Directeur du Département de psychiatrie de 1972 à 1980, puis doyen de la Faculté de médecine de 1981 à 1989 à l'UdeM, Yvon Gauthier est également cofondateur de l'Académie canadienne de psychiatrie de l'enfant et de l'adolescent. En 1994, il a fondé avec deux collègues, les Drs Gloria Jéliu et Gilles Fortin, la Clinique d'attachement du Centre hospitalier universitaire mère-enfant Sainte-Justine, au sein de laquelle il a travaillé pendant près de 15 ans. Il est maintenant professeur mérite au Département de psychiatrie et d’addictologie de l'Université de Montréal.