
Sources de financement :
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Subventions de recherche en partenariat
2022
- 2026
Approches computationnelles multi-omiques pour la recherche sur les maladies cardiovasculaires et la COVID19
Chercheur principal :
Julie Hussin
Sources de financement :
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Junior 2
2024
- 2025
Delineating the Correlates of Tissue Repair Pathways Promoted by Platelet Rich Plasma
Chercheur principal :
Julie Hussin
Sources de financement :
MITACS Inc.
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Stage Accélération Québec - MITACS
2022
- 2023
Interpretability of Deep Learning Approaches Applied to Omics Datasets
Sources de financement :
SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Projet de recherche
2022
- 2023
Canadian Data Integration Centre
Sources de financement :
Ontario Institute for Cancer Research
Programmes de subvention :
2017
- 2023
Determining the genetic and environmental factors associated with metabolic phenotypes across Canada.
Co-chercheurs :
Julie Hussin
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2021
- 2022
Coronavirus Variants Rapid Response Network_CoVaRR-Net (Genomic surveillance and modeling for the COVID-19 variant endgame)
Co-chercheurs :
Julie Hussin
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Subvention de fonctionnement (COVID-19)
2020
- 2022
Génomique computationelle et évolutive en médecine personnalisée
Chercheur principal :
Julie Hussin
Sources de financement :
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Établissement de jeunes chercheurs Juniors 1
2020
- 2022
Génomique computationelle et évolutive en médecine personnalisée
Chercheur principal :
Julie Hussin
Sources de financement :
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Junior 1
2019
- 2022
Biomarqueurs pour l'insuffisance cardiaque à fraction d'éjection préservée: à la recherche de cibles pour le diagnostic et des interventions thérapeutiques grâce à la métabolomique
Chercheur principal :
Christine Des Rosiers
Sources de financement :
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Programme bilatéral de recherche collaborative Québec-Communauté française de Belgique (financement partagé entre les fonds de recherche du Québec)
2020
- 2021
Quantitative Approaches to Understand Differential Immune Responses in COVID-19
Chercheur principal :
Morgan Craig
Co-chercheurs :
Julie Hussin
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Subventions Alliance
2020
- 2021
Analyse de données multi-omiques en recherche cardiovasculaire
Chercheur principal :
Julie Hussin
Sources de financement :
FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Fonds des leaders
2018
- 2021
Les ARNs non-codants dans la physiopathologie, la thérapie et la prognostication de la fibrillation atriale.
Chercheur principal :
Stanley Nattel
Sources de financement :
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Recherches sur les maladies cardiovasculaires NSFC-FRQS
2019
- 2020
Deep Learning Methods in Biomedical Research: from Genomics to Multi-Omics Approaches
Chercheur principal :
Julie Hussin
Sources de financement :
Génome Québec
Programmes de subvention :
2019
Annotation des chromosomes sexuels de l’ornithorynque par apprentissage automatique
Chercheur principal :
Julie Hussin
Sources de financement :
SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2018
- 2019
FICM 2018-2019
Chercheur principal :
Julie Hussin
Sources de financement :
Fondation de l'Institut de cardiologie de Montréal
Programmes de subvention :
Rayonnement
Publications et communications
Disciplines
- Bio-informatique
- Sciences biomédicales
- Génomique
- Épidémiologie et biostatistique
- Informatique
Champ d’expertise
- Bases de données informatiques
- Fouille de données (Data mining)
- Génétique populationnelle
- Technologies biomédicales
- COVID-19
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