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Medical Sciences; Health Sciences

Yoshiaki Tanaka

Professeur sous octroi adjoint

Faculté de médecine - Département de médecine

yoshiaki.tanaka@umontreal.ca

Secondary number: 514 252-3400 #7052 (Laboratoire)

Profile

Research expertise

Son équipe étudie les mécanismes cellulaires et moléculaires à l’œuvre dans l’envahissement tumoral ainsi que la croissance et la pharmacorésistance des tumeurs, le tout au moyen de modèles tridimensionnels de culture de cellules humaines in vitro et d’analyses in silico à grande échelle de données génomiques issues du séquençage de l’ARN unicellulaire (single-cell RNA-seq), de la cartographie des sites d’accessibilité de la chromatine (ATAC-seq), du séquençage ChIP (ChIP-seq) et de la cartographie des contacts chromosomiques (Hi-C). Ce laboratoire vise à élucider les phénomènes moléculaires qui régulent la progression des tumeurs et le processus de métastase, et à orienter le développement de nouveaux traitements.

Biography

Dr Yoshiaki Tanaka a obtenu son diplôme de premier cycle (2006) en sciences pharmaceutiques à l’Université des Sciences de Tokyo au Japon. Pendant sa formation doctorale (2006-2011), il a étudié des méthodologies bioinformatiques d'analyse de données pures en utilisant des données à grande échelle telle que l’ARN-seq et la ChIP-seq pour la modélisation de l’association entre la régulation transcriptionnelle et la régulation épigénétique dans des cellules eucaryotiques sous la supervision du Dr Kenta Nakai de l'Université de Tokyo au Japon. Il a aussi appliqué l’apprentissage-machine aux données de séquençage à haut débit pour étudier la régulation de la conformation de la chromatine. Pour ses études postdoctorales, Dr Tanaka a participé au laboratoire du Dr In-Hyun Park de l'Université de Yale aux États-Unis (2011-2020) pour chercher la formation complémentaire dans la biologie cellulaire et moléculaire dans le but de comprendre la pluripotence des cellules souches et le développement de tissu. Récemment, il a développé des modèles in-vitro du cerveau humain en 3D et a élucidé certains mécanismes du développement du cerveau et des maladies neuronales.  La vision de recherche de Dr Tanaka au Centre de Recherche de l’Hôpital Maisonneuve-Rosemont à l’Université de Montréal est d’explorer des problèmes complexes des tumeurs du cerveau et d’autres maladies du cerveau en utilisant des modèles in-vitro et in-silico. 

Affiliations and responsabilities

Research affiliations

Research units

Membre

Affiliated institutions

  • CIUSSS de l'Est-de-l'Île-de-Montréal – Hôpital Maisonneuve-Rosemont (HMR)

Teaching and supervision

Projects

Research projects

2022 - 2028

BRD4-mediated regulation of human brain development and function

Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-(DGECR) Tremplin vers la découverte
2022 - 2028

BRD4-mediated regulation of human brain development and function

Lead researcher : Yoshiaki Tanaka
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2023 - 2025

Investigating Intercommunications of Glioblastoma with Brain Microenvironment using 3D Organoid

Lead researcher : Yoshiaki Tanaka
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXX5647-(MOP) Subvention de fonctionnement incluant les subventions de fonctionnement programmatiques (général)
2023 - 2025

Investigating Intercommunications of Glioblastoma with Brain Microenvironment using 3D Organoid

Lead researcher : Yoshiaki Tanaka
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2022 - 2025

Investigating Roles of Primate-Specific Retrotransposon-Derived Transcripts in Glioblastoma

Lead researcher : Yoshiaki Tanaka
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-Partenariat avec la Société de recherche sur le cancer
2022 - 2024

Investigating Roles of Primate-Specific Retrotransposon-Derived Transcripts in Glioblastoma

Lead researcher : Yoshiaki Tanaka
Funding sources: SRC/Société de recherche sur le cancer
Grant programs: PVX12154-Subvention de fonctionnement
2021 - 2024

therapeutic potential of the CCNE1 variant in pediatric leukemia.

Lead researcher : Yoshiaki Tanaka
Funding sources: COLE Foundation/Fondation Cole
Grant programs:
2020 - 2024

Étude de la transition du sous-type de tumeur cérébrale à l'aide de l'intelligence artificielle

Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Junior 1
2020 - 2024

Étude de la transition du sous-type de tumeur cérébrale à l'aide de l'intelligence artificielle

Lead researcher : Yoshiaki Tanaka
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Établissement de jeunes chercheurs Juniors 1
2020 - 2024

Versement additionnel COVID-19 pour un étudiant Étude de la transition du sous-type de tumeur cérébrale à l'aide de l'intelligence artificielle

Lead researcher : Yoshiaki Tanaka
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Crédits de relance économique – Soutien chercheurs et chercheuses

Outreach

Publications and presentations

Disciplines

  • Genomics
  • Bioinformatics

Areas of expertise

  • Antibiotics and Resistance
  • Host-Tumour Interaction
  • Cell
  • Molecular Genetics
  • Model Building
  • Genomics
  • Bioinformatics