Sylvie Hamel
Mathématique et informatique
- Directrice de département
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Faculté des arts et des sciences - Département d'informatique et de recherche opérationnelle
- Professeure titulaire
-
Faculté des arts et des sciences - Département d'informatique et de recherche opérationnelle
André-Aisenstadt, local 3161
Médias
Portrait
Expertise de recherche
Mes travaux de recherche se situent à l'interface entre l'informatique et les mathématiques avec des applications en biologie moléculaire. Plus particulièrement, je m'intéresse aux problèmes algorithmiques liés à l'analyse des données provenant du séquençage. Je m'intéresse plus particulièrement à la recherche efficace de mots et de motifs, au réarrangement de génomes et, plus récemment, au repliement de protéines en milieu aqueux. J'ai aussi des intérêts de recherche en informatique théorique, en combinatoire algébrique et en combinatoire des mots.
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Affiliations et responsabilités
Affiliations de recherche
Unités de recherche
Responsable
Membre
Enseignement et encadrement
Enseignement
Cours siglés (session en cours uniquement)
- BCM-70521 – Communication scientifique avancée 2.1
- BCM-70522 – Communication scientifique avancée 2.2
- BIN-1002 – Intégration biosciences et informatique
- BIN-70061 – Communication scientifique avancée 3.1
- BIN-70062 – Communication scientifique avancée 3.2
Programmes
Encadrement
Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)
Combinaison de différents scores génétiques pour mieux évaluer l’impact des CNV sur la cognition
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Étude combinatoire et algorithmique de la médiane de permutations sous la distance de Kendall-Tau
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Étude algorithmique et combinatoire de la méthode de Kemeny-Young et du consensus de classements
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Étude de la médiane de permutations sous la distance de Kendall-Tau
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Analysing artefacts dependencies to evolving software systems
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Evaluating Design Decay during Software Evolution
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Quantification de la relation séquence-activité de l’ARN par prédiction de structure tridimensionnelle
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Modeling protein evolution using secondary structures
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Analyse de la corrélation conditionnelle dérivée de la coévolution d’un système de trois gènes par un modèle du maximum de vraisemblance
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Algorithmes pour la réconciliation d’un arbre de gènes avec un arbre d’espèces
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Helix Explorer : une nouvelle base de données de structures de protéines
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
De nouveaux algorithmes de tri par transpositions
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Parcours de parents immigrants dont le fils a fait l'expérience d'un gang de rue et d'une institutionnalisation : vécu familial bouleversé
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Algorithme de comparaison de structures secondaires d'ARN
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
L'intervention face au phénomène des gangs : l'exemple du Centre jeunesse de Montréal - Institut universitaire
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Application d'algorithmes de bio-informatique à la recherche de patrons de conception
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Projets
Projets de recherche
Centre de recherches mathématiques (CRM)
Algorithmic and combinatorial problems inspired by comparative genomics.
FGR CRSNG en lien avec RN000686
CENTRE DE RECHERCHES MATHEMATIQUES (CRM)
Supplément COVID-19 CRSNG_Algorithmic and combinatorial problems inspired by comparative genomics.
ALGORITHMIC AND COMBINATORIAL STUDIES INSPIRED BY PROGBLEMS OF COMPARATIVE GENOMICS
Réseau Franco-Québécois de recherche sur l'ARN
CENTRE DE RECHERCHES MATHEMATIQUES (CRM)
ALGORITHMIC AND COMBINATORIAL STUDIES INSPIRED BY PROGBLEMS OF COMPARATIVE GENOMICS
Rayonnement
Publications et communications
Disciplines
- Informatique
- Mathématiques fondamentales
- Biologie moléculaire
- Génomique
Champ d’expertise
- Analyse combinatoire
- Combinatoire des mots
- Génomique comparative
- Géométrie combinatoire
- Logique combinatoire
- Optimisation combinatoire
- Recherche de motifs biologiques
- Théorie combinatoire des ensembles
- Théorie combinatoire des groupes
- Théorie combinatoire des nombres
- Topologie combinatoire
- Séquençage de génomes
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