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Sciences de la santé; Sciences médicales

Stephen Michnick

Fonction du gène et interaction en tant qu’ensemble

Professeur titulaire

Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire

Roger-Gaudry, local E523

514 343-5849

stephen.michnick@umontreal.ca

Autres numéros : 514 343-2210 (Télécopieur) 514 343-6111 #3205 (Laboratoire)

Médias

| New Fellow of 2018 - RSC | Stephen Michnick - Université de Montréal

Stephen Michnick, professeur titulaire au Département de biochimie et médecine moléculaire, a été élu membre de la Société royale du Canada.

Portrait

Expertise de recherche

Comment fonctionnent les cellules? Nous pouvons poser cette question de deux manières: premièrement, nous pourrions demander: quelle est la fonction d’un gène et deuxièmement, comment les gènes fonctionnent-ils en tant qu’ensembles. Dans mon laboratoire, nous voulons pouvoir tester des hypothèses sur le fonctionnement des gènes et sur la manière d'étudier leurs interactions à l'échelle du génome.

Le séquençage de quelque 28 000 gènes humains a occupé de nombreux laboratoires à travers le monde et a motivé une activité fébrile des chercheurs biomédicaux pour la compréhension des fonctions des gènes. Cependant, en l'absence de méthodes simples pour établir la fonction, ces activités n'ont pas progressées de manière significative. Nous avons une situation analogue à celle qui consiste à avoir une liste complète des numéros de téléphone d'une ville, mais peu de moyens simples de relier ces numéros à leurs propriétaires, sans parler des relations entre eux. Une façon de définir la fonction d’un gène nouvellement identifié consiste à étudier les interactions de son produit (une protéine) avec des protéines pour lesquelles nous connaissons déjà leur fonction. Nous avons développé des méthodes expérimentales et théoriques nous permettant d’étudier comment les protéines se forment des complexes les unes avec les autres. Nos méthodes nous permettent de déterminer comment, quand et où dans la cellule de nouvelles protéines interagissent avec des protéines connues et quels sont les phénotypes résultants spécifiquement associés à un nouveau gène. Nous étudions également comment des groupes de protéines fonctionnent comme des ensembles pour réguler la prise de décision par la cellule.

Nous avons posé l'hypothèse que les cellules utilisent un nombre limité de stratégies moléculaires pour répondre aux signaux environnementaux afin de prendre la décision de se diviser, de se différencier en de nouvelles formes ou de mourir. Nous recherchons ces mécanismes communs, que nous appelons des «motifs logiques» au niveau du génome. Nous avons déjà découvert plusieurs motifs logiques nécessaires à la survie des cellules et pour lesquels leurs interruptions sont impliquées dans plusieurs maladies, notamment les cancers et les maladies du développement et du vieillissement.

Biographie

Professeur au Département de biochimie et médecine moléculaire, Stephen Michnick est titulaire de la Chaire de recherche du Canada sur l'architecture et la dynamique des cellules (niveau 1). Il est membre du Centre Robert-Cedergren de l’Université de Montréal, qui a pour mission de catalyser l’avancement de la recherche fondamentale et de la formation dans les domaines de la bio-informatique et des sciences génomiques. L'objectif de M. Michnick et de son équipe est de comprendre l'intelligence et la mémoire cellulaires. Pour ce faire, ils étudient les principes d'organisation moléculaire et leur influence sur la cellule et sur la mémoire transgénérationnelle.

Prix et distinctions

  • Membre de la Société royale du Canada - 2018

Affiliations et responsabilités

Enseignement et encadrement

Encadrement

Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)

2019

Phosphoproteomic study on osmotic shock in Saccharomyces cerevisiae over sub-minute and half- hour timescales

Diplômé(e) : Isik, Seckin Sinan
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2017

The regulation and induction of clathrin-mediated endocytosis through a protein aqueous-aqueous phase separation mechanism

Diplômé(e) : Bergeron-Sandoval, Louis-Philippe
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2017

Beyond hairballs: depicting complexity of a kinase-phosphatase network in the budding yeast

Diplômé(e) : Abd-Rabbo, Diala
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2017

The potential role of the multivalent ionic compound PolyP in the assembly of the liquid nature in the cell

Diplômé(e) : Matta, Lara Michel
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2015

Étude de l’effet de la metformine sur la survie cellulaire et sur la réparation de l’ADN chez la levure

Diplômé(e) : Piette, Benjamin L.
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2012

Clustering algorithms and shape factor methods to discriminate among small GTPase phenotypes using DIC image analysis.

Diplômé(e) : Papaluca, Arturo
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2011

Molecular mechanisms for a switch-like mating decision in Saccharomyces cerevisiae

Diplômé(e) : Malleshaiah, Mohan
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2008

Détection, caractérisation et visualisation des structures transitoires de protéines par sondage au tryptophane

Diplômé(e) : Vallée-Bélisle, Alexis
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2006

Cartographe dynamique des voies de signalisation MAPK chez la levure Saccharomyces cerevisiae

Diplômé(e) : Nissaire, Philippe
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2005

Development of a binary positive and negative protein fragment complementation assay using yeast cytosine deaminase

Diplômé(e) : Ear, Po Hien
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

Projets

Projets de recherche

2020 - 2027

Canada Research Chair in Cellular Architecture and Dynamics

Chercheur principal : Stephen Michnick
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVX50399-Chaires de recherche du Canada
2019 - 2026

DISCOVERY, DEVELOPMENT AND VALISATION OF BIOMARKERS AND THERAGNOSTIC APPROACHES

Chercheur principal : Stephen Michnick
Co-chercheurs : Jean-Claude Tardif
Sources de financement : FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'exploitation des infrastructures (FEI)
2019 - 2023

An Integrated Quantitative Biology Initiative (IQBI)

Chercheur principal : Jackalyn Marie Vogel
Co-chercheurs : Stephen Michnick
Sources de financement : FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'exploitation des infrastructures (FEI)
2015 - 2023

Structure, dynamics and function of non-membranous organelles

Chercheur principal : Stephen Michnick
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention : PVXX5647-Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques
2019 - 2022

Drop-based microfluidics (DBM) for single cell studies and ultrahighthroughput phenotypic screens and lab evolution

Chercheur principal : Adrian Serohijos
Co-chercheurs : Franz Bernd Lang , Stephen Michnick , Daniel Zenklusen , Bernard Shapiro
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (OIR) -1 -(de 7 001 $ à 150 000 $)
2018 - 2022

Persistance des bactéries contre les antibiotiques et la vitrosité de leur cytoplasme

Chercheur principal : Stephen Michnick
Co-chercheurs : Adrian Serohijos , Paul François
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2015 - 2022

STRUCTURE, DYNAMICS AND CAUSALITY IN PROTEIN INTERACTION NETWORKS

Chercheur principal : Stephen Michnick
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2020 - 2021

Optimization of specific Frizzled Receptor-targeted antibodies signalling responses

Chercheur principal : Stephen Michnick
Sources de financement : MITACS Inc.
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Stage Élévation Québec - MITACS
2018 - 2021

Macromolecular interaction analysis using a surface plasmon resonance biosensor

Chercheur principal : John Pascal
Co-chercheurs : Adrian Serohijos , Stephen Michnick , Pascale Legault , James G. Omichinski
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (OIR) -1 -(de 7 001 $ à 150 000 $)
2017 - 2021

Elucidating the molecular logic of membrane-free compartment function and assembly.

Chercheur principal : Stephen Michnick
Co-chercheurs : Rohit Pappu , Simon Alberti
Sources de financement : International Human Frontier Science Program Organisation
Programmes de subvention :
2014 - 2021

STRUCTURE DYNAMICS AND CONTINGENCY IN SIGNALING REGULATORY NETWORKS

Chercheur principal : Stephen Michnick
Co-chercheurs : Pierre Thibault
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention : PVXX5647-Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques
2013 - 2020

CHAIRE DE RECHERCHE DU CANADA - ARCHITECTURE ET LA DYNAMIQUE DES CELLULES - CELLULAR ARCHITECTURE AND DYNAMICS

Chercheur principal : Stephen Michnick
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVX50399-Chaires de recherche du Canada
2016 - 2019

An Integrated Quantitative Biology Initiative (IQBI)

Chercheur principal : Stephen Michnick
Co-chercheurs : Jackalyn Marie Vogel
Sources de financement : FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'innovation
2015 - 2019

Microscopie de confinement à l'échelle nanométrique pour l?observation de la dynamiques et des interactions de l'ADN et des protéines

Chercheur principal : Sabrina Leslie
Co-chercheurs : Stephen Michnick
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2015 - 2019

Thermodynamique intra-cellulaire: approche intégrée théorie-expérience

Chercheur principal : Paul François
Co-chercheurs : Stephen Michnick
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2015 - 2019

Thermodynamique intra-cellulaire: approche intégrée théorie-expérience

Chercheur principal : Paul François
Co-chercheurs : Stephen Michnick
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2013 - 2017

MEMORY AND CHANCE DURING NUTRIENT SENSING IN BUDDING YEAST

Chercheur principal : Stephen Michnick
Co-chercheurs : Peter Swain , Kevin Verstrepen
Sources de financement : International Human Frontier Science Program Organisation
Programmes de subvention :
2011 - 2017

NSERC CREATE TRAINING PROGRAM IN BIONANOMACHINES

Chercheur principal : Kalle Burges Gehring
Co-chercheurs : Stephen Michnick
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PV118026-FONCER : Prog. formation orientée nouveauté, la collaboration et l'expérience en recherche
2000 - 2017

STRUCTURE, DYNAMICS AND CONTINGENCY IN NUCLEAR REGULATORY NETWORKS

Chercheur principal : Stephen Michnick
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention : PVXX5647-Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques
2011 - 2016

STRUCTURE, DYNAMICS AND CONTINGENCY IN NUCLEAR REGULATORY NETWORKS

Chercheur principal : Stephen Michnick
2010 - 2016

TRAINING PROGRAM IN CELLULAR DYNAMICS OF MACROMOLECULAR COMPLEXES

Chercheur principal : Christian Baron
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PV118026-FONCER : Prog. formation orientée nouveauté, la collaboration et l'expérience en recherche
1999 - 2016

PROBING STRUCTURE AND CAUSALITY IN BIOCHEMICAL NETWORKS WITH DYNAMIC HOMOMERIC PROTEIN COMPLEXES

Chercheur principal : Stephen Michnick
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2009 - 2015

CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATION DISEASE : IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY : A MODEL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES

Chercheur principal : Stephen Michnick
Co-chercheurs : John David Rioux
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Subvention d'équipe
2009 - 2015

STRUCTURE, DYNAMICS AND CONTINGENCY IN SIGNALING REGULATORY NETWORKS

Chercheur principal : Stephen Michnick
Co-chercheurs : Pierre Thibault , Susan Meakin
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention : PVXX5647-Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques
2009 - 2015

CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATORY DISEASES : IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY : A MODAL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES

Chercheur principal : John David Rioux
Co-chercheurs : Sylvie Lesage , Stephen Michnick , Sylvain Chemtob
Sources de financement : Fondation canadienne des maladies inflammatoires de l'intestin
Programmes de subvention :
2009 - 2015

CIHR EMERGING TEAM IN INTEGRATIVE BIOLOGY OF INFLAMMATORY DISEASES : IL23R AS A CONFIRMED IMMUNE DISEASE PATHWAY: A MODAL FOR TRANSLATING GENETIC DISCOVERIES INTO BETTER DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COMMON DISEASES

Chercheur principal : John David Rioux
Co-chercheurs : Sylvie Lesage , Stephen Michnick , Sylvain Chemtob
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Subvention d'équipe
2012 - 2014

LOW-VOLUME ITC FOR INVESTIGATING BIOMOLECULAR INTERACTIONS

Chercheur principal : James G. Omichinski
Co-chercheurs : Normand Brisson , Rikard Blunck , Jurgen Sygusch , Christian Baron , Stephen Michnick , Pascale Legault
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (OIR) -1 -(de 7 001 $ à 150 000 $)
2010 - 2014

PROBING STRUCTURE AND CAUSALITY IN BIOCHEMICAL NETWORKS WITH DYNAMIC HOMOMERIC PROTEIN COMPLEXES

Chercheur principal : Stephen Michnick
2008 - 2014

STRUCTURE, DYNAMICS AND CONTINGENCY IN SIGNALING REGULATORY NETWORKS

Chercheur principal : Stephen Michnick
2013

CREATE TRAINING PROGRAM IN BIONANOMACHINES

Chercheur principal : Stephen Michnick
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PV118026-FONCER : Prog. formation orientée nouveauté, la collaboration et l'expérience en recherche

Rayonnement

Publications et communications

Publications

  • Tarassov, K. Messier, V., Landry, C.R., Radinovic, S., Serna Molina, M. M., Shames, I., Malitskaya, Y., Vogel, J., Bussey, H. and S. W. Michnick (2008) An in vivo Map of the Yeast Protein Interactome Science Epub May 8.
  • Stefan, E., Aquin, S., Berger, N., Landry, C., Bouvier, M., Michnick, S. W., (2007) Quantification of dynamic protein complexes using Renilla luciferase-fragment complementation applied to PKA activities in vivo. Proc Natl Acad Sci U S A, 104, 16,916-16,921.
  • Michnick, S. W., Ear, P. H., Manderson, E. N., Remy, I., Stefan, E.,  (2007)  Universal strategies in research and drug discovery based on protein-fragment complementation assays. Nature Rev Drug Discov  6, 569-582.
  • MacDonald, M. L., Lamerdin, J., Owens, S., Keon, B. H., Bilter, G. K., Shang, Z., Huang, Z., Yu, H., Dias, J., Minami, T., Michnick, S. W.*, Westwick, J. K.,  (2006)  Identifying off-target effects and hidden phenotypes of drugs in human cells. Nature Chem Biol  2, 329-337.
  • Remy, I., Montmarquette, A., Michnick, S. W.,  (2004)  PKB/Akt modulates TGF-beta signalling through a direct interaction with Smad3. Nature Cell Biol  6, 358-65.

Disciplines

  • Biochimie
  • Bio-informatique
  • Génomique
  • Biologie moléculaire
  • Médecine moléculaire

Champ d’expertise

  • Génomique
  • Gènes
  • Protéomique
  • Acides nucléiques
  • Bioinformatique
  • Cellule
  • Chromosome (Organismes vivants)
  • Enzymes et protéines
  • Gène (Organismes vivants)
  • Mécanismes biologiques et biochimiques
  • Molécules bioactives
  • Macromolécules
  • Signalisation cellulaire et cancer
  • COVID-19
  • COVID19