Daniel Sinnett
Déterminants génétiques de la leucémie de l’enfant
- Professeur titulaire
-
Faculté de médecine - Département de pédiatrie
- Professeur accrédité
-
Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire
Portrait
Expertise de recherche
Rôle du facteur de transcription ETV6 dans la leucémogenèse de l’enfant. L’oncogenèse est un processus multi-étapes impliquant l’accumulation de mutations dans les oncogènes et les gènes répresseurs de tumeurs. Le bras court du chromosome 12 humain est affecté par des réarrangements génétiques menant à la perte de matériel génétique dans diverses tumeurs hématologiques. Il a été démontré que le chromosome 12p12.3 contient un gène répresseur putatif qui serait important dans la leucémogenèse de l’enfant, ainsi que dans l’étiologie de certaines tumeurs solides. Le facteur de transcription ETV6 serait ce gène candidat. Dans ce projet nous poursuivons la caractérisation de ETV6 en identifiant des gènes ciblés par ce répresseur transcriptionnel afin de recréer le réseau de régulation et en déterminant la nature des partenaires protéiques du complexe de répression.
Déterminants génétiques de la leucémie de l’enfant. La leucémie aiguë lymphoblastique (LAL) est le cancer pédiatrique le plus fréquent et la principale cause de décès chez les enfants. Nous proposons que l’origine de la leucémie de l’enfant s’explique par une combinaison de facteurs génétiques de susceptibilité et des expositions environnementales. Peu d'études se sont penchées sur le rôle de variations génétiques héréditaires dans la modulation du risque de LAL chez l'enfant. Nous avons démontré que la LAL pédiatrique pourrait être le fruit d'une collaboration entre plusieurs variations dans les gènes régulant l'efficacité du métabolisme d'agents cancérogènes, le maintient de l'intégrité génomique et la réponse au stress oxydatif. Des études pan-génomiques récentes supportent le rôle de la génétique dans la pathogenèse de la LAL. Toutefois, peu de facteurs de risque génétiques de la LAL ont été caractérisés, laissant les causes génétiques de cette maladie largement inexpliquées, quoiqu'il est probable qu'elle soit le résultats de collaborations entre variantes génétiques rares et communes.Un modèle plus réaliste de cette maladie implique la combinaison de variantes fonctionnelles rares et communes jumelées à des variations génomiques somatiques et des changements épigénetiques. Le développement du séquençage haut-débit et des outils bioinformatiques connexes nous donnent une vue inégalée du paysage génomique de la LAL pédiatrique. Ces données permettent de détecter à la fois les variantes germinales communes et rares ainsi que les mutations somatiques spécifiques aux cellules leucémiques. Ces approchent génomiques génèrent de grands ensembles de jeux de données qui nécessitent de développer des outils bioinformatiques afin d’assurer une gestion, intégration et analyse efficace et productive de ces données. L'identification des événements génétiques menant à la leucémogenèse, ménera au développement d'outils de recherche et cliniques qui amélioreront la détection, le diagnostic et le traitement de la leucémie pédiatrique.
Étude des facteurs génétiques influençant la susceptibilité de développer des effets secondaires à long-terme suite aux traitements chez les survivants de leucémie pédiatrique. Bien que 85% des LAL soient guéries par les traitements actuels, l'exposition aux agents de chimiothérapie ou à la radiothérapie pendant une période de développement critique chez l'enfant a été associée avec une fréquence élevée de problèmes de santé tardifs dans plus de deux tiers des survivants. La sévérité et la fréquence de ces effets dans cette population est très variable et les causes de cette variabilité inconnues. L'absence de marqueurs biologiques permettant de détecter ces effets secondaires tôt dans leur développement demeure un problème.Nous avons réuni une équipe multidisciplinaire regroupant des chercheurs cliniciens et fondamentaux qui se penchera sur ce problème dans le but d’identifier des marqueurs biologiques spécifiques aux effets secondaires les plus communs chez les survivants de la LAL pédiatrique. Ceux-ci comprennent des effets neurocognitifs, un syndrome métabolique, de la cardiotoxicité et de la morbidité squelettique. Nous proposons d'élucider les mécanismes menant à ces problèmes de santé en étudiant les variantes génétiques ainsi qu'une panoplie de biomarqueurs cliniques pertinents. Nous voulons aussi déterminer l'impact de certains marqueurs génétiques et biologiques sur le traitement à long-terme chez les survivants de la LAL pédiatrique. Ces résultats mèneront au développement de nouvelles stratégies et d'outils cliniques pour prévenir, ou du moins réduire, l'apparition des effets à long-terme des traitements, améliorant ainsi la détection, le diagnostic et le traitement de la leucémie pédiatrique.
Biographie
Généticien moléculaire, Daniel Sinnett est professeur titulaire au Département de pédiatrie. Ses recherches portent principalement sur les déterminants génétiques et génomiques des cancers pédiatriques tels que la leucémie. Cofondateur du Childhood Leukemia International Consortium, qui regroupe des chercheurs et chercheuses de 21 pays, il s’intéresse également aux conséquences de la médecine de précision sur la prise de décision clinique et la prise en charge des survivants. Favorisant l’échange et la collaboration entre les divers intervenants du domaine médical, il est engagé auprès de la relève et travaille en étroite collaboration avec plusieurs fondations institutionnelles et privées afin d’élaborer des stratégies d’application et de diffusion des connaissances.
Prix et distinctions
-
Membre de l'Académie canadienne des sciences de la santé - 2022
- Chercheur national, Fonds de la recherche en santé du Québec (FRSQ), 2006-2011
- Lauréat du programme de reconnaissance, Prix recherche, CHU Sainte-Justine, 2009
- Chercheur-boursier Senior, FRSQ, 2002-2006
- Prix d’accomplissement, Recherche Biomédicale, Faculté de Médecine/ Association des diplômés, Université de Montréal, 2005
- Prix du jeune chercheur André Dupont, 2004
- Prix Mérite du Conseil québécois de lutte contre le cancer, 2003
- Titulaire, Chaire de recherche François-Karl Viau en oncogénomique pédiatrique, 2002-présent
- Chercheur-boursier Junior 2, FRSQ, 1998-2002
- Prix d’Excellence, Fondation de la recherche sur les maladies infantiles, 1999
- Chercheur-boursier Junior 1, FRSQ, 1994-1998
- Bourse de recherche postdoctorale, Instituts de recherche en santé du Canada, 1991-1994
Affiliations et responsabilités
Affiliations de recherche
Unités de recherche
Directeur
- CIUSSS NIM — Centre de recherche du CIUSSS Nord-de-l’île-de-Montréal
- RMGA — Réseau de médecine génétique appliquée
Titulaire
Membre
- CIUSSS NIM — Centre de recherche du CIUSSS Nord-de-l’île-de-Montréal
- CRDP — Centre de recherche en droit public
- Centre Robert-Cedergren de l’Université de Montréal
- Centre de recherche Azrieli du CHU Sainte-Justine
- RMGA — Réseau de médecine génétique appliquée
- Réseau de recherche sur le cancer
- Regroupement droit, changements et gouvernance
Établissements affiliés
- Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine (CHU Sainte-Justine)
Enseignement et encadrement
Enseignement
Cours siglés (session en cours uniquement)
Programmes
Encadrement
Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)
Déconvolution des types cellulaires et quantification des infiltrats immunitaires dans les cancers pédiatriques
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Dérégulations épigénétiques suivant une perte temporaire de l’enzyme DNMT1
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Approche bio-informatique permettant de déterminer l'impact des mutations pathogènes de DNMT3A sur la spécification et la programmation de la lignée neuronale dans le syndrome de Tatton-Brown-Rahman
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Classification moléculaire des Tumeurs de Wilms par analyse RNA-Seq
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Étude de l’inflammation placentaire lors de complications de la grossesse
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
DNMT3A P904L : un nouveau variant dans la tumeur de Wilms
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Impact de SRP72 sur le facteur de transcription ETV6 dans la leucémie aiguë lymphoblastique
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Caractérisation de la régulation des nouvelles cibles transcriptionnelles du facteur de transcription ETV6 dans la leucémie lymphoblastique aiguë
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
L’implication de la peptide-déformylase (PDF) dans la leucémie aiguë lymphoblastique de l’enfant
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Paysage génomique de la leucémie aiguë lymphoblastique de l’enfant
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Caractérisation du microDNome et sa modulation par le traitement anti-cancer
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Identification de biomarqueurs génétiques pour la détection précoce des séquelles métaboliques chez les survivants de la leucémie pédiatrique
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Identification de nouvelles cibles transcriptionnelles d’ETV6, un facteur de transcription fréquemment altéré dans la leucémie aiguë lymphoblastique
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Cartographie génétique d’une forme familiale autosomale dominante d’anévrysmes du septum inter-ventriculaire et de communications inter-ventriculaires au chromosome 10p15
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Identification et caractérisation des cibles transcriptionnelles de ETV6, un facteur de transcription impliqué dans la leucémie de l’enfant.
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Impacts fonctionnels des variants génétiques dans les promoteurs des gènes associés à la survie et à la mort cellulaire
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Alternative strategies for deciphering the genetic architecture of childhood Pre-B acute lymphoblastic leukemia
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Impacts fonctionnels des polymorphismes dans les promoteurs des gènes de l’apoptose
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Caractérisation fonctionnelle des variants génétiques de la région régulatrice (rSNP) des gènes du point de contrôle G1/S
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Détection et caractérisation des interactions dans les maladies complexes
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Identification de transcrits modulés par ETV6 : un gène candidat suppresseur de tumeur
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Identification de gènes ciblès par ETV6-AML1, un facteur de transcription chimérique retrouvé dans la leucémie de l'enfant
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Variabilité génétique dans les régions régulatrices de gènes impliqués dans le contrôle du cycle cellulaire
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Polymorphismes dans des gènes de métabolisme des corticostéroïdes : rôle dans la réponse thérapeutique
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Variabilité génétique au niveau des gènes de réparation de l'ADN
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Caractérisation du locus 12p12.3 impliqué dans la leucémie lymphoblastique aiguë
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Genetic basis of neuroblastoma, a model for embryonal tumours
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Rôle de la pharmacocinétique et de la pharmacogénétique en relation avec la réponse thérapeutique en milieu pédiatrique
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Variabilité génétique dans les gènes de réparation de l'ADN : rôle dans la susceptibilité à la leucémie lymphoblastique aiguë
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Régulation transcriptionnelle du gène glypican 3 (GPC3)
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Allélotypage des gènes de réparation de l'ADN dans les cancers non-héréditaires
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Projets
Projets de recherche
Implication of early embryonic epigenetic dysregulation in fetal alcohol spectrum disorders-associated outcomes
CircRNAome in childhood TCF3-PBX1 ALL: Biomaker potential and mechanisms of circRNA dysregulation and function
Le programme VIE: Interventions intégrées pour les patients traités en oncologie pédiatrique
4D spheroids identify type I protein arginine methyltransferases as a target in NSCLC
CALCUL QUEBEC
Vascular remodeling in hypertension and cardiometabolic disease: from mice to humans.
Immuno-magnetic capture of viral particles in biofluids
MicroDNA signature for prognosis of childhood acute lymphoblastic leukemia
MicroDNA signature for prognosis of childhood acute lymphoblastic leukemia
Characterization of childhood acute lymphoblastic leukemia-specific long non-...
Projet VIE : Valorisation, implication, éducation
Characterization of childhood acute lymphoblastic leukemia-specific long non-coding RNAs (the "Project")
Gut microbiota and pediatric cancer: filling the gap.
Profilage de la méthylation des pharmacogènes pendant le traitement de la leucémie lymphoblastique aiguë chez l'enfant
Réseau de médecine génétique appliquée (RMGA).
Pharmacogenetics markers for treatment individualization in childhood patients with acute lymphoblastic leukemia
Development of single-cell RNA-seq strategy to study childhood leukemia heterogeneity a pilot study.
The Terry Fox Precision Oncology for Young people (PROFYLE) Program.
The Terry Fox Precision Oncology for Young people (PROFYLE) Program.
Attribution d’une subvention du Réseau de Médecine Génétique Appliquée (RMGA)
Plateforme Biobanque de cancers pédiatriques
Plateforme ELISpot et Luminex
Service de bioinformatique appliquée.
Identification of novel therapeutic targets by functional genomic characterization of childhood acute lymphoblastic leukemia.
GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS
CLINICAL EVALUATION OF SURFACE-PLASMON RESONANCE AND NANOPARTICLE-BASED FLUORESCENT DETECTION OF SERUM BIOMARKERS
CLINICAL EVALUATION OF SURFACE-PLASMON RESONANCE AND NANOPARTICLE-BASED FLUORESCENT DETECTION OF SERUM BIOMARKERS
Plateforme ELISpot et Luminex.
Service de bioinformatique appliquée.
Stratégie de thérapies ciblées personnalisées dans les cancers réfractaires ou en rechute de l'enfant (Étude TRICEPS).
Plateforme Biobanque de cancers pédiatriques.
LONG NONCODING RNAS DEREGULATED IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA
GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS
GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS
GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS
INVESTIGATION OF THE GENOMIC DETERMINANTS OF CHILDHOOD LEUKEMIA USING NEXT-GENERATION SEQUENCING
MICRODNA - NOVEL SOURCE OF GENETIC VARIABILITY - ROLE IN SHAPING INDIVIDUAL SENSITIVITY TO CANCER TREATMENT.
GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS
GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECT IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS
SOUTIEN LOGISTIQUE/REDACTIONNEL - SALAIRE POUR PROFESSIONNEL #1
INVESTIGATION OF THE GENOMIC DETERMINANTS OF CHILDHOOD LEUKEMIA USING NEXT-GENERATION SEQUENCING
GENOMIC DETERMINANTS OF CHILDHOOD LEUKEMIA
RESEAU DE BIOBANQUES EN LEUCEMIE PEDIATRIQUE AU QUEBEC
MONTREAL BIOBANK NETWORK FOR PEDIATRIC AND YOUNG ADULT LEUKEMIA : CORE 1 PROPOSAL - CHILDREN LEUKEMIA BANK
GENETIC DETERMINANTS OF THE RESISTANCE TO CORTICOSTEROIDS, VINCRISTINE AND ASPARAGINASE IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA
GENOMIC DETERMINANTS OF CHILDHOOD LEUKEMIA
CIHR TEAM OF PREDICTION AND COMMUNICATION OF FAMILIAL RISK OF BREAST CANCER
GENOMICS OF CHILDHOOD LEUKEMIA
GENOMICS OF CHILDHOOD LEUKEMIA
GENOMICS OF CHILDHOOD LEUKEMIA
STUDIES ON THE ROLE OF NK CELL RECEPTOR GENES AND THEIR LIGANDS IN THE DEVELOPMENT OF LEUKEMIA IN HUMANS
GENOMIC DETERMINANTS OF CHILDHOOD LEUKEMIA
CRN-87521 CIHR TEAM OF PREDICTION AND COMMUNICATION OF FAMILIAL RISK OF BREAST CANCER
CIHR TEAM OF PREDICTION AND COMMUNICATION OF FAMILIAL RISK OF BREAST CANCER
REGULATORY POLYMORPHISMS IN APOPTOSIS GENES AND SUSCEPTIBILITY TO CHILDHOOD LEUKEMIA
DEVELOPPEMENT DE DEMANDE: GENOMIC DETERMINANTS OF COMMON LONG-TERM TREATMENT EFFECTS IN CHILDHOOD ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA SURVIVORS
ATELIER GENOMIQUE FRSQ-NSFC, BEIJING, CHINA
Rayonnement
Publications et communications
Publications
Publications choisies
- B. Ge, D. K. Pokholok, E. Grundberg, T. Kwan, L. Morcos, J. Le, D.J. Verlaan, V. Koka, K.C.L. Lam, V. Gagné, J. Dias, R. Hoberman, A. Montpetit, M.M. Joly, E. J. Harvey, D. Sinnett, P. Beaulieu*, R. Hamon*, A. Graziani, K. Dewar, E. Harmsen, J. Majewski, A.K. Naumova, M. Blanchette, H.H.H. Göring, K.L. Gunderson, T. Pastinen (2009). Global patterns of cis-variation in human cells revealed by high-density allelic expression analysis. Nature Genetics Nov;41(11):1216-22.
- Sherborne A, Hosking FJ, Prasad RB, Kumar R, Koehler R, Vijayakrishnan J, Papaemmanuil E, Bartram CR, Stanulla M, Schrappe M, Gast A, Sheridan E, Taylor M, Kinsey SE, Lightfoot T, Roman E, Irving JAE, Allan JM, Moorman AV, Harrison CJ, Tomlinson IP, Szalai C, Semsei AF, Erdelyi DJ, Krajinovic M, Sinnett D, Healy J, Neira AG, Hemminki K, Greaves M, Houlston RS (2010). Variation at 9p21.3 (CKN2A) influences childhood acute lymphoblastic leukemia risk. Nat Genet. Jun;42(6):492-4.
- Busche S, Ge B, Vidal R, Spinella J-F, Saillour V, Richer C, Healy J, Chen S-H, Droit A, Sinnett D#, Pastinen T. (2013) Integration of high-resolution methylome and transcriptome analyses to dissect epigenomic changes in childhood acute lymphoblastic leukemia. Cancer Research, May 35(4) e157-162. #corresponding author.
- Spinella J-F, Cassart P, Richer C, Saillour V, Ouimet M, Langlois S, St-Onge P, Sontag T, Healy J, Minden M, Sinnett D (2016) The genomic characterization of pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia reveals novel recurrent driver mutations. Oncotarget 2016 Sep 1. doi: 10.18632/oncotarget.11796
- Marcoux S, Drouin S, Laverdière C, Alos N, Andelfinger GU, Bertout L, Curnier D, Friedrich MG, Kritikou EA, Levy E, Lippé S, Marcil V, Raboisson M-J, Rauch F, Robaey P, Séguin C, Sultan S, Krajinovic M, Sinnett D. (2016)The PETALE Study: Late Adverse Effects and Biomarkers in Childhood Acute Lymphoblastic Leukemia Survivors. Pediatric Blood & Cancer Dec 4. doi: 10.1002/pbc.26361 (PETALE-CIHR team leader)
Disciplines
- Biologie moléculaire
- Oncologie
- Génétique
- Pédiatrie
Champ d’expertise
- Bioinformatique
- Cancer du sang
- Cellule
- Diagnostic et détection du cancer
- Fouille de données (Data mining)
- Expression et régulation génique
- Gène suppresseur
- Gènes
- Gènes de susceptibilité
- Génétique de traits complexes
- Génétique du cancer
- Génétique et hérédité
- Génétique moléculaire
- Génome
- Génomique
- Génotype et phénotype
- Maladies génétiques
- Marqueurs génétiques
- Micropuces d'ADN et d'ARN
- Polymorphisme
Aide en ligne pour votre profil | Nous joindre
Le Répertoire des professeurs est propulsé par les données du SADVR et est un projet du CENR.