Roger Lippé
Analyse des interactions hôte-pathogène avec le virus HSV-1 et les coronavirus
- Professeur titulaire
-
Faculté de médecine - Département de pathologie et biologie cellulaire
Profile
Research expertise
A) Transport intracellulaire des capsides du virus de l'herpès simplex de type 1 (HSV-1)
Les virus de l'herpès sont des agents pathogènes largement répandus qui sont associés à plusieurs affections bénignes (par exemple, boutons de fièvre, mononucléose, varicelle, etc.), mais également à des maladies sexuellement transmissibles, au zona, à des affections congénitales potentiellement graves et même à la cécité d'origine virale. Une fois infectés, ces virus restent dormants dans notre organisme et peuvent périodiquement se réactiver. Un objectif majeur du laboratoire est de caractériser les interactions moléculaires du virus de l'herpès simplex de type 1 (HSV-1) avec ses cellules hôtes. Ce virus, comme tous les membres de la famille de l’herpès, réplique son génome et l’incorpore dans les capsides virales nouvellement assemblées dans le noyau. Ces particules s'échappent alors du noyau par un chemin inhabituel, car trop volumineuses pour traverser les pores nucléaires. Cela implique le bourgeonnement des capsides à travers la membrane nucléaire interne, produisant des particules virales périnucléaires enveloppées à courte durée de vie. Ces particules fusionnent ensuite avec la membrane nucléaire externe pour libérer des capsides nues dans le cytoplasme. Une autre étape critique dans la sortie des particules virales nouvellement produites est leur acquisition d’une enveloppe finale et mature à partir d’un compartiment intracellulaire, à partir de laquelle elles atteignent finalement la surface cellulaire. Bien que ce cycle de vie de réplication soit généralement accepté, la machinerie moléculaire à l’origine de ces processus est mal comprise (voir le modèle de réplication HSV-1 ci-dessous). Pour étudier la sortie complexe des herpèsvirus, notre laboratoire utilise une combinaison d'outils classiques de biologie cellulaire, de biochimie et de virologie ainsi que des technologies innovantes telles que la spectrométrie de masse, la virométrie en flux et des tests in vitro pour reproduire la sortie virale du HSV-1. Cela nous a permis de définir la composition protéique totales des particules virales matures et intermédiaires, de révéler l'incorporation de nombreuses protéines cellulaires dans ces particules et de caractériser jusqu'à présent les fonctions de certaines d'entre elles. Cela devrait ouvrir la voie à de nouveaux traitements thérapeutiques ciblant les protéines cellulaires essentielles à ces virus.
B) Coronavirus
Le COVID-19 a eu un impact considérable sur notre société et sur la santé des gens. Nous avons donc exploité notre expertise en virologie et en interactions hôte-pathogène pour sonder et caractériser par des moyens innovants les protéines cellulaires incorporées dans les coronavirus matures. Cela nous permettra de mieux déchiffrer leurs interactions hôte-pathogène et, à terme, de concevoir de nouveaux traitements.
C) Maladie d'Alzheimer
Nous avons récemment découvert des liens moléculaires entre le HSV-1 et la maladie d'Alzheimer. Nous étudions actuellement si le virus altère la formation de plaques amyloïdes et pourrait contribuer à la maladie.
Thèmes
- Interactions hôte-pathogènes
- Maladie d'Alzheimer
- Virologie
- Biologie cellulaire
- Virus herpes simplex
- Coronavirus (HCoV-OC43; SARS-CoV-2)
- Protéomique
- Transport intracellulaire
- Virométrie de flux
Intérêts de recherche
- Définir les mécanismes qui régulent le transport intracellulaire des capsides du virus herpès simplex de type 1 (VHS-1) et des coronavirus
- Identifier le contenu protéique des intermédiaires viraux
- Caractériser la séquence d’acquisition du tégument viral
- Élucider le transport du VHS-1 de l’appareil trans-Golgien à la membrane plasmique
- Élucider le rôle des protéines cellulaires incorporées dans les virions matures
- Déterminer les bases moléculaires de la virulence des coronavirus
- Identification de nouvelles cibles thérapeutiques
Biography
Microbiologiste et biologiste cellulaire de formation, le Dr Lippé est diplômé en 1986 de l’Université de Montréal où il a obtenu un baccalauréat en sciences biologiques (option microbiologie). Il a ensuite poursuivi sa formation dans le laboratoire du Dr Frank Graham à l’Université McMaster en obtenant une maîtrise en science (M.Sc.) en 1989. Son projet d’étude était le mode de réplication des Adénovirus, un pathogène humain causant des rhumes mais un carcinogène chez l'animal. Ceci a été suivi d’un doctorat (Ph.D.) obtenu de l’Université de la Colombie britannique (1995) sous la tutelle du Dr Wilfred Jefferies, où il a étudié les interactions de ce même Adénovirus avec le système immunitaire (présentation antigénique dans le contexte du complexe majeur d'histocompatibilité de classe I). Il a finalement poursuivi sa formation par des études post-doctorales dans le laboratoire du Dr Marino Zerial (1995-2000), un expert en biologie cellulaire, notamment en transport intracellulaire. Il est depuis professeur au Département de Pathologie et Biologie cellulaire, d’abord comme professeur associé (2001-2007), ensuite à titre de professeur agrégé (2007-2017) et finalement comme professeur titulaire (2017- ). En 2019, il s'est aussi joint au centre de Recherche du CHUSJ.
Awards and recognitions
- 2015-2021: Subvention à titre d’investigateur principal des IRSC
- 2016-2022: Subvention à titre d’investigateur principal du CRSNG
- 2017-2020: Subvention à titre d’investigateur principal du FRQNT
- 2020-2021: Subvention à titre de co-appliquant du Conseil National de Recherches Canada
- 2021-2024: Subvention à titre de co-appliquant des IRSC
- 2021-2022: Subvention à titre d’investigateur principal de la Faculté de médecine
- 2021-2026: Subvention à titre d’investigateur principal des IRSC
- 2022-2027: Subvention à titre d’investigateur principal du CRSNG
- 2023-2024: Subvention à titre d’investigateur principal de la fondation IDSA
- 2024-2025: Subvention à titre d’investigateur principal des IRSC
- 2023-2025: Fonds du privé (Glycovax Pharma)
education
- 1986 — B.Sc. — Microbiologie — Université de Montréal
- 1989 — M.Sc. — Microbiologie, Virologie — McMaster University
- 1995 — PhD — Biologie cellulaire, Immunologie, Microbiologie, Virologie — University of British Columbia
- 2000 — Post-doctorat — Biologie cellulaire — EMBL
Affiliations and responsabilities
Research affiliations
Research units
Membre
Affiliated institutions
- Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine (CHU Sainte-Justine)
Teaching and supervision
Student supervision
Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)
Role of the host protein DDX3X in HSV-1 nuclear egress
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Proteomics of mature extracellular Human coronavirus OC43
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Production, quantification et détection des coronavirus
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Validation des partenaires de la glycoprotéine M du virus de l’herpès simplex de type 1
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Impact of viral and cellular factors on the nuclear egress of human herpes simplex virus Type-1 (HSV-1) capsids
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Le rôle des importines dans le ciblage à la membrane nucléaire interne de la glycoprotéine M de l'herpès simplex de type 1
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
The role of poly(C)-binding protein 1 in HSV-1 Infection
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Rôle du complexe LINC dans la propagation du virus de l’herpès simplex de type 1
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
The effect of calcium homeostasis on HSV-1 propagation
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Analyse des protéines du tégument par virométrie en flux et protéomique des capsides nucléaires du Virus Herpès Simplex de type 1 (VHS-1)
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Identification des partenaires de gM du virus VHS-1 par BioID couplée à la spectrométrie de masse
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Rôle des modulateurs de la protéine kinase D dans la propagation du virus herpès simplex de type 1
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
L’étude de la glycoprotéine gM du virus Herpès simplex de type 1 (HSV-l) : identification de ses partenaires viraux et cellulaires et leur rôle dans la régulation de l’infection virale.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Impact of ATP-dependent RNA Helicase DDX3X on Herpes Simplex Type 1 (HSV-1) Replication
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Importance des protéines cellulaires incorporées dans les virions matures d’HSV-1
Diplômé(e) : Yakova, Yordanka
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Caractérisation de la migration du virus Herpès simplex de type 1 (HSV-1) par protéomique
Diplômé(e) : Loret, Sandra
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Analyse des protéines cellulaires incorporées dans les particules matures du virus de l’Herpès simplex de type 1
Diplômé(e) : Stegen, Camille
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Étude de la sortie du virus herpès simplex de type 1 (HSV 1) hors du noyau
Diplômé(e) : Rémillard-Labrosse, Gaudeline
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Contribution de la Glycoprotéine M dans la Sortie de HSV-1
Diplômé(e) : Zhang, Jie
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
La protéine majeure de la capside de l’HSV-1 est ubiquitinée
Diplômé(e) : Raymond, Pascal
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
The role of the TGN in the transport of herpes simplex virus type I capsids
Diplômé(e) : Mihai, Constantina
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Protocole d'isolation des virions périnucléaires et extracellulaires chez HSV-1 pour l'étude par une approche protéomique du mécanisme de transport intracellulaire emprunté par le virus
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Détermination du site de ré-enveloppement des capsides de HSV-1
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Theses and dissertation supervision
- Turcotte, Sophie, Détermination du site de ré-enveloppement des capsides de HSV-1. 2005
- Taquet, Geneviève, Protocole d'isolation des virions périnucléaires et extracellulaires chez HSV-1 pour l'étude par une approche protéomique du mécanisme de transport intracellulaire emprunté par le virus. 2004
Projects
Research projects
Molecular insights into the targeting of proteins to the inner nuclear m e m b r a n e
Molecular analysis of Herpes simplex virus type I egress
Deciphering the immunopeptidomic landscape of COVID-19 disease
Molecular analysis of Herpes simplex virus type I egress
Molecular insights into the targeting of proteins to the inner nuclear membrane
Molecular analysis of Herpes simplex virus type I egress
Supplément COVID-19 CRSNG_Molecular insights into the targeting of proteins to the inner nuclear membrane
Transport intracellulaire des virus hépatiques.
Identification de nouveau facteurs de virulence du virus herpès simplex de type 1
Molecular analysis of Herpes simplex virus type I egress
Description
Cold sores are a recurring issue for a third of the population and are typically caused by a virus called Herpes simplex virus type 1 (HSV-1). This virus belongs to a large family of human pathogens associated with several additional clinical consequences (genital herpes, blindness, congenital diseases, mononucleosis, varicella, zona, encephalitis and some cancers). Unfortunately, while the propagation of the virus is treatable, these viruses persist forever in humans once contracted. Moreover, they can be reactivated under certain conditions and even people without symptoms can shed infectious viruses. Finally, drug resistance is becoming an issue, pinpointing the need for novel therapeutics. In an attempt to better understand how these viruses spread, our laboratory examines their intimate interactions with cells, the building blocks of our body. We focus on HSV-1, a virus that is present in nearly 90% of the population. More precisely, we study the mechanism by which the newly replicated virus is released and can thus infect neighboring cells and individuals. These findings should guide us towards novel therapeutic approaches not only against this virus but against the entire herpes family of viruses.
MOLECULAR INSIGHTS INTO THE TARGETING OF PROTEINS TO THE INNER NUCLEAR MEMBRANE
FGR CRSNG : 2015-2016 : Fonds d'urgence IRSC
MOLECULAR ANALYSIS OF HERPES SIMPLEX VIRUS TYPE I EGRESS
Molecular insights into the targeting of proteins to the inner nuclear membrane
MOLECULAR INSIGHTS INTO THE TARGETING OF PROTEINS TO THE INNER NUCLEAR MEMBRANE
MECANISMES IMPLIQUES DANS LA PROPAGATION DE LA PATHOLOGIE DE TAU DANS LA MALADIE D'ALZHEIMER
Tissue Culture Equipment
Ubiquitination of HSV-1 Virions and capsids
Outreach
Publications and presentations
Publications
- Joharinia, N., Bonneil, E., Grandvaux, N., Thibault, P and Lippé R. (2024). Comprehensive Proteomic Analysis of HCoV-OC43 Virions and Virus-Modulated Extracellular Vesicles. J Virol 98(7): e0085024
- Khadivjam, B., Bonneil, E., Thibault, P. and Lippé, R. (2023). RNA helicase DDX3X modulates Herpes Simplex Virus type 1 nuclear egress. Commun Biol. 6 article 134 pp 1-18
- Savoie, C. and Lippé, R. (2022). Optimization of coronavirus OC43 propagation and quantification. PeerJ 10:e13721
- Cruz-Palomar, K., Hawkins, J., Quenneville, J., Gagnon, E. and Lippé, R. (2022). SUN2 Modulates the Propagation of HSV-1. J Virol. 96:e0045322.
- El Bilali, N.§, Khadivjam, B.§, Thornbury, M., Bonneil, E., Thibault, P. and Lippé, R. (2021). Proteomics of Herpes simplex virus type 1 nuclear capsids. J Virol. 95: e01842-19 § Contribution équivalente des deux premiers auteurs
- Boruchowicz, B., Hawkins, J., Cruz-Palomar, K. and Lippé, R. (2020). The XPO6 exportin mediates HSV-1 gM nuclear release late in infection. J Virol (e00753-20).
- Lippé, R. (2020). Transport intracellulaire du Virus Herpès Simplex 1. Virologie 24:210-230
- Lippé, R. (2020). Characterization of extracellular HSV-1 virions by proteomics. Methods Mol Biol. 2060:279-88
- Khadivjam, B. El Bilali, N. and Lippé, R. (2020). Analysis and sorting of individual viral particles by flow virometry. Methods Mol Biol. 2060: 289-303
- Roussel É and Lippé R. (2018). Cellular Protein Kinase D Modulators Play a Role during Multiple Steps of Herpes Simplex Virus Type 1 Egress. J Virol 92: e01486-18
- Lippé, R. (2018). Flow virometry: A Poweful Tool To Functionally Characterize Viruses. J Virol 92: e01765-17
- El Kasmi I, Khadivjam B, Lackman M, Duron J, Bonneil E, Thibault P. and Lippé R. (2017). Extended synaptotagmin 1 interacts with the Herpes simplex virus type 1 glycoprotein M and negatively modulates virus-induced membrane fusion. J Virol 92:e01281-17
- El Bilali, N., Duron, J., Gingras, D. and Lippé, R (2017). Quantitative evaluation of Protein Heterogeneity within Herpes simplex type I Viral Particles. J Virol, 91: e00320-17
- Rodriguez, L, Nguyen-Vi, M. Desjardins, A, Lippé, R., Fon, E and Leclerc N (2017). Rab7A regulates Tau secretion. J Neurochemistry,141: 592-605
- Khadivjam, B., Stegen, C., Hogue-Racine, M.A., El Bilali, N., Döhner, K., Sodeik, B. and Lippé, R. (2017). The host ATP-Dependent RNA Helicase modulates the expression of HSV-1 viral genes. J Virol 91:e02411-16
- Striebinger, H. Zhang, J., Ott, M., Funk, C., Radtke, K., Duron, J., Ruzsics, Z., Haas,J., Lippé, R. and Bailer, S.M. (2015). Subcellular trafficking and functional importance of Herpes simplex virus type 1 Glycoprotein M domains. J Gen Virol 96: 3313-3325
- El Kasmi, I. and Lippé R. (2015). HSV-1 gN partners with gM to modulate the viral fusion machinery. J Virol, 89:2313-23.
Disciplines
- Virology
- Cell Biology
- Microbiology
Areas of expertise
- Cell
- Cellular Defense
- Viral Infections
- Infectious Diseases
- Microorganisms
- Proteomics
- Virus
- Virus (Living Organisms)