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Sciences de la santé; Sciences médicales

Franz Bernd Lang

Génomique, bio-informatique et évolution

Professeur titulaire

Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire

Roger-Gaudry, local H307-15

514 343-5842

franz.lang@umontreal.ca

Autre numéro : 514 343-2210 (Télécopieur)

Portrait

Expertise de recherche

Thèmes 

  • Bactéries et champignons symbiotiques
  • Génomes et évolution de gènes
  • Bioinformatique, génomique, transcriptomique et protéomique

BACTÉRIES ET CHAMPIGNONS SYMBIOTIQUES

Les organismes multicellulaires comme les plantes et les animaux interagissent fréquemment avec des microbes symbiotiques. Ces derniers vont de bénéfiques à pathogènes et peuvent vivre dans les tissus, dans les cellules, ou au contact externe. Nous nous intéressons particulièrement aux symbiotes bénéfiques aux végétaux, afin de comprendre comment ils coopèrent avec leur hôte, au moyen du séquençage et de l’analyse de leurs génomes, transcriptomes et protéomes. Ce projet est d’une grande portée pour une agriculture durable - le remplacement des produits agro-chimiques par les bio-pesticides et les engrais minéraux par la bio-fertilisation.  

GÉNOMES ET EVOLUTION DE GÈNES

Comprendre l'architecture du génome, le contenu en gènes et l'expression génique - dans un contexte évolutif - est à la base de la compréhension des organismes vivants. Nous nous intéressons à un large éventail de bactéries, champignons et eucaryotes unicellulaires, particulièrement les espèces symbiotiques des plantes, de même qu’aux eucaryotes primitifs nous permettant de retracer l'origine des eucaryotes. Notre approche par génomique comparative nous permet d'identifier régulièrement des mécanismes moléculaires innovants, tels l'édition d'ARN, l'épissage en trans, ou le saut de ribosome.

OUTILS BIO-INFORMATIQUES POUR L’ANALYSE DE GÉNOMES

Nous développons des stratégies/procédures/outils bio-informatiques pour l'assemblage de génomes, la reconnaissance de gènes, l'annotation fonctionnelle de génomes. Notre recherche est multidisciplinaire, et basée sur des collaborations nationales et internationales.

Prix et distinctions

  • Société royale du Canada : Les Académies des arts, des lettres et des sciences du Canada 2015 - Société royale du Canada

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Affiliations et responsabilités

Affiliations de recherche

Enseignement et encadrement

Encadrement

Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)

2018

An approach to improved microbial eukaryotic genome annotation

Diplômé(e) : Sarrasin, Matthew
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2015

Développement de méthodes d'assemblage de génomes de novo adaptées aux bactéries endosymbiotes

Diplômé(e) : Théroux, Jean-François
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2013

La RNase P mitochondriale chez Neurospora crassa

Diplômé(e) : Minoiu, Ioana
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2011

Supercomplexes multifonctionnels chez les mitochondries, et chez E. coli

Diplômé(e) : Daoud, Rachid
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2010

A phylogenomics approach to resolving fungal evolution, and phylogenetic method development

Diplômé(e) : Liu, Yu
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2010

Purification of mitochondrial RNase P in A. nidulans

Diplômé(e) : Javadi Khomami, Pasha
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2007

Une approche phylogénomique pour inférer l'évolution des eucaryotes

Diplômé(e) : Rodríguez-Ezpeleta, Naiara
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2005

Évolution structurale et fonctionnelle de la composante ARN de la RNase P mitochondriale

Diplômé(e) : Seif, Elias
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2004

L'évolution de l'édition des ARN de transfert chez les jakobides

Diplômé(e) : Leigh, Jessica
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2004

Caractérisation structurale et fonctionnelle des ARNtm mitochondriaux de jakobides

Diplômé(e) : Jacob, Yannick
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

Projets

Projets de recherche

2018 - 2023

MYCATOK PROJECT: INNOVATING CRANBERRY FARMING WITH BENEFICIAL SYMBIOTIC MICROBES

Chercheur principal : Franz Bernd Lang
Sources de financement : Transport Gaston Nadeau inc.
Programmes de subvention :
2018 - 2023

MYCATOK PROJECT: INNOVATING CRANBERRY FARMING WITH BENEFICIAL SYMBIOTIC MICROBES

Chercheur principal : Franz Bernd Lang
Sources de financement : Entreprises Gillivert inc.
Programmes de subvention :
2018 - 2023

MYCATOK PROJECT: INNOVATING CRANBERRY FARMING WITH BENEFICIAL SYMBIOTIC MICROBES

Chercheur principal : Franz Bernd Lang
Sources de financement : Pampev inc.
Programmes de subvention :
2018 - 2023

MYCATOK PROJECT: INNOVATING CRANBERRY FARMING WITH BENEFICIAL SYMBIOTIC MICROBES

Chercheur principal : Franz Bernd Lang
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG) , Université de Montréal
Programmes de subvention : PVX20973-(RDC-CRD) Partenariat de recherche / Subvention de recherche et développement coopérative ,
2018 - 2023

MYCATOK PROJECT: INNOVATING CRANBERRY FARMING WITH BENEFICIAL SYMBIOTIC MICROBES

Chercheur principal : Franz Bernd Lang
Sources de financement : Canneberges Bieler inc.
Programmes de subvention :
2017 - 2023

Mitochondrial translation systems that break the rules

Chercheur principal : Franz Bernd Lang
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2019 - 2022

Drop-based microfluidics (DBM) for single cell studies and ultrahighthroughput phenotypic screens and lab evolution

Chercheur principal : Adrian Serohijos
Co-chercheurs : Franz Bernd Lang , Stephen Michnick , Daniel Zenklusen , Bernard Shapiro
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (OIR) -1 -(de 7 001 $ à 150 000 $)
2018 - 2022

Génomique comparative d’une lignée d’eucaryotes ancienne: les jakobides

Chercheur principal : Franz Bernd Lang
Co-chercheurs : Gertraud Burger , David Morse
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2017 - 2021

Prédiction automatique de modifications du code génétique et de l’ARN messager

Chercheur principal : Nadia El-Mabrouk
Co-chercheurs : Franz Bernd Lang , Mathieu Blanchette
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2019

Investigation of systematic errors in genome assembly algorithms

Chercheur principal : Franz Bernd Lang
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2017 - 2019

Genomique de l'endosymbiose

Chercheur principal : Franz Bernd Lang
Sources de financement : FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds des leaders
2011 - 2018

STRUCTURE AND EVOLUTION OF MITOCHONDRIAL RNASE P

Chercheur principal : Franz Bernd Lang
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2013 - 2017

EVOLUTION DES GENES D'ARN DE TRANSFERT A L'ECHELLE GENOMIQUE

Chercheur principal : Nadia El-Mabrouk
Co-chercheurs : Franz Bernd Lang , Mathieu Blanchette
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2010 - 2017

CHAIRE DE RECHERCHE DU CANADA EN GENOMIQUE COMPARATIVE ET EVOLUTIVE

Chercheur principal : Franz Bernd Lang
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVX50399-Chaires de recherche du Canada
2011 - 2015

GENOREM IMPROVING BIOREMEDIATION OF POLLUTED SOILS THROUGH ENVIRONMENTAL GENOMICS

Chercheur principal : Franz Bernd Lang
Sources de financement : Génome Québec
Programmes de subvention :
2011 - 2015

STRUCTURE AND EVOLUTION OF MITOCHONDRIAL RNASE P

Chercheur principal : Franz Bernd Lang
2011 - 2015

OPTIMISATION REPRODUCTIVE: LE ROLE DU GUIDAGE DES TUBES POLLINIQUES DANS LA PREVENTION DES CROISEMENTS INTERSPECIFIQUES ET LA SPECIATION CHEZ LES PLANTES

Chercheur principal : Daniel Philippe Matton
Co-chercheurs : Franz Bernd Lang , Daniel J Schoen
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2012 - 2014

A BIOFERTILIZER MANAGEMENT STRATEGY FOR SUSTAINABLE CRANBERRY PRODUCTION, USING BIOCHAR TOGETHER WITH BENEFICIAL MICROBES

Chercheur principal : Franz Bernd Lang
Co-chercheurs : Suha Jabaji-Hare
Sources de financement : MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Programmes de subvention :
2010 - 2014

DEVELOPING MYCORRHIZAL GENOMIC MARKERS TO ENHANCE INDUSTRIAL PRODUCTION AND FORMULATION

Chercheur principal : Mohamed Hijri
Co-chercheurs : Franz Bernd Lang , Claude Vallée
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG) , Premier Tech ltée
Programmes de subvention : PVX20973-(RDC-CRD) Partenariat de recherche / Subvention de recherche et développement coopérative ,

Rayonnement

Publications et communications

Publications

  • Lang BF, et al. , Burger G, Nosek J (2014). Massive programmed translational jumping in mitochondria. Proc Natl Acad Sci U S A. 111:5926-31

  • Burger G, Gray MW, Forget L, Lang BF (2013). A strikingly bacteria-like and gene-rich mitochondrial genome is a hallmark of jakobid protists. Genome Biol Evol 5:418

  • Derelle R and BF Lang (2011). Rooting the eukaryotic tree with mitochondrial and bacterial proteins. Mol Biol Evol 29:1277-1289.

    https://scholar.google.ca/scholar?q=lang+bf

Disciplines

  • Biochimie
  • Génomique
  • Génétique
  • Bio-informatique

Champ d’expertise

  • Acides nucléiques
  • Cellule
  • Chromosome (Organismes vivants)
  • Enzymes et protéines
  • Évolution et phylogénie
  • Gène (Organismes vivants)
  • Mécanismes biologiques et biochimiques
  • Molécules bioactives
  • Bactéries
  • Génome
  • Gènes
  • Génomique
  • Protéomique