Sciences de la santé; Sciences médicales
Brian Wilhelm
Génomique à haut débit
Autre numéro :
514 343-6111 #0923
(Travail 1)
Autre courriel :
brian.wilhelm@umontreal.ca
(Travail)
Portrait
Expertise de recherche
La régulation transcriptionnelle est un processus complexe qui exige le recrutement de l’ARN polymérase vers les sites dirigés de transcription, la modification de la structure locale de la chromatine et l’épissage des nouveaux transcrits. Une interruption de la coordination de ce processus, comme la transcription erronée qui active de façon inappropriée des gènes qui modifient le comportement normal des cellules, peut favoriser l’apparition d’un cancer. Dans le but de comprendre clairement la nature de cette anomalie, il est souvent nécessaire d’avoir un aperçu global du système.
Notre équipe de recherche s’intéresse actuellement à l’utilisation des technologies d’avant-garde, à haut débit, comme les biopuces à ADN et le séquençage d’ADN de nouvelle génération afin d’élucider les connexions sous-jacentes à l’activité transcriptionnelle et au comportement des cellules. Pour comprendre ce phénomène dans le contexte de la biologie du cancer, nous utilisons actuellement ces approches pour caractériser les échantillons de patients atteints de la leucémie myéloïde aiguë (LMA) dans le but d’identifier les mutations qui favorisent l’apparition de la maladie. De plus, nous utilisons la levure à fission (Schizosaccharomyces pombe) comme système modèle pour étudier le recrutement de l’ARN polymérase II et son comportement pendant la transcription. Le fait de mieux comprendre la machinerie moléculaire qui est à la base de ces processus nous permettra ultimement de mettre au point de nouveaux médicaments pour traiter le cancer.
Biographie
Brian Wilhelm obtient son diplôme de doctorat en génétique médicale du UBC au Terry Fox Laboratory de Vancouver, en 2003. Il poursuit une formation postdoctorale au Wellcome Trust Sanger Institute, au Royaume-Uni dans le labo du Dr Jurg Bahler, puis au sein du laboratoire du docteur Guy Sauvageau à l’IRIC.
En 2010, Brian Wilhelm a lancé son laboratoire, l’Unité de recherche en génomique à haut débit de l’Institut, et a débuté comme professeur au Département de médecine de l’Université de Montréal.
Affiliations et responsabilités
Affiliations de recherche
Unités de recherche
Membre
Enseignement et encadrement
Enseignement
Cours siglés (session en cours uniquement)
- BIM7021A – Conférences en biologie du cancer 1
- BIM7021B – Conférences en biologie du cancer 2
- BIM7021C – Conférences en biologie du cancer 3
- BIM7021D – Conférences en biologie du cancer 4
Programmes
Encadrement
Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)
2021
Analyse épigénétique intégrative pour identifier de nouveaux biomarqueurs dans la leucémie myéloïde aiguë causée par des translocations chromosomiques de type KMT2A
Diplômé(e) : Milan, Thomas
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2021
The consequences of CCL23/CCR1 axis signaling in KMT2A-MLLT3 acute myeloid leukemia
Diplômé(e) : Merjaneh, Shahem
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2014
Caractérisation moléculaire d’un récent modèle d’étude de la leucémie myéloïde aigüe à caryotype normal :la lignée cellulaire CG-SH
Diplômé(e) : Gosse, Géraldine
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Projets
Projets de recherche
2024
- 2026
Establishing an optimized protocol for introducing mRNA CRISPR constructs into primary human cells
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Subventions Alliance - International Catalyseur
2023
- 2026
Modélisation in vitro des mutations leucémiques associées au vieillissement et de leurs interactions microenvironnementales
Chercheur principal :
David Knapp
Co-chercheurs :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(FQ) Programme Samuel-De Champlain (volet Recherche)
2020
- 2026
The impact of genetic variation on genome biology and function
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2024
- 2025
Uncovering the molecular and genetic mechanisms of drug resistance in leukemia
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Co-chercheurs :
Sonia Cellot
Sources de financement :
Richard and Edith Strauss Canadian Foundation
Programmes de subvention :
2022
- 2025
Development of novel targeted therapies and diagnostic tools for high risk pediatric leukemias
Chercheur principal :
Frédéric Barabé
Sources de financement :
Pfizer Canada Inc.
Programmes de subvention :
2022
- 2025
Development of novel targeted therapies and diagnostic tools for high risk pediatric leukemias
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
Ministère Économie et Innovation
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-SynergiQc (partenariat CQDM)
2022
- 2025
Development of novel targeted therapies and diagnostic tools for high risk pediatric leukemias
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Prog. soutien rech (PSR v1): Soutien à des projets de recherche
2022
- 2025
Development of novel targeted therapies and diagnostic tools for high risk pediatric leukemias
Sources de financement :
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Oncopole SynergiQc (partenariat CQDM)
2022
- 2025
Development of novel targeted therapies and diagnostic tools for high risk pediatric leukemias
Sources de financement :
Médimabs
Programmes de subvention :
2022
- 2025
Development of novel targeted therapies and diagnostic tools for high risk pediatric leukemias
Sources de financement :
IRICoR
Programmes de subvention :
2021
- 2024
Using chemogenomic data to improve ML-based drug prediction
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention :
2021
- 2024
Using chemogenomic data to improve ML-based drug prediction
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Co-chercheurs :
Rafaël Najmanovich
Sources de financement :
Génome Québec
Programmes de subvention :
2021
- 2023
Development of single-cell sequencing based method for mAb identification and validation
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Subventions Alliance
2021
- 2023
Development of single-cell sequencing based method for mAb identification and validation
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
Médimabs
Programmes de subvention :
2017
- 2023
Systematic studies of human models of acute myeloide leukemia: establishing a pipeline for novel targeted therapeutics
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Programmes de subvention :
2017
- 2023
Systematic studies of human models of acute myeloide leukemia: establishing a pipeline for novel targeted therapeutics
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Subventions de recherche en partenariat
2022
Development of sc-RNA based methods for mAb identification and validation
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
MITACS Inc.
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Stage Accélération Québec - MITACS
2018
- 2022
MARATHON OF HOPE CANCER CENTRES NETWORK PILOT : THE MONTREAL CANCER CONSORTIUM AGREEMENT
Chercheur principal :
Claude Perreault
Sources de financement :
Terry Fox Research Institute
Programmes de subvention :
2018
- 2022
Établissement d'un pipeline de criblage chimiogénomique pour les leucémies pédiatriques à haut risque
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Co-chercheurs :
Guy Sauvageau
,
Sébastien Lemieux
,
Anne Marinier
,
Josée Hébert
,
Michael David Tyers
,
Sonia Cellot
,
Frédéric Barabé
,
Kolja Eppert
Sources de financement :
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Oncopole EMC2 (Équipes multidisciplinaires contre le cancer)
2018
- 2022
Établissement d'un pipeline de criblage chimiogénomique pour les leucémies pédiatriques à haut risque
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Co-chercheurs :
Guy Sauvageau
,
Sébastien Lemieux
,
Anne Marinier
,
Josée Hébert
,
Michael David Tyers
,
Sonia Cellot
,
Frédéric Barabé
,
Kolja Eppert
Sources de financement :
IRICoR
Programmes de subvention :
PV143493-(RCE) Réseaux de centres d'excellence
2021
Development of sc-RNA based methods for mAb identification and validation - Year two
Sources de financement :
MITACS Inc.
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Stage Élévation Québec - MITACS
2018
- 2021
Towards a better risk-adapted therapy in young adults with acute myeloid leukemia
Chercheur principal :
Josée Hébert
Sources de financement :
SRC/Société de recherche sur le cancer
Programmes de subvention :
2018
- 2021
Towards a better risk-adapted therapy in young adults with acute myeloid leukemia
Chercheur principal :
Josée Hébert
Sources de financement :
IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Programmes de subvention :
2018
- 2021
Towards a better risk-adapted therapy in young adults with acute myeloid leukemia
Sources de financement :
IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Programmes de subvention :
2018
- 2021
Towards a better risk-adapted therapy in young adults with acute myeloid leukemia
Chercheur principal :
Josée Hébert
Sources de financement :
(16631)Société canadienne du cancer (16631)
,
COLE Foundation/Fondation Cole
Programmes de subvention :
,
2013
- 2021
MECHANISMS FOR ESTABLISHMENT AND MAINTENANCE OF ALLELE SPECIFIC EXPRESSION OF GATA2
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2020
Development of sc-RNA based methods for mAb identification and validation
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
MITACS Inc.
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Stage Élévation Québec - MITACS
2016
- 2020
Identification de nouveaux mécanismes moléculaires impliqués dans les leucémies myéloïde aigüe en pédiatrie
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Junior 2
2015
- 2020
UNE APPROCHE CHIMIO- ET PROTEO-GENOMIQUE EN MEDECINE PERSONNALISEE POUR LA LEUCEMIE MYELOIDE AIGUE
Chercheur principal :
Guy Sauvageau
Co-chercheurs :
Claude Perreault
,
Stephen Hanessian
,
Michel Bouvier
,
Trang Hoang
,
François Major
,
Denis-Claude Roy
,
Louis Gaboury
,
Sylvie Mader
,
Sylvain Meloche
,
Marc Therrien
,
Pierre Thibault
,
Katherine Borden
,
Jean-Claude Labbé
,
Alain Verreault
,
Julie Lessard
,
Jean Roy
,
Martine Raymond
,
Vincent Archambault
,
Sébastien Lemieux
,
Anne Marinier
,
Jean-Sébastien Delisle
,
Brian Wilhelm
,
Damien D'Amours
,
Philippe P. Roux
,
Josée Hébert
,
Julie Bergeron
,
Léa Harrington
,
Michael David Tyers
,
Grégoire Leclair
Sources de financement :
FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Fonds d'innovation
2018
Machine Learning & Biological Systems
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Subventions Connexion
2017
- 2018
Microfluidic detection of leukemia cells by electronic biomolecular sensors
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Co-chercheurs :
Delphine Bouilly
Sources de financement :
LLS Canada/Leukemia and Lymphoma Society of Canada (The)
Programmes de subvention :
PVXX1862-Subvention de fonctionnement
2017
Optimization of screening procedures for monoclonal antibodies directed against membrane bound proteins
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PV128974-(EGP) Programme de subvention d'engagement partenarial
2015
- 2017
TRANSCRIPTIONAL AND EPIGENETIC CONSEQUENCES OF MLL-AF9 TRANSLOCATIONS
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
Terry Fox Research Institute
,
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
,
COLE Foundation/Fondation Cole
Programmes de subvention :
,
PVXXXXXX-Établissement de jeunes chercheurs Juniors 1
,
PVXXXXXX-Subvention d'équipe: programme nouvelles frontières Terry Fox en cancérologie
2013
- 2017
INNOVATIVE CHEMOGENOMIC TOOLS TO IMPROVE OUTCOME IN ACUTE MYELOID LEUKEMIA
Chercheur principal :
Guy Sauvageau
Co-chercheurs :
Michel Bouvier
,
Sébastien Lemieux
,
Anne Marinier
,
Brian Wilhelm
,
Josée Hébert
,
Alejandro Murua
,
Denise Avard
,
Yann Joly
,
Ma'n Hilmi Mohammad Zawati
,
Frédéric Barabé
Sources de financement :
Génome Canada
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Projets de recherche en génomique à grande échelle et Plates-formes scientifiques tech.
2013
- 2017
INNOVATIVE CHEMOGENOMIC TOOLS TO IMPROVE OUTCOME IN ACUTE MYELOID LEUKEMIA
Co-chercheurs :
Michel Bouvier
,
Sébastien Lemieux
,
Anne Marinier
,
Brian Wilhelm
,
Alejandro Murua
,
Denise Avard
,
Yann Joly
,
Ma'n Hilmi Mohammad Zawati
,
Frédéric Barabé
Sources de financement :
Génome Canada
,
Génome Québec
Programmes de subvention :
,
2013
- 2017
INNOVATIVE CHEMOGENOMIC TOOLS TO IMPROVE OUTCOME IN IN ACUTE MYELOID LEUKEMIA
Chercheur principal :
Guy Sauvageau
Co-chercheurs :
Michel Bouvier
,
Sébastien Lemieux
,
Anne Marinier
,
Brian Wilhelm
,
Josée Hébert
,
Alejandro Murua
,
Denise Avard
,
Yann Joly
,
Ma'n Hilmi Mohammad Zawati
,
Frédéric Barabé
Sources de financement :
Génome Québec
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Projets de recherche en génomique à grande échelle et Plates-formes scientifiques tech.
2013
- 2016
FUNCTIONAL ANALYSIS OF TRANSCRIPTIONAL NETWORKS IN MLL-AF9 PEDIATRIC LEUKEMIA
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
SRC/Société de recherche sur le cancer
Programmes de subvention :
PVX12154-Subvention de fonctionnement
2012
- 2016
IDENTIFICATION DE NOUVEAUX MECANISMES MOLECULAIRES IMPLIQUES DANS LES LEUCEMIES MYELOIDE AIGUE EN PEDIATRIE
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Junior 1
2013
- 2015
ROLE AND BIOLOGY OF MLL FUSION GENES IN HUMAN LEUKEMIAS.
Chercheur principal :
Frédéric Barabé
Co-chercheurs :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
LLS Canada/Leukemia and Lymphoma Society of Canada (The)
Programmes de subvention :
2012
- 2015
IDENTIFICATION DE NOUVEAUX MECANISMES MOLECULAIRES IMPLIQUES DANS LES LEUCEMIES MYELOIDE AIGUE EN PEDIATRIE
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-Établissement de jeunes chercheurs Juniors 1
2011
- 2015
RESEAU POUR LES ETUDES THERAPEUTIQUES ET GENETIQUES DES CELLULES SOUCHES-STEMNET / NOVEL STRATEGIES TO EXPAND HUMAN HEMATOPOIETIC STEM CELL POPULATIONS FOR CLINICAL USE
Chercheur principal :
Guy Sauvageau
Co-chercheurs :
Denis-Claude Roy
,
Pierre Thibault
,
Brian Wilhelm
,
Sandra Cohen
,
Keith Humphries
,
Connie Eaves
,
Peter Zandstra
,
Donna Hogge
,
James Piret
,
Marco Marra
,
Carl Hansen
,
Mick Bhatia
,
Norman Iscove
,
Frédéric Barabé
Sources de financement :
Secrétariat Inter-Conseil et Réseaux des centres d'excellence (RCE)
Programmes de subvention :
PV143493-(RCE) Réseaux de centres d'excellence
2012
- 2014
IMPROVED ASSIGNMENT TO BEST AVAILABLE THERAPY FOR PATIENTS WITH MYELODYSPLASIA AND ACUTE MYELOID LEUKEMIA
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
Terry Fox Research Institute
Programmes de subvention :
2012
- 2014
IMPROVED ASSIGMENT TO BEST AVAILABLE THERAPY FOR PATIENTS WITH MYELODYSPLASIA AND ACUTE MYELOID LEUKEMIA
Chercheur principal :
Guy Sauvageau
Sources de financement :
Terry Fox Research Institute
Programmes de subvention :
2011
- 2013
ESTABLISHMENT OF DR. B WILHELM LAB TO DISCOVER NOVEL AND RECURRENT MUTATIONS IN ACUTE MYELOID LEUKEMIA
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Sources de financement :
FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention :
2010
- 2013
LE PROJET LEUCEGENE : SEQUENCAGE DU TRANSCRIPTOME POUR L'IDENTIFICATION DE NOUVEAUX MARQUEURS PRONOSTIQUES ET CIBLES THERAPEUTIQUES DANS LA LEUCEMIE MYELOIDE AIGUE
Chercheur principal :
Guy Sauvageau
Co-chercheurs :
Michel Bouvier
,
Sébastien Lemieux
,
Brian Wilhelm
,
Josée Hébert
,
Denise Avard
,
Frédéric Barabé
Sources de financement :
Génome Québec
Programmes de subvention :
2011
MONBUG SYMPOSIUM/COLLOQUE DU RÉSEAU DE BIOINFORMATIQUE DE MONTRÉAL
Chercheur principal :
Brian Wilhelm
Rayonnement
Publications et communications
Publications
- Wilhelm BT, Briau M, Austin P, Faubert A, Boucher G, Chagnon P, Hope K, Girard S, Mayotte N, Landry JR, Hébert J, Sauvageau G. RNA-seq analysis of 2 closely related leukemia clones that differ in their self-renewal capacity. Blood. 2011 Jan 13;117(2):e27-38. Epub 2010 Oct 27. PubMed PMID: 20980679.
- Wilhelm BT, Marguerat S, Aligianni S, Codlin S, Watt S, Bähler J. Differential patterns of intronic and exonic DNA regions with respect to RNA polymerase II occupancy, nucleosome density and H3K36me3 marking in fission yeast. Genome Biol. 2011 Aug 22;12(8):R82. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 21859475.
- Wilhelm BT, Marguerat S, Watt S, Schubert F, Wood V, Goodhead I, Penkett CJ, Rogers J, Bähler J. Dynamic repertoire of a eukaryotic transcriptome surveyed at single-nucleotide resolution. Nature. 2008 Jun 26;453(7199):1239-43. Epub 2008 May 18. PubMed PMID: 18488015.
- Wilhelm BT, Mager DL. Rapid expansion of the Ly49 gene cluster in rat. Genomics. 2004 Jul;84(1):218-21. PubMed PMID: 15203220.
- Wilhelm BT, Landry JR, Takei F, Mager DL. Transcriptional control of murine CD94 gene: differential usage of dual promoters by lymphoid cell types. J Immunol. 2003 Oct 15;171(8):4219-26. PubMed PMID: 14530345.
Disciplines
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- Oncologie
- Bio-informatique
- Biologie moléculaire
Champ d’expertise
- Micropuces d'ADN et d'ARN
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- Innovations technologiques
- Technologies biomédicales
- Technologies des soins
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