THÈME GÉNÉRAL

• Comment les différentes formes de vie que nous connaissons ont-elles évoluées ?
• Dans quels aspects leurs cellules fonctionnent-elles différemment au niveau moléculaire ?

L’ÉVOLUTION DES GÉNOMES

Nous étudions les génomes nucléaires d’eucaryotes primitifs afin d’établir les différentes trajectoires de diversification génomique. L’étude des génomes mitochondriaux vise à retracer la transition de l’endosymbionte bactérien vers une structure intégrale de la cellule eucaryote.

MÉCANISMES MOLÉCULAIRES INNOVANTS

 Nous avons découvert des stratégies inouïes d’expression des gènes chez un groupe de micro-eucaryotes. Celles-ci entrent en jeu lors du processing de l'RNA, notemment l’édition des RNA massive et leur épissage systématique en trans. L’identification des mécanismes biochimiques et des machineries moléculaires est en cours dans notre laboratoire.

SYMBIOSES - PRINCIPES ET APPLICATIONS

Le système étudié est la canneberge et ses microbes – des espèces bactériennes et fongiques vivant en collectivité à l’intérieur du même hôte végétal. Ces microbes affectent la croissance, l’assimilation de nutriments et la susceptibilité de la plante à des pathogènes. Le projet vise l’isolement et la classification d’endosymbiontes bénéfiques à la canneberge, ainsi que des essais en plein champ. De plus, le séquençage des génomes microbiens sert à identifier les gènes responsables de la ‘biofertilisation’ et du ‘biocontrôle’. Les aspects agronomiques, microbiologiques, génomiques et métabolomiques sont exécutés par nos collaborateurs. Notre laboratoire effectue le volet transcriptomique pour (i) établir l’effet des microbes sur l’expression des gènes végétaux et (ii) identifier les mécanismes moléculaires des interactions symbiotiques impliqués dans la communication hôte-endosymbionte et endosymbionte-endosymbionte.

APPROCHES EXPÉRIMENTALES

Les principales approches utilisées sont la génomique et la transcriptomique jumelées avec l'analyse bio-informatique (assemblage et annotation des ‘Omes, prédiction de la localisation sub-cellulaire des protéines),  la protéomique, la biochimie des RNA ainsi que la biologie moléculaire en général.

Nos projets comprennent des collaborations multidisciplinaires, au niveau national et international.

BSc et MSc en biologie, doctorat et habilitation en génétique & microbiologie, Ludwig-Maximilian Universität, München, Allemagne

Stages post-doctoraux en Allemagne, Canada, Etats-Unis, France, Italie

Chercheure associée, CNRS, microbiologie, Université Paris-Sud, France

Chercheure associée, biochimie, UdeM

Conception et implémentation des programmes d'études (1er, 2ème, et 3ème cycle) de bio-informatique a l'UdeM

Présidente des comités des études en bio-informatique 2000-2015

Présidente du comité de bourses stratégiques du IRSC-Génétique en bio-informatique 2004-2010

Membre de différents comités factultaires tels que de comités aviseurs et d’autoévaluation, de groupes de travail, etc.

Membre fondateur du Centre Robert-Cedergren en bio-informatique et génomique.

Poste de doctorant en bio-informatique disponible

Supervision de stagiaires postdoctoraux en bio-informatique et en biochimie

Supervision de doctorants en bio-informatique et en biochimie

Supervision d'étudiants à la maîtrise en bio-informatique et en biochimie

Supervision de stages de 1er et de 2ème cycle en bio-informatique et biochimie

Participation à plus de 35 jurys et comités de thèses

Organisation de l'annuel colloque bio-informatique Robert Cedergren 2005 - 2010

Participation à des jurys de thèse de Dalhousie University et University of British Columbia.

PUBLICATIONS CHOISIES

• Burger G, Moreira S, Valach M (2016) “Genes in hiding”. Trends Genet 32(19)535-565
• Burger G, Gray MW, Forget L, Lang BG (2013) “A strikingly bacteria-like and gene-rich mitochondrial genome is a hallmark of jakobid protists.” Genome Biol Evol 5:418
• Shen YQ, Burger G (2010) “TESTLoc: protein subcellular localization prediction from EST data.” BCM Bioinformatics 11:563
   

En voir plus sur : http://megasun.bch.umontreal.ca/People/burger/pubs.html