François-Joseph Lapointe
Des mécanismes de l’évolution biologique (et de leur application au bioart)
- Professeur titulaire
-
Faculté des arts et des sciences - Département de sciences biologiques
Complexe des sciences, room B-6428
Profile
Research expertise
Analyse phylogénétique, biostatistique, bioinformatique, phylogénomique, métagénomique, choréogénétique, microbiome humain, génétique des populations, réseaux complexes, théorie de l’évolution, espèces menacées, mammalogie, herpétologie, biologie de la conservation, bioart, art génétique, performance, art corporel, interdisciplinarité art/science, recherche-création
Biography
François-Joseph Lapointe dirige le Laboratoire d’écologie moléculaire et d’évolution à l’Université de Montréal. Il est professeur titulaire au Département de sciences biologiques. Dans le cadre de ses recherches scientifiques, il s’intéresse à la phylogénétique, à la systématique, à la métagénomique ainsi qu’à la génétique des populations.
Auteur d’une centaine de publications en biologie de l’évolution, il a également développé plusieurs tests statistiques et algorithmes en bioinformatique. François-Joseph Lapointe a complété en 2012 un doctorat en études et pratiques des arts à l’Université du Québec à Montréal sous la supervision de Martine Époque. Dans le cadre de sa thèse intitulée « la choréogénétique, ou l’art de faire danser l’ADN » il a produit un algorithme génétique pour générer des chorégraphies in silico et il a créé Polymorphosum urbanum, une chorégraphie composée in vitro à partir des séquences génétiques de 30 danseurs. Pour sa pratique artistique, il s’inspire des modèles de la biologie moléculaire, de la génétique et de la génomique
Son plus récent projet en bioart consiste à séquencer son microbiome afin de générer des égoportraits métagénomiques. Il a reçu en 1990 la Médaille d’or académique du Gouverneur general, et en 1996 le Prize for Outstanding Research de l’International Federation of Classification Societies. Ses recherches sont notamment financées par le CRSNG, le CRSH, le FRQSC, le FRQNT et le Conseil des arts du Danemark.
education
- 1988 — B.Sc. — Biologie et autres sciences connexes — Université de Montréal
- 2012 — Ph.D. en Études et pratiques des arts — Arts visuels et médiatiques, Biologie et autres sciences connexes, Génétique — Université du Québec à Montréal
- 1992 — Ph.D. — Biologie et autres sciences connexes — Université de Montréal
Affiliations and responsabilities
Research affiliations
Teaching and supervision
Student supervision
Theses and dissertation supervision (Papyrus Institutional Repository)
Utilisations du microbiome en sciences judiciaires
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Microbiome cutané et maladie fongique émergente du syndrome du museau blanc chez les chauves-souris d’Amérique du Nord
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
La génétique au service de la conservation de la tortue des bois (Glyptemys insculpta)
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Dynamique saisonnière du microbiome intestinal en réponse à la diète traditionnelle inuite
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Une invasion dans la discrétion : répartition, origines et expansion des limaces européennes du complexe d'Arion subfuscus s.l. au Québec
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Problème du paradigme dans l'approche écologique de l'individualité chez Turner : une solution méréologique inspirée de Dupré et O'Malley
Cycle : Master's
Grade : M.A.
Phylogéographie comparée de la souris à pattes blanches et de la souris sylvestre, deux vecteurs de la maladie de Lyme au Québec
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Impact des polluants agricoles sur la génétique des populations d’une espèce sentinelle : le ouaouaron (Rana catesbeiana)
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Chimères, données manquantes et congruence : validation de différentes méthodes par simulations et application à la phylogénie des mammifères
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Structure génétique de populations montréalaises de salamandres cendrées (Plethodon cinereus) et de salamandres à points bleus (Ambystoma laterale)
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
La génétique au service de la conservation d'une espèce menacée endémique à Madagascar : la tortue radiée Astrochelys radiata
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Confirmation génétique de la présence de couguars (Puma concolor) dans l'est du Canada
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Caractérisation de l'habitat d'une communauté de salamandres de ruisseaux comportant des hybrides
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Fidélité au site comme mécanisme d'isolement reproducteur entre les membres sexués et asexués et entre les populations sympatriques du complexe Phoxinus eos-neogaeus
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Utilisation de réseaux en analyse phylogénétique : détection de taxons hybrides et combinaison d'arbres
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
De la pertinence de la congruence globale en analyse phylogénétique
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Coévolution des populations québécoises de cutérèbres (Cuterebra grisea et Cuterebra fontinella) et de souris du genre Peromyscus : la souris sylvestre (P. maniculatus) et la souris à pattes blanches (P. leucopus)
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Étude de la phylogénie et la biogéographie du genre Hoya (Asclepiadaceae) basée sur l'analyse de séquences d'ITS
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Effets de la configuration du paysage sur la variabilité génétique de populations de souris sylvestres (Peromyscus maniculatus: Rodentia, Muridae)
Cycle : Doctoral
Grade : Ph. D.
Phylogénie des wallabies des rochers, Petrogale (Marsupialia : Macropodidae), par hybridation ADN/ADN
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Détermination de l'origine des populations québécoises d'Echinochloa crus-galli (L.) Beauv. à l'aide de marqueurs RAPD et de séquences d'ADN
Cycle : Master's
Grade : M. Sc.
Projects
Research projects
Gisants, transis, charogne et putréfaction : l’art du cadavre en milieu naturel
Statistical analysis of microbiome longitudinal data with multiplex networks
Vers la quatrième nature: études pour un jardin semi-vivant
Les cybryontes et l'anthropocène: Des conditions de possibilité de nouvelles symbioses
Regard interdisciplinaire, intersectoriel et intersectionnel sur les violences faites aux femmes et aux filles
Chaire McConnell - Université de Montréal en recherche-création
La maternité comme dispositif : enjeux philosophiques et artistiques
Ordinaire de nature
La grossesse en confinement
Quand les bactéries font la loi - enjeux scientifiques, philosophiques, éthiques, politiques et légaux de l'utilisation du microbiome à des fins d'identification judiciaire
A STATISTICAL FRAMEWORK FOR THE EVALUATION AND COMPARISON OF COMPLEX NETWORKS AND ITS APPLICATION TO MICROBIOME RESEARCH
La conduite responsable en recherche-création : Outiller de façon créative pour répondre aux enjeux d’une pratique en effervescence
Description
Research-creation (RC) is an emerging field at the interface between academic research and creative activities and is defined by the Fonds de recherche du Québec (FRQ) as “research activities or approaches favouring the creation, interpretation of literary or artistic works of any kind.” Researchers in this heterogeneous field must therefore satisfy requirements of dual expertise which may sometimes conflict. As a result, researcher-creators may face very different challenges from colleagues in the rest of the academic world. So far, little is known about the nature of the issues encountered by these researchers in relation to the responsible research conduct (RCR, or scientific integrity), what differences there may be, or how the Canadian RC community responds to institutional policies or provincial / national guidelines.
The results of this international study – supported by a Concerted Action grant from the FRQ – will allow us to identify the RCR issues and challenges of RC, the perceptions of RC researchers on the application of RCR principles, and the needs for and gaps in existing policies (institutional and national) to promote RCR education and awareness. The project will culminate in the 2018 launch of a series of on-line open access tools for both the RC community and supporting actors, such as university RCR directorates, research ethics boards, and granting agencies.
CENTRE DE LA SCIENCE DE LA BIODIVERSITE DU QUEBEC (CSBQ)
Workshop on the responsible conduct in research-creation: involving the research community to develop practical training tools
De la transformation du microbiome humain comme pratique expérimentale du bioart
Organisation d'un atelier en novembre 2017 sur la conduite responsable dans la recherche-création
Réseaux phylogénétiques et leurs applications pratiques en évolution, biogéographie et sciences biomédicales
STATISTICAL ASSESSMENT OF COMPLEX AND LARGE NETWORKS DERIVED FROM (META)GENOMIIC DATA
Réseaux phylogénétiques et leurs applications pratiques en évolution, biogéographie et sciences biomédicales
LA FIGURE DE L'AUTOPORTRAIT METAGENOMIQUE EN MOUVEMENT
AUTOPORTRAIT D'UN METAGENOME
SEEING THE (SUPER)TREES THROUGH THE PHYLOGENOMIC FOREST
INTERACTIONS ENTRE LES ESPECES DE PETIS MAMMIFERES, LES PARASITES ET LA STRUCTURE DU PAYSAGE, ET CONSEQUENCES SUR L'EMERGENCE DE LA MALADIE DE LYME AU QUEBEC
CENTRE DE LA SCIENCE DE LA BIODIVERSITE DU QUEBEC
Seeing the (Super) trees throught the phylogenomic forest
Outreach
Publications and presentations
Disciplines
- Biology and Related Sciences
- Media and Visual Arts
Areas of expertise
- Multivariate statistical analysis
- Biodiversity
- Bioinformatics
- Biostatistics
- Choreogenetics
- Conservation
- Genetic diversity
- Molecular ecology
- Evolution
- Reticulate evolution
- Population genetics
- Herpetology
- Hybridization
- Hybrids
- Mammalogy
- Phylogenetics
- Phylogenomics
- Phylogeography
- Molecular systematics
- Horizontal transfer
- Research-creation