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Health Sciences; Medical Sciences

Michael David Tyers

Biologie des systèmes et biologie synthétique

Professeur titulaire

Faculté de médecine - Département de médecine

Pavillon Marcelle-Coutu, room 4306-3

md.tyers@umontreal.ca

Secondary number: 514 343-6111 #6668 (Travail 1)

Profile

Research expertise

Michael Tyers et son équipe utilisent la biochimie, la génétique, la biologie chimique, la microscopie, la spectrométrie de masse et l’informatique pour déchiffrer la façon dont les réseaux cellulaires sont organisés et contrôlés.

Thématique de recherche

L’équipe de Michael Tyers met en œuvre des cribles protéomiques, génétiques, phénotypiques et chimiogénétiques systématiques pour interroger et manipuler la fonction des réseaux, en mettant l’accent sur le contrôle de la croissance et de la division cellulaire par le système ubiquitine-protéasome, à la fois dans les cellules de levure et dans les cellules humaines.

Les chercheurs utilisent également des méthodes de modélisation biophysiques, biochimiques, structurelles et mathématiques pour comprendre la dynamique de la reconnaissance des protéines au sein de ces réseaux.

Le groupe a entre autres développé une plateforme de biologie synthétique pour découvrir des molécules de type produits naturels comme nouvelles sondes chimiques et comme candidats précoces pour le développement de médicaments.

Objectifs de recherche

Le laboratoire de Michael Tyers se concentre particulièrement sur l’étude de la structure et du contrôle des réseaux d’interactions biologiques au niveau des protéines et aux niveaux génétique et chimique. Ces nouvelles connaissances visent à permettre le développement de nouvelles approches synthétiques afin de modifier les réseaux naturels et de construire des réseaux entièrement artificiels pouvant remplir de nouvelles fonctions biologiques.

Grâce à la récente technologie CRISPR, qui permet l’interrogation systématique de la fonction des gènes dans les lignées cellulaires humaines, Michael Tyers et son équipe ont entre autres réalisé un crible à l’échelle du génome sur une lignée cellulaire de lymphome B. En identifiant les gènes essentiels à la croissance cellulaire, à la prolifération et à la survie des cellules humaines et en cartographiant les processus qui les contrôlent, les recherches du groupe de Michael Tyers devraient permettre de comprendre le mécanisme d’action précis des médicaments dans les cellules cancéreuses et d’autres maladies.

Biography

Après l’obtention de son doctorat en biochimie à l’Université McMaster, Michael Tyers effectue un stage postdoctoral au Cold Spring Harbor Laboratory, à New York. Il débute sa carrière en enseignement, en 1992, au Département de génétique médicale et de microbiologie de l’Université de Toronto, puis occupe le poste de chercheur principal à l’Institut de recherche Samuel Lunenfeld. En 2007, il prend la direction de l’Alliance des sciences de la vie des universités écossaises et enseigne la biologie des systèmes à l’Université d’Édimbourg.

De retour au Canada, il se joint à l’IRIC en tant que chercheur principal de l’Unité de recherche en biologie des systèmes et biologie synthétique. Michael Tyers est également professeur titulaire au Département de médecine de l’Université de Montréal.

Teaching and supervision

Student supervision

Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)

2022

Synthetic natural products and surrogate genetics as novel strategies for drug discovery

Graduate : Jacques, Samuel
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2020

Genetic analysis of cell size homeostasis in human cells

Graduate : Costa, Marcela
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2016

Generation and screening of natural product-like compounds for antibiotic discovery

Graduate : Jacques, Samuel
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.

Projects

Research projects

2019 - 2029

Architecture and chemical modulation of genetic networks

Lead researcher : Michael David Tyers
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(FDN) Subvention Fondation
2022 - 2027

Novel generative active learning algorithms for exploring the space of antimicrobial peptides to respond to antibiotics resistance

Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-Horizons de la découverte
2018 - 2025

Canada Research Chair in Systems and Synthetic Biology

Lead researcher : Michael David Tyers
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVX50399-Chaires de recherche du Canada
2022 - 2024

Thème 4 : L'IA pour la découverte de matériaux et molécules

Lead researcher : Yoshua Bengio
Co-researchers : Michael David Tyers , Mickaël Dollé , Yelena Simine
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada
2019 - 2024

Genetic and chemical ablation of senescent cells that result from age-dépendent telomere erosion

Lead researcher : Léa Harrington
Co-researchers : Michael David Tyers
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2018 - 2024

A synthetic biology platform to generate and screen natural product-like chemical space for novel antibiotic activities

Lead researcher : Michael David Tyers
Co-researchers : Gerard Wright
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2020 - 2023

A yeast synthetic biotic platform for microbiome remediation / Transfert McMaster

Lead researcher : Brian Coombes
Co-researchers : Michael David Tyers
Funding sources: The W. Garfield Weston Foundation
Grant programs:
2020 - 2023

Targeting genetic and chemical vulnerabilities of novel coronavirus SARS-CoV-2

Lead researcher : Matthew Miller
Co-researchers : Michael David Tyers
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-Subvention de fonctionnement (COVID-19)
2018 - 2023

Next-generation molecular docking leveraging artificial intelligence techniques to understand large-scale ligand binding datasets - Partenariat avec Génome Québec (175 000 $) et contribution de M. Tyers (75 000 $)

Lead researcher : Rafaël Najmanovich
Co-researchers : Graciela Piñeyro , Michael David Tyers
Funding sources: Génome Québec , Génome Canada , Génome Canada
Grant programs: , PVXXXXXX-Projets de recherche en génomique à grande échelle et Plates-formes scientifiques tech. , PVXXXXXX-Programme d'aide lié à la COVID-19
2017 - 2023

Centre for Advanced Proteomic and Chemogenomic Analyses (CAPCA)

Lead researcher : Pierre Thibault
Co-researchers : Michael David Tyers
Funding sources: Génome Canada
Grant programs: PVXXXXXX-Projets de recherche en génomique à grande échelle et Plates-formes scientifiques tech.
2018 - 2022

Établissement d'un pipeline de criblage chimiogénomique pour les leucémies pédiatriques à haut risque

Lead researcher : Brian Wilhelm
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Oncopole EMC2 (Équipes multidisciplinaires contre le cancer)
2018 - 2022

Établissement d'un pipeline de criblage chimiogénomique pour les leucémies pédiatriques à haut risque

Lead researcher : Brian Wilhelm
Funding sources: IRICoR
Grant programs: PV143493-(RCE) Réseaux de centres d'excellence
2017 - 2022

Interrogation of drug and toxin mechanism of action by a matrix of chemogenomic profiles in human cells

Lead researcher : Michael David Tyers
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2016 - 2022

Systems biology of cell size homeostasis

Lead researcher : Michael David Tyers
Co-researchers : Pierre Thibault
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2020 - 2021

Development of novel protease inhibitors active against the SARS-CoV-2 coronavirus

Lead researcher : Michael David Tyers
Funding sources: MITACS Inc.
Grant programs: PVXXXXXX-Stage Accélération Québec - MITACS
2020 - 2021

A yeast-based oral vaccine for rapid deployment against the SARS-CoV-2

Lead researcher : Matthew Miller
Co-researchers : Michael David Tyers
Funding sources: The W. Garfield Weston Foundation
Grant programs:
2015 - 2021

Grand Challenges - New Interventions for Global Health: A synthetic biology platform for rapid generation of highly diverse natural product-like compounds active against Mycobacterium tuberculosis.

Lead researcher : Michael David Tyers
Co-researchers : Gerard Wright , Patrick Cai
Funding sources: Bill and Melinda Gates Foundation
Grant programs:
2019 - 2020

A yeast synthetic biotic platform for microbiome remediation / Transfert McMaster

Lead researcher : Gerard Wright , Brian Coombes
Co-researchers : Michael David Tyers
Funding sources: The W. Garfield Weston Foundation
Grant programs:
2018 - 2020

Programme de stages postdoctoraux - IVADO - Candidat: Jasmin Coulombe-Huntington / Prédire les mécanismes d'action et synergies de drogues anticancer à partir de données d'interactions chimiques/génétiques à grande échelle

Lead researcher : Michael David Tyers
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2016 - 2020

Towards understanding and treatment of MeCP2-related disorders

Co-researchers : Michael David Tyers
Funding sources: Wellcome Trust
Grant programs:
2015 - 2020

UNE APPROCHE CHIMIO- ET PROTEO-GENOMIQUE EN MEDECINE PERSONNALISEE POUR LA LEUCEMIE MYELOIDE AIGUE

Lead researcher : Guy Sauvageau
Funding sources: FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'innovation
2015 - 2020

Targeting brain tumour stem cell epigenetic and molecular networks.

Lead researcher : Samuel Weiss , Peter Dirks
Co-researchers : Michael David Tyers
Funding sources: Ontario Genomics
Grant programs:
2013 - 2019

MODULATION OF THE CDC34 UBIQUITIN CONJUGATING ENZYME IN CANCER

Lead researcher : Michael David Tyers
Co-researchers : Frank Sicheri
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2016 - 2018

Biomedical Data TRanlator Technical FEasability Assessment and Architecture Design.

Lead researcher : Sui Hang
Co-researchers : Michael David Tyers
Funding sources: NIH/National Institutes of Health (NIH)
Grant programs: PVXXXXXX-Subvention de recherche
2016 - 2018

A cell microfactory platform for in vivo biosynthesis and delivery of genetically encoded natural products and synthetic antibodies

Lead researcher : Michael David Tyers
Co-researchers : Gerard Wright
Funding sources: Génome Canada
Grant programs: PVXXXXXX-Projets de recherche en génomique à grande échelle et Plates-formes scientifiques tech.
2015 - 2018

Inhibition of Fbw7 as an anticancer strategy

Lead researcher : Michael David Tyers
Co-researchers : Frank Sicheri
Funding sources: IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs: PV132873-Subventions pour l'innovation
2011 - 2018

SYSTEMS AND SYNTHETIC BIOLOGY

Lead researcher : Michael David Tyers
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVX50399-Chaires de recherche du Canada
2015 - 2017

Center for Advanced Proteomics Analyses (CAPA)

Lead researcher : Pierre Thibault
Co-researchers : Michael David Tyers
Funding sources: Génome Canada
Grant programs:
2014 - 2017

Computational and machine learning approaches to improve design and screening of high bioactivity peptides for drug discovery

Lead researcher : Jacques Corbeil
Co-researchers : Michael David Tyers
Funding sources: CQDM/Consortium québécois sur la découverte du médicament
Grant programs:
2014 - 2017

Approches computationnelles et apprentissage machine pour la génération de peptides bioactifs facilitant la découverte du médicaments

Lead researcher : Jacques Corbeil
Co-researchers : Michael David Tyers
Funding sources: CQDM/Consortium québécois sur la découverte du médicament
Grant programs:
2011 - 2017

SYSTEMS LEVEL ANALYSIS AND CONTROL OF BIOLOGICAL NETWORKS IN HUMAN HEALTH

Lead researcher : Michael David Tyers
Funding sources: Génome Québec
Grant programs:
2013 - 2016

AN INTEGRATED ULTRA-HIGH-THROUGHPUT PLATFORM FOR CHEMICAL SYSTEMS BIOLOGY

Lead researcher : Michael David Tyers
Funding sources: FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs:
2013 - 2016

PROHITS NEXT GENERATION : A FLEXIBLE SYSTEM FOR TRACKING ANALYZING AND REPORTING

Lead researcher : Michael David Tyers
Co-researchers : Pierre Thibault
Funding sources: Génome Québec
Grant programs:
2013 - 2016

PROHITS NEXT GENERATION : A FLEXIBLE SYSTEM FOR TRACKING ANALYZING AND REPORTING FUNCTIONNAL PROTEOMICS DATA

Lead researcher : Anne-Claude Gingras
Co-researchers : Pierre Thibault , Michael David Tyers
Funding sources: Génome Canada , IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: ,
2011 - 2016

SYSTEMATIC DATA CURATION AND INTEGRATION TO LINK MODELS OF HUMAN DISEASE

Lead researcher : Kara Dolinski
Co-researchers : Michael David Tyers
Funding sources: NIH/National Institutes of Health (NIH)
Grant programs:
2013 - 2015

PROHITS NEXT GENERATION : A FLEXIBLE SYSTEM FOR TRACKING ANALYZING AND REPORTING

Lead researcher : Michael David Tyers
Co-researchers : Pierre Thibault
Funding sources: Génome Québec
Grant programs:
2012 - 2013

AN INFRASTRUCTURE PLATFORM FOR SYNTHETIC BIOLOGY

Lead researcher : Michael David Tyers
Funding sources: FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs:

Outreach

Publications and presentations

Disciplines

  • Biochemistry
  • Genetics
  • Medical Biochemistry

Areas of expertise

  • Bioinformatics
  • COVID-19
  • COVID19
  • Proteomics
  • Cell
  • Cellular Division
  • Cellular Defense
  • Model Building
  • Cancer Genetics
  • Cancer Diagnosis and Detection