François Major
Bio-informatique et ARN
- Professeur titulaire
-
Faculté des arts et des sciences - Département d'informatique et de recherche opérationnelle
Pavillon Marcelle-Coutu, local 3306-11
- Professeur accrédité
-
Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire
Médias
François Major est chercheur principal à l'IRIC
© IRIC
Portrait
Expertise de recherche
Approche bioinformatique pour la détermination et la prédiction de structure et fonction des ARN et des protéines (financement IRSC). Développement de méthodes pour la recherche et l'analyse de motifs structuraux dans les ARN (financement CRSNG). Approche bioinformatique pour la recherche et l'analyse des micro-ARN et des ARN d'interférence (financement stratégique CRSNG).
Biographie
François Major compte parmi les précurseurs de la bio-informatique. Alors qu’il entame ses études supérieures en informatique à l’Université de Montréal en 1984, il s’affaire à utiliser l’informatique pour répondre aux questions de la biologie. Son travail l’amène à développer un logiciel de modélisation tridimensionnelle des ARN sous la supervision de Robert Cedergren et de Guy Lapalme.
Après l’obtention de son diplôme de doctorat en 1990, le chercheur effectue un stage postdoctoral au NCBI sous la direction de David Lipman. L’Université de Montréal l’embauche en 1994 à titre de chercheur. En 2005, Francois Major est recruté par l’IRIC à titre de chercheur principal.
Prix et distinctions
- Prix Urgel-Archambault 2010 - Association francophone pour le savoir (Acfas)
Affiliations et responsabilités
Affiliations de recherche
Enseignement et encadrement
Enseignement
Cours siglés (session en cours uniquement)
- BIN-6001 – Algorithmes en bio-informatique moléculaire
- IFT-1025 – Programmation 2
- IFT-2015 – Structures de données
- IFT-6292 – Bio-informatique moléculaire
Programmes
- 115510 – Baccalauréat en géographie environnementale
- 117510 – Baccalauréat en informatique
- 117520 – Majeure en informatique
- 117540 – Mineure en informatique
- 119010 – Baccalauréat en mathématiques
- 119020 – Majeure en mathématiques
- 119110 – Baccalauréat en mathématiques et informatique
- 119110 – Baccalauréat en mathématiques et informatique
- 120510 – Baccalauréat en physique et informatique
- 120510 – Baccalauréat en physique et informatique
- 122012 – Baccalauréat en neuroscience cognitive
- 124161 – Microprogramme de 1er cycle en analyse des mégadonnées en sciences humaines et sociales
- 146811 – Baccalauréat en bio-informatique
- 146811 – Baccalauréat en bio-informatique
- 196710 – Programme d'accueil en sciences
- 217510 – Maîtrise en informatique
- 246810 – Maîtrise en bio-informatique
Encadrement
Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)
Predicting biomolecular function from 3D dynamics : sequence-sensitive coarse-grained elastic network model coupled to machine learning
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Dissecting the effects of tumor microenvironment factors on cancer cells to reveal novel targets for multi-targeting RNA-based therapeutics
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
La reconnaissance automatique des brins complémentaires : leçons concernant les habiletés des algorithmes d'apprentissage automatique en repliement des acides ribonucléiques
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Comprendre la fonction cellulaire par l’analyse du transcriptome : une approche bio-informatique
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Modélisation des réseaux de régulation de l’expression des gènes par les microARN
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Caractérisation systématique des motifs de régulation en cis à l’échelle transcriptomique et liens avec la localisation des ARN
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Nucleotide Complementarity Features in the Design of Effective Artificial miRNAs
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Prédiction et visualisation de la réactivité chimique des ARN. Proposition d’un modèle basé sur la réactivité : des cycles minimaux et des sous-structures composées de ces cycles.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Étude de la signature dynamique de transcrits primaires impliquée dans la maturation des microARN
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Unfolding RNA 3D structures for secondary structure prediction benchmarking
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Identification de caractéristiques communes et rares dans les ARN structurés dans la base de données Rfam
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Une signature du polymorphisme structural d’acides ribonucléiques non-codants permettant de comparer leurs niveaux d’activités biochimiques
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Modélisation de réseaux d'interactions des microARN et analyse et validation expérimentale de leurs boucles minimales avec des facteurs de transcription
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Quantification de la relation séquence-activité de l’ARN par prédiction de structure tridimensionnelle
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Riboswitches : le cas des atténuateurs de la transcription du type terminateur/antiterminateur chez les bactéries
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Prédiction de boucles de régulation associant microARN et gènes régulés par le récepteur de l'acide rétinoïque dans le cancer du sein
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Étude structurale conformationnelle des toxines de l’anthrax par cryo-microscopie et dynamique moléculaire
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
A new paradigm for the folding of ribonucleic acids
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Prédiction structurale de biomolécules à l'aide d'une construction d'automates cellulaires simulant la dynamique moléculaire
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Identification in silico d’éléments de réponse de récepteurs nucléaires impliqués dans le cancer du sein
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Représentation et recherche de motifs cycliques et structuraux d’ARN connus dans les structures secondaires
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Conception de microARNs pour attenuer l'expression de genes
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Analyse de motifs d'ARN
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Approche plurielle à l'étude de la structure tertiaire de l'ARN chez les virus
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
MC-Map, un nouvel outil d'intégration de motifs
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Un dictionnaire pour faciliter la recherche des gènes dans la littérature et sur Internet
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Les feuillets beta dans les protéines : annotation, comparaison et construction
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Prédiction des pré-miARN basée sur la conservation de structure dans les pri-miARN
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Analyse des données d'expression de gènes
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Prédiction de la structure commune aux ARN messagers codant pour la protéine STG
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Modélisation tridimensionnelle des ARN par exploration de l'espace conformationnel et satisfaction de contraintes
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Recherche de motifs structuraux dans les complexes acides ribonucléiques/protéines
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Sélection d'oligonucléotides pour la fabrication de biopuces d'ADN
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Modélisation automatisée de la structure 3-D des ARNs
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Un algorithme génétique pour l'arrimage moléculaire
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Étude de la structure des ARNm et des protéines impliqués dans les maladies neurodégénératives à prion
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Définition d'une mesure de compatibilité séquence-structure dans les protéines à l'aide de modèles probabilistes graphiques et de réseaux de neurones artificiels
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Détection et analyse de motifs structuraux et fonctionnels dans les acides ribonucléiques
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Étude des environnements de microsimulation économique avec agents partiellement rationnels
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Modélisation des boucles dans les protéines
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Modélisation de la structure 3-D des ARN par satisfaction de contraintes
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Phylogénétique basée sur les cassures du génome
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Propriétés relationnelles tridimensionnelles des structures d'acides nucléiques
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Projets
Projets de recherche
Computational analysis and modeling of ribonucleic acid structure, function, and dynamics
CECR_IRICoR_Integration of Multiple Algorithms into a Service Platform for Accurate and Precise Design and Structure Prediction of Coding and Non-Coding RNA Sequences
COMPUTATIONAL ANALYSIS AND MODELING OF NONCODING RIBONUCLEIC ACID STRUCTURE AND FUNCTION
Supplément COVID-19 CRSNG_Computational analysis and modeling of ribonucleic acid structure, function, and dynamics
Identifier le talon d’Achille du SARS-CoV-2
Computation of cell-specific microRNA: Mrna rgulatory networks enables the design of efficient RNAi-based therapeutics
UNE APPROCHE CHIMIO- ET PROTEO-GENOMIQUE EN MEDECINE PERSONNALISEE POUR LA LEUCEMIE MYELOIDE AIGUE
Programme de bourse d'été et d'initiation à la recherche au premier cycle IVADO. Candidat: Jorge Luis Flores / Discoverning the RNA structural determinants of the RNA-binding proteins
Deciphering and targeting the gene interaction networks that shape cancer cells
RÉSEAU FRANCO-QUÉBÉCOIS DE RECHERCHE SUR L'ARN
COMPUTATIONAL PREDICTION OF RNA 3D STRUCTURE USING LOW RESOLUTION DATA AND A NEW RNA FOLDING ALGORITHM
METHODES INFORMATIQUE POUR PREDIRE LES MUTATIONS MODIFIANT LA STRUCTURE TERTIAIRE DES ARNS
COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL STUDIES OF GENE SILENCING MECHANISMS
COMPUTERIZED ANALYSIS AND PREDICTION OF RNA STRUCTURE AND FUNCTION
METHODES INFORMATIQUES POUR PREDIRE LES MUTATIONS MODIFIANT LA STRUCTURE TERTIAIRE DES ARNS
COMPUTERIZED ANALYSIS AND PREDICTION OF RNA STRUCTURE AND FUNCTION
RNA FOLDING AS A MEDIATOR OF STRESS RESPONSE IN PLANTS
COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL STUDIES OF GENE SILENCING MECHANISMS
DEVELOPING AND TESTING SMALL RNA-BASED MULTIPLE-TARGET GENE THERAPIES AGAINST CANCER AND AIDS
TECHNOLOGICAL ADVANCES IN RNA THERAPY SYMPOSIUM
Rayonnement
Publications et communications
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