Health Sciences; Medical Sciences
Benoit Coulombe
- Professeur/chercheur titulaire
-
Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire
Secondary email:
benoit.coulombe@ircm.qc.ca
(Travail)
Profile
Research expertise
Mon laboratoire cherche à développer une compréhension détaillée des mécanismes de régulation de la transcription génique par l'ARN polymérase II chez les mammifères.
Le génome des mammifères compte environ 30 000 gènes dont l’expression doit être contrôlée avec précision pour permettre la croissance et la différenciation des cellules. L’expression d’un gène est activée lorsque l’information qu’il encode est transcrite sous forme d’ARNm par l’enzyme ARN polymérase II. La transcription par l’ARN polymérase II est un processus complexe au cours duquel la polymérase doit reconnaitre le promoteur génique, ouvrir la double-hélice d’ADN au site d’initiation de la transcription, catalyser la polymérisation des ribonucleotides en utilisant l’un des brins d’ADN comme matrice, et se déplacer le long de l’unité génique en allongeant l’ARN. De nombreuses interactions moléculaires entre la polymérase et la matrice d’ADN, l’ARN en synthèse et une myriade de protéines régulatrices contrôlent l’activité transcriptionnelle. Notre laboratoire développe et utilise des technologies de pointe en biologie moléculaire, en biochimie, en génomique, en protéomique et en bioinformatique afin de construire une compréhension détaillée des mécanismes de régulation de la transcription par l’ARN polymérase II.
Affiliations and responsabilities
Research affiliations
Research units
Membre
Affiliated institutions
- Institut de recherches cliniques de Montréal (IRCM)
Teaching and supervision
Teaching
Courses taught (current session only)
Programs
- 106010 – Baccalauréat en chimie
- 106020 – Majeure en chimie
- 106040 – Mineure en chimie
- 117510 – Baccalauréat en informatique
- 117520 – Majeure en informatique
- 117540 – Mineure en informatique
- 146511 – Baccalauréat en biochimie et médecine moléculaire
- 146811 – Baccalauréat en bio-informatique
- 146811 – Baccalauréat en bio-informatique
- 196710 – Programme d'accueil en sciences
Student supervision
Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)
2015
Étude de la fonction de la protéine RPAP4 et de son association avec l’ARN polymérase II
Graduate : Lacombe, Andrée-Anne
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2011
Analyse de la localisation génomique et identification de nouvelles fonctions des sous-unités Rpb4/Rpb7 de l’ARN polymérase II et des facteurs TFIIF, TFIIS et UBR5
Graduate : Cojocaru, Marilena
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2011
Cartographie du réseau d'interactions protéiques de la machinerie de transcription dans les cellules humaines
Graduate : Rusu, Natalia
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2009
Systematic analysis of protein complexes involved in the human RNA polymerase II machinery
Graduate : Al-Khoury, Racha
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2008
Analyse des complexes protéiques interagissant avec la machinerie de l'ARN polymérase II dans les cellules humaines
Graduate : Jeronimo, Célia
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2005
Mécanismes de transcription par l'ARN polymérase II : étude structure-fonction du site catalytique et rôles des facteurs de transcription TFIIA, TFIIE et TFIIF
Graduate : Langelier, Marie-France
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2005
Étude fonctionnelle des domaines structuraux des sous-unités catalytiques de l'ARN polymérase II humaine
Graduate : Baali, Dania
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2005
Localisation de l'ARN polymérase II humaine à travers le génome en couplant double immunoprécipitation de la chromatine et clonage
Graduate : Côté, Pierre
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2005
La machinerie transcriptionnelle basale : étude de son organisation moléculaire au promoteur génique et de ses interactions avec les régulateurs XAB1 et DDX5
Graduate : Thérien, Cynthia
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Projects
Research projects
2019
- 2024
Profiles and biomarkers of neuromuscular junctions of ALS patients
Lead researcher :
Richard Robitaille
Funding sources:
SLA Canada/Société canadienne de la sclérose latérale amyotrophique
Grant programs:
2020
- 2023
Reducing the activity of the phosphatase STEP to improve memory performance during aging
Lead researcher :
Jonathan Brouillette
Co-researchers :
Benoit Coulombe
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2017
- 2021
A patent-derived IPSC platform of disease relevant cell models for biological studies
Lead researcher :
Guy Rouleau
Co-researchers :
Benoit Coulombe
Funding sources:
Fondation Brain Canada
Grant programs:
2016
- 2021
A patent-derived iPSC platform of disease relevant cell models for biological studies
Lead researcher :
Guy Rouleau
Co-researchers :
Benoit Coulombe
Funding sources:
SLA Canada/Société canadienne de la sclérose latérale amyotrophique
Grant programs:
2017
- 2020
Unraveling the molecular basis of novel forms of hypomyelinating leukodystrophies
Lead researcher :
Genevieve Bernard
Co-researchers :
Benoit Coulombe
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2016
- 2020
Deciphering breast cancer HER2-negativity with regard to HER2-targeted therapy
Lead researcher :
Francine Durocher
Co-researchers :
Benoit Coulombe
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2015
- 2019
Caractérisation du protéome associé à des loci génétiques d'intérêt
Lead researcher :
François Robert
Co-researchers :
Benoit Coulombe
Funding sources:
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs:
PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2016
- 2018
POLR3-related leukodystrophiy: a step forward clinical trials
Lead researcher :
Benoit Coulombe
Funding sources:
ELA/Association européenne contre les leucodystrophies
Grant programs:
2013
- 2018
THE FUNCTION AND REGULATION OF PCSK9: A NOVEL MODULATOR OF LDLR ACTIVITY
Lead researcher :
Nabil Georges Seidah
Funding sources:
Fondation Leducq
Grant programs:
2016
Identification of small-molecule proteostasis regulators to repair conformational defects in POLR3 hypomyelinating leukodusytrophies
Lead researcher :
Benoit Coulombe
Funding sources:
Fondation Leuco dystrophie
Grant programs:
2013
- 2016
REGULATION OF THE INCLUSION BODY MYOSITIS-ASSOCIATED PROTEIN VCP BY METHYLATION
Lead researcher :
Benoit Coulombe
Funding sources:
Association canadienne de la dystrophie musculaire (L')
Grant programs:
2012
- 2016
CLINICAL, MOLECULAR AND PATHOPHYSIOLOGICAL CHARACTERIZATION OF POL III-RELATED LEUKODYSTROPHIES
Lead researcher :
Genevieve Bernard
Co-researchers :
Benoit Coulombe
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
2010
- 2016
Training program in cellular dynamics of macromolecular complexes
Lead researcher :
Christian Baron
Co-researchers :
Jurgen Sygusch
,
Stephen Michnick
,
Antonio Nanci
,
Benoit Coulombe
,
Pascal Chartrand
,
Nicolas Lartillot
,
Marlene Oeffinger
,
James G. Omichinski
,
Daniel Zenklusen
,
Jackalyn Marie Vogel
,
James W Coulton
,
Sachdev Sidhu
,
Franck Duong
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PV118026-FONCER : Prog. formation orientée nouveauté, la collaboration et l'expérience en recherche
2012
- 2014
NSERC CREATE TRAINING PROGRAM : CELLULAR DYNAMICS OF MACROMILECULAR COMPLEXES
Lead researcher :
Benoit Coulombe
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
2009
REMBOURSEMENT DE FRAIS - ATELIER GENOMIQUE FRSQ-VSFC, BEIJING CHINA
Lead researcher :
Benoit Coulombe
Outreach
Publications and presentations
Disciplines
- Biochemistry
- Molecular Biology
Areas of expertise
- Nucleic Acids
- Cell
- Combinatorial Chemistry
- Chromosome (Living Organisms)
- Inorganic and Organometallic Compounds
- Enzymes and Proteins
- Gene (Living Organisms)
- Macromolecules
- Biological and Biochemical Mechanisms
- Metals and Nonmetals
- Bioactive Molecules
- Organic Molecules and Biomolecules
- Quantum Phenomena
- Chemical Synthesis and Catalysis
- COVID-19
- COVID19