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Natural Sciences and Engineering; Health Sciences; Medical Sciences

Adrian Serohijos

Observation de l’évolution microbienne et comprendre les mutations du génome des bactéries

Professeur adjoint

Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire

Roger-Gaudry, room H307-7

514 343-6328

adrian.serohijos@umontreal.ca

Secondary number: 514 343-6111 #4976 (Laboratoire)

Profile

Research expertise

L'interaction entre la biophysique moléculaire et les processus de mutation, de sélection et de dérive génétique façonnent l'évolution. Les méthodes traditionnelles qui étudient le repli et la conception de protéines se concentrent sur l’explication des propriétés moléculaires des protéines à partir des principes de la physique et de la chimie. L'étude de l’évolution moléculaire traditionnelle se concentre elle sur l'explication de la variation des séquences à partir des principes de la biologie de l’évolution et de la génétique des populations. 

La synthèse de la biophysique et de la biologie de l’évolution est une nécessité scientifique qui a des répercussions pratiques sur notre compréhension de l'évolution de la résistance aux antibiotiques, de la progression du cancer, ou encore de la propagation d'agents pathogènes. 

Nous avons utilisé cette approche intégrée pour déterminer les paramètres biophysiques, cellulaires et de génétique des populations qui régissent le taux d'évolution des protéines. Cette approche a été également appliquée à l'évolution des virus à ARN et des bactéries. 

Nous utilisons maintenant une approche similaire pour prédire l’accroissement de la résistance aux antibiotiques, pour quantifier les contraintes épistatiques et pléiotropiques sur la capacité d'évolution des protéines, et pour développer de nouvelles méthodologies en phylogénie.

Nos projets sont pluridisciplinaires. Nous collaborons aussi avec des laboratoires au Canada et le monde.

education

  • 2015 — Post-doctorat — Biologie et autres sciences connexes, MicrobiologieHarvard University
  • 2002 — Baccalauréat — PhysiqueUniversité Ateneo de Manille
  • 2003 — Baccalauréat — Génie informatique et génie logicielUniversité Ateneo de Manille
  • 2009 — Doctorat — PhysiqueUniversité de Caroline du Nord à Chapel Hill

Affiliations and responsabilities

Teaching and supervision

Student supervision

Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)

2019

A multiscale framework for microbial evolution to identify the emergence of antibiotic resistance

Graduate : Ton, Anh-Tien
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.

Projects

Research projects

2019 - 2025

Comprehensive mapping and evolutionary dynamics of the mutational landscape of antimicrobial resistance

Lead researcher : Adrian Serohijos
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2018 - 2023

Canada Research Chair in Evolutionary Biophysics and Population Dynamics

Lead researcher : Adrian Serohijos
Funding sources: SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Grant programs: PVX50399-Chaires de recherche du Canada
2019 - 2022

Drop-based microfluidics (DBM) for single cell studies and ultrahighthroughput phenotypic screens and lab evolution

Lead researcher : Adrian Serohijos
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (OIR) -1 -(de 7 001 $ à 150 000 $)
2018 - 2022

Biophysique évolutive: intégrer la biophysique des protéines, la biologie évolutive et la génétique des populations pour prédire l’émergence de la résistance aux antibiotiques des microbes

Lead researcher : Adrian Serohijos
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Établissement de jeunes chercheurs Juniors 1
2018 - 2022

Biophysique évolutive: intégrer la biophysique des protéines, la biologie évolutive et la génétique des populations pour prédire l’émergence de la résistance aux antibiotiques des microbes

Lead researcher : Adrian Serohijos
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Junior 1
2018 - 2022

Persistance des bactéries contre les antibiotiques et la vitrosité de leur cytoplasme

Lead researcher : Stephen Michnick
Co-researchers : Adrian Serohijos , Paul François
Funding sources: FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs: PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2016 - 2022

Experimentally derived quantitative model of protein evolution

Lead researcher : Adrian Serohijos
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2018 - 2021

Macromolecular interaction analysis using a surface plasmon resonance biosensor

Lead researcher : John Pascal
Co-researchers : Adrian Serohijos , Stephen Michnick , Pascale Legault , James G. Omichinski
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (OIR) -1 -(de 7 001 $ à 150 000 $)
2018 - 2021

L'intégration de la biophysique et de la génétique des populations pour la prédiction de la résistance aux médicaments et le développement de nouveaux outils en évolution moléculaire.

Lead researcher : Adrian Serohijos
Funding sources: FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'exploitation des infrastructures (FEI)
2018 - 2020

Bourse postdoc, Candidat Pouria Dasmeh / Une approche d'apprentissage profond pour prédire le niveau de résistance et le potentiel de propagation de la résistance aux antibiotiques / Subvention accordée au projet Apogée Données au service des Canadiens..

Lead researcher : Adrian Serohijos
Funding sources: FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2017 - 2019

A versatile broad range microscale thermophoresis apparatus for the measurement of biomolecular interactions

Lead researcher : Rafaël Najmanovich
Co-researchers : John Pascal , Adrian Serohijos , Rikard Blunck , Christian Baron , Rémy Sauvé , James G. Omichinski
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (OIR) -1 -(de 7 001 $ à 150 000 $)
2016 - 2018

L'intégration de la biophysique et de la génétique des populations pour la prédiction de la résistance aux médicaments et le développement de nouveaux outils en évolution moléculaire.

Lead researcher : Adrian Serohijos
Funding sources: FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds des leaders

Outreach

Publications and presentations

Disciplines

  • Bioinformatics
  • Biochemistry
  • Microbiology
  • Infectious Diseases
  • Molecular Biology
  • Genetics

Areas of expertise

  • Mutation (Process)
  • Molecular Genetics
  • Evolutionary Genetics
  • Genome
  • Population Genetics
  • Antibiotics and Resistance
  • Global Health and Emerging Diseases
  • Evolution and Phylogenesis
  • Canada
  • COVID-19
  • COVID19