L'immunothérapie du cancer par blocage de récepteurs inhibiteurs révolutionne l'oncologie clinique. Cependant, on ne sait toujours pas pourquoi seul un sous-groupe de patients présente des réponses cliniques durables et de nouvelles méthodes et technologies sont nécessaires pour améliorer l'efficacité de ce type d’immunothérapie. En tant que chercheur principal au Centre de recherche du CHU Sainte-Justine, l'objectif principal de notre équipe de recherche est de développer et d'appliquer la spectrométrie de masse de nouvelle génération (SWATH ou acquisition indépendante des données) pour faire progresser le domaine de l’immunothérapie du cancer. Nous utilisons particulièrement des méthodes ultraperformantes de protéomique, d’immunopeptidomique et de spectrométrie de masse computationnelle afin de mieux comprendre les mécanismes de la résistance tumorale face à ce type d’immunothérapie. En collaboration avec des cliniciens chercheurs, nous nous intéressons également à identifier 1) des biomarqueurs protéiques de la réponse et de la rechute au traitement, et 2) de nouvelles formes de néo-antigènes spécifiques à la tumeur afin de concevoir des vaccins anticancéreux innovants pour chacun des patients réfractaires. Enfin, nous sommes co-fondateurs du projet international Human Immuno-Peptidome (https://www.hupo.org/Human-Immuno-Peptidome-Project) et nous développons le projet SysteMHC Atlas (https://systemhcatlas.org/) pour rendre accessible à la communauté un domaine émergent axé sur le "Big Immuno-Peptidomic Data". Notre programme de recherche multidisciplinaire est de nature hautement collaborative et nous visons à avoir un impact significatif sur le traitement des patients dans le monde entier.

Étienne Caron a fait son PhD dans le laboratoire de Claude Perreault à l’Université de Montréal. En combinant la spectrométrie de masse et la biologie computationnelle à une solide formation en immunologie fondamentale, il a pu élucider de nouveaux mécanismes régulant la présentation des antigènes par les molécules du CMH. Son doctorat a été soutenu par les IRSC et le FRQS et a mené à la publication de 10 articles au total. Étienne a ensuite poursuivi sa formation dans le laboratoire de Luis Serrano en Espagne, expert en biologie des systèmes du cancer, puis dans le laboratoire de Ruedi Aebersold en Suisse, un leader mondial et pionnier de la protéomique et de la spectrométrie de masse. Étienne a développé non seulement une expertise approfondie dans le développement de nouvelles approches de spectrométrie de masse pour étudier la complexité de l’immunopeptidome humain, mais est également devenu un leader mondial dans la création et la présidence du "Human Immuno-Peptidome Project", une initiative internationale réunissant des leaders mondiaux en spectrométrie de masse et immunologie. Ses travaux ont abouti à la publication de 14 articles dans des revues à fort impact (notamment Immunity, eLife, Cell Rep, Nucleic Acids Res, Nature). Soutenu par les plus prestigieuses bourses européennes (EMBO et Marie Curie), le travail postdoctoral d’Etienne constitue le fondement de son programme de recherche actuel. En tant que chercheur principal au Centre de recherche CHU Sainte-Justine, l’objectif de son laboratoire  est d’avoir un impact significatif dans le domaine de l’immunothérapie du cancer et ce, en développant des approches innovantes de spectrométrie de masse pour étudier le protéome et l’immunopeptidome de cellules cancéreuses et immunitaires dans différents types de cancer, particulièrement dans le mélanome et la leucémie myéloïde aiguë.

• Poste de boursier postdoctoral - informatique en spectrométrie de masse

• Schuster H, Shao W, Weiss T, Pedrioli P, Roth P, Weller M, Campbell DS, Deutsch EW, Moritz RL, Rammensee HG, Aebersold R*, Caron E*. A tissue-based draft map of the murine MHC class I immunopeptidome. Sci. Data. 2018, 5:180157. *Co-corresponding author
• Shao W, Pedrioli P, Wolski W, Scurtescu C, Schmid E, Vizcaino JA, Courcelles M, Schuster H, Kowalewski D, Marino F, Arlehamn CSL, Vaughan K, Peters B, Sette A, Ottenhoff THM, Meijgaarden KE, Nieuwenhuizen N, Kaufmann SHE, Schlapbach R, Castle JC, Nesvizhskii AI, Nielsen M, Deutsch EW, Campbell DS, Moritz RL, Zubarev RA, Ytterberg AJ, Purcell AW, Marcilla M, Paradela A, Wang Q, Costello CE, Ternette N, van Veelen PA, van Els CACM, Heck AJR, de Souza GA, Sollid LM, Admon A, Stevanovic S, Rammensee HG, Thibault P, Perreault C, Bassani-Sternberg M, Aebersold R*, and Caron E*. The SysteMHC Atlas project. Nucleic Acids Res. 2018, 46(D1):D1237-D1247.*Co-corresponding author
• Caron E^¶*, Aebersold R, Banaei-Esfahani A, Chong C, Bassani-Sternberg M*. A Case for a Human Immuno-Peptidome Project Consortium. Immunity. 2017, 47:203-208. ^¶Lead contact, *Co-corresponding author
• Caron E*, Roncagalli R*, Takeshi H, Wolski WE, Meena C, Menoita MG, Durand S, Garcia-Blesa A, Fierro-Monti I, Sajic T, Heusel M, Weiss T, Malissen M, Schlapbach R, Collins B, Ghosh S, Kitano H, Aebersold R, Malissen B, Gstaiger M. Precise temporal profiling of protein signaling complexes in primary cells using SWATH mass spectrometry. Cell Rep. 2017, 18:3219-3226. *Co-first author
• Caron E*, Espona L, Kowalewski D, Schuster H, Ternette N, Alpízar A, Schittenhelm RB, Lindestam CSA, Koh CC, Gillet L, Rabsteyn A, Sturm T, Navarro P, Kim S, Lam H, Marcilla M, Sette A, Campbell DS, Deutsch EW, Moritz RL, Purcell AW, Rammensee HG, Stevanovic S, Aebersold R*. An open-source computational and data resource to analyze quantitative digital maps of immunopeptidomes. eLife. 2015, 4:e07661.*Co-corresponding author
• Gubin MM, Zhang X, Schuster H, Caron E, Noguchi T, Ward JP, Ivanova Y, Hundal J, Arthur CD, Krebber WJ, Mulder GE, Vesely MD, Lam SSK, Korman AJ, Allison JP, Freeman GJ, Sharpe AH, Pearce EL, Aebersold R, Rammensee HG, Melief CJM, Mardis ER, Gillanders WE, Artyomov MN, Schreiber RD. Checkpoint blockade cancer immunotherapy targets tumour-specific mutant antigens. Nature. 2014, 515:577-581.
• Caron E*, Vincent K*, Fortier MH*, Laverdure JP, Bramoullé A, Hardy MP, Voisin G, Roux PP, Lemieux S, Thibault P, Perreault C. The MHC class I immunopeptidome conveys to the cell surface an integrative view of cellular regulation. Mol. Syst. Biol. 2011, 7:753. *Co-first author
• Caron E, Ghosh S, Matsuoka Y, Ashton-Beaucage D, Therrien M, Lemieux S, Perreault C, Roux PP, Kitano H. A comprehensive map of the mTOR signaling network. Mol. Syst. Biol. 2010, 6:453.
• Fortier MH*, Caron E*, Hardy MP, Voisin G, Lemieux S, Perreault C, Thibault P. The MHC class I peptide repertoire is molded by the transcriptome. J. Exp. Med. 2008, 205:595-610. *Co-first author

• Yale University, Immunobiology, New Haven, USA, 2018/06.  
• Centre d’Immunologie de Marseille-Luminy, Marseille, France, 2018/05.             
• The Scripps Research Institute, La Jolla, USA, 2018/03.            
• University of Chicago, Institute of Molecular Engineering, Chicago, USA, 2018/02.           
• Duke University, Immunology, Durham, USA, 2018/01.