Health Sciences; Natural Sciences and Engineering
James G. Omichinski
- Professeur titulaire
-
Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire
Roger-Gaudry, room D301
Profile
Research expertise
NMR three-dimensional structure determination of DNA-protein complexes; systems involved in regulation of transcription, viral infections (HIV), cancer and development of new therapeutic agents.
Affiliations and responsabilities
Teaching and supervision
Teaching
Courses taught (current session only)
- BCM-2501 – Macromolécules biologiques
- BCM-4001 – Stage honor en biochimie 1
- BCM-4003 – Stage honor en génétique et génomique 1
- BCM-6200 – Structure des macromolécules biologiques
Programs
- 123510 – Baccalauréat en sciences biologiques
- 146511 – Baccalauréat en biochimie et médecine moléculaire
- 146811 – Baccalauréat en bio-informatique
- 146811 – Baccalauréat en bio-informatique
- 148410 – Baccalauréat en sciences biomédicales
- 150010 – Baccalauréat en microbiologie et immunologie
- 246510 – Génétique moléculaire
- 246810 – Maîtrise en bio-informatique
- 351210 – Doctorat en pathologie et biologie cellulaire
Student supervision
Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)
2023
Investigating the role of acetylation of LC3-family proteins in regulating autophagy
Graduate : Ali, Mohamed
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2021
Posttranslational modification and evolution of tetramerization domain in tumor suppressor protein p53
Graduate : Nakagawa, Natsumi
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2020
Études structurales et fonctionnelles sur les mécanismes de régulation des interactions entre protéines SUMOs et les domaines SIMs.
Graduate : Lussier-Price, Mathieu
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2019
Régulation de l’activité de Dicer par TRBP dans la biogénèse des micro-ARN
Graduate : Bouvette, Jonathan
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2018
Caractérisation structurale et biophysique de l’impact de l’acétylation de SUMO1 sur son interaction dépendante de la phosphorylation avec PML
Graduate : Gagnon, Christina
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2018
Détection à grande échelle des réarrangements génomiques et élucidation de leurs mécanismes
Graduate : Tremblay-Belzile, Samuel
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2017
Structural and biochemical characterization of the irganomercurial Lyase MerB
Graduate : Abdelgawwad, Haytham Mohamed Gamaleldin Wahba
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2017
Études structurales d’interactions protéine/protéine impliquées dans la leucopoïèse
Graduate : Idrissa Moussa, Mohamed
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2014
Étude sur la reconnaissance de l'ubiquitine par les domaines de transactivation acides des activateurs de transcription
Graduate : Lussier-Price, Mathieu
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2010
Études structurales d’interactions protéine/protéine impliquées dans l’érythropoïèse
Graduate : Mas, Caroline
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Projects
Research projects
2023
- 2029
Structural and functional characterization of proteinmetal interactions
Lead researcher :
James G. Omichinski
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2022
- 2025
An integrated AI based platform for the identification of broad-spetrum host therapeutic targets fo hemorrahgic fever virus infections
Lead researcher :
Kylene Kehn-Hall
Co-researchers :
James G. Omichinski
Funding sources:
Defense Threat Reduction Agency
Grant programs:
2022
- 2025
Studies of transient complexes that regulate PML nuclear bodies
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2017
- 2024
Structural and functional characterization of proteinmetal interactions
Lead researcher :
James G. Omichinski
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2015
- 2023
Structural and functional studies of macromolecular interactions regulating hematopoietic development
Lead researcher :
James G. Omichinski
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2020
- 2021
Supplément COVID-19 CRSNG_Structural and functional characterization of proteinmetal interactions
Lead researcher :
James G. Omichinski
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVXXXXXX-Supplément à l’appui des étudiants, des stagiaires postdoctoraux et du personnel de soutien à la recherche COVID-19
2018
- 2021
Macromolecular interaction analysis using a surface plasmon resonance biosensor
Lead researcher :
John Pascal
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (de 7 001 $ à 150 000 $)
2013
- 2021
STRUCTURAL AND FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF DYNAMIC COMPLEXES INVOLVED IN TRANSCRIPTION DNA REPAIR AND VIRAL INFECTION AND THEIR ASSOCIATION TO CANCER FORMATION
Lead researcher :
James G. Omichinski
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2018
- 2019
Groupe d"etude des proteines membranaires (GEPROM)
Lead researcher :
Derek Bowie
Co-researchers :
James G. Omichinski
Funding sources:
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs:
PVXXXXXX-Subvention de groupe de recherche
2017
- 2019
A versatile broad range microscale thermophoresis apparatus for the measurement of biomolecular interactions
Lead researcher :
Rafaël Najmanovich
Co-researchers :
Rémy Sauvé
,
Christian Baron
,
Rikard Blunck
,
James G. Omichinski
,
Adrian Serohijos
,
John Pascal
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (de 7 001 $ à 150 000 $)
2012
- 2018
STRUCTURAL AND FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF PROTEIN-METAL INTERACTIONS
Lead researcher :
James G. Omichinski
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2015
- 2017
ROBOT FOR LIPIDIC CUBIC PHASE (LCP) CRYSTALLIZATION OF MEMBRANE PROTEINS
Lead researcher :
Christian Baron
Co-researchers :
Jurgen Sygusch
,
Michel Bouvier
,
Lucie Parent
,
Rikard Blunck
,
James G. Omichinski
,
Kalle Burges Gehring
,
Peter Pawelek
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (de 7 001 $ à 150 000 $)
2015
- 2017
Groupe de recherche axé sur la recherche des protéines (GRASP)
Lead researcher :
Kalle Burges Gehring
Co-researchers :
James G. Omichinski
Funding sources:
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs:
PVXXXXXX-Subvention de groupe de recherche
2010
- 2016
Training program in cellular dynamics of macromolecular complexes
Lead researcher :
Christian Baron
Co-researchers :
Jurgen Sygusch
,
Stephen Michnick
,
Antonio Nanci
,
Benoit Coulombe
,
Pascal Chartrand
,
Nicolas Lartillot
,
Marlene Oeffinger
,
James G. Omichinski
,
Daniel Zenklusen
,
Jackalyn Marie Vogel
,
James W Coulton
,
Sachdev Sidhu
,
Franck Duong
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PV118026-FONCER : Prog. formation orientée nouveauté, la collaboration et l'expérience en recherche
2005
- 2016
STRUCTURAL AND FUNCTIONAL STUDIES OF PROTEIN/PROTEIN AND PROTEIN/DNA INTERACTIONS REGULATING HEMATOPOIETIC DEVELOPMENT
Lead researcher :
James G. Omichinski
Funding sources:
IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs:
PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2011
- 2015
STRUCTURE AND MECHANISTIC STUDIES OF THE BACTERIAL ORGANOMERCURIAL LYASE MERB
Lead researcher :
James G. Omichinski
2002
- 2015
GROUPE DETUDE DES PROTEINES MEMBRANAIRES (GEPROM)
Lead researcher :
Rikard Blunck
Co-researchers :
Jean-Yves Lapointe
,
Réjean Couture
,
Daniel Bichet
,
Rémy Sauvé
,
Normand Mousseau
,
Lucie Parent
,
Jean-Louis Schwartz
,
Madhu Anand-Srivastava
,
Audrey Claing
,
Michael Mourez
,
Christian Baron
,
James G. Omichinski
,
Guillaume Lamoureux
,
Paul William Wiseman
,
James W Coulton
,
John Orlowski
,
John R Silvius
,
Alvin Shrier
,
John W Hanrahan
,
Isabelle Rouiller
,
Brett Christopher
Funding sources:
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs:
PVXXXXXX-Subvention de groupe de recherche
2012
- 2014
LOW-VOLUME ITC FOR INVESTIGATING BIOMOLECULAR INTERACTIONS
Lead researcher :
James G. Omichinski
Co-researchers :
Jurgen Sygusch
,
Stephen Michnick
,
Normand Brisson
,
Pascale Legault
,
Christian Baron
,
Rikard Blunck
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (OIR) -1 -(de 7 001 $ à 150 000 $)
2011
- 2014
GROUPE D'ETUDE DES PROTEINES MEMBRANAIRES (GEPROM)
Lead researcher :
Lucie Parent
Co-researchers :
Jean-Yves Lapointe
,
Réjean Couture
,
Daniel Bichet
,
Rémy Sauvé
,
Normand Mousseau
,
Jean-Louis Schwartz
,
Madhu Anand-Srivastava
,
Audrey Claing
,
Michael Mourez
,
Christian Baron
,
Rikard Blunck
,
James G. Omichinski
,
Guillaume Lamoureux
,
Paul William Wiseman
,
James W Coulton
,
John Orlowski
,
John R Silvius
,
Alvin Shrier
,
John W Hanrahan
,
Isabelle Rouiller
,
Brett Christopher
Funding sources:
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs:
PVXXXXXX-Subvention de groupe de recherche
2009
- 2014
STRUCTURAL AND FUNCTIONAL STUDIES OF PROTEIN/PROTEIN AND PROTEIN/DNA INTERACTIONS REGULATING HEMATOPOIETIC DEVELOPMENT
Lead researcher :
James G. Omichinski
2008
- 2014
ROLE OF THE INTERACTIONS OF TFIIH WITH ACTIVATOR PROTEINS IN REGULATING TRANSCRIPTION
Lead researcher :
James G. Omichinski
Funding sources:
IRSCC/Institut de recherche de la Société canadienne du cancer
Grant programs:
2005
- 2014
STRUCTURE AND MECHANISTIC STUDIES OF THE BACTERIAL ORGANOMERCURIAL LYASE MERB
Lead researcher :
James G. Omichinski
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2009
INVESTIGATIONS OF BIOMOLECULES BY FLUORESCENCE SPECTROSCOPY
Lead researcher :
James G. Omichinski
Outreach
Publications and presentations
Disciplines
- Biochemistry
- Virology
- Molecular Biology
- Chemistry
- Toxicology
Areas of expertise
- COVID-19
- Macromolecules
- Viral Infections
- Gene Therapy
- Antibiotics and Resistance
- Carcinogenesis
- Mining and Petroleum Contamination
- Proteins
- Virus
- Metals and Nonmetals
- Microorganisms
- Stress and Cancer