Passer au contenu

/ Research

Je donne

Rechercher

Health Sciences; Medical Sciences

Brian Wilhelm

Génomique à haut débit

Professeur sous octroi agrégé

Faculté de médecine - Département de médecine

Pavillon Marcelle-Coutu, room 4306-13

514 343-6111 #0923

brian.wilhelm@umontreal.ca

Profile

Research expertise

La régulation transcriptionnelle est un processus complexe qui exige le recrutement de l’ARN polymérase vers les sites dirigés de transcription, la modification de la structure locale de la chromatine et l’épissage des nouveaux transcrits. Une interruption de la coordination de ce processus, comme la transcription erronée qui active de façon inappropriée des gènes qui modifient le comportement normal des cellules, peut favoriser l’apparition d’un cancer. Dans le but de comprendre clairement la nature de cette anomalie, il est souvent nécessaire d’avoir un aperçu global du système.

Notre équipe de recherche s’intéresse actuellement à l’utilisation des technologies d’avant-garde, à haut débit, comme les biopuces à ADN et le séquençage d’ADN de nouvelle génération afin d’élucider les connexions sous-jacentes à l’activité transcriptionnelle et au comportement des cellules. Pour comprendre ce phénomène dans le contexte de la biologie du cancer, nous utilisons actuellement ces approches pour caractériser les échantillons de patients atteints de la leucémie myéloïde aiguë (LMA) dans le but d’identifier les mutations qui favorisent l’apparition de la maladie. De plus, nous utilisons la levure à fission (Schizosaccharomyces pombe) comme système modèle pour étudier le recrutement de l’ARN polymérase II et son comportement pendant la transcription. Le fait de mieux comprendre la machinerie moléculaire qui est à la base de ces processus nous permettra ultimement de mettre au point de nouveaux médicaments pour traiter le cancer.

Biography

Brian Wilhelm obtient son diplôme de doctorat en génétique médicale du UBC au Terry Fox Laboratory de Vancouver, en 2003. Il poursuit une formation postdoctorale au Wellcome Trust Sanger Institute, au Royaume-Uni dans le labo du Dr Jurg Bahler, puis au sein du laboratoire du docteur Guy Sauvageau à l’IRIC.

En 2010, Brian Wilhelm a lancé son laboratoire, l’Unité de recherche en génomique à haut débit de l’Institut, et a débuté comme professeur au Département de médecine de l’Université de Montréal.

Affiliations and responsabilities

Teaching and supervision

Student supervision

Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)

Projects

Research projects

2017 - 2023

Systematic studies of human models of acute myeloide leukemia: establishing a pipeline for novel targeted therapeutics

Lead researcher : Brian Wilhelm
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Subventions de recherche en partenariat
2017 - 2023

Systematic studies of human models of acute myeloide leukemia: establishing a pipeline for novel targeted therapeutics

Lead researcher : Brian Wilhelm
Funding sources: IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs:
2018 - 2021

Towards a better risk-adapted therapy in young adults with acute myeloid leukemia

Lead researcher : Josée Hébert
Co-researchers : Brian Wilhelm , Sonia Cellot
Funding sources: SRC/Société de recherche sur le cancer
Grant programs:
2018 - 2021

Towards a better risk-adapted therapy in young adults with acute myeloid leukemia

Lead researcher : Josée Hébert
Co-researchers : Brian Wilhelm , Sonia Cellot
Funding sources: IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs:
2018 - 2021

Towards a better risk-adapted therapy in young adults with acute myeloid leukemia

Lead researcher : Josée Hébert
Co-researchers : Sonia Cellot , Brian Wilhelm
Funding sources: (16631)Société canadienne du cancer (16631) , COLE Foundation/Fondation Cole
Grant programs: ,
2018 - 2021

Towards a better risk-adapted therapy in young adults with acute myeloid leukemia

Co-researchers : Brian Wilhelm , Josée Hébert
Funding sources: IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs:
2018 - 2021

Établissement d'un pipeline de criblage chimiogénomique pour les leucémies pédiatriques à haut risque

Lead researcher : Brian Wilhelm
Funding sources: IRICoR
Grant programs: PV143493-(RCE) Réseaux de centres d'excellence
2018 - 2021

Établissement d'un pipeline de criblage chimiogénomique pour les leucémies pédiatriques à haut risque

Lead researcher : Brian Wilhelm
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Oncopole EMC2 (Équipes multidisciplinaires contre le cancer)
2013 - 2021

MECHANISMS FOR ESTABLISHMENT AND MAINTENANCE OF ALLELE SPECIFIC EXPRESSION OF GATA2

Lead researcher : Brian Wilhelm
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2020

Development of sc-RNA based methods for mAb identification and validation

Lead researcher : Brian Wilhelm
Funding sources: MITACS Inc.
Grant programs: PVXXXXXX-Stage Élévation Québec - MITACS
2018 - 2020

MARATHON OF HOPE CANCER CENTRES NETWORK PILOT : THE MONTREAL CANCER CONSORTIUM AGREEMENT

Lead researcher : Claude Perreault
Co-researchers : Michel Bouvier , Brian Wilhelm , Sonia Cellot , Elie Haddad
Funding sources: Terry Fox Research Institute
Grant programs:
2016 - 2020

Identification de nouveaux mécanismes moléculaires impliqués dans les leucémies myéloïde aigüe en pédiatrie

Lead researcher : Brian Wilhelm
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Junior 2
2015 - 2019

UNE APPROCHE CHIMIO- ET PROTEO-GENOMIQUE EN MEDECINE PERSONNALISEE POUR LA LEUCEMIE MYELOIDE AIGUE

Lead researcher : Guy Sauvageau
Funding sources: FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'innovation
2018

Machine Learning & Biological Systems

Lead researcher : Brian Wilhelm
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-Subventions Connexion
2017 - 2018

Microfluidic detection of leukemia cells by electronic biomolecular sensors

Lead researcher : Brian Wilhelm
Co-researchers : Delphine Bouilly
Funding sources: LLS Canada/Leukemia and Lymphoma Society of Canada (The)
Grant programs: PVXX1862-Subvention de fonctionnement
2017

Optimization of screening procedures for monoclonal antibodies directed against membrane bound proteins

Lead researcher : Brian Wilhelm
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PV128974-(EGP) Programme de subvention d'engagement partenarial
2015 - 2017

TRANSCRIPTIONAL AND EPIGENETIC CONSEQUENCES OF MLL-AF9 TRANSLOCATIONS

Lead researcher : Brian Wilhelm
Funding sources: Terry Fox Research Institute , FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ) , COLE Foundation/Fondation Cole
Grant programs: , PVXXXXXX-Établissement de jeunes chercheurs Juniors 1 , PVXXXXXX-Subvention d'équipe: programme nouvelles frontières Terry Fox en cancérologie
2013 - 2017

INNOVATIVE CHEMOGENOMIC TOOLS TO IMPROVE OUTCOME IN ACUTE MYELOID LEUKEMIA

Lead researcher : Josée Hébert , Guy Sauvageau
Funding sources: Génome Canada , Génome Québec
Grant programs: ,
2013 - 2017

INNOVATIVE CHEMOGENOMIC TOOLS TO IMPROVE OUTCOME IN ACUTE MYELOID LEUKEMIA

Lead researcher : Guy Sauvageau
Funding sources: Génome Canada
Grant programs: PVXXXXXX-Projets de recherche en génomique à grande échelle et Plates-formes scientifiques tech.
2013 - 2017

INNOVATIVE CHEMOGENOMIC TOOLS TO IMPROVE OUTCOME IN IN ACUTE MYELOID LEUKEMIA

Lead researcher : Guy Sauvageau
Funding sources: Génome Québec
Grant programs: PVXXXXXX-Projets de recherche en génomique à grande échelle et Plates-formes scientifiques tech.
2013 - 2016

FUNCTIONAL ANALYSIS OF TRANSCRIPTIONAL NETWORKS IN MLL-AF9 PEDIATRIC LEUKEMIA

Lead researcher : Brian Wilhelm
Funding sources: SRC/Société de recherche sur le cancer
Grant programs: PVX12154-Subvention de recherche
2012 - 2016

IDENTIFICATION DE NOUVEAUX MECANISMES MOLECULAIRES IMPLIQUES DANS LES LEUCEMIES MYELOIDE AIGUE EN PEDIATRIE

Lead researcher : Brian Wilhelm
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Junior 1
2013 - 2015

ROLE AND BIOLOGY OF MLL FUSION GENES IN HUMAN LEUKEMIAS.

Lead researcher : Frédéric Barabé
Co-researchers : Brian Wilhelm
Funding sources: LLS Canada/Leukemia and Lymphoma Society of Canada (The)
Grant programs:
2012 - 2015

IDENTIFICATION DE NOUVEAUX MECANISMES MOLECULAIRES IMPLIQUES DANS LES LEUCEMIES MYELOIDE AIGUE EN PEDIATRIE

Lead researcher : Brian Wilhelm
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Établissement de jeunes chercheurs Juniors 1
2011 - 2015

RESEAU POUR LES ETUDES THERAPEUTIQUES ET GENETIQUES DES CELLULES SOUCHES-STEMNET / NOVEL STRATEGIES TO EXPAND HUMAN HEMATOPOIETIC STEM CELL POPULATIONS FOR CLINICAL USE

Lead researcher : Guy Sauvageau
Funding sources: Secrétariat Inter-Conseil et Réseaux des centres d'excellence (RCE)
Grant programs: PV143493-(RCE) Réseaux de centres d'excellence
2012 - 2014

IMPROVED ASSIGMENT TO BEST AVAILABLE THERAPY FOR PATIENTS WITH MYELODYSPLASIA AND ACUTE MYELOID LEUKEMIA

Lead researcher : Guy Sauvageau
Co-researchers : Brian Wilhelm , Josée Hébert , Stephane Couban
Funding sources: Terry Fox Research Institute
Grant programs:
2012 - 2014

IMPROVED ASSIGNMENT TO BEST AVAILABLE THERAPY FOR PATIENTS WITH MYELODYSPLASIA AND ACUTE MYELOID LEUKEMIA

Lead researcher : Brian Wilhelm
Funding sources: Terry Fox Research Institute
Grant programs:
2011 - 2013

ESTABLISHMENT OF DR. B WILHELM LAB TO DISCOVER NOVEL AND RECURRENT MUTATIONS IN ACUTE MYELOID LEUKEMIA

Lead researcher : Brian Wilhelm
Funding sources: FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs:
2010 - 2013

LE PROJET LEUCEGENE : SEQUENCAGE DU TRANSCRIPTOME POUR L'IDENTIFICATION DE NOUVEAUX MARQUEURS PRONOSTIQUES ET CIBLES THERAPEUTIQUES DANS LA LEUCEMIE MYELOIDE AIGUE

Lead researcher : Guy Sauvageau
Funding sources: Génome Québec
Grant programs:
2011

MONBUG SYMPOSIUM/COLLOQUE DU RÉSEAU DE BIOINFORMATIQUE DE MONTRÉAL

Lead researcher : Brian Wilhelm

Outreach

Publications and presentations

Publications

  • Wilhelm BT, Briau M, Austin P, Faubert A, Boucher G, Chagnon P, Hope K, Girard S, Mayotte N, Landry JR, Hébert J, Sauvageau G. RNA-seq analysis of 2 closely related leukemia clones that differ in their self-renewal capacity. Blood. 2011 Jan 13;117(2):e27-38. Epub 2010 Oct 27. PubMed PMID: 20980679.
  • Wilhelm BT, Marguerat S, Aligianni S, Codlin S, Watt S, Bähler J. Differential patterns of intronic and exonic DNA regions with respect to RNA polymerase II occupancy, nucleosome density and H3K36me3 marking in fission yeast. Genome Biol. 2011 Aug 22;12(8):R82. [Epub ahead of print] PubMed PMID: 21859475.
  • Wilhelm BT, Marguerat S, Watt S, Schubert F, Wood V, Goodhead I, Penkett CJ, Rogers J, Bähler J. Dynamic repertoire of a eukaryotic transcriptome surveyed at single-nucleotide resolution. Nature. 2008 Jun 26;453(7199):1239-43. Epub 2008 May 18. PubMed PMID: 18488015.
  • Wilhelm BT, Mager DL. Rapid expansion of the Ly49 gene cluster in rat. Genomics. 2004 Jul;84(1):218-21. PubMed PMID: 15203220.
  • Wilhelm BT, Landry JR, Takei F, Mager DL. Transcriptional control of murine CD94 gene: differential usage of dual promoters by lymphoid cell types. J Immunol. 2003 Oct 15;171(8):4219-26. PubMed PMID: 14530345.

Disciplines

  • Genomics
  • Oncology
  • Bioinformatics
  • Molecular Biology

Areas of expertise

  • DNA and RNA Chips
  • Genomics
  • Genome
  • Biotechnology
  • Technological Innovations
  • Biomedical Technologies
  • Health Care Technologies
  • Cancer Genetics