Marlene Oeffinger
Régulation et dynamique des voies de maturation de l'ARN
- Professeure/chercheuse agrégée
-
Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire
Portrait
Expertise de recherche
Nous étudions la régulation et la dynamique des voies de maturation de l’ARN. Notre objectif principal est de déterminer l’ensemble temporelle et spatiale et la coordination des facteurs de maturation de l’ARN, ainsi que d’identifier les mécanismes de contrôle sous-jacents qui conduisent le traitement, la modification et l’assemblage des différents ARN dans la levure bourgeonnante S.cerevisiae et les humains. Nous combinons des approches protéomiques, biochimiques et computationnelles pour construire une image dynamique des voies de maturation de l’ARN dans différents contextes cellulaires et organismes pour obtenir des informations importantes sur la façon dont la maturation des ARN est liée à d’autres processus cellulaires, y compris les voies qui détectent et réparent les dommages à l’ADN, le développement et l’apparition de diverses maladies telles que la maladie d’Alzheimer et la SLA.
Affiliations et responsabilités
Affiliations de recherche
Enseignement et encadrement
Encadrement
Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)
Deciphering mRNP – nuclear pore interactions : study of basket protein dynamics in budding yeast
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Uncovering parallel ribosome biogenesis pathways during pre-60S subunit maturation
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Projets
Projets de recherche
Determining the role of the nuclear basket protein Mlp1/TPR in mRNA homeostasis
Determining spatial arrangement, stoichiometry, and substrate specificity of messenger RNA-binding proteins along the gene expression pathway.
Determining spatial arrangement, stoichiometry, and substrate specificity of messenger RNA-binding proteins along the gene expression pathway.
Nuclear Transport Meeting 2022
Determining the pathways, components and functional niches that define specialized ribosomes.
DETERMINING THE MOLECULAR MECHANISMS OF RIBOSOMAL EXPORT THROUGH THE NUCLEAR PORE
Supplément COVID-19 CRSNG_Determining spatial arrangement, stoichiometry, and substrate specificity of messenger RNA-binding proteins along the gene expression pathway.
Disséquer les mécanismes et les composants qui définissent la fonction différentielle des ribosomes dans l’ homéostasie cellulaire
Host factors involved in polyomavirus genome replication
HOST FACTORS INVOLVED IN POLYOMAVIRUS GENOME REPLICATION
THE ROLES OF MBNL PROTEINS IN THE PATHOGENESIS OF MYOTONIC DYSTROPHY
Proteomic and transcriptomic profiling of paraspeckle function in healthy and LAS model neuronal cells
DISSECTING THE DYNAMICS OF LARGE RIBONUCLEOPROTEIN COMPLEX MATURATION
DISSECTING THE DYNAMICS OF LARGE RIBONUCLEOPROTEIN COMPLEX MATURATION
INTERACTIONS BETWEEN RIBOSOME BIOGENESIS AND REGULATORY NETWORKS OF CELL DIVISION IN EUKARYOTIC CELLS
Training program in cellular dynamics of macromolecular complexes
DISSECTING THE DYNAMICS OF LARGE RIBONUCLEOPROTEIN COMPLEX MATURATION
LA MATURATION DYNAMIQUE DES COMPLEXES DES PROTEINES RIBONUCLEIQUES
LA MATURATION DYNAMIQUE DES COMPLEXES DES PROTEINES RIBONUCLEIQUES
LA MATURATION DYNAMIQUE DES COMPLEXES DES PROTÉINES RIBONUCLÉIQUES
INTERACTIONS BETWEEN RIBOSOME BIOGENESIS AND REGULATORY NETWORKS OF CELL DIVISION IN EUKARYOTIC CELLS
Rayonnement
Publications et communications
Publications
- Lessard F, Igelmann S, Trahan C, Huot G, Saint-Germain E, Mignacca L, Del Toro N, Lopes-Paciencia S, Le Calvé B, Montero M, Deschênes-Simard X, Bury M, Moiseeva O, Rowell MC, Zorca CE, Zenklusen D, Brakier-Gingras L, Bourdeau V, Oeffinger M and Ferbeyre G. (2018) Ribosome biogenesis defects in senescence reveal a novel checkpoint to control CDK4. Nat Cell Biology June 25.
- Scott DD, Trahan C, Zindy PJ, Aguilar LC, Delubac M, Van Nostrand EL, Adivarahan S, Wei KE, Zenklusen D, Yeo GW and Oeffinger M. (2017) Nol12 is a multifunctional endonuclease at the nexus of RNA and DNA metabolism. Acids Res. EPub Oct 23. doi: 10.1093/nar/gkx963.
- Trahan C and Oeffinger M. (2016) Targeted cross-linking-mass spectrometry determines vicinal interactomes within heterogeneous RNP complexes. Acids Res. Feb; 44(3): 1354-69.
- Burlacu E, Lackmann F, Aguilar LC, Berlikoc S, van Nues R, Trahan C, Hector RD, Whiteley ND, Cockroft SL, Wieslander L, Oeffinger M and Granneman S. (2017) High through-put RNA structure probing reveals critical folding events during early stages of ribosome biogenesis in yeast. Nat Comm. Sep 28;8(1):714.
- Oeffinger M and Montpetit B. (2015) Emerging properties of nuclear RNP biogenesis and export. Curr Opinion Cell Biol. – Special Issue Cell Nucleus June; (34): 46-53.
Disciplines
- Biochimie
- Biochimie médicale
- Génomique
- Biologie cellulaire
Champ d’expertise
- Mécanismes biologiques et biochimiques
- Protéomique
- Protéomique fonctionnelle et structurale
- Maladie d'Alzheimer
- Sclérose en plaques
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