Passer au contenu

/ Research

Je donne

Rechercher

Health Sciences; Medical Sciences

Daniel Sinnett

Déterminants génétiques de la leucémie de l’enfant

Professeur titulaire

Faculté de médecine - Département de pédiatrie

514 345-4931

daniel.sinnett@umontreal.ca

Professeur accrédité

Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire

Secondary numbers: 514 345-4931 #2990 (Travail 1) 514 338-2222 #3710 (Travail 2)
Secondary email: daniel.sinnett.cnmtl@ssss.gouv.qc.ca (Travail)

Profile

Research expertise

Leukemogenesis and tumor suppressor genes

Oncogenesis is a multistep process that involves the accumulation of mutations in oncogenes and tumor suppressor genes. The short arm of chromosome 12 is affected by genetic rearrangements leading to the loss of genetic material in a wide range of hematological malignancies. It has been shown that chromosome 12p12.3 is associated with a putative tumor suppressor that may play an important in childhood leukemogenesis as well as in certain solid neoplasias. The transcription factor ETV6 is a suitable candidate gene. In this project, we propose to characterize ETV6 by identifying the genes targeted by this transcription repressor in order to build the corresponding regulatory network and by determining the nature of the protein partners involved in the repression complex.Genetic determinants of childhood leukemiaSporadic cancer is a complex disease, where the effect of the environment is modulated by a series of genes whose allelic forms represent functional polymorphisms (DNA variants). According to this model, the origin of childhood leukemia could be explained by a combination of genetic susceptibility factors and environmental exposures. Because of the much shorter latency period, the study of pediatric tumors allows a more realistic evaluation of the input of genetic factors and environment exposures during vulnerable periods of development (foetal life and young childhood). In this project, we propose to identify the genetic factors underlying the individual’s susceptibility to childhood leukemia by performing genetic epidemiology studies.Regulatory genomicsGenetic diversity in regulatory sequences might lead to allelic variation in gene expression levels (quantitative changes). Such variability could alter tightly regulated biological pathways (e.g. cell cycle) and then contribute to change in disease risk. In this project, we propose to determine the extent of genetic variants in regulatory regions and to validate the functional impact of these variants.

Biography

Généticien moléculaire, Daniel Sinnett est professeur titulaire au Département de pédiatrie. Ses recherches portent principalement sur les déterminants génétiques et génomiques des cancers pédiatriques tels que la leucémie. Cofondateur du Childhood Leukemia International Consortium, qui regroupe des chercheurs et chercheuses de 21 pays, il s’intéresse également aux conséquences de la médecine de précision sur la prise de décision clinique et la prise en charge des survivants. Favorisant l’échange et la collaboration entre les divers intervenants du domaine médical, il est engagé auprès de la relève et travaille en étroite collaboration avec plusieurs fondations institutionnelles et privées afin d’élaborer des stratégies d’application et de diffusion des connaissances.

Awards and recognitions

  • Membre de l'Académie canadienne des sciences de la santé - 2022

  • Chercheur national, Fonds de la recherche en santé du Québec (FRSQ), 2006-2011
  • Lauréat du programme de reconnaissance, Prix recherche, CHU Sainte-Justine, 2009
  • Chercheur-boursier Senior, FRSQ, 2002-2006
  • Prix d’accomplissement, Recherche Biomédicale, Faculté de Médecine/ Association des diplômés, Université de Montréal, 2005
  • Prix du jeune chercheur André Dupont, 2004
  • Prix Mérite du Conseil québécois de lutte contre le cancer, 2003
  • Titulaire, Chaire de recherche François-Karl Viau en oncogénomique pédiatrique, 2002-présent
  • Chercheur-boursier Junior 2, FRSQ, 1998-2002
  • Prix d’Excellence, Fondation de la recherche sur les maladies infantiles, 1999
  • Chercheur-boursier Junior 1, FRSQ, 1994-1998
  • Bourse de recherche postdoctorale, Instituts de recherche en santé du Canada, 1991-1994

Teaching and supervision

Student supervision

Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)

2022

Dérégulations épigénétiques suivant une perte temporaire de l’enzyme DNMT1

Graduate : Lemieux, Anthony
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2021

Étude de l’inflammation placentaire lors de complications de la grossesse

Graduate : Duval, Cyntia
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2021

Classification moléculaire des Tumeurs de Wilms par analyse RNA-Seq

Graduate : Roux, Cedric
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2020

DNMT3A P904L : un nouveau variant dans la tumeur de Wilms

Graduate : Roy, Anne-Marie
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2018

L’implication de la peptide-déformylase (PDF) dans la leucémie aiguë lymphoblastique de l’enfant

Graduate : Jimenez Cortes, Camille
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2018

Impact de SRP72 sur le facteur de transcription ETV6 dans la leucémie aiguë lymphoblastique

Graduate : Fuchs, Claire
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2017

Paysage génomique de la leucémie aiguë lymphoblastique de l’enfant

Graduate : Spinella, Jean-François
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2017

Caractérisation du microDNome et sa modulation par le traitement anti-cancer

Graduate : Mehanna, Pamela
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2009

Impacts fonctionnels des polymorphismes dans les promoteurs des gènes de l’apoptose

Graduate : Lalonde, Marie-Eve
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2008

Détection et caractérisation des interactions dans les maladies complexes

Graduate : St-Onge, Pascal
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2006

Identification de transcrits modulés par ETV6 : un gène candidat suppresseur de tumeur

Graduate : Boily, Gino
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2003

Variabilité génétique au niveau des gènes de réparation de l'ADN

Graduate : Meloche, Caroline
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.

Projects

Research projects

2021 - 2027

Implication of early embryonic epigenetic dysregulation in fetal alcohol spectrum disorders-associated outcomes

Lead researcher : Serge McGraw
Co-researchers : Daniel Sinnett , Elsa Rossignol , Amanda MacFarlane
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2022 - 2025

Le programme VIE: Interventions intégrées pour les patients traités en oncologie pédiatrique

Lead researcher : Valérie Marcil
Co-researchers : Daniel Sinnett , Serge Sultan , Daniel Curnier , Josée Brossard
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Priorité Patient
2020 - 2023

4D spheroids identify type I protein arginine methyltransferases as a target in NSCLC

Lead researcher : Noël J-M Raynal
Co-researchers : Daniel Sinnett , Stéphane Richard
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2015 - 2023

Vascular remodeling in hypertension and cardiometabolic disease: from mice to humans.

Lead researcher : Ernesto Luis Schiffrin
Co-researchers : Daniel Sinnett
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
2015 - 2023

CALCUL QUEBEC

Co-researchers : Laurent J. Lewis , Anne Bruneau , Damian Labuda , Georges Michaud , Rémy Sauvé , Michel Côté , Jacques Drouin , Normand Mousseau , François Schiettekatte , Daniel Sinnett , Mohamed Hijri , Jesse Shapiro , Mark E. Samuels , Pierre-Louis Bellec , Armand Soldera , David Sénéchal , Nikolas Provatas , Pierre-Étienne Jacques , Pierre-Étienne Jacques , Nicolas Moitessier , Stefan Sinclair , Georges Dionne , Erica Moodie , Victoria Kaspi , Lorne Archie Nelson , Jackalyn Marie Vogel , Alan C Evans , Brigitte Jaumard , Russell Davidson , Martin Aube , Ali Dolatabadi , Pierre Proulx , François Vidal , Claude Legault , Hong Guo , Alain Rochefort , André-Marie Tremblay , Alexandre Blais , Sivakumaran Nadarajah , François Bertrand , Frédéric Sirois , G. Peslherbe , Marius Paraschivoiu , André Dieter Bandrauk , Noureddine Atalla , Adam Skorek , R Platt , Hugo Larochelle , Guillaume Bourque , W Robert J Funnell , Sang Yong Jeon , Guy Moore , Jacek A. Majewski , Andrew Piper , Luc Mongeau , Daniel Joseph Kirshbaum , Jun Song , Jean-Yves Trépanier , François Guibault , Éric Laurendeau , Wagdi Habashi , Thomas Fevens , Kalifa Goïta , Stéphane Moreau , Patrizio Antici , Dany Dumont , Jannette Frandsen , Gabriel Crainic , Marc Parizeau , Leandro Coelho , Hugo Martel , Laxmi Sushama , Guy Dumas , Christian Gagné , Pierre Gauthier , Louis Jean Dubé , Louis Pérusse , Alain De Champlain , Daniel Reinharz , Arnaud Droit , Frédéric Maps , Abdelkader Baggag , René Laprise , Simon Guillotte , Marie-Jean Meurs
Funding sources: FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs: PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques
2021 - 2022

MicroDNA signature for prognosis of childhood acute lymphoblastic leukemia

Lead researcher : Maja Krajinovic
Co-researchers : Daniel Sinnett , Henrique Neves Bittencourt , Ivan Brukner , Teodor Veres
Funding sources: LLS Canada/Leukemia and Lymphoma Society of Canada (The)
Grant programs:
2020 - 2021

MicroDNA signature for prognosis of childhood acute lymphoblastic leukemia

Lead researcher : Maja Krajinovic
Co-researchers : Daniel Sinnett , Henrique Neves Bittencourt , Ivan Brukner , Teodor Veres
Funding sources: IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs:
2018 - 2021

Characterization of childhood acute lymphoblastic leukemia-specific long non-...

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs: PVX12154-Subvention de recherche
2016 - 2021

Projet VIE : Valorisation, implication, éducation

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Fondation Charles Bruneau
Grant programs:
2019 - 2020

Characterization of childhood acute lymphoblastic leukemia-specific long non-coding RNAs (the "Project")

Lead researcher : Éric Lécuyer
Co-researchers : Daniel Sinnett
Funding sources: IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs:
2018 - 2020

Gut microbiota and pediatric cancer: filling the gap.

Lead researcher : Valérie Marcil
Co-researchers : Daniel Sinnett , Caroline Laverdière
Funding sources: SRC/Société de recherche sur le cancer
Grant programs: PVX12154-Subvention de recherche
2018 - 2020

Profilage de la méthylation des pharmacogènes pendant le traitement de la leucémie lymphoblastique aiguë chez l'enfant

Lead researcher : Isabelle Laverdière
Co-researchers : Maja Krajinovic , Daniel Sinnett , Serge McGraw
Funding sources: SRC/Société de recherche sur le cancer
Grant programs: PVX12154-Subvention de recherche
2016 - 2020

Réseau de médecine génétique appliquée (RMGA).

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Réseaux thématiques de recherche
2017 - 2019

Pharmacogenetics markers for treatment individualization in childhood patients with acute lymphoblastic leukemia

Lead researcher : Maja Krajinovic
Co-researchers : Daniel Sinnett , Caroline Laverdière
Funding sources: SRC/Société de recherche sur le cancer
Grant programs: PVX12154-Subvention de recherche
2017 - 2018

Development of single-cell RNA-seq strategy to study childhood leukemia heterogeneity a pilot study.

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Fondation Charles Bruneau
Grant programs:
2016 - 2017

Plateforme ELISpot et Luminex

Lead researcher : Daniel Sinnett
Co-researchers : Hugo Soudeyns
Funding sources: Fondation Charles Bruneau
Grant programs:
2016 - 2017

Attribution d’une subvention du Réseau de Médecine Génétique Appliquée (RMGA)

Co-researchers : Daniel Sinnett
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Réseaux thématiques de recherche
2016 - 2017

The Terry Fox Precision Oncology for Young people (PROFYLE) Program.

Co-researchers : Daniel Sinnett
Funding sources: Terry Fox Research Institute
Grant programs:
2016 - 2017

Service de bioinformatique appliquée.

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Fondation Charles Bruneau
Grant programs:
2016 - 2017

The Terry Fox Precision Oncology for Young people (PROFYLE) Program.

Co-researchers : Daniel Sinnett
Funding sources: Terry Fox Research Institute
Grant programs:
2016 - 2017

Plateforme Biobanque de cancers pédiatriques

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Fondation Charles Bruneau
Grant programs:
2015 - 2017

Identification of novel therapeutic targets by functional genomic characterization of childhood acute lymphoblastic leukemia.

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: LLS Canada/Leukemia and Lymphoma Society of Canada (The)
Grant programs: PVXX1862-Subvention de fonctionnement
2013 - 2017

GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Pediatric Oncology Group of Ontario
Grant programs:
2013 - 2017

CLINICAL EVALUATION OF SURFACE-PLASMON RESONANCE AND NANOPARTICLE-BASED FLUORESCENT DETECTION OF SERUM BIOMARKERS

Lead researcher : Joelle Pelletier
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(PRCS) Recherche concertée sur la santé (en partenariat avec le CRSNG)
2013 - 2017

CLINICAL EVALUATION OF SURFACE-PLASMON RESONANCE AND NANOPARTICLE-BASED FLUORESCENT DETECTION OF SERUM BIOMARKERS

Lead researcher : Joelle Pelletier
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-(PRCS/CHRP) Recherche en équipe concertée sur la santé avec l'appareillage (avec IRSC)
2015 - 2016

Service de bioinformatique appliquée.

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Fondation Charles Bruneau
Grant programs:
2015 - 2016

Plateforme ELISpot et Luminex.

Lead researcher : Daniel Sinnett
Co-researchers : Hugo Soudeyns
Funding sources: Fondation Charles Bruneau
Grant programs:
2015 - 2016

Plateforme Biobanque de cancers pédiatriques.

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Fondation Charles Bruneau
Grant programs:
2015 - 2016

Stratégie de thérapies ciblées personnalisées dans les cancers réfractaires ou en rechute de l'enfant (Étude TRICEPS).

Lead researcher : Daniel Sinnett
Co-researchers : Maja Krajinovic , Michel Duval , Sonia Cellot
Funding sources: Ministère Économie et Innovation
Grant programs: PVXXXXXX-Soutien à la valorisation et au transfert (PSVT-v2): Soutien aux projets structurants
2014 - 2016

LONG NONCODING RNAS DEREGULATED IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs:
2013 - 2016

GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: The C17 Research Network: Children's Cancer & Blood Disorders
Grant programs:
2011 - 2016

GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-Subvention d'équipe
2011 - 2016

GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS

Lead researcher : Daniel Sinnett
2010 - 2016

INVESTIGATION OF THE GENOMIC DETERMINANTS OF CHILDHOOD LEUKEMIA USING NEXT-GENERATION SEQUENCING

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2013 - 2015

MICRODNA - NOVEL SOURCE OF GENETIC VARIABILITY - ROLE IN SHAPING INDIVIDUAL SENSITIVITY TO CANCER TREATMENT.

Lead researcher : Maja Krajinovic
Co-researchers : Daniel Sinnett , Ivan Brukner
Funding sources: IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs:
2012 - 2015

GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECT IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: SICK KIDS/The Hospital for Sick Children (Sick Kids)
Grant programs:
2012 - 2015

GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: SRC/Société de recherche sur le cancer
Grant programs:
2011 - 2015

SOUTIEN LOGISTIQUE/REDACTIONNEL - SALAIRE POUR PROFESSIONNEL #1

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Fondation Charles Bruneau
Grant programs:
2010 - 2015

INVESTIGATION OF THE GENOMIC DETERMINANTS OF CHILDHOOD LEUKEMIA USING NEXT-GENERATION SEQUENCING

Lead researcher : Daniel Sinnett
2011 - 2014

GENOMIC DETERMINANTS OF CHILDHOOD LEUKEMIA

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: TFF/ Terry Fox Foundation/Fondation Terry Fox (La)
Grant programs:
2011 - 2014

RESEAU DE BIOBANQUES EN LEUCEMIE PEDIATRIQUE AU QUEBEC

Lead researcher : Daniel Sinnett
Co-researchers : Josée Hébert
Funding sources: Ministère Économie et Innovation
Grant programs: PVXXXXXX-Prog. soutien rech (PSR v1): Soutien à des projets de recherche
2010 - 2014

MONTREAL BIOBANK NETWORK FOR PEDIATRIC AND YOUNG ADULT LEUKEMIA : CORE 1 PROPOSAL - CHILDREN LEUKEMIA BANK

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: COLE Foundation/Fondation Cole
Grant programs:
2010 - 2014

GENETIC DETERMINANTS OF THE RESISTANCE TO CORTICOSTEROIDS, VINCRISTINE AND ASPARAGINASE IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA

Lead researcher : Maja Krajinovic
Co-researchers : Daniel Sinnett , Marie-Hélène Roy-Gagnon , Caroline Laverdière
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2010 - 2014

GENOMIC DETERMINANTS OF CHILDHOOD LEUKEMIA

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-Subvention d'équipe: programme nouvelles frontières Terry Fox en cancérologie
2009 - 2014

CIHR TEAM OF PREDICTION AND COMMUNICATION OF FAMILIAL RISK OF BREAST CANCER

Lead researcher : Jacques Simard
Co-researchers : Bernard Lespérance , Daniel Sinnett , Christine Maugard , Denise Avard
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
2011 - 2013

GENOMICS OF CHILDHOOD LEUKEMIA

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: Regroupement de compagnies, corporations canadiennes
Grant programs:
2011 - 2013

GENOMICS OF CHILDHOOD LEUKEMIA

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: MSSS/Ministère de la Santé et des Services sociaux
Grant programs:
2011 - 2013

GENOMICS OF CHILDHOOD LEUKEMIA

Lead researcher : Daniel Sinnett
Funding sources: FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs:
2010 - 2013

STUDIES ON THE ROLE OF NK CELL RECEPTOR GENES AND THEIR LIGANDS IN THE DEVELOPMENT OF LEUKEMIA IN HUMANS

Lead researcher : Ali Ahmad
Co-researchers : Daniel Sinnett , Philip Awadalla , Michel Duval , Elie Haddad
Funding sources: IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs:
2010 - 2013

GENOMIC DETERMINANTS OF CHILDHOOD LEUKEMIA

Lead researcher : Daniel Sinnett
2008 - 2013

CRN-87521 CIHR TEAM OF PREDICTION AND COMMUNICATION OF FAMILIAL RISK OF BREAST CANCER

Lead researcher : Jacques Simard
Co-researchers : Bernard Lespérance , Daniel Sinnett , Bartha Maria Knoppers , Christine Maugard , Denise Avard
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
2008 - 2013

CIHR TEAM OF PREDICTION AND COMMUNICATION OF FAMILIAL RISK OF BREAST CANCER

Lead researcher : Bartha Maria Knoppers
Co-researchers : Bernard Lespérance , Daniel Sinnett , Christine Maugard , Denise Avard , Jacques Simard
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
2008 - 2011

REGULATORY POLYMORPHISMS IN APOPTOSIS GENES AND SUSCEPTIBILITY TO CHILDHOOD LEUKEMIA

Lead researcher : Daniel Sinnett
2010

DEVELOPPEMENT DE DEMANDE: GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS

Lead researcher : Daniel Sinnett
2009

ATELIER GENOMIQUE FRSQ-NSFC, BEIJING, CHINA

Lead researcher : John David Rioux , Daniel Sinnett

Outreach

Publications and presentations

Publications

Publications choisies

  • B. Ge, D. K. Pokholok, E. Grundberg,  T. Kwan, L. Morcos, J. Le,  D.J. Verlaan, V. Koka, K.C.L. Lam, V. Gagné, J. Dias, R. Hoberman, A. Montpetit, M.M. Joly, E. J. Harvey, D. Sinnett, P. Beaulieu*, R. Hamon*, A. Graziani, K. Dewar, E. Harmsen, J. Majewski, A.K. Naumova,  M. Blanchette, H.H.H. Göring, K.L. Gunderson, T. Pastinen (2009). Global patterns of cis-variation in human cells revealed by high-density allelic expression analysis. Nature Genetics  Nov;41(11):1216-22.
  • Sherborne A, Hosking FJ, Prasad RB, Kumar R, Koehler R, Vijayakrishnan J, Papaemmanuil E, Bartram CR, Stanulla M, Schrappe M, Gast A, Sheridan E, Taylor M, Kinsey SE, Lightfoot T, Roman E, Irving JAE, Allan JM, Moorman AV, Harrison CJ, Tomlinson IP, Szalai C, Semsei AF, Erdelyi DJ, Krajinovic M, Sinnett D, Healy J, Neira AG, Hemminki K, Greaves M, Houlston RS (2010). Variation at 9p21.3 (CKN2A) influences childhood acute lymphoblastic leukemia risk. Nat Genet. Jun;42(6):492-4.
  • Busche S, Ge B, Vidal R, Spinella J-F, Saillour V, Richer C, Healy J, Chen S-H, Droit A, Sinnett D#, Pastinen T. (2013) Integration of high-resolution methylome and transcriptome analyses to dissect epigenomic changes in childhood acute lymphoblastic leukemia. Cancer Research, May 35(4) e157-162. #corresponding author.
  • Spinella J-F, Cassart P, Richer C, Saillour V, Ouimet M, Langlois S, St-Onge P, Sontag T, Healy J, Minden M, Sinnett D (2016) The genomic characterization of pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia reveals novel recurrent driver mutations.  Oncotarget 2016 Sep 1. doi: 10.18632/oncotarget.11796
  • Marcoux S, Drouin S, Laverdière C, Alos N, Andelfinger GU, Bertout L, Curnier D, Friedrich MG, Kritikou EA, Levy E, Lippé S, Marcil V, Raboisson M-J, Rauch F, Robaey P, Séguin C, Sultan S, Krajinovic M, Sinnett D.  (2016)The PETALE Study: Late Adverse Effects and Biomarkers in Childhood Acute Lymphoblastic Leukemia Survivors.  Pediatric Blood & Cancer Dec 4. doi: 10.1002/pbc.26361  (PETALE-CIHR team leader)

Disciplines

  • Molecular Biology
  • Oncology
  • Genetics
  • Pediatrics

Areas of expertise

  • Bioinformatics
  • Leukemia
  • Cell
  • Cancer Diagnosis and Detection
  • Data mining
  • Gene Regulation and Expression
  • Suppressor Gene
  • Genes
  • Susceptibility Genes
  • Complex Trait Genetics
  • Cancer Genetics
  • Genetics and Heredity
  • Molecular Genetics
  • Genome
  • Genomics
  • Genotype and Phenotype
  • Genetic Diseases
  • Genetic Markers
  • DNA and RNA Chips
  • Polymorphism