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Health Sciences; Medical Sciences

Rafaël Najmanovich

Professeur sous octroi agrégé

Faculté de médecine - Département de pharmacologie et physiologie

Pavillon Paul-G.-Desmarais, room 3147

514 343-6345

rafael.najmanovich@umontreal.ca

Professeur accrédité

Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire

Secondary number: 514 343-6111 #3289 (Laboratoire)

Profile

Research expertise

La majorité des processus biochimiques et cellulaires impliquent des interactions entre protéines, acides nucléiques et petites molécules. Au plan moléculaire, ces interactions sont gouvernées par une balance délicate entre des effets entropiques et des forces moléculaires impliquant les groupements qui interagissent ensemble. Collectivement, ces forces moléculaires et ces effets entropiques peuvent être rassemblés sous le terme de la reconnaissance moléculaire (Leckband and Israelachvili, 2001). Afin de décrire les interactions moléculaires spécifiques qui ont lieu à l’intérieur d’une cellule, nous devons tenir compte de la « promiscuité de liaison » découlant du fait que l’environnement cellulaire contient une myriade de molécules pouvant interférer avec les interactions spécifiques. À cet égard, nous avons étudié la relation entre la structure et la fonction de sites de liaisons de plusieurs familles de protéines. Dans cette étude, nous avons observé que des protéines non homologues qui ont évolué vers une spécificité pour un même ligand ont des sites de liaisons différents. Nous croyons que cette divergence contribue à limiter la promiscuité de liaison et que l’étude de la promiscuité de liaison est essentielle à notre compréhension et à la prédiction de l’évolution de la fonction des protéines. De plus, la promiscuité de liaison joue un rôle critique en médecine. En effet, nous avons qu’à penser aux effets indésirables que peuvent causer des interactions non souhaitables entre les médicaments et des protéines autres que celles qui sont ciblées. Notre but est donc d’étudier les causes structurales, les mécanismes de contrôle et les conséquences de la promiscuité de liaison par l’intégration d’études structurales et de la biologie des systèmes. Nous serons alors en mesure de comprendre et de prédire la fonction des protéines et d’appliquer cette connaissance au développement de méthodologie innovatrice pour détecter, empêcher et exploiter la promiscuité de liaison dans le « design » et le développement rationnels de nouveaux médicaments. Par exemple, dans l’étude des protéines de la famille des sulfotransférases humaines, impliquées dans la régulation des hormones et des neurotransmetteurs ainsi que dans le métabolisme des drogues et autres molécules xénobiotiques.

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Affiliations and responsabilities

Teaching and supervision

Other educational activities

Projects

Research projects

2019 - 2025

Development of an accessible integrated computational protein design software suite

Lead researcher : Rafaël Najmanovich
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2019 - 2022

Désing moléculaire: petite molécules, protéines, leurs interactions et fonctions.

Lead researcher : Rafaël Najmanovich
Funding sources: FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds des leaders
2018 - 2022

L’intégration de la pharmacologie structurale et numérique dans la conception de médicaments pour maladies d'expansion de trinucleotides.

Lead researcher : Rafaël Najmanovich
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Senior
2018 - 2021

Next-generation molecular docking leveraging artificial intelligence techniques to understand large-scale ligand binding datasets - Partenariat avec Génome Québec (175 000 $) et contribution de M. Tyers (75 000 $)

Lead researcher : Rafaël Najmanovich
Funding sources: Génome Québec , Génome Canada
Grant programs: , PVXXXXXX-Projets de recherche en génomique à grande échelle et Plates-formes scientifiques tech.
2017 - 2021

Structural causes, control mechanisms and consequences of small-molecule protein binding promiscuity

Lead researcher : Rafaël Najmanovich
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2017 - 2019

A versatile broad range microscale thermophoresis apparatus for the measurement of biomolecular interactions

Lead researcher : Rafaël Najmanovich
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (OIR) -1 -(de 7 001 $ à 150 000 $)
2016 - 2018

L'intégration de la bioinformatique structurelle et la biologie des systèmes dans la recherche de nouvelles antibiotiques ciblant C. difficile

Lead researcher : Rafaël Najmanovich
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Junior 2

Outreach

Publications and presentations

Disciplines

  • Biochemistry
  • Pharmacology
  • Medical Biochemistry
  • Molecular Biology
  • Molecular Medicine

Areas of expertise

  • Biological and Biochemical Mechanisms
  • Structural Tissue Engineering / Biomaterials
  • Proteins
  • Development of Drug Delivery Systems
  • Drug Metabolism