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Medical Sciences; Life Sciences; Health Sciences

John Pascal

Professeur titulaire

Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire

Roger-Gaudry, room D347

514 343-6111 #4890

john.pascal@umontreal.ca

Secondary number: 514 343-2110 (Télécopieur)

Profile

Research expertise

Notre groupe de recherche étudie la structure et la fonction des protéines afin de comprendre les détails moléculaires des macromolécules impliquées dans les processus cellulaires fondamentaux. Une meilleure connaissance de la fonction des protéines nous permet de mieux comprendre comment des déficiences au niveau de certaines protéines peuvent conduire à des maladies chez l’humain et d’identifier de nouvelles façons de réguler l’activité de ces protéines afin de traiter ces maladies. Un des objectifs principaux de notre recherche est de déterminer la structure tridimensionnelle des protéines afin de comprendre comment leur architecture est liée à leur fonction cellulaire. Nous utilisons la cristallographie aux rayons x comme outil principal pour la détermination de la structure des protéines et des complexes protéines-ADN. Nous utilisons aussi un nombre variés d’outils biophysiques, biochimiques et d’essais cellulaires afin d’obtenir une meilleure compréhension de la fonction cellulaire des protéines d’intérêts.

Thèmes

  • Biologie structurale de la cellule
  • Cristallographie aux rayons x des macromolécules
  • Mécanismes de réparation et réplication de l’ADN
  • Fonction et régulation des Poly(ADP-ribose) polymérases (PARPs)

Biography

John Pascal a obtenu son doctorat en biochimie de l'Université du Texas. Suite à une formation postdoctorale à l'Université Harvard, il a été recruté comme professeur à l'Université Thomas Jefferson à Philadelphie au département de biochimie. Il s’est joint au Département de biochimie et médecine moléculaire de la Faculté de médecine de l'Université de Montréal, en juin 2015 à titre de professeur agrégé. M. Pascal étudie la structure et la fonction de complexes macromoléculaires cellulaires. En particulier, il s'intéresse aux mécanismes de réparation de l'ADN et plus particulièrement à la famille des Poly(ADP-ribose) polymérases (PARPs).

Affiliations and responsabilities

Projects

Research projects

2023 - 2027

Un editosome d'ARN inédit chez des micro-eucaryotes marins très abondants et divers

Lead researcher : Gertraud Burger
Co-researchers : John Pascal , Reza Salavati
Funding sources: FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs: PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2020 - 2027

Structural biology and biochemistry of PARP enzyme regulation in the DNA damage response and in cancer therapy

Lead researcher : John Pascal
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2021 - 2026

Structural cell biology of DNA repair machines

Lead researcher : John Tainer
Co-researchers : John Pascal
Funding sources: NIH/National Institutes of Health (NIH)
Grant programs: PVXXXXXX-Subvention de recherche
2022 - 2025

Tuning Parp-1 retention and release on DNA breaks

Lead researcher : Ben E. Black
Co-researchers : John Pascal
Funding sources: NIH/National Institutes of Health (NIH)
Grant programs:
2017 - 2025

Structural Biology of Tankyrase Activity and Regulation in Cell Signaling

Lead researcher : John Pascal
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2022 - 2024

Structural and functional characterization of type IV secretion system pili

Lead researcher : John Pascal
Co-researchers : Khanh Huy Bui
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2015 - 2023

Structural biology of DNA damage-dependent PARPs

Lead researcher : John Pascal
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2019 - 2022

Photon III X-ray detector for metal jet diffractometer

Lead researcher : Frank Schaper
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (de 7 001 $ à 150 000 $)
2017 - 2022

Biologie structurale et biochimie des complexes macromoléculaires

Lead researcher : John Pascal
Funding sources: FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'exploitation des infrastructures (FEI)
2015 - 2022

Structural Biochemistry of Coordinated DNA Damage Repair Pathways

Lead researcher : John Pascal
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2018 - 2021

Macromolecular interaction analysis using a surface plasmon resonance biosensor

Lead researcher : John Pascal
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (de 7 001 $ à 150 000 $)
2016 - 2021

Sructural cell biology of DNA repair machines : Project 4 : PARP-dépendent break repair

Lead researcher : John Tainer
Co-researchers : John Pascal
Funding sources: NIH/National Institutes of Health (NIH)
Grant programs: PVXXXXXX-Subvention de recherche
2017 - 2019

A versatile broad range microscale thermophoresis apparatus for the measurement of biomolecular interactions

Lead researcher : Rafaël Najmanovich
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (de 7 001 $ à 150 000 $)
2016 - 2018

Biologie structurale des protéines impliquées dans la réparation de l' ADN

Lead researcher : John Pascal
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Senior
2015 - 2016

Biologie structurale et biochimie des complexes macromoléculaires

Lead researcher : John Pascal
Co-researchers : Christian Baron
Funding sources: FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds des leaders

Outreach

Publications and presentations

Publications

  • Riccio AA, Cingolani G, Pascal JM. (2016) PARP-2 domain requirements for DNA damage-dependent activation and localization to sites of DN damage. Nucleic Acids Research 44, 1691-702.
  • Dawicki-McKenna JM, Langelier MF, DeNizio JE, Riccio AA, Cao CD, Karch KR, McCauley M, Steffen JD, Black BE, Pascal JM. (2015) PARP-1 activation requires local unfolding of an autoinhibitory domain. Molecular Cell 60, 755-68.
  • Eustermann S, Wu WF, Langelier MF, Yang JC, Easton LE, Riccio AA, Pascal JM, Neuhaus D. (2015) Structural basis of detection and signaling of DNA single-strand breaks by human PARP-1. Molecular Cell 60, 742-54.
  • Langelier MF, Riccio AA, Pascal JM. (2014) PARP-2 and PARP-3 are selectively activated by 5’ phosphorylated DNA breaks through an allosteric regulatory mechanism shared with PARP-1. Nucleic Acids Research 42, 7762-75.
  • Steffen JD, Tholey RM, Langelier MF, Planck JL, Schiewer MJ, Lal S, Bildzukewicz NA, Yeo CJ, Knudsen KE, Brody JR, Pascal JM. (2014) Targeting PARP-1 allosteric regulation offers therapeutic potential against cancer. Cancer Research 74, 31-7.
  • Langelier MF, Pascal JM. (2013) PARP-1 mechanism for coupling DNA damage detection to poly(ADP-ribose) synthesis. Current Opinion in Structural Biology 23, 134-43.
  • Langelier MF, Planck JL, Roy S, Pascal JM (2012) Structural basis for DNA-dependent poly(ADP-ribosyl)ation by human PARP-1. Science 336, 728-32.
  • Zhang M, Pascal JM, Schumann M, Armen RS, Zhang J-f (2012) Identification of the functional binding pocket for compounds targeting small-conductance Ca2+-activated potassium channels. Nature Communications 3, 1021.
  • Langelier M-F, Planck JL, Roy S, Pascal JM (2011) Crystal structures of poly(ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1) zinc fingers bound to DNA: structural and functional insights into DNA-dependent PARP-1 activity. Journal of Biological Chemistry 286, 10690-701.
  • Langelier M-F, Ruhl DD, Planck JL, Kraus WL, Pascal JM (2010) The Zn3 domain of human poly(ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1) functions in both DNA-dependent poly(ADP-ribose) synthesis activity and chromatin compaction. Journal of Biological Chemistry 285, 18877-87.
  • Langelier M-F, Servent KM, Rogers EE, Pascal JM (2008) A third zinc binding domain in Poly(ADPribose) polymerase 1 coordinates DNA-dependent enzyme activation. Journal of Biological Chemistry 283, 4105-14.

Disciplines

  • Biochemistry
  • Medical Biochemistry
  • Molecular Biology
  • Molecular Medicine

Areas of expertise

  • Cell
  • Biological Behavior
  • X-Rays
  • Macromolecules
  • Biological and Biochemical Mechanisms
  • Proteins
  • Chromosomes: Structure / Organization