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Sciences de la santé; Sciences médicales

Rafaël Najmanovich

Professeur sous octroi agrégé

Faculté de médecine - Département de pharmacologie et physiologie

Pavillon Paul-G.-Desmarais, local 3147

514 343-6345

rafael.najmanovich@umontreal.ca

Professeur accrédité

Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire

Autre numéro : 514 343-6111 #3289 (Laboratoire)

Portrait

Expertise de recherche

La majorité des processus biochimiques et cellulaires impliquent des interactions entre protéines, acides nucléiques et petites molécules. Au plan moléculaire, ces interactions sont gouvernées par une balance délicate entre des effets entropiques et des forces moléculaires impliquant les groupements qui interagissent ensemble. Collectivement, ces forces moléculaires et ces effets entropiques peuvent être rassemblés sous le terme de la reconnaissance moléculaire (Leckband and Israelachvili, 2001). Afin de décrire les interactions moléculaires spécifiques qui ont lieu à l’intérieur d’une cellule, nous devons tenir compte de la « promiscuité de liaison » découlant du fait que l’environnement cellulaire contient une myriade de molécules pouvant interférer avec les interactions spécifiques. À cet égard, nous avons étudié la relation entre la structure et la fonction de sites de liaisons de plusieurs familles de protéines. Dans cette étude, nous avons observé que des protéines non homologues qui ont évolué vers une spécificité pour un même ligand ont des sites de liaisons différents. Nous croyons que cette divergence contribue à limiter la promiscuité de liaison et que l’étude de la promiscuité de liaison est essentielle à notre compréhension et à la prédiction de l’évolution de la fonction des protéines. De plus, la promiscuité de liaison joue un rôle critique en médecine. En effet, nous avons qu’à penser aux effets indésirables que peuvent causer des interactions non souhaitables entre les médicaments et des protéines autres que celles qui sont ciblées. Notre but est donc d’étudier les causes structurales, les mécanismes de contrôle et les conséquences de la promiscuité de liaison par l’intégration d’études structurales et de la biologie des systèmes. Nous serons alors en mesure de comprendre et de prédire la fonction des protéines et d’appliquer cette connaissance au développement de méthodologie innovatrice pour détecter, empêcher et exploiter la promiscuité de liaison dans le « design » et le développement rationnels de nouveaux médicaments. Par exemple, dans l’étude des protéines de la famille des sulfotransférases humaines, impliquées dans la régulation des hormones et des neurotransmetteurs ainsi que dans le métabolisme des drogues et autres molécules xénobiotiques.

Pour en savoir plus…

Affiliations et responsabilités

Projets

Projets de recherche

2019 - 2025

Development of an accessible integrated computational protein design software suite

Chercheur principal : Rafaël Najmanovich
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2018 - 2022

L’intégration de la pharmacologie structurale et numérique dans la conception de médicaments pour maladies d'expansion de trinucleotides.

Chercheur principal : Rafaël Najmanovich
Sources de financement : FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Senior
2019 - 2021

Désing moléculaire: petite molécules, protéines, leurs interactions et fonctions.

Chercheur principal : Rafaël Najmanovich
Sources de financement : FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds des leaders
2018 - 2021

Next-generation molecular docking leveraging artificial intelligence techniques to understand large-scale ligand binding datasets - Partenariat avec Génome Québec (175 000 $) et contribution de M. Tyers (75 000 $)

Chercheur principal : Rafaël Najmanovich
Sources de financement : Génome Québec , Génome Canada
Programmes de subvention : , PVXXXXXX-Projets de recherche en génomique à grande échelle et Plates-formes scientifiques tech.
2017 - 2020

Structural causes, control mechanisms and consequences of small-molecule protein binding promiscuity

Chercheur principal : Rafaël Najmanovich
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2017 - 2019

A versatile broad range microscale thermophoresis apparatus for the measurement of biomolecular interactions

Chercheur principal : Rafaël Najmanovich
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (OIR) -1 -(de 7 001 $ à 150 000 $)
2016 - 2018

L'intégration de la bioinformatique structurelle et la biologie des systèmes dans la recherche de nouvelles antibiotiques ciblant C. difficile

Chercheur principal : Rafaël Najmanovich
Sources de financement : FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Junior 2

Rayonnement

Publications et communications

Disciplines

  • Biochimie
  • Pharmacologie
  • Biochimie médicale
  • Biologie moléculaire
  • Médecine moléculaire

Champ d’expertise

  • Mécanismes biologiques et biochimiques
  • Génie des tissus structuraux / Biomatériaux
  • Protéines
  • Développement de vecteurs de transport des médicaments
  • Métabolisme des médicaments