Sciences naturelles et génie; Arts et lettres
François-Joseph Lapointe
Des mécanismes de l’évolution biologique (et de leur application au bioart)
- Professeur titulaire
-
Faculté des arts et des sciences - Département de sciences biologiques
Complexe des sciences, local B-6428
Autre numéro :
514 343-2293
(Télécopieur)
Autre courriel :
lapoinf@biol.umontreal.ca
(Travail)
Portrait
Expertise de recherche
Analyse phylogénétique, biostatistique, bioinformatique, phylogénomique, métagénomique, choréogénétique, microbiome humain, génétique des populations, réseaux complexes, théorie de l’évolution, espèces menacées, mammalogie, herpétologie, biologie de la conservation, bioart, art génétique, performance, art corporel, interdisciplinarité art/science, recherche-création
Biographie
François-Joseph Lapointe dirige le Laboratoire d’écologie moléculaire et d’évolution à l’Université de Montréal. Il est professeur titulaire au Département de sciences biologiques. Dans le cadre de ses recherches scientifiques, il s’intéresse à la phylogénétique, à la systématique, à la métagénomique ainsi qu’à la génétique des populations.
Auteur d’une centaine de publications en biologie de l’évolution, il a également développé plusieurs tests statistiques et algorithmes en bioinformatique. François-Joseph Lapointe a complété en 2012 un doctorat en études et pratiques des arts à l’Université du Québec à Montréal sous la supervision de Martine Époque. Dans le cadre de sa thèse intitulée « la choréogénétique, ou l’art de faire danser l’ADN » il a produit un algorithme génétique pour générer des chorégraphies in silico et il a créé Polymorphosum urbanum, une chorégraphie composée in vitro à partir des séquences génétiques de 30 danseurs. Pour sa pratique artistique, il s’inspire des modèles de la biologie moléculaire, de la génétique et de la génomique
Son plus récent projet en bioart consiste à séquencer son microbiome afin de générer des égoportraits métagénomiques. Il a reçu en 1990 la Médaille d’or académique du Gouverneur general, et en 1996 le Prize for Outstanding Research de l’International Federation of Classification Societies. Ses recherches sont notamment financées par le CRSNG, le CRSH, le FRQSC, le FRQNT et le Conseil des arts du Danemark.
Formation
- 1988 — B.Sc. — Biologie et autres sciences connexes — Université de Montréal
- 2012 — Ph.D. en Études et pratiques des arts — Arts visuels et médiatiques, Biologie et autres sciences connexes, Génétique — Université du Québec à Montréal
- 1992 — Ph.D. — Biologie et autres sciences connexes — Université de Montréal
Affiliations et responsabilités
Affiliations de recherche
Enseignement et encadrement
Enseignement
Cours siglés (session en cours uniquement)
Programmes
- 105010 – Baccalauréat en anthropologie
- 105020 – Majeure en anthropologie
- 123510 – Baccalauréat en sciences biologiques
- 123520 – Majeure en sciences biologiques
- 123540 – Mineure en sciences biologiques
- 146511 – Baccalauréat en biochimie et médecine moléculaire
- 146811 – Baccalauréat en bio-informatique
- 146811 – Baccalauréat en bio-informatique
- 150010 – Baccalauréat en microbiologie et immunologie
- 183412 – Baccalauréat en enseignement des mathématiques au secondaire
- 196710 – Programme d'accueil en sciences
- 202311 – DESS en environnement et développement durable
- 202312 – Maîtrise en environnement et développement durable (avec stage)
Encadrement
Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)
2024
Utilisations du microbiome en sciences judiciaires
Diplômé(e) : Leblanc, Audrey-Anne
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2021
Microbiome cutané et maladie fongique émergente du syndrome du museau blanc chez les chauves-souris d’Amérique du Nord
Diplômé(e) : Lemieux-Labonté, Virginie
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2021
La génétique au service de la conservation de la tortue des bois (Glyptemys insculpta)
Diplômé(e) : Bouchard, Cindy
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2017
Dynamique saisonnière du microbiome intestinal en réponse à la diète traditionnelle inuite
Diplômé(e) : Dubois, Geneviève
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2017
Une invasion dans la discrétion : répartition, origines et expansion des limaces européennes du complexe d'Arion subfuscus s.l. au Québec
Diplômé(e) : L'Heureux, Érik
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2015
Problème du paradigme dans l'approche écologique de l'individualité chez Turner : une solution méréologique inspirée de Dupré et O'Malley
Diplômé(e) : Hutter, Thiago
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M.A.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M.A.
2014
Phylogéographie comparée de la souris à pattes blanches et de la souris sylvestre, deux vecteurs de la maladie de Lyme au Québec
Diplômé(e) : Fiset, Jessica
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2010
Impact des polluants agricoles sur la génétique des populations d’une espèce sentinelle : le ouaouaron (Rana catesbeiana)
Diplômé(e) : Lefebvre, Isabelle
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2009
Chimères, données manquantes et congruence : validation de différentes méthodes par simulations et application à la phylogénie des mammifères
Diplômé(e) : Campbell, Véronique
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2009
Structure génétique de populations montréalaises de salamandres cendrées (Plethodon cinereus) et de salamandres à points bleus (Ambystoma laterale)
Diplômé(e) : Noël-Boissonneault, Sarah
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2008
La génétique au service de la conservation d'une espèce menacée endémique à Madagascar : la tortue radiée Astrochelys radiata
Diplômé(e) : Rioux Paquette, Sébastien
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2007
Confirmation génétique de la présence de couguars (Puma concolor) dans l'est du Canada
Diplômé(e) : Lang, Le Duing
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2006
Caractérisation de l'habitat d'une communauté de salamandres de ruisseaux comportant des hybrides
Diplômé(e) : Boutin, Anaïs
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2006
Fidélité au site comme mécanisme d'isolement reproducteur entre les membres sexués et asexués et entre les populations sympatriques du complexe Phoxinus eos-neogaeus
Diplômé(e) : Massicotte, Rachel
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2006
Utilisation de réseaux en analyse phylogénétique : détection de taxons hybrides et combinaison d'arbres
Diplômé(e) : Gauthier, Olivier
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2005
De la pertinence de la congruence globale en analyse phylogénétique
Diplômé(e) : Levasseur, Claudine
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2004
Coévolution des populations québécoises de cutérèbres (Cuterebra grisea et Cuterebra fontinella) et de souris du genre Peromyscus : la souris sylvestre (P. maniculatus) et la souris à pattes blanches (P. leucopus)
Diplômé(e) : Noël-Boissonneault, Sarah
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2002
Étude de la phylogénie et la biogéographie du genre Hoya (Asclepiadaceae) basée sur l'analyse de séquences d'ITS
Diplômé(e) : Lemay, Anne-Marie
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2001
Effets de la configuration du paysage sur la variabilité génétique de populations de souris sylvestres (Peromyscus maniculatus: Rodentia, Muridae)
Diplômé(e) : Landry, Pierre-Alexandre
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2001
Phylogénie des wallabies des rochers, Petrogale (Marsupialia : Macropodidae), par hybridation ADN/ADN
Diplômé(e) : Campeau-Péloquin, Antoine
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
1999
Détermination de l'origine des populations québécoises d'Echinochloa crus-galli (L.) Beauv. à l'aide de marqueurs RAPD et de séquences d'ADN
Diplômé(e) : Roy, Sophie
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Projets
Projets de recherche
2023
- 2027
Gisants, transis, charogne et putréfaction : l’art du cadavre en milieu naturel
Chercheur principal :
François-Joseph Lapointe
Sources de financement :
FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(RC) Appui à la recherche-création - Volet Individuel
2021
- 2027
Statistical analysis of microbiome longitudinal data with multiplex networks
Chercheur principal :
François-Joseph Lapointe
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2020
- 2026
Les cybryontes et l'anthropocène: Des conditions de possibilité de nouvelles symbioses
Sources de financement :
CRSH/Conseil de recherches en sciences humaines du Canada
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Subvention Savoir
2021
- 2025
Vers la quatrième nature: études pour un jardin semi-vivant
Chercheur principal :
Thierry Bardini
Co-chercheurs :
François-Joseph Lapointe
Sources de financement :
FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(RC) Appui à la recherche-création - Volet Équipe
2020
- 2025
Regard interdisciplinaire, intersectoriel et intersectionnel sur les violences faites aux femmes et aux filles
Chercheur principal :
Marie-Marthe Cousineau
Co-chercheurs :
François-Joseph Lapointe
,
Bilkis Vissandjée
,
Dominique Damant
,
Carolina Bottari
,
Vardit Ravitsky
,
Catherine Richardson
,
Estibaliz Jimenez
,
Mylène Fernet
,
Rachel Chagnon
,
Isabelle Marchand
,
Sylvie Lévesque
,
Sylvie Genest
,
Catherine Flynn
,
Jeanne-Marie Rugira
,
ROXANNE GUYON
Sources de financement :
FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(SE) Programme Soutien aux équipes de recherche - Stade de développement : Nouvelle équipe
2019
- 2024
Chaire McConnell - Université de Montréal en recherche-création
Chercheur principal :
François-Joseph Lapointe
Sources de financement :
CRSH/Conseil de recherches en sciences humaines du Canada
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-FGR – Subvention de recherche institutionnelle
2019
- 2023
La maternité comme dispositif : enjeux philosophiques et artistiques
Chercheur principal :
François-Joseph Lapointe
Sources de financement :
FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(RC) Appui à la recherche-création - Volet Individuel
2021
- 2022
Ordinaire de nature
Chercheur principal :
Antoine C Dussault
Co-chercheurs :
François-Joseph Lapointe
Sources de financement :
Pôle lavallois d'enseignement supérieur en arts numériques et économie créative
Programmes de subvention :
2020
- 2022
La grossesse en confinement
Chercheur principal :
François-Joseph Lapointe
Sources de financement :
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Projets spéciaux - Conférences - Congrès - Colloques
2018
- 2022
Quand les bactéries font la loi - enjeux scientifiques, philosophiques, éthiques, politiques et légaux de l'utilisation du microbiome à des fins d'identification judiciaire
Chercheur principal :
François-Joseph Lapointe
Sources de financement :
FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-AUDACE (financement partagé entre les fonds de recherche du Québec)
2015
- 2022
A STATISTICAL FRAMEWORK FOR THE EVALUATION AND COMPARISON OF COMPLEX NETWORKS AND ITS APPLICATION TO MICROBIOME RESEARCH
Chercheur principal :
François-Joseph Lapointe
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2016
- 2020
La conduite responsable en recherche-création : Outiller de façon créative pour répondre aux enjeux d’une pratique en effervescence
Chercheur principal :
Bryn Williams-Jones
Sources de financement :
FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(AC) Actions concertées - générique
Description
La recherche-création (RC) est un domaine émergent à l’interface de la recherche universitaire et des activités créatrices et est définie par les Fonds de recherche du Québec (FRQ) comme « les activités ou démarches de recherche favorisant la création ou l’interprétation d’œuvres littéraires ou artistiques de quelque type que ce soit ». Les chercheurs de ce domaine hétérogène doivent donc satisfaire à des exigences de double expertise qui peuvent parfois entrer en conflit. En conséquence, le chercheur-créateur rencontre dans sa pratique des défis différents du reste du monde universitaire. Actuellement, la façon dont la communauté de RC éprouve des difficultés liés à la conduite responsable en recherche (CRR) et comment cette communauté peut répondre aux lignes directrices et politiques institutionnelles de CRR reste à déterminer.
Les résultats de cette étude internationale – financée dans le cadre d’une Action concertée des FRQ – permettront à la fois d’identifier d’identifier les enjeux et défis de CRR spécifiques à la RC, de mettre en relief les perceptions qu’ont les chercheurs-créateurs concernant ces enjeux et l’application des principes de la CRR et d’identifier les besoins et les lacunes des politiques existantes (institutionnelles et nationales) pour favoriser l’éducation et la sensibilisation de la CRR en RC. Le projet culminera par le lancement en 2018 d’une série d’outils en ligne destinés tant à la communauté de RC qu’aux acteurs les soutenant tels que les directions de la conduite responsable en recherche des universités, les membres des comités d’éthique et les organismes subventionnaires.
2014
- 2020
CENTRE DE LA SCIENCE DE LA BIODIVERSITE DU QUEBEC (CSBQ)
Chercheur principal :
François-Joseph Lapointe
Co-chercheurs :
Andrew Gonzalez
Sources de financement :
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques
2017
- 2019
Workshop on the responsible conduct in research-creation: involving the research community to develop practical training tools
Chercheur principal :
Bryn Williams-Jones
Sources de financement :
CRSH/Conseil de recherches en sciences humaines du Canada
Programmes de subvention :
PV152160-Subvention Connexion
2015
- 2019
De la transformation du microbiome humain comme pratique expérimentale du bioart
Chercheur principal :
François-Joseph Lapointe
Sources de financement :
FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(RC) Appui à la recherche-création - Volet Individuel
2017
- 2018
Organisation d'un atelier en novembre 2017 sur la conduite responsable dans la recherche-création
Chercheur principal :
Bryn Williams-Jones
Co-chercheurs :
François-Joseph Lapointe
Sources de financement :
FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Subvention générale et projets spéciaux (non partageable au prorata)
2015
- 2017
Réseaux phylogénétiques et leurs applications pratiques en évolution, biogéographie et sciences biomédicales
Chercheur principal :
Vladimir Makarenkov
Co-chercheurs :
François-Joseph Lapointe
Sources de financement :
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention :
PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2014
- 2016
STATISTICAL ASSESSMENT OF COMPLEX AND LARGE NETWORKS DERIVED FROM (META)GENOMIIC DATA
Chercheur principal :
François-Joseph Lapointe
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2013
- 2016
Réseaux phylogénétiques et leurs applications pratiques en évolution, biogéographie et sciences biomédicales
Chercheur principal :
Vladimir Makarenkov
Sources de financement :
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention :
PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2013
- 2016
LA FIGURE DE L'AUTOPORTRAIT METAGENOMIQUE EN MOUVEMENT
Chercheur principal :
François-Joseph Lapointe
Sources de financement :
CRSH/Conseil de recherches en sciences humaines du Canada
Programmes de subvention :
PV153480-Subventions de développement Savoir
2013
- 2015
AUTOPORTRAIT D'UN METAGENOME
Chercheur principal :
François-Joseph Lapointe
Sources de financement :
CRSH/Conseil de recherches en sciences humaines du Canada
Programmes de subvention :
PVX20020-Subvention institutionnelle du CRSH - Petites subventions
1994
- 2015
SEEING THE (SUPER)TREES THROUGH THE PHYLOGENOMIC FOREST
Chercheur principal :
François-Joseph Lapointe
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2011
- 2014
INTERACTIONS ENTRE LES ESPECES DE PETIS MAMMIFERES, LES PARASITES ET LA STRUCTURE DU PAYSAGE, ET CONSEQUENCES SUR L'EMERGENCE DE LA MALADIE DE LYME AU QUEBEC
Chercheur principal :
Virginie Millien
Sources de financement :
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention :
PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2010
- 2014
CENTRE DE LA SCIENCE DE LA BIODIVERSITE DU QUEBEC
Chercheur principal :
François-Joseph Lapointe
Co-chercheurs :
Andrew Gonzalez
Sources de financement :
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques
2009
- 2013
Seeing the (Super) trees throught the phylogenomic forest
Chercheur principal :
François-Joseph Lapointe
Rayonnement
Publications et communications
Disciplines
- Biologie et autres sciences connexes
- Arts visuels et médiatiques
Champ d’expertise
- Analyse statistique multivariable
- Biodiversité
- Bioinformatique
- Biostatistique
- Choréogénétique
- Conservation
- Diversité génétique
- Écologie moléculaire
- Évolution
- Évolution réticulée
- Génétique des populations
- Herpétologie
- Hybridation
- Hybride
- Mammalogie
- Phylogénétique
- Phylogénomique
- Phylogéographie
- Systématique moléculaire
- Transfert horizontal
- Recherche-création
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