L'ubiquitination est une modification post-traductionnelle qui joue un rôle primordial dans la régulation de plusieurs fonctions cellulaires. D'un point de vue clinique, des mutations de nombreux gènes du système ubiquitine ont été liées de manière causale à diverses maladies, dont le cancer. L'ubiquitination est un processus réversible dû à la présence des déubiquitinases (enzymes qui enlèvent spécifiquement l'ubiquitine des protéines cibles). Bien que les déubiquitinases soient peu connues, elles sont néanmoins en train d'émerger comme des régulateurs centraux du système ubiquitine. 

Notre objectif est de caractériser les fonctions biologiques et les mécanismes d'action des déubiquitinases impliquées dans la transcription et la réparation de l'ADN, deux processus dont la dérégulation joue un rôle fondamental dans le développement du cancer.

Nous utilisons des approches de biochimie, de biologie moléculaire et de culture cellulaire, à la fine pointe de la technologie, afin de caractériser les fonctions des déubiquitinases.

Nos travaux permettent une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires gouvernant le système ubiquitine. De plus, de nouveaux concepts pourront être développés concernant la régulation de la transcription et la réparation de l'ADN. D'autre part, nos travaux devraient contribuer à l'identification de nouvelles cibles thérapeutiques pour traiter le cancer en médecine personnalisée.

El Bachir Affar, docteur en physiologie-endocrinologie dirige l'unité de recherche Signalisation cellulaire et cancer de l'Hôpital Maisonneuve-Rosemont. Il est également professeur titulaire au Département de médecine et professeur accrédité au Département de biochimie et médecine moléculaire de l'Université de Montréal. 

El Bachir Affar s’intéresse à la signalisation cellulaire via l’ubiquitination, aux processus associés à l’ADN et à la chromatine (transcription et réparation de l’ADN), et aux bases moléculaires du cancer. Son équipe travaille particulièrement sur le gène BAP1, un gène fréquemment muté dans certains types de cancers.

• Membre de l'Oncopole

• Membre de la Fondation du cancer du sein du Québec

Publications choisies

• Daou, N Mashtalir, I Hammond-Martel, H Pak, H Yu, G Sui, TM. Kristie and EB Affar.  Crosstalk Between O-GlcNAcylation And Proteolytic Cleavage Regulates The HCF-1 Maturation Pathway. Proc Natl Acad Sci., 2011;108(7):2747-52
• I Hammond-Martel, H Pak, H Yu, R Rouget, AA Horwitz, JD. Parvin, EA. Drobetsky and EB Affar. PI 3 Kinase Related Kinases-Independent Proteolysis of BRCA1 Regulates Rad51 Recruitment During Genotoxic Stress in Human Cells. PlosONE 10.1371/journal.pone.0014027 (2010).
• H Yu, N Mashtalir, S Daou, I Hammond-Martel, J Ross, G Sui, GW. Hart, FJ Rauscher III, EA Drobetsky, E Milot, Y Shi and EB Affar. The Ubiquitin Carboxyl Hydrolase BAP1 Forms a Ternary Complex with YY1 and HCF-1 and is a Critical Regulator of Gene Expression.  Mol. Cell. Biol.30(21):5071-85, (2010). Raphael Rouget , Yannick Auclair, Martin Loignon, El Bachir Affar, Elliot Drobetsky. A sensitive flow cytometry-based nucleotide excision repair assay unexpectedly reveals that mitogen-activated protein kinase signalling does not regulate the removal of UV-induced DNA damage in human cells. Journal of Biological Chemistry, 283(9):5533-5541, (2008).
• Andrew A. Horwitz, El Bachir Affar, George F. Heine, Yang shi, Jeffrey D. Parvin. A novel mechanism for transcriptional repression dependent on the BRCA1 E3 ubiquitin ligase. Proc. Natl. Acad. Sci., 104(16):6614-6619, (2007).
• Yu May Ma, Emmanuel Boucrot, Judit Villen, El Bachir Affar, Steven P. Gygi, Heinrich G. Gottlinger and Tomas Kirchhausen. Targeting of AMSH to endosomes is required for EGF receptor degradation. Journal of Biological Chemistry, 282(13):9805-9812, (2007).
• El Bachir Affar, Margaret Po-shan Luke, Frédérique Gay, Dominica Calvo, Guangchao Sui, Robert S. Weiss, En Li, and Yang Shi. Targeted Ablation of Par-4 Reveals a Cell-Type Specific Susceptibility To Apoptosis-Inducing Agents. Cancer Research, 66(7):3456-3462, (2006)
• El Bachir Affar*, Frédérique Gay*, Yujiang Shi, Huifei Liu, Maite Huarte, Su Wu, Collins Tucker, En Li, and Yang Shi. Essential dosage-dependent functions of the transcription factor Yin Yang 1 in late embryonic development and cell cycle progression. Molecular and Cellular Biology, 26(9):3565-3581, (2006). * Equal Contribution.
• Sang Ki Park, Minh Dang Nguyen, André Fisher, Margaret Po-Shan Luke, El Bachir Affar, Paul B. Dieffenbach, Huang-Chun Tseng, Yang Shi and Li-Huei Tsai. Par-4 links dopamine signaling and depression. Cell,122(2):275-287, (2005).
• Guangchao Sui, El Bachir Affar*, Yujiang Shi*, Chrystelle Brignone, Nathan R. Wall, Peng Yin, Mary Donohoe, Dominica Calvo, Margaret P. Luke, Steven R. Grossman, Yang Shi. Yin Yang 1 is a negative regulator of p53. Cell, 117(7): 859-872, (2004). * Equal contribution.
• Yujiang Shi, Jun-ichi Sawada, Guangchao Sui, El Bachir Affar, Johnathan R. Whetstine, Fei Lan, Hidesato Ogawa, Margaret Po-Shan Luke, Yoshihiro Nakatani and Yang Shi. Coordinated histone modifications mediated by a CtBP co-repressor complex. Nature, 422(6933):735-738, (2003).
• Guangchao Sui*, Christina Soohoo*, El Bachir Affar*, Frédérique Gay, Yujiang Shi, William Forrester and Yang Shi. A DNA vector-based RNAi technology to suppress gene expression in mammalian cells. Proc. Natl. Acad. Sci., 99:5515-5520, (2002). * Equal Contribution.
• El Bachir Affar, Rashmi G. Shah, Annie K. Dallaire, Vincent Castonguay and Girish M. Shah. Role of poly(ADP-ribose) polymerase in rapid intracellular acidification induced by alkylating DNA damage. Proc. Natl. Acad. Sci., 99: 245-250, (2002).