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Health Sciences

John David Rioux

Base génétique et fonctionnelle des maladies inflammatoires

Professeur titulaire

Faculté de médecine - Département de médecine

514 376-3330

john.david.rioux@umontreal.ca

Secondary number: 514 376-3330 #3741 (Travail 1)

Profile

Research expertise

Le laboratoire de génétique et médecine génomique en inflammation étudie la base génétique et fonctionnelle des maladies inflammatoires communes dont l'asthme, les maladies cardiovasculaires, la maladie de Crohn, la colite ulcéreuse, le lupus érythémateux disséminé, la polyarthrite rhumatoïde et la sclérose en plaques. En plus, notre groupe s'intéresse à identifier des gènes responsables de maladies mendéliens rares qui affectent la population canadienne française.

Biography

John D. Rioux est professeur agrégé de médecine à l'Université de Montréal et à l’Institut de Cardiologie de Montréal où il œuvre en tant que chercheur et directeur du Laboratoire de génétique et médecine génomique en inflammation. Depuis 2005, il est titulaire de la Chaire de recherche du Canada en génétique et médecine génomique.

Le Dr Rioux a obtenu un baccalauréat en sciences (B.Sc. Immunologie) en 1987 et un doctorat en médecine (Ph.D. Médecine expérimentale) de l'Université McGill en 1994. Il a ensuite complété un stage postdoctoral au Whitehead Institute/MIT Center for Genome Research en 1997. À la suite de cette formation, le Dr Rioux a créé un groupe de recherche travaillant sur la génétique et la génomique des maladies monogéniques et des maladies polygéniques/complexes. En 2001, il est devenu directeur du groupe de recherche sur les maladies inflammatoires au Whitehead Institute/MIT Center for Genome Research, puis au Broad Institute of MIT and Harvard. Il a été nommé professeur adjoint au Harvard Medical School et au Brigham and Women’s Hospital en 2003 et, en 2004, membre associé du Broad Institute of MIT and Harvard jusqu’en 2007.

Ses recherches ont pour but de découvrir les facteurs de risque génétiques des maladies communes (polygéniques) et de déterminer les mécanismes biologiques par lesquelles ces variantes génétiques influencent le risque de développer ces maladies chroniques.  Il est membre fondateur de quatre consortiums internationaux en génétique. Dr. Rioux a plus de 150 publications incluant plusieurs publications dans les revues de prestige comme  Nature, Science, Nature Genetics, et New England Journal of Medicine.

Affiliations and responsabilities

Research affiliations

Research units

Titulaire

Membre

Affiliated institutions

  • Institut de cardiologie de Montréal (ICM)

Teaching and supervision

Student supervision

Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)

2016

Développement d’une méthode bio-informatique permettant de relier les gènes aux métabolites

Graduate : Cherkaoui, Sarah
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2016

Déterminer le rôle de C1orf106, un gène associé aux maladies inflammatoires de l’intestin

Graduate : Lévesque, Chloé
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.

Projects

Research projects

2022 - 2029

Canada Research Chair in Genetics and Genomic Medicine

Lead researcher : John David Rioux
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVX50399-Chaires de recherche du Canada
2021 - 2027

Identifying and functionally validating IBD genes and variants impacting intestinal epithelial barrier integrity

Lead researcher : John David Rioux
Co-researchers : François Boudreau
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2018 - 2024

Characterization of the immunologic events that lead to development of Systemic Autoimmune Rheumatic Disease

Lead researcher : Joan Elizabeth Wither
Co-researchers : John David Rioux
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2021 - 2022

Developing an inexpensive blood-based diagnostic test for Crohn's Disease

Lead researcher : John David Rioux
Funding sources: Génome Québec
Grant programs:
2015 - 2022

Génétique et médecine génomique

Lead researcher : John David Rioux
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVX50399-Chaires de recherche du Canada
2018 - 2021

A prospective study of immune cell responsiveness to understand drug response in UC patients treated with tofacitinib

Lead researcher : John David Rioux
Funding sources: Pfizer Canada Inc.
Grant programs:
2015 - 2021

Suvention FICM 2015-2018

Lead researcher : John David Rioux
Funding sources: Fondation de l'Institut de cardiologie de Montréal
Grant programs:
2014 - 2021

Insights into Parkinson's disease, Crohn's disease and leprosy: common role of LRRK2

Lead researcher : David Park
Co-researchers : John David Rioux
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
2019 - 2020

Comprendre l'hétérogénéité tissulaire dans l'acidose lactique: une fenêtre sur les mécanismes physiopathologiques et cardioprotection

Lead researcher : John David Rioux
Funding sources: Le Grand Défi Pierre Lavoie
Grant programs:
2018 - 2020

Canadian Autoimmunity Standardization Core (CAN-ASC)

Co-researchers : Christine Des Rosiers , John David Rioux
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
2018 - 2019

Understanding the role of Epigenetic Reader SP 140 in IBD

Lead researcher : John David Rioux
Funding sources: NIH/National Institutes of Health (NIH)
Grant programs:
2013 - 2018

IBD GENOMIC MEDICINE CONSORTIUM (IGENOMED) : TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO A PERSONALIZED APPROACH TO TREATING THE INFLAMMATORY BOWEL DISEASES

Co-researchers : John David Rioux , Jean Lachaine
Funding sources: Génome Québec
Grant programs:
2013 - 2018

IBD GENOMIC MEDICINE CONSORTIUM (IGENOMED): TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO A PERSONALIZED APPROACH TO TREATING THE INFLAMMATORY BOWEL DISEASES

Lead researcher : John David Rioux
Co-researchers : Christine Des Rosiers , Guillaume Lettre , Sylvie Lesage , Jean Lachaine , Lambert Busque , Brian White-Guay , Sidhu Sachdev , Lawrence Joseph , Alain Bitton , Harding Mathew , Levings Megan , Denis J. Garand , Sophie Veilleux
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada , Génome Canada , AmorChem , Génome Québec
Grant programs: , , ,
2016 - 2017

Plateforme de support aux analyses cellulaires et génomiques appliquées à la recherche biomédicale

Lead researcher : John David Rioux
Funding sources: FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds des leaders
2015 - 2017

Defining the causality & biologic impact of genes within ulcerative colitis loci.

Lead researcher : John David Rioux
Funding sources: NIH/National Institutes of Health (NIH)
Grant programs:
2014 - 2017

IBD GENOMIC MEDICINE CONSORTIUM (IGENOMED) : TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO A PERSONALIZED APPROACH TO TREATING THE INFLAMMATORY BOWEL DISEASES

Co-researchers : John David Rioux , Brian White-Guay
Funding sources: Génome Québec
Grant programs:
2015 - 2016

Studies of immune status and responsiveness, metabolites and secreted proteins in retrospective and prospective IBD cohorts

Co-researchers : John David Rioux
Funding sources: NIH/National Institutes of Health (NIH)
Grant programs:
2013 - 2015

SUBVENTION FICM 2013-2014

Lead researcher : John David Rioux
Funding sources: Fondation de l'Institut de cardiologie de Montréal
Grant programs:
2010 - 2015

GENETICS AND GENOMIC MEDICINE OF INFLAMMATION

Lead researcher : John David Rioux
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVX50399-Chaires de recherche du Canada
2009 - 2015

CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATORY DISEASES : IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY: A MODAL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES

Lead researcher : John David Rioux
Co-researchers : Sylvain Chemtob , Stephen Michnick , Sylvie Lesage
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-Subvention d'équipe
2009 - 2015

CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATION DISEASE : IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY : A MODEL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES

Lead researcher : Stephen Michnick
Co-researchers : John David Rioux
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-Subvention d'équipe
2009 - 2015

CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATORY DISEASES : IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY : A MODAL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES

Lead researcher : John David Rioux
Co-researchers : Sylvain Chemtob , Stephen Michnick , Sylvie Lesage
Funding sources: Fondation canadienne des maladies inflammatoires de l'intestin
Grant programs:
2009 - 2015

CIHR TEAM IN THE LEIGH SYNDROME FRENCH CANADIAN TYPE (LSFC) : TRANSLATING LSFC GENE DISCOVERY INTO TREATMENTS FOR PATIENTS

Lead researcher : Christine Des Rosiers
Co-researchers : Bruce G. Allen , Lise Coderre , Yan Burelle , John David Rioux , Catherine Laprise , Eric Alan Shoubridge , Charles Morin
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
2014

IBD GENOMIC MEDECINE CONSORTIUM (IGENOMED) : TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO A PERSONALIZED APPROACH TO TREATING THE INFLAMMATORY BOWEL DISEASES

Lead researcher : John David Rioux
Funding sources: Crohn's and Colitis Foundation of America
Grant programs:
2013 - 2014

MONTREAL-BOSTON COLLABORATIVE IBD GENETIC RESEARCH CENTER

Lead researcher : John David Rioux
Co-researchers : Alain Bitton
Funding sources: NIH/National Institutes of Health (NIH)
Grant programs:
2009 - 2014

CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATORY DISEASES: IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY: A MODAL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES

Lead researcher : John David Rioux
2011 - 2013

GENETIQUE ET MEDECINE GENOMIQUE DE L'INFLAMMATION

Lead researcher : John David Rioux
Funding sources: FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs:
2011 - 2013

GENETIQUE ET MEDECINE GENOMIQUE DE L'INFLAMMATION

Lead researcher : John David Rioux
Funding sources: Regroupement de compagnies, corporations canadiennes
Grant programs:
2011 - 2013

GENETIQUE ET MEDECINE GENOMIQUE DE L'INFLAMMATION

Lead researcher : John David Rioux
Funding sources: MSSS/Ministère de la Santé et des Services sociaux
Grant programs:
2009 - 2011

BIOLOGIE INTEGRATIVE DES GENES ASSOCIES A PLUSIEURS MALADIES INFLAMMATOIRES: AMELIORATIONS DIAGNOSTIQUE ET THERAPEUTIQUE

Lead researcher : John David Rioux
2009

ATELIER GENOMIQUE FRSQ-NSFC, BEIJING, CHINA

Lead researcher : Daniel Sinnett , John David Rioux

Outreach

Publications and presentations

Disciplines

  • Genetics

Areas of expertise

  • Genetic Mapping
  • Chromosomes: Structure / Organization
  • Genetic Screening of Diseases
  • Genomic Damage and Repair
  • Gene Regulation and Expression
  • Genes
  • Susceptibility Genes
  • Applied Genetics
  • Complex Trait Genetics
  • Developmental Genetics
  • Genetics and Ethics
  • Genetics and Heredity
  • Evolutionary Genetics
  • Molecular Genetics
  • Population Genetics
  • Genome
  • Genomics
  • Gene-Environment Interactions
  • Genetic Diseases
  • Genetic Markers
  • DNA and RNA Chips
  • Transgenic Model
  • Mutation (Process)
  • Phenotype
  • Polymorphism
  • Proteins
  • Proteomics
  • Telomeres
  • Gene Therapy