Natural Sciences and Engineering; Arts and Literature
François-Joseph Lapointe
Des mécanismes de l’évolution biologique (et de leur application au bioart)
- Professeur titulaire
-
Faculté des arts et des sciences - Département de sciences biologiques
Complexe des sciences, room B-6428
Secondary number:
514 343-2293
(Télécopieur)
Secondary email:
lapoinf@biol.umontreal.ca
(Travail)
Profile
Research expertise
Analyse phylogénétique, biostatistique, bioinformatique, phylogénomique, métagénomique, choréogénétique, microbiome humain, génétique des populations, réseaux complexes, théorie de l’évolution, espèces menacées, mammalogie, herpétologie, biologie de la conservation, bioart, art génétique, performance, art corporel, interdisciplinarité art/science, recherche-création
Biography
François-Joseph Lapointe dirige le Laboratoire d’écologie moléculaire et d’évolution à l’Université de Montréal. Il est professeur titulaire au Département de sciences biologiques. Dans le cadre de ses recherches scientifiques, il s’intéresse à la phylogénétique, à la systématique, à la métagénomique ainsi qu’à la génétique des populations.
Auteur d’une centaine de publications en biologie de l’évolution, il a également développé plusieurs tests statistiques et algorithmes en bioinformatique. François-Joseph Lapointe a complété en 2012 un doctorat en études et pratiques des arts à l’Université du Québec à Montréal sous la supervision de Martine Époque. Dans le cadre de sa thèse intitulée « la choréogénétique, ou l’art de faire danser l’ADN » il a produit un algorithme génétique pour générer des chorégraphies in silico et il a créé Polymorphosum urbanum, une chorégraphie composée in vitro à partir des séquences génétiques de 30 danseurs. Pour sa pratique artistique, il s’inspire des modèles de la biologie moléculaire, de la génétique et de la génomique
Son plus récent projet en bioart consiste à séquencer son microbiome afin de générer des égoportraits métagénomiques. Il a reçu en 1990 la Médaille d’or académique du Gouverneur general, et en 1996 le Prize for Outstanding Research de l’International Federation of Classification Societies. Ses recherches sont notamment financées par le CRSNG, le CRSH, le FRQSC, le FRQNT et le Conseil des arts du Danemark.
education
- 1988 — B.Sc. — Biologie et autres sciences connexes — Université de Montréal
- 2012 — Ph.D. en Études et pratiques des arts — Arts visuels et médiatiques, Biologie et autres sciences connexes, Génétique — Université du Québec à Montréal
- 1992 — Ph.D. — Biologie et autres sciences connexes — Université de Montréal
Affiliations and responsabilities
Research affiliations
Teaching and supervision
Teaching
Courses taught (current session only)
Programs
- 105010 – Baccalauréat en anthropologie
- 105020 – Majeure en anthropologie
- 123510 – Baccalauréat en sciences biologiques
- 123520 – Majeure en sciences biologiques
- 123540 – Mineure en sciences biologiques
- 146511 – Baccalauréat en biochimie et médecine moléculaire
- 146811 – Baccalauréat en bio-informatique
- 146811 – Baccalauréat en bio-informatique
- 150010 – Baccalauréat en microbiologie et immunologie
- 183412 – Baccalauréat en enseignement des mathématiques au secondaire
- 196710 – Programme d'accueil en sciences
- 202311 – DESS en environnement et développement durable
- 202312 – Maîtrise en environnement et développement durable (avec stage)
Student supervision
Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)
2024
Utilisations du microbiome en sciences judiciaires
Graduate : Leblanc, Audrey-Anne
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2021
Microbiome cutané et maladie fongique émergente du syndrome du museau blanc chez les chauves-souris d’Amérique du Nord
Graduate : Lemieux-Labonté, Virginie
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2021
La génétique au service de la conservation de la tortue des bois (Glyptemys insculpta)
Graduate : Bouchard, Cindy
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2017
Dynamique saisonnière du microbiome intestinal en réponse à la diète traditionnelle inuite
Graduate : Dubois, Geneviève
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2017
Une invasion dans la discrétion : répartition, origines et expansion des limaces européennes du complexe d'Arion subfuscus s.l. au Québec
Graduate : L'Heureux, Érik
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2015
Problème du paradigme dans l'approche écologique de l'individualité chez Turner : une solution méréologique inspirée de Dupré et O'Malley
Graduate : Hutter, Thiago
Cycle : Master's
Grade : M.A.
Cycle : Master's
Grade : M.A.
2014
Phylogéographie comparée de la souris à pattes blanches et de la souris sylvestre, deux vecteurs de la maladie de Lyme au Québec
Graduate : Fiset, Jessica
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2010
Impact des polluants agricoles sur la génétique des populations d’une espèce sentinelle : le ouaouaron (Rana catesbeiana)
Graduate : Lefebvre, Isabelle
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2009
Chimères, données manquantes et congruence : validation de différentes méthodes par simulations et application à la phylogénie des mammifères
Graduate : Campbell, Véronique
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2009
Structure génétique de populations montréalaises de salamandres cendrées (Plethodon cinereus) et de salamandres à points bleus (Ambystoma laterale)
Graduate : Noël-Boissonneault, Sarah
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2008
La génétique au service de la conservation d'une espèce menacée endémique à Madagascar : la tortue radiée Astrochelys radiata
Graduate : Rioux Paquette, Sébastien
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2007
Confirmation génétique de la présence de couguars (Puma concolor) dans l'est du Canada
Graduate : Lang, Le Duing
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2006
Caractérisation de l'habitat d'une communauté de salamandres de ruisseaux comportant des hybrides
Graduate : Boutin, Anaïs
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2006
Fidélité au site comme mécanisme d'isolement reproducteur entre les membres sexués et asexués et entre les populations sympatriques du complexe Phoxinus eos-neogaeus
Graduate : Massicotte, Rachel
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2006
Utilisation de réseaux en analyse phylogénétique : détection de taxons hybrides et combinaison d'arbres
Graduate : Gauthier, Olivier
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2005
De la pertinence de la congruence globale en analyse phylogénétique
Graduate : Levasseur, Claudine
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2004
Coévolution des populations québécoises de cutérèbres (Cuterebra grisea et Cuterebra fontinella) et de souris du genre Peromyscus : la souris sylvestre (P. maniculatus) et la souris à pattes blanches (P. leucopus)
Graduate : Noël-Boissonneault, Sarah
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2002
Étude de la phylogénie et la biogéographie du genre Hoya (Asclepiadaceae) basée sur l'analyse de séquences d'ITS
Graduate : Lemay, Anne-Marie
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2001
Effets de la configuration du paysage sur la variabilité génétique de populations de souris sylvestres (Peromyscus maniculatus: Rodentia, Muridae)
Graduate : Landry, Pierre-Alexandre
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2001
Phylogénie des wallabies des rochers, Petrogale (Marsupialia : Macropodidae), par hybridation ADN/ADN
Graduate : Campeau-Péloquin, Antoine
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
1999
Détermination de l'origine des populations québécoises d'Echinochloa crus-galli (L.) Beauv. à l'aide de marqueurs RAPD et de séquences d'ADN
Graduate : Roy, Sophie
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Projects
Research projects
2023
- 2027
Gisants, transis, charogne et putréfaction : l’art du cadavre en milieu naturel
Lead researcher :
François-Joseph Lapointe
Funding sources:
FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Grant programs:
PVXXXXXX-(RC) Appui à la recherche-création - Volet Individuel
2021
- 2027
Statistical analysis of microbiome longitudinal data with multiplex networks
Lead researcher :
François-Joseph Lapointe
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2020
- 2026
Les cybryontes et l'anthropocène: Des conditions de possibilité de nouvelles symbioses
Funding sources:
CRSH/Conseil de recherches en sciences humaines du Canada
Grant programs:
PVXXXXXX-Subvention Savoir
2021
- 2025
Vers la quatrième nature: études pour un jardin semi-vivant
Lead researcher :
Thierry Bardini
Co-researchers :
François-Joseph Lapointe
Funding sources:
FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Grant programs:
PVXXXXXX-(RC) Appui à la recherche-création - Volet Équipe
2020
- 2025
Regard interdisciplinaire, intersectoriel et intersectionnel sur les violences faites aux femmes et aux filles
Lead researcher :
Marie-Marthe Cousineau
Co-researchers :
François-Joseph Lapointe
,
Bilkis Vissandjée
,
Dominique Damant
,
Carolina Bottari
,
Vardit Ravitsky
,
Catherine Richardson
,
Estibaliz Jimenez
,
Mylène Fernet
,
Rachel Chagnon
,
Isabelle Marchand
,
Sylvie Lévesque
,
Sylvie Genest
,
Catherine Flynn
,
Jeanne-Marie Rugira
,
ROXANNE GUYON
Funding sources:
FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Grant programs:
PVXXXXXX-(SE) Programme Soutien aux équipes de recherche - Stade de développement : Nouvelle équipe
2019
- 2024
Chaire McConnell - Université de Montréal en recherche-création
Lead researcher :
François-Joseph Lapointe
Funding sources:
CRSH/Conseil de recherches en sciences humaines du Canada
Grant programs:
PVXXXXXX-FGR – Subvention de recherche institutionnelle
2019
- 2023
La maternité comme dispositif : enjeux philosophiques et artistiques
Lead researcher :
François-Joseph Lapointe
Funding sources:
FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Grant programs:
PVXXXXXX-(RC) Appui à la recherche-création - Volet Individuel
2021
- 2022
Ordinaire de nature
Lead researcher :
Antoine C Dussault
Co-researchers :
François-Joseph Lapointe
Funding sources:
Pôle lavallois d'enseignement supérieur en arts numériques et économie créative
Grant programs:
2020
- 2022
La grossesse en confinement
Lead researcher :
François-Joseph Lapointe
Funding sources:
FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs:
PVXXXXXX-Projets spéciaux - Conférences - Congrès - Colloques
2018
- 2022
Quand les bactéries font la loi - enjeux scientifiques, philosophiques, éthiques, politiques et légaux de l'utilisation du microbiome à des fins d'identification judiciaire
Lead researcher :
François-Joseph Lapointe
Funding sources:
FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Grant programs:
PVXXXXXX-AUDACE (financement partagé entre les fonds de recherche du Québec)
2015
- 2022
A STATISTICAL FRAMEWORK FOR THE EVALUATION AND COMPARISON OF COMPLEX NETWORKS AND ITS APPLICATION TO MICROBIOME RESEARCH
Lead researcher :
François-Joseph Lapointe
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2016
- 2020
La conduite responsable en recherche-création : Outiller de façon créative pour répondre aux enjeux d’une pratique en effervescence
Lead researcher :
Bryn Williams-Jones
Funding sources:
FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Grant programs:
PVXXXXXX-(AC) Actions concertées - générique
Description
Research-creation (RC) is an emerging field at the interface between academic research and creative activities and is defined by the Fonds de recherche du Québec (FRQ) as “research activities or approaches favouring the creation, interpretation of literary or artistic works of any kind.” Researchers in this heterogeneous field must therefore satisfy requirements of dual expertise which may sometimes conflict. As a result, researcher-creators may face very different challenges from colleagues in the rest of the academic world. So far, little is known about the nature of the issues encountered by these researchers in relation to the responsible research conduct (RCR, or scientific integrity), what differences there may be, or how the Canadian RC community responds to institutional policies or provincial / national guidelines.
The results of this international study – supported by a Concerted Action grant from the FRQ – will allow us to identify the RCR issues and challenges of RC, the perceptions of RC researchers on the application of RCR principles, and the needs for and gaps in existing policies (institutional and national) to promote RCR education and awareness. The project will culminate in the 2018 launch of a series of on-line open access tools for both the RC community and supporting actors, such as university RCR directorates, research ethics boards, and granting agencies.
2014
- 2020
CENTRE DE LA SCIENCE DE LA BIODIVERSITE DU QUEBEC (CSBQ)
Lead researcher :
François-Joseph Lapointe
Co-researchers :
Andrew Gonzalez
Funding sources:
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs:
PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques
2017
- 2019
Workshop on the responsible conduct in research-creation: involving the research community to develop practical training tools
Lead researcher :
Bryn Williams-Jones
Funding sources:
CRSH/Conseil de recherches en sciences humaines du Canada
Grant programs:
PV152160-Subvention Connexion
2015
- 2019
De la transformation du microbiome humain comme pratique expérimentale du bioart
Lead researcher :
François-Joseph Lapointe
Funding sources:
FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Grant programs:
PVXXXXXX-(RC) Appui à la recherche-création - Volet Individuel
2017
- 2018
Organisation d'un atelier en novembre 2017 sur la conduite responsable dans la recherche-création
Lead researcher :
Bryn Williams-Jones
Co-researchers :
François-Joseph Lapointe
Funding sources:
FRQSC/Fonds de recherche du Québec - Société et culture (FQRSC)
Grant programs:
PVXXXXXX-Subvention générale et projets spéciaux (non partageable au prorata)
2015
- 2017
Réseaux phylogénétiques et leurs applications pratiques en évolution, biogéographie et sciences biomédicales
Lead researcher :
Vladimir Makarenkov
Co-researchers :
François-Joseph Lapointe
Funding sources:
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs:
PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2014
- 2016
STATISTICAL ASSESSMENT OF COMPLEX AND LARGE NETWORKS DERIVED FROM (META)GENOMIIC DATA
Lead researcher :
François-Joseph Lapointe
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2013
- 2016
Réseaux phylogénétiques et leurs applications pratiques en évolution, biogéographie et sciences biomédicales
Lead researcher :
Vladimir Makarenkov
Funding sources:
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs:
PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2013
- 2016
LA FIGURE DE L'AUTOPORTRAIT METAGENOMIQUE EN MOUVEMENT
Lead researcher :
François-Joseph Lapointe
Funding sources:
CRSH/Conseil de recherches en sciences humaines du Canada
Grant programs:
PV153480-Subventions de développement Savoir
2013
- 2015
AUTOPORTRAIT D'UN METAGENOME
Lead researcher :
François-Joseph Lapointe
Funding sources:
CRSH/Conseil de recherches en sciences humaines du Canada
Grant programs:
PVX20020-Subvention institutionnelle du CRSH - Petites subventions
1994
- 2015
SEEING THE (SUPER)TREES THROUGH THE PHYLOGENOMIC FOREST
Lead researcher :
François-Joseph Lapointe
Funding sources:
CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs:
PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2011
- 2014
INTERACTIONS ENTRE LES ESPECES DE PETIS MAMMIFERES, LES PARASITES ET LA STRUCTURE DU PAYSAGE, ET CONSEQUENCES SUR L'EMERGENCE DE LA MALADIE DE LYME AU QUEBEC
Lead researcher :
Virginie Millien
Funding sources:
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs:
PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2010
- 2014
CENTRE DE LA SCIENCE DE LA BIODIVERSITE DU QUEBEC
Lead researcher :
François-Joseph Lapointe
Co-researchers :
Andrew Gonzalez
Funding sources:
FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs:
PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques
2009
- 2013
Seeing the (Super) trees throught the phylogenomic forest
Lead researcher :
François-Joseph Lapointe
Outreach
Publications and presentations
Disciplines
- Biology and Related Sciences
- Media and Visual Arts
Areas of expertise
- Multivariate statistical analysis
- Biodiversity
- Bioinformatics
- Biostatistics
- Choreogenetics
- Conservation
- Genetic diversity
- Molecular ecology
- Evolution
- Reticulate evolution
- Population genetics
- Herpetology
- Hybridization
- Hybrids
- Mammalogy
- Phylogenetics
- Phylogenomics
- Phylogeography
- Molecular systematics
- Horizontal transfer
- Research-creation