Sciences de la santé; Sciences médicales
Benoit Coulombe
- Professeur/chercheur titulaire
-
Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire
Autre courriel :
benoit.coulombe@ircm.qc.ca
(Travail)
Portrait
Expertise de recherche
Mon laboratoire cherche à développer une compréhension détaillée des mécanismes de régulation de la transcription génique par l'ARN polymérase II chez les mammifères.
Le génome des mammifères compte environ 30 000 gènes dont l’expression doit être contrôlée avec précision pour permettre la croissance et la différenciation des cellules. L’expression d’un gène est activée lorsque l’information qu’il encode est transcrite sous forme d’ARNm par l’enzyme ARN polymérase II. La transcription par l’ARN polymérase II est un processus complexe au cours duquel la polymérase doit reconnaitre le promoteur génique, ouvrir la double-hélice d’ADN au site d’initiation de la transcription, catalyser la polymérisation des ribonucleotides en utilisant l’un des brins d’ADN comme matrice, et se déplacer le long de l’unité génique en allongeant l’ARN. De nombreuses interactions moléculaires entre la polymérase et la matrice d’ADN, l’ARN en synthèse et une myriade de protéines régulatrices contrôlent l’activité transcriptionnelle. Notre laboratoire développe et utilise des technologies de pointe en biologie moléculaire, en biochimie, en génomique, en protéomique et en bioinformatique afin de construire une compréhension détaillée des mécanismes de régulation de la transcription par l’ARN polymérase II.
Affiliations et responsabilités
Affiliations de recherche
Unités de recherche
Membre
Établissements affiliés
- Institut de recherches cliniques de Montréal (IRCM)
Enseignement et encadrement
Enseignement
Cours siglés (session en cours uniquement)
Programmes
- 106010 – Baccalauréat en chimie
- 106020 – Majeure en chimie
- 106040 – Mineure en chimie
- 117510 – Baccalauréat en informatique
- 117520 – Majeure en informatique
- 117540 – Mineure en informatique
- 146511 – Baccalauréat en biochimie et médecine moléculaire
- 146811 – Baccalauréat en bio-informatique
- 146811 – Baccalauréat en bio-informatique
- 196710 – Programme d'accueil en sciences
Encadrement
Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)
2015
Étude de la fonction de la protéine RPAP4 et de son association avec l’ARN polymérase II
Diplômé(e) : Lacombe, Andrée-Anne
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2011
Analyse de la localisation génomique et identification de nouvelles fonctions des sous-unités Rpb4/Rpb7 de l’ARN polymérase II et des facteurs TFIIF, TFIIS et UBR5
Diplômé(e) : Cojocaru, Marilena
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2011
Cartographie du réseau d'interactions protéiques de la machinerie de transcription dans les cellules humaines
Diplômé(e) : Rusu, Natalia
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2009
Systematic analysis of protein complexes involved in the human RNA polymerase II machinery
Diplômé(e) : Al-Khoury, Racha
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2008
Analyse des complexes protéiques interagissant avec la machinerie de l'ARN polymérase II dans les cellules humaines
Diplômé(e) : Jeronimo, Célia
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2005
Mécanismes de transcription par l'ARN polymérase II : étude structure-fonction du site catalytique et rôles des facteurs de transcription TFIIA, TFIIE et TFIIF
Diplômé(e) : Langelier, Marie-France
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2005
Étude fonctionnelle des domaines structuraux des sous-unités catalytiques de l'ARN polymérase II humaine
Diplômé(e) : Baali, Dania
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2005
Localisation de l'ARN polymérase II humaine à travers le génome en couplant double immunoprécipitation de la chromatine et clonage
Diplômé(e) : Côté, Pierre
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2005
La machinerie transcriptionnelle basale : étude de son organisation moléculaire au promoteur génique et de ses interactions avec les régulateurs XAB1 et DDX5
Diplômé(e) : Thérien, Cynthia
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Projets
Projets de recherche
2019
- 2024
Profiles and biomarkers of neuromuscular junctions of ALS patients
Chercheur principal :
Richard Robitaille
Sources de financement :
SLA Canada/Société canadienne de la sclérose latérale amyotrophique
Programmes de subvention :
2020
- 2023
Reducing the activity of the phosphatase STEP to improve memory performance during aging
Chercheur principal :
Jonathan Brouillette
Co-chercheurs :
Benoit Coulombe
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2017
- 2021
A patent-derived IPSC platform of disease relevant cell models for biological studies
Chercheur principal :
Guy Rouleau
Co-chercheurs :
Benoit Coulombe
Sources de financement :
Fondation Brain Canada
Programmes de subvention :
2016
- 2021
A patent-derived iPSC platform of disease relevant cell models for biological studies
Chercheur principal :
Guy Rouleau
Co-chercheurs :
Benoit Coulombe
Sources de financement :
SLA Canada/Société canadienne de la sclérose latérale amyotrophique
Programmes de subvention :
2017
- 2020
Unraveling the molecular basis of novel forms of hypomyelinating leukodystrophies
Chercheur principal :
Genevieve Bernard
Co-chercheurs :
Benoit Coulombe
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2016
- 2020
Deciphering breast cancer HER2-negativity with regard to HER2-targeted therapy
Chercheur principal :
Francine Durocher
Co-chercheurs :
Benoit Coulombe
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2015
- 2019
Caractérisation du protéome associé à des loci génétiques d'intérêt
Chercheur principal :
François Robert
Co-chercheurs :
Benoit Coulombe
Sources de financement :
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention :
PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2016
- 2018
POLR3-related leukodystrophiy: a step forward clinical trials
Chercheur principal :
Benoit Coulombe
Sources de financement :
ELA/Association européenne contre les leucodystrophies
Programmes de subvention :
2013
- 2018
THE FUNCTION AND REGULATION OF PCSK9: A NOVEL MODULATOR OF LDLR ACTIVITY
Chercheur principal :
Nabil Georges Seidah
Sources de financement :
Fondation Leducq
Programmes de subvention :
2016
Identification of small-molecule proteostasis regulators to repair conformational defects in POLR3 hypomyelinating leukodusytrophies
Chercheur principal :
Benoit Coulombe
Sources de financement :
Fondation Leuco dystrophie
Programmes de subvention :
2013
- 2016
REGULATION OF THE INCLUSION BODY MYOSITIS-ASSOCIATED PROTEIN VCP BY METHYLATION
Chercheur principal :
Benoit Coulombe
Sources de financement :
Association canadienne de la dystrophie musculaire (L')
Programmes de subvention :
2012
- 2016
CLINICAL, MOLECULAR AND PATHOPHYSIOLOGICAL CHARACTERIZATION OF POL III-RELATED LEUKODYSTROPHIES
Chercheur principal :
Genevieve Bernard
Co-chercheurs :
Benoit Coulombe
Sources de financement :
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention :
2010
- 2016
Training program in cellular dynamics of macromolecular complexes
Chercheur principal :
Christian Baron
Co-chercheurs :
Jurgen Sygusch
,
Stephen Michnick
,
Antonio Nanci
,
Benoit Coulombe
,
Pascal Chartrand
,
Nicolas Lartillot
,
Marlene Oeffinger
,
James G. Omichinski
,
Daniel Zenklusen
,
Jackalyn Marie Vogel
,
James W Coulton
,
Sachdev Sidhu
,
Franck Duong
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
PV118026-FONCER : Prog. formation orientée nouveauté, la collaboration et l'expérience en recherche
2012
- 2014
NSERC CREATE TRAINING PROGRAM : CELLULAR DYNAMICS OF MACROMILECULAR COMPLEXES
Chercheur principal :
Benoit Coulombe
Sources de financement :
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention :
2009
REMBOURSEMENT DE FRAIS - ATELIER GENOMIQUE FRSQ-VSFC, BEIJING CHINA
Chercheur principal :
Benoit Coulombe
Rayonnement
Publications et communications
Disciplines
- Biochimie
- Biologie moléculaire
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- Cellule
- Chimie combinatoire
- Chromosome (Organismes vivants)
- Composés inorganiques et organométalliques
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- Gène (Organismes vivants)
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- Mécanismes biologiques et biochimiques
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