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Health Sciences

El Bachir Affar

Signalisation cellulaire via l'ubiquitination

Professeur sous octroi agrégé

Faculté de médecine - Département de médecine

el.bachir.affar@umontreal.ca

Professeur accrédité

Faculté de médecine - Département de biochimie et médecine moléculaire

el.bachir.affar@umontreal.ca

Secondary numbers: 514 252-3400 #3343 (Travail 1) 514 252-3430 (Télécopieur) 514 252-3400 #4683 (Travail 2)
Secondary email: aelbachir.hmr@ssss.gouv.qc.ca (Travail)

Profile

Research expertise

Ubiquitination of proteins is a post-translational modification required for a wide spectrum of biological functions, and defects in several processes involving ubiquitination underlie human diseases. The best characterized ubiquitination reaction involves the formation of polyubiquitin chains, leading to the degradation of target proteins by the proteasome. However, ubiquitination is a complex modification that also mediates cellular functions other than protein degradation. Protein modification by ubiquitin is a reversible reaction and specific proteases can remove the ubiquitin moiety. A vast repertoire of deubiquitinases (DUBs), including approximately 80 genes, are encoded by the human genome, and are emerging as important regulators of the ubiquitination-mediated processes. As the DUBs are largely unknown, establishing the biological functions and the molecular mechanisms of these proteases is not only a crucial step toward understanding ubiquitin-mediated signaling, but is also a fundamental aspect of cancer biology. We use functional genomics and proteomics approaches to determine the functions and mechanisms of action of DUB enzymes. Our investigations are primarily on DUB genes that are important for the expression and stability of the genome.

Biography

Le Dr El Bachir Affar est titulaire d’un doctorat en physiologie-endocrinologie du Centre hospitalier de l’Université Laval (CHUL), ainsi que de deux postdoctorats : le premier du Laboratoire de recherche sur le cancer de la peau du CHUL, et le deuxième du département de pathologie de la Harvard Medical School. Il s’intéresse principalement à la signalisation cellulaire via l’ubiquitination, aux processus associés à l’ADN et à la chromatine (transcription et réparation de l’ADN), et aux bases moléculaires du cancer.

Affiliations and responsabilities

Research affiliations

Teaching and supervision

Student supervision

Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)

2018

Régulation du complexe suppresseur de tumeurs BAP1/ASXL2 par ubiquitination

Graduate : Ahmed, Oumaima
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2016

Étude fonctionnelle d’un nouveau complexe multi-enzymatique régulant l’épigénome

Graduate : Daou, Salima
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2016

Biochemical and functional characterization of the tumor suppressors BRCA1 and BAP1

Graduate : Hammond-Martel, Ian
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2014

Regulation of BAP1 tumor suppressor complex by post-translational modifications

Graduate : Mashtalir, Nazar
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2011

Rôle de la déubiquitinase BAP1 dans la réponse cellulaire aux dommages à l'ADN

Graduate : Ghram, Mehdi
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.

Projects

Research projects

2015 - 2022

UNRAVELING THE FUNCTION AND THE MECHANISM OF ACTION OF THE DEUBIQUITINASE MYSM1

Lead researcher : El Bachir Affar
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2017 - 2019

A Benchtop Cell Sorter for Accelerating the Discovery of Physiopathological Processes

Lead researcher : Éric Milot
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (OIR) -1 -(de 7 001 $ à 150 000 $)
2016 - 2019

Le système ubiquitine dans la régulation des processus associés à l' ADN et le cancer

Lead researcher : El Bachir Affar
Funding sources: FRQS/Fonds de recherche du Québec - Santé (FRSQ)
Grant programs: PVXXXXXX-Bourse de chercheur-boursier : Senior
2016 - 2018

A microcalorimetry system to define the biochemical parameters of molecular interactions

Lead researcher : El Bachir Affar
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (OIR) -1 -(de 7 001 $ à 150 000 $)
2011 - 2016

TRANSCRIPTIONAL REGULATION BY A NOVEL DEUBIQUITINASE MULTI-PROTEIN COMPLEX

Lead researcher : El Bachir Affar
Funding sources: IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Grant programs: PVXXXXXX-(MSH) Bourses de nouveaux chercheurs
2011 - 2016

TRANSCRIPTIONAL REGULATION BY A NOVEL DEUBIQUITINASE MULTI-PROTEIN COMPLEX

Lead researcher : El Bachir Affar
2010 - 2016

ROLE OF THE DEUBIQUITINASE USP16 IN CELL CYCLE PROGRESSION

Lead researcher : El Bachir Affar
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2011 - 2014

RÔLES DU SYSTÈME UBIQUITINE DANS LA TRANSCRIPTION ET LA RÉPARATION DE L'ADN

Lead researcher : El Bachir Affar
2009 - 2014

ROLE OF THE DEUBIQUITINASE USP16 IN CELL CYCLE PROGRESSION

Lead researcher : El Bachir Affar
2011

CHARACTERIZATION OF NOVEL EPIGENETIC MARKS

Lead researcher : El Bachir Affar
2010

MONITORING GENE FUNCTION AND REGULATION IN PHYSIO-PATHOLOGOCAL PROCESSES

Lead researcher : El Bachir Affar

Outreach

Publications and presentations

Disciplines

  • Biochemistry
  • Immunology
  • Oncology