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Sciences naturelles et génie; Sciences de la santé; Sciences médicales

François Major

Bio-informatique et ARN

Professeur titulaire

Faculté des arts et des sciences - Département d'informatique et de recherche opérationnelle

Pavillon Marcelle-Coutu, local 3306-11

514 343-6752

francois.major@umontreal.ca

Professeur accrédité

Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire

Autre numéro : 514 343-5834 (Télécopieur)

Médias

ARN, sport et rock'n roll

Chercheur, sportif et D.J., François Major met ses talents de programmeur informatique au service de la lutte contre le cancer. Avec son équipe, il travaille sur les acides ribonucléiques, mieux connu sous le nom de ARN. Il existe plusieurs familles d'ARN, mais ce sont les ARN messagers qui permettent à nos gènes de fabriquer les protéines nécessaires à la survie des cellules.

François Major est chercheur principal à l'IRIC

 - © IRIC

Portrait

Expertise de recherche

Approche bioinformatique pour la détermination et la prédiction de structure et fonction des ARN et des protéines (financement IRSC). Développement de méthodes pour la recherche et l'analyse de motifs structuraux dans les ARN (financement CRSNG). Approche bioinformatique pour la recherche et l'analyse des micro-ARN et des ARN d'interférence (financement stratégique CRSNG).

Biographie

François Major compte parmi les précurseurs de la bio-informatique. Alors qu’il entame ses études supérieures en informatique à l’Université de Montréal en 1984, il s’affaire à utiliser l’informatique pour répondre aux questions de la biologie. Son travail l’amène à développer un logiciel de modélisation tridimensionnelle des ARN sous la supervision de Robert Cedergren et de Guy Lapalme.

Après l’obtention de son diplôme de doctorat en 1990, le chercheur effectue un stage postdoctoral au NCBI sous la direction de David Lipman. L’Université de Montréal l’embauche en 1994 à titre de chercheur. En 2005, Francois Major est recruté par l’IRIC à titre de chercheur principal.

Prix et distinctions

  • Prix Urgel-Archambault 2010 - Association francophone pour le savoir (Acfas)

Enseignement et encadrement

Encadrement

Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)

2022

Comprendre la fonction cellulaire par l’analyse du transcriptome : une approche bio-informatique

Diplômé(e) : Mola, Saraï
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2021

Modélisation des réseaux de régulation de l’expression des gènes par les microARN

Diplômé(e) : Poirier-Morency, Guillaume
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2020

Caractérisation systématique des motifs de régulation en cis à l’échelle transcriptomique et liens avec la localisation des ARN

Diplômé(e) : Benoit Bouvrette, Louis Philip
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2019

Nucleotide Complementarity Features in the Design of Effective Artificial miRNAs

Diplômé(e) : Yan, Yifei
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2017

Étude de la signature dynamique de transcrits primaires impliquée dans la maturation des microARN

Diplômé(e) : Robitaille, Julie
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2017

Unfolding RNA 3D structures for secondary structure prediction benchmarking

Diplômé(e) : C-Parent, Gabriel
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2016

Identification de caractéristiques communes et rares dans les ARN structurés dans la base de données Rfam

Diplômé(e) : El Korbi, Amell
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2013

Quantification de la relation séquence-activité de l’ARN par prédiction de structure tridimensionnelle

Diplômé(e) : St-Onge, Karine
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2012

Riboswitches : le cas des atténuateurs de la transcription du type terminateur/antiterminateur chez les bactéries

Diplômé(e) : Abella, Maria de los A.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2011

Étude structurale conformationnelle des toxines de l’anthrax par cryo-microscopie et dynamique moléculaire

Diplômé(e) : Fabre, Lucien
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2010

A new paradigm for the folding of ribonucleic acids

Diplômé(e) : Parisien, Marc
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2009

Identification in silico d’éléments de réponse de récepteurs nucléaires impliqués dans le cancer du sein

Diplômé(e) : Laperrière, David
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2009

Représentation et recherche de motifs cycliques et structuraux d’ARN connus dans les structures secondaires

Diplômé(e) : Louis-Jeune, Caroline
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2009

Conception de microARNs pour attenuer l'expression de genes

Diplômé(e) : Caron, Maxime
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2008

Analyse de motifs d'ARN

Diplômé(e) : Lavoie, Louis-Philippe
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2007

Approche plurielle à l'étude de la structure tertiaire de l'ARN chez les virus

Diplômé(e) : Permal, Emmanuelle
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2007

MC-Map, un nouvel outil d'intégration de motifs

Diplômé(e) : St-Onge, Nicolas
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2007

Un dictionnaire pour faciliter la recherche des gènes dans la littérature et sur Internet

Diplômé(e) : Halawani, Amine
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2005

Les feuillets beta dans les protéines : annotation, comparaison et construction

Diplômé(e) : Parisien, Marc
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2005

Prédiction des pré-miARN basée sur la conservation de structure dans les pri-miARN

Diplômé(e) : Tibiche, Chabane
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2005

Analyse des données d'expression de gènes

Diplômé(e) : Paquet, Éric
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2005

Prédiction de la structure commune aux ARN messagers codant pour la protéine STG

Diplômé(e) : Terbaoui, Ratiba
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2004

Modélisation tridimensionnelle des ARN par exploration de l'espace conformationnel et satisfaction de contraintes

Diplômé(e) : Thibault, Philippe
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2003

Recherche de motifs structuraux dans les complexes acides ribonucléiques/protéines

Diplômé(e) : Drapeau, Mathieu
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2002

Sélection d'oligonucléotides pour la fabrication de biopuces d'ADN

Diplômé(e) : Dallaire, Paul
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2002

Modélisation automatisée de la structure 3-D des ARNs

Diplômé(e) : Lemieux, Sébastien
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2002

Un algorithme génétique pour l'arrimage moléculaire

Diplômé(e) : Levac, François
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2001

Étude de la structure des ARNm et des protéines impliqués dans les maladies neurodégénératives à prion

Diplômé(e) : Barrette, Isabelle H.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2000

Détection et analyse de motifs structuraux et fonctionnels dans les acides ribonucléiques

Diplômé(e) : Gendron, Patrick
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
1999

Étude des environnements de microsimulation économique avec agents partiellement rationnels

Diplômé(e) : Trussart, Vincent
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
1999

Modélisation des boucles dans les protéines

Diplômé(e) : Lefebvre, Sébastien
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
1999

Modélisation de la structure 3-D des ARN par satisfaction de contraintes

Diplômé(e) : Lemieux, Sébastien
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
1998

Phylogénétique basée sur les cassures du génome

Diplômé(e) : Blanchette, Mathieu
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
1998

Propriétés relationnelles tridimensionnelles des structures d'acides nucléiques

Diplômé(e) : Ftouhi, Abdelmjid
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

Projets

Projets de recherche

2020 - 2027

Computational analysis and modeling of ribonucleic acid structure, function, and dynamics

Chercheur principal : François Major
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2023 - 2025

CECR_IRICoR_Integration of Multiple Algorithms into a Service Platform for Accurate and Precise Design and Structure Prediction of Coding and Non-Coding RNA Sequences

Co-chercheurs : François Major
Sources de financement : Secrétariat Inter-Conseil et Réseaux des centres d'excellence (RCE)
Programmes de subvention :
2014 - 2022

COMPUTATIONAL ANALYSIS AND MODELING OF NONCODING RIBONUCLEIC ACID STRUCTURE AND FUNCTION

Chercheur principal : François Major
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2020 - 2021

Supplément COVID-19 CRSNG_Computational analysis and modeling of ribonucleic acid structure, function, and dynamics

Chercheur principal : François Major
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Supplément à l’appui des étudiants, des stagiaires postdoctoraux et du personnel de soutien à la recherche COVID-19
2020 - 2021

Identifier le talon d’Achille du SARS-CoV-2

Chercheur principal : François Major
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Projet de recherche
2016 - 2021

Computation of cell-specific microRNA: Mrna rgulatory networks enables the design of efficient RNAi-based therapeutics

Chercheur principal : François Major
Co-chercheurs : Thomas Duchaine
Sources de financement : Génome Canada , IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Projets de recherche en génomique à grande échelle et Plates-formes scientifiques tech. , PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2015 - 2020

UNE APPROCHE CHIMIO- ET PROTEO-GENOMIQUE EN MEDECINE PERSONNALISEE POUR LA LEUCEMIE MYELOIDE AIGUE

Chercheur principal : Guy Sauvageau
Sources de financement : FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'innovation
2018

Programme de bourse d'été et d'initiation à la recherche au premier cycle IVADO. Candidat: Jorge Luis Flores / Discoverning the RNA structural determinants of the RNA-binding proteins

Chercheur principal : François Major
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2015 - 2018

Deciphering and targeting the gene interaction networks that shape cancer cells

Chercheur principal : François Major
Co-chercheurs : Étienne Gagnon
Sources de financement : SRC/Société de recherche sur le cancer
Programmes de subvention : PVX12154-Subvention de fonctionnement
2013 - 2016

RÉSEAU FRANCO-QUÉBÉCOIS DE RECHERCHE SUR L'ARN

Chercheur principal : Jérôme Waldispuhl
Co-chercheurs : François Major , Éric Lécuyer
Sources de financement : Centre/Coop.Interuni.Franco-Québéc/Fra
Programmes de subvention :
2010 - 2016

COMPUTATIONAL PREDICTION OF RNA 3D STRUCTURE USING LOW RESOLUTION DATA AND A NEW RNA FOLDING ALGORITHM

Chercheur principal : François Major
Sources de financement : NIH/National Institutes of Health (NIH)
Programmes de subvention :
2011 - 2015

METHODES INFORMATIQUE POUR PREDIRE LES MUTATIONS MODIFIANT LA STRUCTURE TERTIAIRE DES ARNS

Chercheur principal : Jérôme Waldispuhl
Co-chercheurs : François Major
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2009 - 2015

COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL STUDIES OF GENE SILENCING MECHANISMS

Chercheur principal : François Major
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention : PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
1997 - 2015

COMPUTERIZED ANALYSIS AND PREDICTION OF RNA STRUCTURE AND FUNCTION

Chercheur principal : François Major
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2011 - 2014

METHODES INFORMATIQUES POUR PREDIRE LES MUTATIONS MODIFIANT LA STRUCTURE TERTIAIRE DES ARNS

Chercheur principal : Jérôme Waldispuhl
Co-chercheurs : François Major
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2009 - 2013

COMPUTERIZED ANALYSIS AND PREDICTION OF RNA STRUCTURE AND FUNCTION

Chercheur principal : François Major
2009 - 2013

RNA FOLDING AS A MEDIATOR OF STRESS RESPONSE IN PLANTS

Chercheur principal : François Major
Sources de financement : International Human Frontier Science Program Organisation
Programmes de subvention :
2008 - 2013

COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL STUDIES OF GENE SILENCING MECHANISMS

Chercheur principal : François Major
2009 - 2012

DEVELOPING AND TESTING SMALL RNA-BASED MULTIPLE-TARGET GENE THERAPIES AGAINST CANCER AND AIDS

Chercheur principal : François Major
2011

TECHNOLOGICAL ADVANCES IN RNA THERAPY SYMPOSIUM

Chercheur principal : François Major

Rayonnement

Publications et communications

Disciplines

  • Bio-informatique
  • Biochimie
  • Informatique
  • Génomique

Champ d’expertise

  • Bio-informatique
  • Génomique
  • Structures de données
  • Modélisation
  • Micropuces d'ADN et d'ARN
  • COVID-19
  • COVID19

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