Health Sciences; Medical Sciences
Marlene Oeffinger
Régulation et dynamique des voies de maturation de l'ARN
- Professeure/chercheuse agrégée
-
Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire
Secondary number:
514 987-5668
(Travail 1)
Secondary email:
marlene.oeffinger@ircm.qc.ca
(Travail)
Profile
Research expertise
Nous étudions la régulation et la dynamique des voies de maturation de l’ARN. Notre objectif principal est de déterminer l’ensemble temporelle et spatiale et la coordination des facteurs de maturation de l’ARN, ainsi que d’identifier les mécanismes de contrôle sous-jacents qui conduisent le traitement, la modification et l’assemblage des différents ARN dans la levure bourgeonnante S.cerevisiae et les humains. Nous combinons des approches protéomiques, biochimiques et computationnelles pour construire une image dynamique des voies de maturation de l’ARN dans différents contextes cellulaires et organismes pour obtenir des informations importantes sur la façon dont la maturation des ARN est liée à d’autres processus cellulaires, y compris les voies qui détectent et réparent les dommages à l’ADN, le développement et l’apparition de diverses maladies telles que la maladie d’Alzheimer et la SLA.
Affiliations and responsabilities
Research affiliations
Teaching and supervision
Student supervision
Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)
2021
Deciphering mRNP – nuclear pore interactions : study of basket protein dynamics in budding yeast
Graduate : Bensidoun, Pierre
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2014
Uncovering parallel ribosome biogenesis pathways during pre-60S subunit maturation
Graduate : Aguilar, Lisbeth C.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Projects
Research projects
2020
- 2027
Determining the role of the nuclear basket protein Mlp1/TPR in mRNA homeostasis
Lead researcher :
Daniel Zenklusen
Co-researchers :
Marlene Oeffinger
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2020
- 2026
Determining spatial arrangement, stoichiometry, and substrate specificity of messenger RNA-binding proteins along the gene expression pathway.
Lead researcher :
Marlene Oeffinger
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2020
- 2026
Determining spatial arrangement, stoichiometry, and substrate specificity of messenger RNA-binding proteins along the gene expression pathway.
Lead researcher :
Marlene Oeffinger
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PV118029-(RGPAS) Programme de suppléments d'accélération à la découverte
2022
- 2025
Nuclear Transport Meeting 2022
Lead researcher :
Daniel Zenklusen
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXXXXXX-Subventions pour réunion, planification et dissémination
2017
- 2023
Determining the pathways, components and functional niches that define specialized ribosomes.
Lead researcher :
Marlene Oeffinger
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2015
- 2022
DETERMINING THE MOLECULAR MECHANISMS OF RIBOSOMAL EXPORT THROUGH THE NUCLEAR PORE
Lead researcher :
Marlene Oeffinger
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2020
- 2021
Supplément COVID-19 CRSNG_Determining spatial arrangement, stoichiometry, and substrate specificity of messenger RNA-binding proteins along the gene expression pathway.
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVXXXXXX-Supplément à l’appui des étudiants, des stagiaires postdoctoraux et du personnel de soutien à la recherche COVID-19
2018
- 2020
Disséquer les mécanismes et les composants qui définissent la fonction différentielle des ribosomes dans l’ homéostasie cellulaire
Lead researcher :
Marlene Oeffinger
Funding sources:
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs:
PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Junior 2
2016
- 2019
Host factors involved in polyomavirus genome replication
Lead researcher :
Jacques Archambault
Co-researchers :
Marlene Oeffinger
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
2013
- 2019
HOST FACTORS INVOLVED IN POLYOMAVIRUS GENOME REPLICATION
Lead researcher :
Jacques Archambault
Co-researchers :
Marlene Oeffinger
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2013
- 2018
THE ROLES OF MBNL PROTEINS IN THE PATHOGENESIS OF MYOTONIC DYSTROPHY
Lead researcher :
Pascal Chartrand
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
,
Association canadienne de la dystrophie musculaire (L')
Grant programs:
PVXXXXXX-Subvention de fonctionnement - annonce de priorités
,
2017
Proteomic and transcriptomic profiling of paraspeckle function in healthy and LAS model neuronal cells
Lead researcher :
Marlene Oeffinger
Funding sources:
ALS/Amyotrophic Lateral Sclerosis Association
Grant programs:
2011
- 2017
DISSECTING THE DYNAMICS OF LARGE RIBONUCLEOPROTEIN COMPLEX MATURATION
Lead researcher :
Marlene Oeffinger
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXXXXXX-(MSH) Bourses de nouveaux chercheurs
2010
- 2016
DISSECTING THE DYNAMICS OF LARGE RIBONUCLEOPROTEIN COMPLEX MATURATION
Lead researcher :
Marlene Oeffinger
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2010
- 2016
INTERACTIONS BETWEEN RIBOSOME BIOGENESIS AND REGULATORY NETWORKS OF CELL DIVISION IN EUKARYOTIC CELLS
Lead researcher :
Marlene Oeffinger
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2010
- 2016
Training program in cellular dynamics of macromolecular complexes
Lead researcher :
Christian Baron
Co-researchers :
Jurgen Sygusch
,
Stephen Michnick
,
Antonio Nanci
,
Benoit Coulombe
,
Pascal Chartrand
,
Nicolas Lartillot
,
Marlene Oeffinger
,
James G. Omichinski
,
Daniel Zenklusen
,
Jackalyn Marie Vogel
,
James W Coulton
,
Sachdev Sidhu
,
Franck Duong
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PV118026-FONCER : Prog. formation orientée nouveauté, la collaboration et l'expérience en recherche
2010
- 2016
DISSECTING THE DYNAMICS OF LARGE RIBONUCLEOPROTEIN COMPLEX MATURATION
Lead researcher :
Marlene Oeffinger
2011
- 2015
LA MATURATION DYNAMIQUE DES COMPLEXES DES PROTEINES RIBONUCLEIQUES
Lead researcher :
Marlene Oeffinger
Funding sources:
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs:
PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier clinicien: junior I et II et senior (offre seulement)
2011
- 2014
LA MATURATION DYNAMIQUE DES COMPLEXES DES PROTEINES RIBONUCLEIQUES
Lead researcher :
Marlene Oeffinger
Funding sources:
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs:
PVXXXXXX-Établissement de jeunes chercheurs Juniors 1
2011
- 2014
LA MATURATION DYNAMIQUE DES COMPLEXES DES PROTÉINES RIBONUCLÉIQUES
Lead researcher :
Marlene Oeffinger
2010
- 2014
INTERACTIONS BETWEEN RIBOSOME BIOGENESIS AND REGULATORY NETWORKS OF CELL DIVISION IN EUKARYOTIC CELLS
Lead researcher :
Marlene Oeffinger
Outreach
Publications and presentations
Publications
- Lessard F, Igelmann S, Trahan C, Huot G, Saint-Germain E, Mignacca L, Del Toro N, Lopes-Paciencia S, Le Calvé B, Montero M, Deschênes-Simard X, Bury M, Moiseeva O, Rowell MC, Zorca CE, Zenklusen D, Brakier-Gingras L, Bourdeau V, Oeffinger M and Ferbeyre G. (2018) Ribosome biogenesis defects in senescence reveal a novel checkpoint to control CDK4. Nat Cell Biology June 25.
- Scott DD, Trahan C, Zindy PJ, Aguilar LC, Delubac M, Van Nostrand EL, Adivarahan S, Wei KE, Zenklusen D, Yeo GW and Oeffinger M. (2017) Nol12 is a multifunctional endonuclease at the nexus of RNA and DNA metabolism. Acids Res. EPub Oct 23. doi: 10.1093/nar/gkx963.
- Trahan C and Oeffinger M. (2016) Targeted cross-linking-mass spectrometry determines vicinal interactomes within heterogeneous RNP complexes. Acids Res. Feb; 44(3): 1354-69.
- Burlacu E, Lackmann F, Aguilar LC, Berlikoc S, van Nues R, Trahan C, Hector RD, Whiteley ND, Cockroft SL, Wieslander L, Oeffinger M and Granneman S. (2017) High through-put RNA structure probing reveals critical folding events during early stages of ribosome biogenesis in yeast. Nat Comm. Sep 28;8(1):714.
- Oeffinger M and Montpetit B. (2015) Emerging properties of nuclear RNP biogenesis and export. Curr Opinion Cell Biol. – Special Issue Cell Nucleus June; (34): 46-53.
Disciplines
- Biochemistry
- Medical Biochemistry
- Genomics
- Cell Biology
Areas of expertise
- Biological and Biochemical Mechanisms
- Proteomics
- Functional and Structural Proteomics
- Alzheimer’s Disease
- Multiple Sclerosis