Franz Bernd Lang
Génomique, bio-informatique et évolution
- Professeur titulaire
-
Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire
Roger-Gaudry, local H307-15
Portrait
Expertise de recherche
Thèmes
- Bactéries et champignons symbiotiques
- Génomes et évolution de gènes
- Bioinformatique, génomique, transcriptomique et protéomique
BACTÉRIES ET CHAMPIGNONS SYMBIOTIQUES
Les organismes multicellulaires comme les plantes et les animaux interagissent fréquemment avec des microbes symbiotiques. Ces derniers vont de bénéfiques à pathogènes et peuvent vivre dans les tissus, dans les cellules, ou au contact externe. Nous nous intéressons particulièrement aux symbiotes bénéfiques aux végétaux, afin de comprendre comment ils coopèrent avec leur hôte, au moyen du séquençage et de l’analyse de leurs génomes, transcriptomes et protéomes. Ce projet est d’une grande portée pour une agriculture durable - le remplacement des produits agro-chimiques par les bio-pesticides et les engrais minéraux par la bio-fertilisation.
GÉNOMES ET EVOLUTION DE GÈNES
Comprendre l'architecture du génome, le contenu en gènes et l'expression génique - dans un contexte évolutif - est à la base de la compréhension des organismes vivants. Nous nous intéressons à un large éventail de bactéries, champignons et eucaryotes unicellulaires, particulièrement les espèces symbiotiques des plantes, de même qu’aux eucaryotes primitifs nous permettant de retracer l'origine des eucaryotes. Notre approche par génomique comparative nous permet d'identifier régulièrement des mécanismes moléculaires innovants, tels l'édition d'ARN, l'épissage en trans, ou le saut de ribosome.
OUTILS BIO-INFORMATIQUES POUR L’ANALYSE DE GÉNOMES
Nous développons des stratégies/procédures/outils bio-informatiques pour l'assemblage de génomes, la reconnaissance de gènes, l'annotation fonctionnelle de génomes. Notre recherche est multidisciplinaire, et basée sur des collaborations nationales et internationales.
Prix et distinctions
- Société royale du Canada : Les Académies des arts, des lettres et des sciences du Canada 2015 - Société royale du Canada
Pour en savoir plus…
-
29-05-2015 Mitochondrie, l'étranger dans la maison
Des scientifiques, dont quatre professeurs de l'Université de Montréal, ont participé à un programme audio d'éducation citoyenne portant sur la mitochondrie. Diffusé sous forme de podcast, il comporte quatre épisodes de 20 mn environ.
- 08-09-2015 Quatre professeurs entrent à la Société royale du Canada
Affiliations et responsabilités
Affiliations de recherche
Enseignement et encadrement
Enseignement
Cours siglés (session en cours uniquement)
- BCM-3532 – Stage en laboratoire de recherche
- BCM-3533 – Stage en génétique et génomique
- BCM-3536 – Proposition de recherche en biochimie
- BIN-3005 – Stage en laboratoire de recherche
- BIN-3005 – Stage en laboratoire de recherche
Programmes
Encadrement
Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)
Séquençage des génomes nucléaires d’eucaryotes unicellulaires ‘primitifs’ : les jakobides
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Caractérisation moléculaire des micro-organismes endophytes de la canneberge (Vaccinium macrocarpon Ait.)
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Microbial endophytes and their interactions with cranberry plants
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Endophytes of commercial Cranberry cultivars that control fungal pathogens.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
An approach to improved microbial eukaryotic genome annotation
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Développement de méthodes d'assemblage de génomes de novo adaptées aux bactéries endosymbiotes
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
La RNase P mitochondriale chez Neurospora crassa
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Supercomplexes multifonctionnels chez les mitochondries, et chez E. coli
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Purification of mitochondrial RNase P in A. nidulans
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
A phylogenomics approach to resolving fungal evolution, and phylogenetic method development
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Une approche phylogénomique pour inférer l'évolution des eucaryotes
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Évolution structurale et fonctionnelle de la composante ARN de la RNase P mitochondriale
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
L'évolution de l'édition des ARN de transfert chez les jakobides
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Caractérisation structurale et fonctionnelle des ARNtm mitochondriaux de jakobides
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Projets
Projets de recherche
Enhanced eukaryotic genome annotation by exploiting advanced experimental and computational technologies
Mitochondrial translation systems that break the rules
Genomique de l'endosymbiose
MYCATOK PROJECT: INNOVATING CRANBERRY FARMING WITH BENEFICIAL SYMBIOTIC MICROBES
Drop-based microfluidics (DBM) for single cell studies and ultrahighthroughput phenotypic screens and lab evolution
Génomique comparative d’une lignée d’eucaryotes ancienne: les jakobides
Supplément COVID-19 CRSNG_Mitochondrial translation systems that break the rules
Prédiction automatique de modifications du code génétique et de l’ARN messager
Investigation of systematic errors in genome assembly algorithms
Genomique de l'endosymbiose
STRUCTURE AND EVOLUTION OF MITOCHONDRIAL RNASE P
EVOLUTION DES GENES D'ARN DE TRANSFERT A L'ECHELLE GENOMIQUE
CHAIRE DE RECHERCHE DU CANADA EN GENOMIQUE COMPARATIVE ET EVOLUTIVE
OPTIMISATION REPRODUCTIVE: LE ROLE DU GUIDAGE DES TUBES POLLINIQUES DANS LA PREVENTION DES CROISEMENTS INTERSPECIFIQUES ET LA SPECIATION CHEZ LES PLANTES
GENOREM IMPROVING BIOREMEDIATION OF POLLUTED SOILS THROUGH ENVIRONMENTAL GENOMICS
STRUCTURE AND EVOLUTION OF MITOCHONDRIAL RNASE P
A BIOFERTILIZER MANAGEMENT STRATEGY FOR SUSTAINABLE CRANBERRY PRODUCTION, USING BIOCHAR TOGETHER WITH BENEFICIAL MICROBES
DEVELOPING MYCORRHIZAL GENOMIC MARKERS TO ENHANCE INDUSTRIAL PRODUCTION AND FORMULATION
Rayonnement
Publications et communications
Publications
-
Lang BF, et al. , Burger G, Nosek J (2014). Massive programmed translational jumping in mitochondria. Proc Natl Acad Sci U S A. 111:5926-31
-
Burger G, Gray MW, Forget L, Lang BF (2013). A strikingly bacteria-like and gene-rich mitochondrial genome is a hallmark of jakobid protists. Genome Biol Evol 5:418
-
Derelle R and BF Lang (2011). Rooting the eukaryotic tree with mitochondrial and bacterial proteins. Mol Biol Evol 29:1277-1289.
https://scholar.google.ca/scholar?q=lang+bf
Disciplines
- Biochimie
- Génomique
- Génétique
- Bio-informatique
Champ d’expertise
- Acides nucléiques
- Cellule
- Chromosome (Organismes vivants)
- Enzymes et protéines
- Évolution et phylogénie
- Gène (Organismes vivants)
- Mécanismes biologiques et biochimiques
- Molécules bioactives
- Bactéries
- Génome
- Gènes
- Génomique
- Protéomique
Aide en ligne pour votre profil | Nous joindre
Le Répertoire des professeurs est propulsé par les données du SADVR et est un projet du CENR.