Mohamed Hijri
Biodiversité microbienne
- Professeur titulaire
-
Faculté des arts et des sciences - Département de sciences biologiques
Institut de recherche en biologie végétale, local F344
Médias
Projet GénoRem
Mohammed Hijri est codirecteur du Projet GenoRem. GenoRem réunit des chercheurs de plusieurs horizons qui mettent en commun leur expertise afin de trouver des éléments de solution susceptibles d’améliorer les techniques vertes de décontamination des sols pollués.
Portrait
Expertise de recherche
Mes intérêts de recherche sont dans le domaine de la génétique moléculaire, cytogénétique, génomique, l’évolution et la biodiversité des champignons mycorhiziens à arbuscules.
L’objectif de mes recherches est de comprendre la structure génétique, l’évolution et la reproduction des champignons mycorhiziens à arbuscules. De telles connaissances sont extrêmement importantes pour l’agriculture et l’aménagement de l’environnement. L’impact d’un futur savoir quant au fonctionnement au point de vue génétique de ces organismes est vital et nécessaire à la compréhension de leur rôle primordial dans la nature.
Biographie
Mohamed Hijri a fait ses recherches à l'Institut national de la recherche agronomique (INRA) de Dijon et il a obtenu son doctorat en 1999 à l'Université de Bourgogne (Dijon, France). Il a fait un stage postdoctoral en Suisse de 1999 à 2005 aux Universités de Bâle et Lausanne. Il s’est joint au Département de sciences biologiques de l'Université de Montréal en 2005 en tant que professeur adjoint pour ensuite devenir professeur agrégé en 2010. Dr Hijri est un expert mondialement reconnu sur les recherches en mycorhizes. Il dirige et co-dirige des projets de grande envergure en partenariat avec l'industrie.
Formation
- 2005 — Postdoctorat (1999-2005) — Biologie moléculaire, Génétique — Université de Bâle, Université de Lausanne
- 1999 — Doctorat — Biochimie, Biologie cellulaire, Biologie moléculaire — Université de Bourgogne
- 1995 — Maîtrise (équivalent) — Biochimie, Biologie cellulaire, Biologie moléculaire — Université de Bourgogne
- 1994 — Baccalauréat (équivalent) — Biologie cellulaire — Université de Bourgogne
- 1993 — Baccalauréat (équivalent) — Biologie et autres sciences connexes — Université Cadi Ayyad
Affiliations et responsabilités
Affiliations de recherche
Unités de recherche
Membre
Enseignement et encadrement
Enseignement
Cours siglés (session en cours uniquement)
- BIO-1804 – Introduction à la microbiologie environnementale
- BIO-2350 – Diversité fongique
- BIO-3080 – Stage d'animation en biologie
- BIO-3080 – Stage d'animation en biologie
- BIO-3781 – Microorganismes phytopathogènes
Programmes
- 102321 – Majeure en environnement, société et transitions
- 123510 – Baccalauréat en sciences biologiques
- 123520 – Majeure en sciences biologiques
- 123540 – Mineure en sciences biologiques
- 148110 – Baccalauréat en santé publique environnementale et sécurité du travail
- 150010 – Baccalauréat en microbiologie et immunologie
- 196710 – Programme d'accueil en sciences
- 202311 – DESS en environnement et développement durable
- 202312 – Maîtrise en environnement et développement durable (avec stage)
Encadrement
Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)
Soil histories continue to structure the bacterial and oomycete communities of Brassicaceae host plants through time on the Canadian prairies
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Le microbiote rhizosphérique et racinaire du bleuetier sauvage
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Caractérisation de la structure et de la composition des communautés microbiennes natives d’écosystèmes naturels hyperphosphatés et de leur contribution à l’élaboration d’inoculums solubilisateurs de phosphate de roche
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Structural and functional diversity of bacterial communities in petroleum hydrocarbons contaminated soils subjected to phytoremediation
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Structure, variations temporelles et interactions biotiques du microbiote souterrain du canola (B. napus L.) dans les Prairies Canadiennes
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Effets des inoculants de champignon mycorhizien arbusculaire et de rhizobactéries sur les insectes du soja
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
L'effet de l'utilisation du thé de compost sur la diversité et la structure bactérienne du sol et les rendements de soja dans les champs
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Manipulation du microbiome rhizosphérique et son application en phytoremédiation
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Phytoremédiation d’un sol contaminé par des contaminants organiques et inorganiques
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Arbuscular mycorrhizal fungal communities of 31 durum wheat cultivars (Triticum turgidum var. durum) under field conditions in Eastern Canadian province of Quebec
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Novel bioinformatics programs for taxonomical classification and functional analysis of the whole genome sequencing data of arbuscular mycorrhizal fungi
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
The evolution of RNA interference system, blue light sensing mechanism and circadian clock in Rhizophagus irregularis give insight on Arbuscular mycorrhizal symbiosis
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Phytoremediation of soil contaminated with petroleum hydrocarbons and trace elements
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Étude de la diversité mycorhizienne associée à la rhizosphère de plantes poussant spontanément dans un des bassins d'un site hautement contaminé par des hydrocarbures pétroliers
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Biodiversity of arbuscular mycorrhizal fungi from extreme petroleum hydrocarbon contaminated site
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Étude de la biodiversité microbienne associée aux champignons mycorhiziens arbusculaires dans des sites hautement contaminés par des hydrocarbures pétroliers
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
La face cachée de la dune : communautés fongiques du sol: dynamique, succession et interactions avec la végétation d’un écosystème dunaire côtier aux Îles de la Madeleine, Qc
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Développement des marqueurs moléculaires spécifiques pour l'identification et la quantification de deux espèces de champignons mycorhiziens arbusculaires en utilisant la PCR en temps réel
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Diversité des organismes endophytes dans les racines de plantes poussant en milieu contaminé en hydrocarbures
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Comparative mitochondrial genomics toward understanding genetics and evolution of arbuscular mycorrhizal fungi
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
La génomique évolutive mitochondriale révèle des échanges génétiques et la ségrégation chez les Gloméromycètes
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
The evolution of inter-genomic variation in arbuscular mycorrhizal fungi
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Molecular interactions of arbuscular mycorrhizal fungi with mycotoxin-producing fungi and their role in plant defense responses
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Étude de l’interaction entre le champignon mycorhizien Glomus irregulare et les bactéries du sol
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Molecular biodiversity of microbial communities in polluted soils and their role in soil phytoremediation
Cycle : Doctorat
Diplôme obtenu : Ph. D.
Reproduction et échanges génétiques horizontaux chez les champignons mycorhiziens à arbuscules
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Extent of intra-isolate genetic polymorphism in glomus etunicatum using a molecular genetic approach
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Étude du polymorphisme intra- et inter-spécifique du gène β-tubuline chez des espèces de champignons mycorhiziens à arbuscules en vue de développer des marqueurs moléculaires
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
Projets
Projets de recherche
Functional Diversity of Arbuscular Mycorrhizal Fungi and their interaction with non-host plants
From genes to farms: achieving Canada's net-zero emission target with innovative OMICS sensors that lower the nitrous oxide emissions from food cropping systems
Développement des biostimulants d'une nouvelle génération pour les grandes cultures agricoles et maraîchères.
Improving plant biostimulants based on natural products and beneficial microorganisms
Développement des biostimulants d'une nouvelle génération pour les grandes cultures agricoles et maraîchères.
The arbuscular mycorrhizal (AM) symbiosis as a tripartite association: understanding the recruitment mechanisms among plants, AM fungi and their associated soil microbes
Caractérisation d’espèces fongiques du Canada et du Rwanda
Centre de la Science de la Biodiversite du Quebec_CSBQ /Quebec Centre for Biodiversity Science_QCBS (2019-2021). Écologie et biodiversité microbienne.
CALCUL QUEBEC
L'utilisation potentielle de champignons mycorhiziens arbusculaires et de Trichoderma pour augmenter le rendement du canola et réduire les stress biotiques
Supplément COVID-19 CRSNG_The arbuscular mycorrhizal (AM) symbiosis as a tripartite association: understanding the recruitment mechanisms among plants, AM fungi and their associated soil microbes
Développement de mycofiltres à partir de déchets textiles pour la décontamination des eaux de surface polluées par les hydrocarbures pétroliers
Enhancing the Beneficial Root Microbiome in Canola
CENTRE DE LA SCIENCE DE LA BIODIVERSITE DU QUEBEC
Lutte biologique des pathogènes vasculaires de la tomate en serre en utilisant les champignons mycorhiziens et du biocharbon
Microbial recruitment mechanisms in complex interactions of plant roots, mycorrhizal fungi and soil microbes
FGR CRSNG : 2018-2019
MATING, PHEROMONE-SIGNALLING PATHWAY AND GENETIC EXCHANGE IN ARBUSCULAR MYCORRHIZAL FUNGI
Diversité des champignons mycorhiziens à éricacées dans des champs de production des bleuets sauvages à Saguenay-Lac-St-Jean
Développement de mycélium pour la production de gaz carbonique en serres et la faisabilité de la culture de morille au Québec
Beneficial Effects of Ascophyllum Nodosum extract on crop microbiome, soil fertility and crop growth
CARACTERISATION ET QUANTIFICATION DES GLOMERALES DANS DES SOLS AGRICOLES ET DES RACINES DES PLANTES CULTIVEES
SPINNING DISC CONFOCAL LASER MICROSCOPE
Concours Génome Canada 2015 / Avis d'octroi - Financement de soutien (Soutien à l'élaboration d'une demande de subvention)
SOILBIOME : MANAGEMENT OF SOIL MICROORGANISMS TO MEET MODERN AGRICULTURAL DEMANDS
CSBQ BOURSE POUR STAGE INTERNATIONAL POUR CHARLOTTE MARCHAND
RESEAU D'INNOVATION SUR LES GRAINS (INNOVAGRAINS)
GENOREM IMPROVING BIOREMEDIATION OF POLLUTED SOILS THROUGH ENVIRONMENTAL GENOMICS
RESEAU D'INNOVATION SUR LES GRAINS (INNOVAGRAINS)
RESEAU D'INNOVATION SUR LES GRAINS (INNOVAGRAINS)
CENTRE DE LA SCIENCE DE LA BIODIVERSITE DU QUEBEC
DEVELOPING MYCORRHIZAL GENOMIC MARKERS TO ENHANCE INDUSTRIAL PRODUCTION AND FORMULATION
PORTION MARYAM NADIMI - DEVELOPPEMENT DE MARQUEURS GENETIQUES MYCORRHIZIENS POUR AMELIORER LA PRODUCTION ET LA FORMULATION INDUSTRIELLE
PORTION STEPHANIE BERTHIAUME - DEVELOPPEMENT DE MARQUEURS GENETIQUES MYCORRHIZIENS POUR AMELIORER LA PRODUCTION ET LA FORMULATION INDUSTRIELLE
PORTION DENIS BEAUDET - DEVELOPPEMENT DE MARQUEURS GENETIQUES MYCORRHIZIENS POUR AMELIORER LA PRODUCTION ET LA FORMULATION INDUSTRIELLE
DEVELOPPEMENT DE MARQUEURS GENETIQUES MYCORRHIZIENS POUR AMELIORER LA PRODUCTION ET LA FORMULATION INDUSTRIELLE
RESEAU MITACS // DEVELOPPEMENT DE MARQUEURS GENETIQUES MYCORRHIZIENS POUR AMELIORER LA PRODUCTION ET LA FORMULATION INDUSTRIELLE
Développement de marqueurs génétiques mycorrhiziens pour améliorer la production et la formulation industrielle
Description
Projets de valorisation
Réseau Canadensys
Description
Descriptif du projet
Les collections biologiques contiennent de grandes quantités d’informations d’ordre taxonomique, géographique, temporel, numérique, et historique. Ces informations sont essentielles à une bonne compréhension et gestion de la biodiversité et des écosystèmes mais sont souvent difficiles à obtenir. Le réseau Canadensys, géré par le Centre sur la biodiversité de l’Université de Montréal, est un projet pancanadien visant à rendre l’information contenue dans les collections biologiques accessible à tous.
Pendant sa phase initiale, le réseau se concentre sur les données de trois groupes d’organismes parmi les plus divers et les plus importants du point de vue écologique et économique: les plantes, les insectes et les champignons. Malgré l’attention accrue accordée récemment aux deux derniers groupes, nos connaissances restent incomplètes et il est encore difficile d’avancer des chiffres sur le nombre d’espèces qu’ils représentent. Pour l’instant le réseau comprend 11 universités participantes, cinq jardins botaniques et deux musées qui hébergent collectivement plus de 13 millions de spécimens.
Nous avons l’intention d’informatiser, de publier et de géoréférencer 3 millions de spécimens (20%) pendant les cinq années initiales du projet, grâce à un réseau de bases de données distribuées compatible avec le Système canadien d’information sur la biodiversité (SCIB) et le Système mondial d’information sur la biodiversité (SMIB/GBIF). Les conservateurs des collections publieront leurs données en format Darwin Core, un format standard d’information sur la biodiversité accepté internationalement. Un portail Web central donnera accès aux données sur les spécimens mises en réseau (incluant les images et les données géospatiale) ainsi qu’à d’autres informations, telles que les noms provenant de la Base de données des plantes vasculaires canadiennes (VASCAN) et du Catalogue of Life.
Grâce à Canadensys, il sera possible d’analyser ces données et de les entrer dans des modèles environnementaux et géospatiaux, ce qui aboutira à une meilleure compréhension des problématiques environnementales mondiales et à la mise en place de politiques judicieuses en matière de biodiversité à travers le pays.
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Publications et communications
Publications
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