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Sciences de la santé; Sciences médicales

El Bachir Affar

Signalisation cellulaire via l'ubiquitination

Professeur sous octroi agrégé

Faculté de médecine - Département de médecine

el.bachir.affar@umontreal.ca

Professeur accrédité

Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire

el.bachir.affar@umontreal.ca

Autres numéros : 514 252-3400 #3343 (Travail 1) 514 252-3430 (Télécopieur) 514 252-3400 #4683 (Travail 2)
Autre courriel : aelbachir.hmr@ssss.gouv.qc.ca (Travail)

Portrait

Expertise de recherche

L’ubiquitination est une modification post-traductionnelle qui joue un rôle primordial dans la régulation de plusieurs fonctions cellulaires. D’un point de vue clinique, des mutations de nombreux gènes du système ubiquitine ont été liées de manière causale à diverses maladies, dont le cancer. L’ubiquitination est un processus réversible dû à la présence des déubiquitinases (enzymes qui enlèvent spécifiquement l’ubiquitine des protéines cibles). Bien que les déubiquitinases soient peu connues, elles sont néanmoins en train d’émerger comme des régulateurs centraux du système ubiquitine. Notre objectif est de caractériser les fonctions biologiques et les mécanismes d’action des déubiquitinases impliquées dans la transcription et la réparation de l’ADN, deux processus dont la dérégulation joue un rôle fondamental dans le développement du cancer.Nous utilisons des approches de biochimie, biologie moléculaire et culture cellulaire afin de caractériser les fonctions des déubiquitinases. Nos travaux devraient permettre une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires gouvernant le système ubiquitine. De plus, de nouveaux concepts pourront être développés concernant la régulation de la transcription et la réparation de l’ADN.

Biographie

Le Dr El Bachir Affar est titulaire d’un doctorat en physiologie-endocrinologie du Centre hospitalier de l’Université Laval (CHUL), ainsi que de deux postdoctorats : le premier du Laboratoire de recherche sur le cancer de la peau du CHUL, et le deuxième du département de pathologie de la Harvard Medical School. Il s’intéresse principalement à la signalisation cellulaire via l’ubiquitination, aux processus associés à l’ADN et à la chromatine (transcription et réparation de l’ADN), et aux bases moléculaires du cancer.

Prix et distinctions

1999 :

  • Tableau d’honneur du doyen (Ph. D.), Université Laval
  • Chercheur-boursier - Junior 1, Fonds de recherche du Québec – Santé (FRQS)
  • Bourse Taplin, Université Harvard
  • Bourse de nouveau chercheur, Instituts de recherche en santé du Canada (IRSC)

2011 :

  • Finaliste, Prix de nouveau chercheur principal Maud Menten, Institut de génétique, IRSC

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Affiliations et responsabilités

Affiliations de recherche

Contribution au fonctionnement de l’institution

Activités au sein d’organismes ou d’entités de l’institution

Enseignement et encadrement

Encadrement

Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)

2018

Régulation du complexe suppresseur de tumeurs BAP1/ASXL2 par ubiquitination

Diplômé(e) : Ahmed, Oumaima
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2016

Étude fonctionnelle d’un nouveau complexe multi-enzymatique régulant l’épigénome

Diplômé(e) : Daou, Salima
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2016

Biochemical and functional characterization of the tumor suppressors BRCA1 and BAP1

Diplômé(e) : Hammond-Martel, Ian
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2016

Régulation du facteur de transcription FOXK1 par O-GlcNAcylation : implications dans la différenciation adipocytaire

Diplômé(e) : Iannantuono, Nicholas
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2014

Regulation of BAP1 tumor suppressor complex by post-translational modifications

Diplômé(e) : Mashtalir, Nazar
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
2013

The role of ubiquitination and deubiquitination in the regulation of BRCA1 function during genotoxic stress

Diplômé(e) : Pak, Helen
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2011

Rôle de la déubiquitinase BAP1 dans la réponse cellulaire aux dommages à l'ADN

Diplômé(e) : Ghram, Mehdi
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

Projets

Projets de recherche

2015 - 2022

UNRAVELING THE FUNCTION AND THE MECHANISM OF ACTION OF THE DEUBIQUITINASE MYSM1

Chercheur principal : El Bachir Affar
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2017 - 2019

A Benchtop Cell Sorter for Accelerating the Discovery of Physiopathological Processes

Chercheur principal : Éric Milot
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (OIR) -1 -(de 7 001 $ à 150 000 $)
2016 - 2019

Le système ubiquitine dans la régulation des processus associés à l' ADN et le cancer

Chercheur principal : El Bachir Affar
Sources de financement : FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Senior
2016 - 2018

A microcalorimetry system to define the biochemical parameters of molecular interactions

Chercheur principal : El Bachir Affar
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (OIR) -1 -(de 7 001 $ à 150 000 $)
2011 - 2016

TRANSCRIPTIONAL REGULATION BY A NOVEL DEUBIQUITINASE MULTI-PROTEIN COMPLEX

Chercheur principal : El Bachir Affar
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(MSH) Bourses de nouveaux chercheurs
2011 - 2016

TRANSCRIPTIONAL REGULATION BY A NOVEL DEUBIQUITINASE MULTI-PROTEIN COMPLEX

Chercheur principal : El Bachir Affar
2010 - 2016

ROLE OF THE DEUBIQUITINASE USP16 IN CELL CYCLE PROGRESSION

Chercheur principal : El Bachir Affar
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2011 - 2014

RÔLES DU SYSTÈME UBIQUITINE DANS LA TRANSCRIPTION ET LA RÉPARATION DE L'ADN

Chercheur principal : El Bachir Affar
2009 - 2014

ROLE OF THE DEUBIQUITINASE USP16 IN CELL CYCLE PROGRESSION

Chercheur principal : El Bachir Affar
2011

CHARACTERIZATION OF NOVEL EPIGENETIC MARKS

Chercheur principal : El Bachir Affar
2010

MONITORING GENE FUNCTION AND REGULATION IN PHYSIO-PATHOLOGOCAL PROCESSES

Chercheur principal : El Bachir Affar

Rayonnement

Autres activités et contributions

  • Membre de la Fondation du cancer du sein du Québec

Publications et communications

Publications

Publications choisies

  • Daou, N Mashtalir, I Hammond-Martel, H Pak, H Yu, G Sui, TM. Kristie and EB Affar.  Crosstalk Between O-GlcNAcylation And Proteolytic Cleavage Regulates The HCF-1 Maturation Pathway. Proc Natl Acad Sci., 2011;108(7):2747-52
  • I Hammond-Martel, H Pak, H Yu, R Rouget, AA Horwitz, JD. Parvin, EA. Drobetsky and EB Affar. PI 3 Kinase Related Kinases-Independent Proteolysis of BRCA1 Regulates Rad51 Recruitment During Genotoxic Stress in Human Cells. PlosONE 10.1371/journal.pone.0014027 (2010).
  • H Yu, N Mashtalir, S Daou, I Hammond-Martel, J Ross, G Sui, GW. Hart, FJ Rauscher III, EA Drobetsky, E Milot, Y Shi and EB Affar. The Ubiquitin Carboxyl Hydrolase BAP1 Forms a Ternary Complex with YY1 and HCF-1 and is a Critical Regulator of Gene Expression.  Mol. Cell. Biol.30(21):5071-85, (2010). Raphael Rouget , Yannick Auclair, Martin Loignon, El Bachir Affar, Elliot Drobetsky. A sensitive flow cytometry-based nucleotide excision repair assay unexpectedly reveals that mitogen-activated protein kinase signalling does not regulate the removal of UV-induced DNA damage in human cells. Journal of Biological Chemistry, 283(9):5533-5541, (2008).
  • Andrew A. Horwitz, El Bachir Affar, George F. Heine, Yang shi, Jeffrey D. Parvin. A novel mechanism for transcriptional repression dependent on the BRCA1 E3 ubiquitin ligase. Proc. Natl. Acad. Sci., 104(16):6614-6619, (2007).
  • Yu May Ma, Emmanuel Boucrot, Judit Villen, El Bachir Affar, Steven P. Gygi, Heinrich G. Gottlinger and Tomas Kirchhausen. Targeting of AMSH to endosomes is required for EGF receptor degradation. Journal of Biological Chemistry, 282(13):9805-9812, (2007).
  • El Bachir Affar, Margaret Po-shan Luke, Frédérique Gay, Dominica Calvo, Guangchao Sui, Robert S. Weiss, En Li, and Yang Shi. Targeted Ablation of Par-4 Reveals a Cell-Type Specific Susceptibility To Apoptosis-Inducing Agents. Cancer Research, 66(7):3456-3462, (2006)
  • El Bachir Affar*, Frédérique Gay*, Yujiang Shi, Huifei Liu, Maite Huarte, Su Wu, Collins Tucker, En Li, and Yang Shi. Essential dosage-dependent functions of the transcription factor Yin Yang 1 in late embryonic development and cell cycle progression. Molecular and Cellular Biology, 26(9):3565-3581, (2006). * Equal Contribution.
  • Sang Ki Park, Minh Dang Nguyen, André Fisher, Margaret Po-Shan Luke, El Bachir Affar, Paul B. Dieffenbach, Huang-Chun Tseng, Yang Shi and Li-Huei Tsai. Par-4 links dopamine signaling and depression. Cell,122(2):275-287, (2005).
  • Guangchao Sui, El Bachir Affar*, Yujiang Shi*, Chrystelle Brignone, Nathan R. Wall, Peng Yin, Mary Donohoe, Dominica Calvo, Margaret P. Luke, Steven R. Grossman, Yang Shi. Yin Yang 1 is a negative regulator of p53. Cell, 117(7): 859-872, (2004). * Equal contribution.
  • Yujiang Shi, Jun-ichi Sawada, Guangchao Sui, El Bachir Affar, Johnathan R. Whetstine, Fei Lan, Hidesato Ogawa, Margaret Po-Shan Luke, Yoshihiro Nakatani and Yang Shi. Coordinated histone modifications mediated by a CtBP co-repressor complex. Nature, 422(6933):735-738, (2003).
  • Guangchao Sui*, Christina Soohoo*, El Bachir Affar*, Frédérique Gay, Yujiang Shi, William Forrester and Yang Shi. A DNA vector-based RNAi technology to suppress gene expression in mammalian cells. Proc. Natl. Acad. Sci., 99:5515-5520, (2002). * Equal Contribution.
  • El Bachir Affar, Rashmi G. Shah, Annie K. Dallaire, Vincent Castonguay and Girish M. Shah. Role of poly(ADP-ribose) polymerase in rapid intracellular acidification induced by alkylating DNA damage. Proc. Natl. Acad. Sci., 99: 245-250, (2002).

Disciplines

  • Biochimie
  • Immunologie
  • Oncologie
  • Biologie moléculaire

Champ d’expertise

  • Signalisation cellulaire et cancer
  • Transport moléculaire
  • Génétique du cancer
  • Gènes