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Natural Sciences and Engineering; Health Sciences; Information and Communication Technologies

Simon Dufour

Épidémiologie animale, santé bovine, production laitière et qualité du lait

Professeur titulaire

Faculté de médecine vétérinaire - Département de pathologie et microbiologie

Pavillon 1500, av. des Vétérinaires, room 3917-A

simon.dufour@umontreal.ca

Secondary numbers: 450 773-8521 #8605 (Travail 1) 514 343-6111 #8605 (Travail 2)

Media

L'équipe du RCRMBQL

Dr Dufour en compagnie des membres de l'équipe du RCRMBLQ. De gauche à droite sur la photo : Annik L’Espérance, gestionnaire de réseau ; Simon Dufour,directeur scientifique, Mario Jacques, directeur administratif et Hélène Poirier, agente de transfert. - © 2013 RCRMBQL

Dr Dufour en compagnie des membres de l'équipe du RCRMBLQ. De gauche à droite sur la photo : Annik L’Espérance, gestionnaire de réseau ; Simon Dufour,directeur scientifique, Mario Jacques, directeur administratif et Hélène Poirier, agente de transfert.

Conférence au Symposium Bovins Laitiers du Québec 2017

Équipe de recherche 2017

Logo du RCRMBQL

Simon Dufour est directeur scientifique du Réseau canadien de recherche sur la mammite bovine et la qualité du lait (RCRMBQL). - © RCRMBQL

Simon Dufour est directeur scientifique du Réseau canadien de recherche sur la mammite bovine et la qualité du lait (RCRMBQL).

Intérêts de recherche

Profile

Research expertise

PROFIL:

Je suis un épidémiologiste vétérinaire qui compte 20 ans d'expérience pratique et de recherche dans le secteur des produits laitiers. J'ai un programme de recherche et de transfert de connaissances bien établi sur la mammite et sur d'autres maladies infectieuses chez les bovins laitiers, ainsi que sur l'utilisation des antibiotiques en production animale. Mon programme de recherche porte également sur la visualisation de données ainsi que sur l'utilisation des modèles Bayesiens de variable à classe latente pour la validation de tests diagnostiques et la réalisation d'analyses épidémiologiques, comme, par exemple, l'analyse quantitative des biais (https://www.simondufour.ca/). 

Je dirige le Regroupement FRQNT Op+lait (http://oplait.org) et je co-dirige la Chaire de recherche de biosécurité en production laitière (https://www.chairebiosecuritelait.org/).
 

EXPERTISES:

  • Dynamique des infections intramammaires et facteurs de risque associés.
  • Analyses Bayesiennes.
  • Développement d’outils permettant la surveillance et le contrôle des maladies infectieuses sur les fermes laitières.
  • Développement d’une approche structurée d’amélioration de la qualité du lait des fermes laitière canadiennes.
  • Analyse de biais.
  • Développement de modèles statistiques permettant de prendre en compte la sensibilité et la spécificité imparfaite d’un test diagnostique lors de l’analyse d’études longitudinales.
  • Validation de questionnaires épidémiologiques.
  • Développement de nouvelles approches d’évaluation du raisonnement clinique en pédagogie vétérinaire.
  • Stratégies de communication et transfert de connaissances.
  • Visualisation de données.

Biography

Avant de commencer une carrière en recherche à l’Université de Montréal, Dr. Dufour a travaillé comme vétérinaire praticien pendant une dizaine d’années au Québec et en Colombie-Britannique. Sa connaissance du terrain est donc une base importante pour ses activités de recherches. Ses recherches portent principalement sur les facteurs de risque associés à la différentes maladies infectieuses des ruminants, sur le développement d’outils pour le monitoring de la santé et de l'utilisation des antibiotiques dans les troupeaux commerciaux et sur la validation de tests diagnostiques. Il joue un rôle important au sein du Regroupement FRQNT Op+lait en tant que directeur et il co-dirige la Chaire de recherche de biosécurité en production laitière.

Awards and recognitions

  • 2021 American College of Veterinary Ophthalmologists best manuscript award in the clinical medicine category
  • 2020 Prix d’excellence Zoetis pour la recherche
  • 2018 Prix Vétoquinol pour la qualité de l'encadrement en recherche - An award attributed each year to a teacher from the Faculté de médecine vétérinaire for its outstanding supervisory skills with graduate students
  • 2015 Prix meilleur partenariat de recherche entreprises-chercheurs de l'Association pour le Développement et la Recherche et de l'Innovation du Québec (ADRIQ) - An award from a provincial organization for best university-private sector research partnership (all fields of research considered)
  • 2015 American Dairy Science Association (ADSA) - Award for the most-cited manuscript in Physiology and management (Dufour et al., J. Dairy Sci., 2012)
  • 2014 American Dairy Science Association (ADSA) - Award for the most-cited manuscript in Physiology and management (Reyher et al., J. Dairy Sci., 2011).
  • 2014 American College of Veterinary Internal Medicine (ACVIM) - Best 10 research papers related to Food Animal Medicine in 2013-2014 (Boulay et al., J. Dairy Sci., 2014).

education

  • 2012 — Stage post-doctoral, épidémiologie-science informatique (Fellowship) — Épidémiologie et biostatistique, Médecine vétérinaireUniversity of Prince Edward Island
  • 2011 — Doctorat, sciences vétérinaires, option épidémiologie — Épidémiologie et biostatistique, Médecine vétérinaireUniversité de Montréal
  • 1998 — Doctorat en médecine vétérinaire (DMV) — Médecine vétérinaireUniversité de Montréal

Teaching and supervision

Student supervision

Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)

2022

Traitement antibiotique sélectif au tarissement des vaches laitières

Graduate : Kabera, Fidèle
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2018

Performance and health of dairy cows incompletely milked during the first five days in milk

Graduate : Krug, Catarina
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
2017

Récurrence de mammite clinique chez la vache laitière : incidence, facteurs de risque et impacts

Graduate : Jamali, Hossein
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
2017

Economic impacts of mastitis in canadian dairy herds

Graduate : Aghamohammadi, Mahjoob
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.

Projects

Research projects

2024 - 2031

Réseau Québécois en Reproduction

Lead researcher : Derek Boerboom , Jocelyn Dubuc
Funding sources: FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs: PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques
2024 - 2031

Op+lait: Regroupement de recherche pour un lait de qualité optimale

Lead researcher : Simon Dufour
Funding sources: FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs: PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques
2023 - 2029

Étude de la qualité du lait à l'aide de la spectroscopie infra-rouge avec transformation de Fourier et de la cytométrie en flux.

Lead researcher : Simon Dufour
Funding sources: Université de Montréal
Grant programs: PVXXXXXX-FEI sans restriction
2023 - 2028

Optimizing use of antimicrobials using novel diagnostic and mastitis control strategies (activity 15)

Lead researcher : Simon Dufour
Co-researchers : Jean-Philippe Roy , François Malouin
Funding sources: Producteurs laitiers du Canada (Les)
Grant programs:
2024 - 2027

Initiatives en formation de la relève

Lead researcher : Simon Dufour
Co-researchers : Stéphane Bayen
Funding sources: FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs: Pôle de recherche et d'innovation-Volet2- Programmation de recherche non traditionnelle
2020 - 2027

Novel methodologies for design and analysis of dairy health surveillance programs

Lead researcher : Simon Dufour
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2022 - 2026

Plan de transfert de connaissances_Analyse du résistome des bovins laitiers au Québec avant et après la restriction de l’utilisation des antibiotiques de catégorie 1

Lead researcher : Alexandre Thibodeau
Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs:
2022 - 2025

Étude de la qualité du lait à l'aide de la spectroscopie infra-rouge avec transformation de Fourier et de la cytométrie en flux.

Lead researcher : Simon Dufour
Funding sources: FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds des leaders
2022 - 2025

Plan de financement_Analyse du résistome des bovins laitiers au Québec avant et après la restriction de l’utilisation des antibiotiques de catégorie 1

Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs:
2021 - 2025

Plan de transfert de connaissances // Développement, validation et mise en place d'un outil de benchmarking de l'utilisation des antibiotiques dans les troupeaux laitiers du Québec

Lead researcher : Simon Dufour
Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs:
2021 - 2025

Plan de transfert de connaissances_Évaluation de la valeur ajoutée du comptage différentiel des cellules somatiques du lait pour le diagnostic des infections intra mammaires

Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs:
2020 - 2025

Chaire industrielle CRSNG-MAPAQ biosécurité en production laitière

Lead researcher : Simon Dufour
Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation , Université de Montréal
Grant programs: ,
2020 - 2025

Chaire industrielle CRSNG-MAPAQ biosécurité en production laitière

Lead researcher : Simon Dufour
2020 - 2025

Biosecurity 2.0 for the modern Canadian dairy farm

Lead researcher : Simon Dufour
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-Subventions Alliance
2020 - 2025

Biosecurity 2.0 for the modern Canadian dairy farm

Lead researcher : Simon Dufour
Funding sources: Novalait
Grant programs:
2020 - 2025

Biosecurity 2.0 for the modern Canadian dairy farm

Lead researcher : Simon Dufour
Funding sources: Producteurs laitiers du Canada (Les)
Grant programs:
2017 - 2025

Op+LAIT : Regroupement de recherche pour un lait de qualité optimale

Lead researcher : Simon Dufour , Mario Jacques
Funding sources: FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs: PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques
2023 - 2024

Validation of individual- and herd-level tests for diagnosing leukosis in dairy cattle

Lead researcher : Simon Dufour
Co-researchers : Juan Carlos Arango Sabogal
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-Subventions Alliance - Option 1
2023 - 2024

Validation of individual- and herd-level tests for diagnosing leukosis in dairy cattle

Lead researcher : Simon Dufour
Co-researchers : Juan Carlos Arango Sabogal
Funding sources: Valacta
Grant programs:
2021 - 2024

Plan de financement_Évaluation de la valeur ajoutée du comptage différentiel des cellules somatiques du lait pour le diagnostic des infections intra mammaires

Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs:
2021 - 2024

Plan de financement // Développement, validation et mise en place d'un outil de benchmarking de l'utilisation des antibiotiques dans les troupeaux laitiers du Québec

Lead researcher : Simon Dufour
Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs:
2020 - 2024

Évolution de l'utilisation des antibiotiques et de l'antibiorésistance dans les troupeaux laitiers québécois avant et après la mise en application d'un règlement sur les antibiotiques d'importance critique (Plan de transfert de connaissances)

Lead researcher : Jean-Philippe Roy
Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs:
2020 - 2024

Plan de transfert de connaissances_Validation d'outils diagnostiques réalisables à la ferme pour favoriser une utilisation judicieuse des antibiotiques chez les bovins laitiers

Lead researcher : Jocelyn Dubuc
Co-researchers : Jean-Philippe Roy , Sébastien Buczinski , Simon Dufour , Marie-Lou Gauthier
Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs:
2020 - 2023

Évolution de l'utilisation des antibiotiques et de l'antibiorésistance dans les troupeaux laitiers québécois avant et après la mise en application d'un règlement sur les antibiotiques d'importance critique.

Lead researcher : Jean-Philippe Roy
Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs:
2020 - 2023

Plan de financement_Validation d'outils diagnostiques réalisables à la ferme pour favoriser une utilisation judicieuse des antibiotiques chez les bovins laitiers

Lead researcher : Jocelyn Dubuc
Co-researchers : Jean-Philippe Roy , Sébastien Buczinski , Simon Dufour , Marie-Lou Gauthier
Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs:
2018 - 2023

The Canadian Bovine Mastitis and Milk Quality Research Network: continuing the advancement of milk quality in Canada

Lead researcher : Simon Dufour
Funding sources: Producteurs laitiers du Canada (Les)
Grant programs:
2018 - 2023

Dairy_Cluster 3, Activity 13B (D.Roy)

Lead researcher : Denis Roy , David Kelton
Co-researchers : Mario Jacques , Simon Dufour
Funding sources: Producteurs laitiers du Canada (Les)
Grant programs:
2018 - 2022

Validation of bulk tank milk sampling strategies and identification of risk factors for Salmonella Dublin in dairies.

Lead researcher : Simon Dufour
2018 - 2022

Validation of bulk tank milk sampling stratégies and identification of risk factors for Salmonella Dublin in dairies

Lead researcher : Simon Dufour
Funding sources: Les Producteurs de lait du Québec , CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: , PVX20973-(RDC-CRD) Partenariat de recherche / Subvention de recherche et développement coopérative
2018 - 2022

DairyeCluster3,Activity14

Lead researcher : David Kelton , Herman Barkema , Javier Sanchez
Co-researchers : Simon Dufour
Funding sources: Producteurs laitiers du Canada (Les)
Grant programs:
2015 - 2022

NSERC CREATE in Milk Quality

Lead researcher : Mario Jacques
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PV118026-FONCER : Prog. formation orientée nouveauté, la collaboration et l'expérience en recherche
2013 - 2022

FACTORS ASSOCIATED WITH INTRA-MAMMARY INFECTIONS DYNAMIC AND DEVELOPMENT OF TAILORED SAMPLING STRATEGIES AND ANALYTICAL METHODS

Lead researcher : Simon Dufour
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVX20965-(RGP) Programme de subvention à la découverte individuelle ou de groupe
2020 - 2021

Supplément COVID-19 CRSNG_Novel methodologies for design and analysis of dairy health surveillance programs

Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-Supplément à l’appui des étudiants, des stagiaires postdoctoraux et du personnel de soutien à la recherche COVID-19
2017 - 2021

Technologie MALDI-TOF pour l'étude de la dynamique des infections de la glande mammaire

Lead researcher : Simon Dufour
Funding sources: FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds d'exploitation des infrastructures (FEI)
2017 - 2020

Amélioration des stratégies diagnostiques de détection des veaux lourds souffrant de pneumonies

Lead researcher : Sébastien Buczinski
Co-researchers : Simon Dufour , David Francoz , Nandini Dendukuri
Funding sources: Les producteurs de bovins du Québec , MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs: ,
2017 - 2020

Impacts des méthodes de préparation de la litière à base de fumier recyclé sur ses qualités microbiennes, sur la santé des vaches laitières et sur la qualité du lait

Lead researcher : Simon Dufour
Co-researchers : Gilles Fecteau , Philippe Fravalo , Denis Roy
2017 - 2020

Impacts des méthodes de préparation de la litière à base de fumier recyclé sur ses qualités microbiennes, sur la santé des vaches laitières et sur la qualité du lait.

Lead researcher : Simon Dufour
Co-researchers : Philippe Fravalo , Denis Roy
2016 - 2020

Prévalence, cause et contrôle de l'antibiorésistance sur les fermes laitières québécoises

Lead researcher : Marie Archambault
Co-researchers : Jean-Philippe Roy , Julie Arsenault , Simon Dufour , André Ravel , David Francoz
Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs:
2016 - 2020

Impacts des méthodes de préparation de la litière à base de fumier recyclé sur ses qualités microbiennes, sur la santé des vaches laitières et sur la qualité du lait.

Lead researcher : Simon Dufour
Co-researchers : Gilles Fecteau , Philippe Fravalo , Denis Roy
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG) , Novalait , FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT) , CRIBIQ/Consortium de recherche et innovations en bioprocédés industriels au Québec
Grant programs: PVX20973-(RDC-CRD) Partenariat de recherche / Subvention de recherche et développement coopérative , , PVXXXXXX-(LG) Prog de rech en partenariat pour l'innovation en production et en transformation laitières ,
2015 - 2019

Évaluation des pratiques d'utilisation des agents antimicrobiens par les médecins vétérinaires et les producteurs de bovins laitiers du Québec

Lead researcher : David Francoz
Co-researchers : Jean-Philippe Roy , Marie Archambault , Simon Dufour
Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs:
2016 - 2018

Technologie MALDI-TOF pour l'étude de la dynamique des infections de la glande mammaire

Lead researcher : Simon Dufour
Funding sources: FCI/Fondation canadienne pour l'innovation
Grant programs: PVXXXXXX-Fonds des leaders
2015 - 2018

OPTILAIT : REGROUPEMENT DE RECHERCHE POUR UN LAIT DE QUALITE OPTIMALE (OPTILAIT)

Lead researcher : Mario Jacques
Funding sources: FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs: PVXXXXXX-(RS) Programme de regroupements stratégiques
2015 - 2018

DEVELOPPEMENT D'OUTILS TECHNOLOGIQUES POUR UNE APPROCHE CONCERTEE D'AMELIORATION DE LA SANTE DE LA GLANDE MAMMAIRE ET DE LA QUALITE DU LAIT SUR LES FERMES LAITIERES QUEBECOISES

Lead researcher : Simon Dufour
Co-researchers : Jean-Philippe Roy
Funding sources: Ministère Économie et Innovation
Grant programs: PVXXXXXX-Soutien à la valorisation et au transfert (PSVT-v2): Soutien aux projets structurants
2013 - 2018

TRAITE AJUSTEE EN PERIODE DE TRANSITION AFIN DE MIEUX CONTROLER LE BILAN ENERGETIQUE NEGATIF ET SES CONSEQUENCES

Lead researcher : Simon Dufour
Funding sources: FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs: PVXXXXXX-(LG) Prog de rech en partenariat pour l'innovation en production et en transformation laitières
2016 - 2017

Évaluation de la validité d'un test de comptage différentiel des cellules somatiques dans le lait comme outil rapide et abordable pour diagnostiquer les cas de mammites sous-cloniques

Lead researcher : Debora Santschi
Co-researchers : Simon Dufour
Funding sources: MAPAQ/Ministère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'Alimentation
Grant programs:
2014 - 2017

RESEAU CANADIEN DE RECHERCHE SUR LA MAMMITE BOVINE ET LA QUALITE DU LAIT

Lead researcher : Mario Jacques
Funding sources: Producteurs laitiers du Canada (Les)
Grant programs:
2014 - 2016

BEAD-BASED MULTIPLEXING TECHNOLOGY ('LUMINEX') FOR MULTIDISCIPLINARY STUDIES IN VETERINARY MEDECINE

Lead researcher : Mariela Segura
Funding sources: CRSNG/Conseil de recherches en sciences naturelles et génie du Canada (CRSNG)
Grant programs: PVXXXXXX-(OIR) Outils et d'instruments de recherche (de 7 001 $ à 150 000 $)
2013 - 2016

FACTEURS DE RISQUE ASSOCIES A LA RECURRENCE DE MAMMITE CLINIQUE CHEZ LA VACHE LAITIERE

Lead researcher : Simon Dufour
Funding sources: FRQNT/Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FQRNT)
Grant programs: PVXXXXXX-(NC) Établissement de la relève professorale

Outreach

Publications and presentations

Publications

Disciplines

  • Veterinary Sciences
  • Epidemiology and Biostatistics
  • Communication

Areas of expertise

  • Epidemiology
  • Animaux de la ferme
  • Bovins
  • Mammite
  • Insulte tissulaire, immunité et infection
  • Canada

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