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Sciences naturelles et génie; Sciences appliquées

Guy Wolf

Professeur adjoint

Faculté des arts et des sciences - Département de mathématiques et de statistique

André-Aisenstadt, local 6165

514 343-6694

guy.wolf@umontreal.ca

Portrait

Expertise de recherche

Mes sujets de recherche se situent à l'intersection de l'apprentissage automatique, des sciences des données et des mathématiques appliquées. En particulier, je suis intéressé par les méthodes d'exploration des données qui utilisent l'apprentissage des variétés et l'apprentissage profond géométrique. Je m'intéresse aussi aux applications d'analyse exploratoire des données biomédicales, surtout ceux qui portent sur les données de cellules uniques (p.ex. scRNA-seq et CyTOF).

Biographie

Guy Wolf est professeur adjoint au département de mathématiques et de statistique de l’Université de Montréal. Ses sujets de recherche se situent à l’intersection de l’apprentissage automatique, de la science des données et des mathématiques appliquées. Il s’intéresse en particulier aux méthodes d’exploration des données qui utilisent l’apprentissage des variétés et l’apprentissage profond géométrique, ainsi qu’aux applications d’analyse exploratoire des données biomédicales, surtout ceux qui portent sur les données de cellules uniques (p.ex. scRNA-seq et CyTOF).

Affiliations et responsabilités

Enseignement et encadrement

Encadrement

Thèses et mémoires dirigés (dépôt institutionnel Papyrus)

2024

Horseshoe regularization for wavelet-based lensing inversion

Diplômé(e) : Nafisi, Hasti
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2023

Taxonomy of datasets in graph learning : a data-driven approach to improve GNN benchmarking

Diplômé(e) : Cantürk, Semih
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2023

Exploratory and predictive methods for multivariate time series data analysis in healthcare

Diplômé(e) : Aumon, Adrien Andréas
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2023

Application de méthodes d’apprentissage profond pour images avec structure additionnelle à différents contextes

Diplômé(e) : Alsène-Racicot, Laurent
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2022

Parametric Scattering Networks

Diplômé(e) : Gauthier, Shanel
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.
2020

Optimizing ANN Architectures using Mixed-Integer Programming

Diplômé(e) : ElAraby, Mostafa
Cycle : Maîtrise
Diplôme obtenu : M. Sc.

Projets

Projets de recherche

2023 - 2030

Combining Space, Time, and cell types to decode and explain the effect sizes of rare genomic variants on cognition and psychopathology

Chercheur principal : Sébastien Jacquemont
Co-chercheurs : Guy Wolf , Guillaume Dumas , Tomas Paus , Celia Greenwood
Sources de financement : IRSC/Instituts de recherche en santé du Canada
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(PJT) Subvention Projet
2022 - 2029

Centre de recherches mathématiques (CRM)

Chercheur principal : Octavian Cornea
Co-chercheurs : Yoshua Bengio , François Lalonde , Gilles Brassard , Michel Delfour , Marlène Frigon , Véronique Hussin , Christiane Rousseau , Jacques Bélair , Paul M Gauthier , Sabin Lessard , Alain Vinet , Nadia El-Mabrouk , Gena Hahn , Christian Léger , Fahima Nekka , Iosif Polterovich , Yvan Saint Aubin , Andrew Granville , Sylvie Hamel , Manuel Morales , François Perron , Mylène Bédard , Pierre Duchesne , Matilde Lalin , Robert Gwyn Owens , Manu Paranjape , Dana Schlomiuk , Luc Vinet , Mireille Schnitzer , Karim Jerbi , Alexander Fribergh , Alejandro Murua , Maciej Augustyniak , Benoît Mâsse , Dimitrios Koukoulopoulos , Jun Li , Benjamin Seamone , William Witczak-Krempa , Egor Shelukhin , Morgan Craig , Guillaume Lajoie , Margarida Carvalho , Guy Wolf , Florian Maire , Frédéric Dupont-Dupuis , Michael C. Mackey , Frédéric Lesage , Russell Steele , Erica Moodie , Paul François , Henri Darmon , Maxime Descoteaux , Prakash Panangaden , André Dieter Bandrauk , Peter Bartello , Chantal David , Jean-Marc Lina , Anthony Raymond Humphries , John P. Harnad , Jacques Claude Hurtubise , Pengfei Guan , John A Toth , Niky Kamran , Adrian Iovita , Eyal Goren , Dmitry Jakobson , Vojkan Jaksic , Daniel Tzvi Wise , André Garon , Éric P. Marchand , Debbie Janice Dupuis , Yogendra Chaubey , Pawel Gora , Hershy Kisilevsky , Galia Dafni , D. Korotkin , Marco Bertola , Alina Stancu , Lea Popovic , Ibrahim Assem , Tomasz Kaczynski , Shiping Liu , Vasilisa Shramchenko , Bruno L. Rémillard , Richard Fournier , Alfred Michel Grundland , David Stephens , Xiaowen Chang , Frederic Guichard , Erik P. Cook , Robert Brandenberger , Adrian Vetta , Keshav Dasgupta , Christophe Grova , Gantumur Tsogtgerel , Johanna Neslehova , Jean-Christophe Nave , Anmar Khadra , Adam M. Oberman , Michael Yves Michel Pichot , Alexander Maloney , Dana Louigi Addario-Berry , José Garrido , Alexei Kokotov , Wei Sun , Patrice Gaillardetz , Linan Chen , Piotr Przytycki , Vladimir Makarenkov , Louis-Paul Rivest , François Bergeron , Steven P. Boyer , Line Baribeau , Frédéric Gourdeau , Claude Levesque , Thomas Joseph Ransford , Jean-Marie De Koninck , Javad Mashreghi , Thierry Duchesne , Srecko Brlek , Christophe Reutenauer , Vestislav Apostolov , Steven Lu , Geneviève Lefebvre , Hélène Cossette , Étienne Marceau , José Manuel Urquiza , Hugo Chapdelaine , Michael Lau , Alexandre Girouard , Antonio Lei , Jean-François Renaud , Christophe Hohlweg , Mathieu Boudreault , FRANCO SALIOLA , Alexandre Roch , Frédéric Rochon , Alexandre Blondin-Massé , Clement Hyvrier , Denis Talbot , Alexandre Bureau , Fabrice Larribe , Aurélie Labbe , Cody Hyndman , Khader Khadraoui , Hamed Hatami , Roger Villemaire , Frédéric Godin , Marcin Sabok , Yi Yang , Anne Mackay , Jérôme Vétois , Ting-Huei Chen , Habib Benali , Taoufik Bouezmani , Christian Genest , Xiaowen Zhou , Sorana Froda , Mélina Mailhot , Alexandra Schmidt , Simon Philippe Caron-Huot , Abdoulaye Banire Diallo , Jean-Philippe Lessard , Sarah Harrison , Anne-Sophie Charest , Masoud Asgharian-Dastenael , Rustum Choksi , Abbas Khalili Mahmoudabadi , Simon Gravel , Arusharka Sen , Arthur Charpentier , Mathieu Pigeon , Benoit Larose , Thomas Brüstle , Laurent Charlin , Janosch Ortmann , Tim Hoheisel , Jean Deteix , Jessica Lin , Michael Lipnowski , Giovanni Rosso , Thomas Hugh , Jean-Philippe Burelle , Julien Keller , Félix Camirand Lemyre , Marie-Pier Côté , Damir Kinzebulatov , Duncan McCoy , Klaus Herrmann , Felix Kwok , Courtney Paquette , Anush Tserunyan , Suresh Krishna , Valentino Tosatti , Patrick Brodie Allen , Behrooz Yousefzadeh , Marc-Hubert Nicole , Rober Platt
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques
2024 - 2028

Méthodes de persistence en mathématiques pures et appliquées

Chercheur principal : Octavian Cornea
Co-chercheurs : Iosif Polterovich , Egor Shelukhin , Guy Wolf
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PV113724-(PR) Projets de recherche en équipe (et possibilité d'équipement la première année)
2021 - 2027

Representation learning and exploration of data geometries

Chercheur principal : Guy Wolf
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(DGECR) Tremplin vers la découverte
2021 - 2027

Representation learning and exploration of data geometries

Chercheur principal : Guy Wolf
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2023 - 2026

Multiscale data geometric networks for learning representations and dynamics of biological systems

Chercheur principal : Smita Krishnaswamy
Co-chercheurs : Guy Wolf
Sources de financement : National Science Foundation
Programmes de subvention :
2023 - 2026

Vers une meilleure compréhension et une utilisation efficace du calcul en profondeur dans les réseaux de neurones modernes

Chercheur principal : Guy Wolf
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Programme NOVA pour chercheur(e)s de la relève (partenariat avec FRQNT)
2023 - 2026

Vers une meilleure compréhension et une utilisation efficace du calcul en profondeur dans les réseaux de neurones modernes

Chercheur principal : Guy Wolf
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Programme NOVA pour chercheur(e)s de la relève (partenariat avec CRSNG)
2021 - 2025

Representation learning and exploration of data geometries

Chercheur principal : Guy Wolf
Sources de financement : CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(MDN) Supplément aux subventions à la découverte
2022 - 2024

Diffusion Geometry & Topology Approach to Data Fusion and Mitigating Batch Effects

Chercheur principal : Guy Wolf
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2021 - 2024

Geometry preserving deep networks

Chercheur principal : Guy Wolf
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2021 - 2024

Exploitation de structures de graphes dans les réseaux de neurones par transformée de scattering géométrique

Chercheur principal : Guy Wolf
Sources de financement : FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-(NC) Établissement de la relève professorale
2019 - 2024

Finding emergent structure un multi-sample biological data with the dual geometry of cells and features

Chercheur principal : Matthew J. Hirn
Co-chercheurs : Guy Wolf
Sources de financement : NIH/National Institutes of Health (NIH)
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Subvention de recherche
2023

Des données pour raconter // Vincent Chrétien

Chercheur principal : Guy Wolf
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2020 - 2023

Unified approach to graph structure utilization in data science

Chercheur principal : Guy Wolf
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Projet de recherche
2018 - 2022

Programme de fonds de démarrage et d'opération pour professeure IVADO - Compte pour le fonds d'opération - Guy Wolf

Chercheur principal : Guy Wolf
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Fonds démarrage et opération
2021

Integreted data-driven approaches for understanding immunological data

Chercheur principal : Guy Wolf
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2020

PHATE-NET

Chercheur principal : Guy Wolf
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2019

Probing learned network structure in a multi-task setting

Chercheur principal : Guy Wolf
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Bourse
2018 - 2019

Programme de fonds de démarrage et d'opération pour professeure IVADO - Compte pour le fonds de démarrage - Guy Wolf

Chercheur principal : Guy Wolf
Sources de financement : SPIIE/Secrétariat des programmes interorganismes à l’intention des établissements
Programmes de subvention : PVXXXXXX-Fonds d'excellence en recherche Apogée Canada/Fonds démarrage et opération

Rayonnement

Publications et communications

Disciplines

  • Mathématiques appliquées
  • Mathématiques fondamentales
  • Sciences biomédicales

Champ d’expertise

  • Bases de données informatiques
  • Modes d'apprentissage
  • Fouille de données (Data mining)
  • Technologies biomédicales
  • COVID-19
  • COVID19

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