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À l’intention des médias

Sciences naturelles et génie; Sciences appliquées

Timothée Poisot

Comment peut-on prédire la perte de biodiversité, et l'émergence de nouvelles maladies infectieuses?

Professeur agrégé

Faculté des arts et des sciences - Département de sciences biologiques

Complexe des sciences, local B-5439

514 343-7691

timothee.poisot@umontreal.ca

SÉRi 7 - Vitrine technologique – Timothée Poisot - UdeM

Timothée Poisot de l’UdeM nous présente la vitrine technologique: « L'écologie computationnelle pour les décideurs » Vitrine technologique - SÉRI 7 - Végétalissime 14 mai 2019

SÉRI MONTRÉAL

« What should we eat next? » par Timothée Poisot | SÉRI Montréal, le 17 octobre 2017

Conférence de M. Timothée Poisot, professeur adjoint au département des sciences biologiques de l'Université de Montréal , sur « What should we eat next? Using machine learning to predict the structure of ecological systems » présentée le 17 octobre 2017 à l'événement SÉRI Montréal "Intelligence: (r)évolution".

SÉRI MONTRÉAL

Portrait

Expertise de recherche

Mes questions centrales sont:

comment la variation spatio-temporelle des interactions biotique contribue à la distribution spatiale des propriétés écosystemiques
comment intégrer la variabilité des interactions dans les approches de conservation et de gestion (notamment du risque infectieux)
comment intégrer différents domaines de l'écologie pour développer des méthodes numériques permettant de prédire la structure des interactions entre espèces sachant que les observations empiriques sont difficiles/couteuses/rares.

Biographie

Timothée Poisot est professeur agrégé au département de sciences biologiques de l’Université de Montréal et chercheur au Centre de sciences de la biodiversité du Québec. Il mène une étude internationale sur les calculs des risques d’une prochaine pandémie.

Prix et distinctions

Prix d'excellence du CSBQ - 2014/04
Société Française d'Écologie: Prix jeune chercheur - meilleur travail doctoral- 2012/07
Prix d'excellence du CSBQ - 2012/04
Prix d'excelence à l'Université de Montpellier II - 2008/06

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Affiliations et responsabilités

Affiliations de recherche

Unités de recherche

Membre

Enseignement et encadrement

Enseignement

Cours siglés (session en cours uniquement)

Programmes

Encadrement

Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)

2024

Évaluer le potentiel et les défis de la variation intraspécifique pour les réseaux neuronaux profonds de reconnaissance de chants d’oiseaux : l’exemple des bruants des prés (Passerculus sandwichensis) de l’île Kent, Nouveau-Brunswick

Diplômé(e) : Rondeau Saint-Jean, Camille
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

2024

Tools O' the Times : understanding the common proporties of species interaction networks across space

Diplômé(e) : Strydom, Tanya
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

2023

Améliorer les modèles génératifs des structures de réseaux trophiques avec la pondération de la stabilité

Diplômé(e) : Volz, Valentine
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

2022

Laisser sa trace : utiliser les interactions pour comprendre l'évolution

Diplômé(e) : Besson, Mathilde
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

2022

Biogéographie socio-écologique des lacs au Canada

Diplômé(e) : Dupont, Andréanne
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

2021

Évaluation de l'unicité écologique à grande étendue spatiale à l'aide de modèles de répartition d'espèces

Diplômé(e) : Dansereau, Gabriel
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

2020

Nouvelle approche multispécifique intégrant les milieux aquatiques et terrestres pour l’évaluation de la connectivité du paysage

Diplômé(e) : Lecours Tessier, Daphnée
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

2020

What does a bioenergetic network approach tell us about the functioning of ecological communities?

Diplômé(e) : Delmas, Eva
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.

Projets

Projets de recherche

2024 - 2029

Centre de la Science de la Biodiversite du Quebec_CSBQ //Séroprévalence du CDT en milieu urbain

Chercheur principal : Andrew Gonzalez

Co-chercheurs : Timothée Poisot

Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)

Programmes de subvention : PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques

2021 - 2028

Calcul Québec

Chercheur principal : Marie-Jean Meurs

Co-chercheurs : Timothée Poisot

Sources de financement : FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)

Programmes de subvention : PVXXXXXX-(AGO) Initiative AGORA

2021 - 2027

The many paths to ecological network inference: reconciling machine learning, empirical data, and ecological knowledge

Chercheur principal : Timothée Poisot

Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)

Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe

2021 - 2027

The many paths to ecological network inference: reconciling machine learning, empirical data, and ecological knowledge

Chercheur principal : Timothée Poisot

Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)

Programmes de subvention : PV118029-(RGPAS) Programme de suppléments d'accélération à la découverte

2024 - 2026

Financement de recherche postdoctorale IVADO 2024 - Michael Catchen

Chercheur principal : Timothée Poisot

Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements

Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse

2020 - 2026

NSERC CREATE in ecology, evolution and environmental science: The Living Data Project

Chercheur principal : Diane Srivastava

Co-chercheurs : Timothée Poisot , Éric Harvey

Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)

Programmes de subvention : PV118026-FONCER : Prog. formation orientée nouveauté, la collaboration et l'expérience en recherche

2021 - 2025

Coupling biodiversity and ecosystem models for efficient biodiversity monitoring

Chercheur principal : Timothée Poisot

Sources de financement : Wellcome Trust

Programmes de subvention :

2018 - 2025

BIOS2 : Computational Biodiversity Science and Services

Chercheur principal : Dominique Gravel

Co-chercheurs : Timothée Poisot

Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)

Programmes de subvention : PV118026-FONCER : Prog. formation orientée nouveauté, la collaboration et l'expérience en recherche

2022 - 2024

Reconnaissance de microdialectes et de chants individuels de Bruants des prés avec un réseau neural profond

Chercheur principal : Timothée Poisot

Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements

Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse

2018 - 2024

BIOS2 : Computational Biodiversity Science and Services

Chercheur principal : Dominique Gravel

Co-chercheurs : Anne Bruneau , Timothée Poisot

Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)

Programmes de subvention :

2022 - 2023

BON in a Box 2.0

Sources de financement : Université McGill

Programmes de subvention :

2022 - 2023

Alliance de recherche numérique du Canada - Soutien à Calcul Québec 2022-2023

Sources de financement : Alliance de recherche numérique du Canada

Programmes de subvention :

2021 - 2023

CSBQ // K2A Network on EBV's

Chercheur principal : Andrew Gonzalez

Co-chercheurs : Timothée Poisot

Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)

Programmes de subvention : PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques

2019 - 2023

Laboratoire d'écologie quantitative et informatique

Chercheur principal : Timothée Poisot

Sources de financement : Université de Montréal

Programmes de subvention : PVXXXXXX-FEI sans restriction

2019 - 2023

Apogée Canada fonds d'excellence en recherche / Bourse d'excellence IVADO au doctorat Francis Banville

Chercheur principal : Timothée Poisot

Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements

Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse

2019 - 2023

Laboratoire d'écologie quantitative et informatique

Chercheur principal : Timothée Poisot

Sources de financement : FCI/Fondation canadienne pour l'innovation

Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'exploitation des infrastructures (FEI)

2015 - 2023

CALCUL QUEBEC

Chercheur principal : Paul Charbonneau , Timothée Poisot , Marie-Jean Meurs

Co-chercheurs : Laurent J. Lewis , Anne Bruneau , Damian Labuda , Georges Michaud , Rémy Sauvé , Michel Côté , Jacques Drouin , Normand Mousseau , François Schiettekatte , Daniel Sinnett , Mohamed Hijri , Jesse Shapiro , Mark E. Samuels , Pierre-Louis Bellec , Armand Soldera , David Sénéchal , Nikolas Provatas , Pierre-Étienne Jacques , Pierre-Étienne Jacques , Nicolas Moitessier , Stefan Sinclair , Georges Dionne , Erica Moodie , Victoria Kaspi , Lorne Archie Nelson , Jackalyn Marie Vogel , Alan C Evans , Brigitte Jaumard , Russell Davidson , Martin Aube , Ali Dolatabadi , Pierre Proulx , François Vidal , Claude Legault , Hong Guo , Alain Rochefort , André-Marie Tremblay , Alexandre Blais , Sivakumaran Nadarajah , François Bertrand , Frédéric Sirois , G. Peslherbe , Marius Paraschivoiu , André Dieter Bandrauk , Noureddine Atalla , Adam Skorek , Hugo Larochelle , Guillaume Bourque , W Robert J Funnell , Sang Yong Jeon , Guy Moore , Jacek A. Majewski , Andrew Piper , Luc Mongeau , Daniel Joseph Kirshbaum , Jun Song , Jean-Yves Trépanier , François Guibault , Éric Laurendeau , Wagdi Habashi , Thomas Fevens , Kalifa Goïta , Stéphane Moreau , Patrizio Antici , Dany Dumont , Jannette Frandsen , Gabriel Crainic , Marc Parizeau , Leandro Coelho , Hugo Martel , Laxmi Sushama , Guy Dumas , Christian Gagné , Pierre Gauthier , Louis Jean Dubé , Louis Pérusse , Alain De Champlain , Daniel Reinharz , Arnaud Droit , Frédéric Maps , Abdelkader Baggag , René Laprise , Simon Guillotte , Marie-Jean Meurs , Rober Platt

Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)

Programmes de subvention : PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques

2015 - 2023

Contribution complémentaire pour le financement de Calcul-Québec

Chercheur principal : Paul Charbonneau , Timothée Poisot

Co-chercheurs : Laurent J. Lewis , Nikolas Provatas , Pierre-Étienne Jacques , Pierre-Étienne Jacques , Marc Parizeau

Sources de financement : FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)

Programmes de subvention : PVXXXXXX-Regroupement stratégique

2015 - 2023

Contribution complémentaire 2015-2016 pour le financement de Calcul-Québec

Chercheur principal : Paul Charbonneau , Timothée Poisot

Co-chercheurs : Laurent J. Lewis , Nikolas Provatas , Pierre-Étienne Jacques , Pierre-Étienne Jacques , Marc Parizeau

Sources de financement : FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)

Programmes de subvention : PVXXXXXX-Subvention générale et projets spéciaux (non partageable au prorata)

2021 - 2022

Assembling, predicting and refining a predator-prey metaweb for Canada Canadian metaweb prediction and forecasting

Chercheur principal : Timothée Poisot

Co-chercheurs : Laura Jo Pollock

Sources de financement : ICÉÉ-CIEE/Institut canadien d'écologie et d'évolution/Canadian institute of ecology and evolution

Programmes de subvention :

2016 - 2022

Laboratoire d'écologie quantitative et informatique

Chercheur principal : Timothée Poisot

Sources de financement : FCI/Fondation canadienne pour l'innovation

Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds des leaders

2015 - 2022

Causes and consequences of spatio-temporal variation of species interactions at the community scale

Chercheur principal : Timothée Poisot

Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)

Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe

2020 - 2021

Develop a rapid assessment pipeline to project global preparedness needs for the next SARS-like coronavirus pandemic, using machine learning in support of cross-disciplinary data synthesis to identify the hotspots of these viral threats in wildlife

Chercheur principal : Timothée Poisot

Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements

Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Projet de recherche

2018 - 2020

Convention de subvention 2018-2020 avec le MEI pour le soutien des activités de Calcul Québec

Chercheur principal : Timothée Poisot

Co-chercheurs : Laurent J. Lewis , Nikolas Provatas , Pierre-Étienne Jacques , Pierre-Étienne Jacques , Marc Parizeau

Sources de financement : Ministère Économie et Innovation

Programmes de subvention : PVXXXXXX-Soutien aux organismes de recherche et innovation (PSO) - Volet 2: Soutien aux projets

2018 - 2020

Contribution ponctuelle pour le financement de Calcul Québec

Chercheur principal : Timothée Poisot , Marie-Jean Meurs

Co-chercheurs : Laurent J. Lewis , Paul Charbonneau , Nikolas Provatas , Pierre-Étienne Jacques , Pierre-Étienne Jacques , Marc Parizeau

Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)

Programmes de subvention : PVXXXXXX-Plateforme Calcul Québec (financement partagé entre les fonds de recherche du Québec)

2016 - 2020

Ecological Society of America (ESA) //Centre de la Science de la Biodiversité du Québec (CSBQ)

Chercheur principal : Andrew Gonzalez

Co-chercheurs : Timothée Poisot

Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)

Programmes de subvention : PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques

2018 - 2019

FGR CRSNG : 2018-2019

Chercheur principal : Timothée Poisot

Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)

Programmes de subvention : PVXXXXXX-FGR - Subvention de recherche institutionnelle

2018 - 2019

RéseauLab: a novel social-ecological innovation system for transformative change towards sustainability

Chercheur principal : Roxane Maranger

Co-chercheurs : Kathryn Furlong , Sara Teitelbaum , Julie Talbot , Timothée Poisot

Sources de financement : CRSH/Conseil de recherches en sciences humaines du Canada

Programmes de subvention : PVXXXXXX-FGR – Subvention de recherche institutionnelle

2017 - 2018

Convention de subvention 2016-2018 pour le soutien du MESI aux activités de Calcul Québec pour l'année 2017-2018

Chercheur principal : Timothée Poisot

Co-chercheurs : Laurent J. Lewis , Nikolas Provatas , Pierre-Étienne Jacques , Pierre-Étienne Jacques , Marc Parizeau

Sources de financement : Ministère Économie et Innovation

Programmes de subvention : PVXXXXXX-Prog. soutien rech (PSR v1): Soutien à des projets de recherche

2015 - 2018

Nouveaux outils numériques pour décomposer la variation de la structure des communautés écologiques

Chercheur principal : Timothée Poisot

Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)

Programmes de subvention : PVXXXXXX-(NC) Établissement de la relève professorale

2016 - 2017

Pôle d'Analyse et Visualisation de l'Information Climatique et Scientifique _PAVICS )programme Logiciels de recherche de CANARIE)

Chercheur principal : Timothée Poisot

Co-chercheurs : Laurent J. Lewis

Sources de financement : Ouranos, Consortium sur la climatologie régionale et l'adaptation aux changements climatiques

Programmes de subvention :

Rayonnement

Publications et communications

Disciplines

Biologie et autres sciences connexes
Épidémiologie et biostatistique
Statistiques
Mathématiques appliquées

Champ d’expertise

Écologie computationnelle
Biostatistique
Écologie des communautés
Modélisation
Coévolution
Interactions biotiques
Réseaux d'interactions
Biodiversité
Écologie évolutive
Analyse phylogénétique
Écologie quantitative
Écologie numérique
Calcul scientifique
Informatique de la biodiversité

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Le Répertoire des professeurs est propulsé par les données du SADVR et est un projet du CENR.

Personnes-ressource dans nos équipes

Formulaires, procédures et systèmes

Timothée Poisot

Comment peut-on prédire la perte de biodiversité, et l'émergence de nouvelles maladies infectieuses?

Médias

Portrait

Expertise de recherche

Biographie

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Unités de recherche

Membre

Enseignement et encadrement

Enseignement

Cours siglés (session en cours uniquement)

Programmes

Encadrement

Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)

Projets

Projets de recherche

Centre de la Science de la Biodiversite du Quebec_CSBQ //Séroprévalence du CDT en milieu urbain

Calcul Québec

The many paths to ecological network inference: reconciling machine learning, empirical data, and ecological knowledge

The many paths to ecological network inference: reconciling machine learning, empirical data, and ecological knowledge

Financement de recherche postdoctorale IVADO 2024 - Michael Catchen

NSERC CREATE in ecology, evolution and environmental science: The Living Data Project

Coupling biodiversity and ecosystem models for efficient biodiversity monitoring

BIOS2 : Computational Biodiversity Science and Services

Reconnaissance de microdialectes et de chants individuels de Bruants des prés avec un réseau neural profond

BIOS2 : Computational Biodiversity Science and Services

BON in a Box 2.0

Alliance de recherche numérique du Canada - Soutien à Calcul Québec 2022-2023

CSBQ // K2A Network on EBV's

Laboratoire d'écologie quantitative et informatique

Apogée Canada fonds d'excellence en recherche / Bourse d'excellence IVADO au doctorat Francis Banville

Laboratoire d'écologie quantitative et informatique

CALCUL QUEBEC

Contribution complémentaire pour le financement de Calcul-Québec

Contribution complémentaire 2015-2016 pour le financement de Calcul-Québec

Assembling, predicting and refining a predator-prey metaweb for Canada Canadian metaweb prediction and forecasting

Laboratoire d'écologie quantitative et informatique

Causes and consequences of spatio-temporal variation of species interactions at the community scale

Develop a rapid assessment pipeline to project global preparedness needs for the next SARS-like coronavirus pandemic, using machine learning in support of cross-disciplinary data synthesis to identify the hotspots of these viral threats in wildlife

Convention de subvention 2018-2020 avec le MEI pour le soutien des activités de Calcul Québec

Contribution ponctuelle pour le financement de Calcul Québec

Ecological Society of America (ESA) //Centre de la Science de la Biodiversité du Québec (CSBQ)

FGR CRSNG : 2018-2019

RéseauLab: a novel social-ecological innovation system for transformative change towards sustainability

Convention de subvention 2016-2018 pour le soutien du MESI aux activités de Calcul Québec pour l'année 2017-2018

Nouveaux outils numériques pour décomposer la variation de la structure des communautés écologiques

Pôle d'Analyse et Visualisation de l'Information Climatique et Scientifique _PAVICS )programme Logiciels de recherche de CANARIE)

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