John David Rioux
Base génétique et fonctionnelle des maladies inflammatoires
- Professeur titulaire
-
Faculté de médecine - Département de médecine
Profile
Research expertise
Le laboratoire de génétique et médecine génomique en inflammation étudie la base génétique et fonctionnelle des maladies inflammatoires communes dont l'asthme, les maladies cardiovasculaires, la maladie de Crohn, la colite ulcéreuse, le lupus érythémateux disséminé, la polyarthrite rhumatoïde et la sclérose en plaques. En plus, notre groupe s'intéresse à identifier des gènes responsables de maladies mendéliens rares qui affectent la population canadienne française.
Biography
John D. Rioux est professeur agrégé de médecine à l'Université de Montréal et à l’Institut de Cardiologie de Montréal où il œuvre en tant que chercheur et directeur du Laboratoire de génétique et médecine génomique en inflammation. Depuis 2005, il est titulaire de la Chaire de recherche du Canada en génétique et médecine génomique.
Le Dr Rioux a obtenu un baccalauréat en sciences (B.Sc. Immunologie) en 1987 et un doctorat en médecine (Ph.D. Médecine expérimentale) de l'Université McGill en 1994. Il a ensuite complété un stage postdoctoral au Whitehead Institute/MIT Center for Genome Research en 1997. À la suite de cette formation, le Dr Rioux a créé un groupe de recherche travaillant sur la génétique et la génomique des maladies monogéniques et des maladies polygéniques/complexes. En 2001, il est devenu directeur du groupe de recherche sur les maladies inflammatoires au Whitehead Institute/MIT Center for Genome Research, puis au Broad Institute of MIT and Harvard. Il a été nommé professeur adjoint au Harvard Medical School et au Brigham and Women’s Hospital en 2003 et, en 2004, membre associé du Broad Institute of MIT and Harvard jusqu’en 2007.
Ses recherches ont pour but de découvrir les facteurs de risque génétiques des maladies communes (polygéniques) et de déterminer les mécanismes biologiques par lesquelles ces variantes génétiques influencent le risque de développer ces maladies chroniques. Il est membre fondateur de quatre consortiums internationaux en génétique. Dr. Rioux a plus de 150 publications incluant plusieurs publications dans les revues de prestige comme Nature, Science, Nature Genetics, et New England Journal of Medicine.
Affiliations and responsabilities
Research affiliations
Research units
Titulaire
Membre
Affiliated institutions
- Institut de cardiologie de Montréal (ICM)
Teaching and supervision
Student supervision
Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)
L'effet d'une prédisposition génétique aux maladies inflammatoires de l'intestin sur la barrière épithéliale intestinale
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Comprendre la fonction cellulaire par l’analyse du transcriptome : une approche bio-informatique
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Facteurs de risque pour les maladies inflammatoires de l’intestin : caractérisation de l’impact de variants rares d’IFIH1 sur la réponse épithéliale antivirale
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Développement d’un outil bio-informatique pour l’annotation des associations entre gènes et métabolites basée sur les voies métaboliques
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Étude génétique et fonctionnelle des gènes de la région 14q31 associée aux maladies inflammatoires de l’intestin
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Développement d’une méthode bio-informatique permettant de relier les gènes aux métabolites
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Déterminer le rôle de C1orf106, un gène associé aux maladies inflammatoires de l’intestin
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Syndrome du QT long: étude clinique à l’Institut Cardiologique de Montréal et recherche de nouvelles variantes causales par séquençage à haut débit
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
MAST3 : facteur de risque génétique aux maladies inflammatoires de l’intestin et modulateur d’inflammation
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Le locus 1q32 : susceptibilité aux maladies inflammatoires de l’intestin et rôles biologiques de C1orf106 et KIF21B
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Étude génétique et fonctionnelle de variantes de la région chromosomique 3p21 associée aux maladies inflammatoires de l'intestin
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Projects
Research projects
Canada Research Chair in Genetics and Genomic Medicine
Identifying and functionally validating IBD genes and variants impacting intestinal epithelial barrier integrity
Characterization of the immunologic events that lead to development of Systemic Autoimmune Rheumatic Disease
Montreal-Boston Collaborative GRC
Canadian autoimmunity standardization core (CAN-ASC)
Understanding the role of Epigenetic Reader SP 140 in IBD
Developing an inexpensive blood-based diagnostic test for Crohn's Disease
Génétique et médecine génomique
A prospective study of immune cell responsiveness to understand drug response in UC patients treated with tofacitinib
Suvention FICM 2015-2018
Insights into Parkinson's disease, Crohn's disease and leprosy: common role of LRRK2
Comprendre l'hétérogénéité tissulaire dans l'acidose lactique: une fenêtre sur les mécanismes physiopathologiques et cardioprotection
Canadian Autoimmunity Standardization Core (CAN-ASC)
IBD GENOMIC MEDICINE CONSORTIUM (IGENOMED): TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO A PERSONALIZED APPROACH TO TREATING THE INFLAMMATORY BOWEL DISEASES
IBD GENOMIC MEDICINE CONSORTIUM (IGENOMED) : TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO A PERSONALIZED APPROACH TO TREATING THE INFLAMMATORY BOWEL DISEASES
Plateforme de support aux analyses cellulaires et génomiques appliquées à la recherche biomédicale
Defining the causality & biologic impact of genes within ulcerative colitis loci.
IBD GENOMIC MEDICINE CONSORTIUM (IGENOMED) : TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO A PERSONALIZED APPROACH TO TREATING THE INFLAMMATORY BOWEL DISEASES
Studies of immune status and responsiveness, metabolites and secreted proteins in retrospective and prospective IBD cohorts
SUBVENTION FICM 2013-2014
GENETICS AND GENOMIC MEDICINE OF INFLAMMATION
CIHR TEAM IN THE LEIGH SYNDROME FRENCH CANADIAN TYPE (LSFC) : TRANSLATING LSFC GENE DISCOVERY INTO TREATMENTS FOR PATIENTS
CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATION DISEASE : IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY : A MODEL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES
CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATORY DISEASES : IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY : A MODAL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES
CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATORY DISEASES : IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY: A MODAL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES
IBD GENOMIC MEDECINE CONSORTIUM (IGENOMED) : TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO A PERSONALIZED APPROACH TO TREATING THE INFLAMMATORY BOWEL DISEASES
MONTREAL-BOSTON COLLABORATIVE IBD GENETIC RESEARCH CENTER
CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATORY DISEASES: IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY: A MODAL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES
GENETIQUE ET MEDECINE GENOMIQUE DE L'INFLAMMATION
GENETIQUE ET MEDECINE GENOMIQUE DE L'INFLAMMATION
GENETIQUE ET MEDECINE GENOMIQUE DE L'INFLAMMATION
BIOLOGIE INTEGRATIVE DES GENES ASSOCIES A PLUSIEURS MALADIES INFLAMMATOIRES: AMELIORATIONS DIAGNOSTIQUE ET THERAPEUTIQUE
ATELIER GENOMIQUE FRSQ-NSFC, BEIJING, CHINA
Outreach
Publications and presentations
Disciplines
- Genetics
Areas of expertise
- Genetic Mapping
- Chromosomes: Structure / Organization
- Genetic Screening of Diseases
- Genomic Damage and Repair
- Gene Regulation and Expression
- Genes
- Susceptibility Genes
- Applied Genetics
- Complex Trait Genetics
- Developmental Genetics
- Genetics and Ethics
- Genetics and Heredity
- Evolutionary Genetics
- Molecular Genetics
- Population Genetics
- Genome
- Genomics
- Gene-Environment Interactions
- Genetic Diseases
- Genetic Markers
- DNA and RNA Chips
- Transgenic Model
- Mutation (Process)
- Phenotype
- Polymorphism
- Proteins
- Proteomics
- Telomeres
- Gene Therapy